• de unión a ADN • de unión a ADN específica de secuencia • actividad dimerización de la proteína • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 DNA-binding factor de transcripción actividad • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Actividad activadora de la transcripción de unión al ADN, específica de la ARN polimerasa II • Unión al factor de transcripción • GO: 0001948 Unión a proteínas • Unión a histona acetiltransferasa • Actividad de heterodimerización de proteínas • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Unión a ADN actividad del factor de transcripción, específico de la ARN polimerasa II
Componente celular
• citoplasma • citosol • mota nuclear • complejo regulador de la transcripción • nucleoplasma • núcleo celular
Proceso biológico
• homeostasis del surfactante • diferenciación celular • respuesta a la hipoxia • regulación de la transcripción, plantilla de ADN • regulación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II en respuesta al estrés oxidativo • desarrollo pulmonar • proceso metabólico de la noradrenalina • homeostasis de iones de hierro • organización de la mitocondria • desarrollo de la placenta embrionaria • Maduración celular • Respuesta al estrés oxidativo • Transcripción, plantilla de ADN • Regulación de la frecuencia cardíaca • Desarrollo de organismos multicelulares • remodelación de los vasos sanguíneos • compromiso del destino de los mioblastos • angiogénesis • regulación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II en respuesta a la hipoxia • diferenciación de eritrocitos • transducción de señales • percepción visual • regulación positiva de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • respuesta celular a la hipoxia • transcripción de Promotor de ARN polimerasa II • modificación postraduccional • hematopoyesis • regulación de la transcripción del promotor de ARN polimerasa II • regulación positiva de la termogénesis inducida por frío • ubiquitinación de proteínas
Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies
Humano
Ratón
Entrez
2034
13819
Ensembl
ENSG00000116016
ENSMUSG00000024140
UniProt
Q99814
P97481
RefSeq (ARNm)
NM_001430
NM_010137
RefSeq (proteína)
NP_001421
NP_034267
Ubicación (UCSC)
Crónicas 2: 46,29 - 46,39 Mb
Crónicas 17: 86,75 - 86,83 Mb
Búsqueda en PubMed
[3]
[4]
Wikidata
Ver / editar humano
Ver / Editar mouse
La proteína 1 que contiene el dominio PAS endotelial ( EPAS1 , también conocida como factor 2 alfa inducible por hipoxia (HIF-2 alfa)) es una proteína codificada por el gen EPAS1 en mamíferos. Es un tipo de factor inducible por hipoxia , un grupo de factores de transcripción implicados en la respuesta fisiológica a la concentración de oxígeno. [5] [6] [7] [8] El gen está activo en condiciones hipóxicas . También es importante para el desarrollo del corazón y para mantener el equilibrio de catecolaminas necesario para la protección del corazón. La mutación a menudo conduce a tumores neuroendocrinos.
Sin embargo, varios alelos caracterizados de EPAS1 contribuyen a la adaptación a gran altitud en humanos . [9] [10] Se sabe que uno de esos alelos, que se ha heredado de los homínidos arcaicos de Denisovan , confiere un mayor rendimiento atlético en algunas personas y, por lo tanto, se lo conoce como el "gen del súper atleta". [11]
Contenido
1 función
2 alelos
3 Importancia clínica
4 Interacciones
5 referencias
6 Lecturas adicionales
7 Enlaces externos
Función [ editar ]
El gen EPAS1 codifica una subunidad de un factor de transcripción involucrado en la inducción de genes regulados por oxígeno, y que se induce a medida que cae la concentración de oxígeno (hipoxia). La proteína contiene un dominio de dimerización de proteína básica hélice-bucle-hélice , así como un dominio que se encuentra en las proteínas de transducción de señales que responden a los niveles de oxígeno. EPAS1 participa en el desarrollo del corazón embrionario y se expresa en las células endoteliales que recubren las paredes de los vasos sanguíneos del cordón umbilical .
EPAS1 también es esencial para el mantenimiento de la homeostasis de las catecolaminas y la protección contra la insuficiencia cardíaca durante el desarrollo embrionario temprano. [8] Las catecolaminas reguladas por EPAS1 incluyen epinefrina y norepinefrina . Es fundamental que la producción de catecolaminas permanezca en condiciones homeostáticas para que tanto el delicado corazón fetal como el corazón adulto no se esfuercen demasiado e induzcan insuficiencia cardíaca. La producción de catecolaminas en el embrión está relacionada con el control del gasto cardíaco al aumentar la frecuencia cardíaca fetal. [12]
Alelos [ editar ]
Un alto porcentaje de tibetanos porta un alelo de EPAS1 que mejora el transporte de oxígeno. El alelo beneficioso también se encuentra en el genoma extinto de Denisovan , lo que sugiere que surgió en ellos y entró en la población humana moderna a través de la hibridación . [13]
El lobo del Himalaya [14] y el mastín tibetano [15] han heredado un alelo del gen que se adapta a la altitud del cruzamiento con una población fantasma de un cánido desconocido parecido a un lobo. Se sabe que el alelo EPAS1 confiere una ventaja adaptativa a los animales que viven en altitudes elevadas. [14]
Importancia clínica [ editar ]
Las mutaciones en el gen EPAS1 están relacionadas con la aparición temprana de tumores neuroendocrinos como paragangliomas, somatostatinomas y / o feocromocitomas . Las mutaciones son comúnmente mutaciones somáticas sin sentido que se localizan en el sitio de hidroxilación primaria de HIF-2α, que interrumpen el mecanismo de hidroxilación / degradación de proteínas y conducen a la estabilización de proteínas y la señalización pseudohipóxica. Además, estos tumores neuroendocrinos liberan eritropoyetina (EPO) en la sangre circulante y provocan policitemia. [16] [17]
Las mutaciones en este gen se asocian con eritrocitosis familiar tipo 4, [8] hipertensión pulmonar y mal de montaña crónico. [18] También hay evidencia de que ciertas variantes de este gen brindan protección a las personas que viven a gran altura, como en el Tíbet. [9] [10] [19] El efecto es más profundo entre los tibetanos que viven en el Himalaya a una altitud de unos 4.000 metros sobre el nivel del mar, cuyo entorno es intolerable para otras poblaciones humanas debido al 40% menos de oxígeno atmosférico.
Publicado en 2010 por UCLA en Berkeley, un estudio identificó más de 30 factores genéticos que hacen que los cuerpos de los tibetanos sean adecuados para grandes altitudes, incluido EPAS1. [20] Los tibetanos no sufren problemas de salud asociados con el mal de altura , sino que producen niveles bajos de pigmento sanguíneo ( hemoglobina ) suficiente para menos oxígeno, vasos sanguíneos más elaborados, [21] tienen menor mortalidad infantil, [22] y son más pesados al nacer . [23]
EPAS1 es útil en altitudes elevadas como respuesta adaptativa a corto plazo. Sin embargo, EPAS1 también puede causar una producción excesiva de glóbulos rojos que conduce al mal de montaña crónico que puede conducir a la muerte e inhibir la capacidad reproductiva. Algunas mutaciones que aumentan su expresión se asocian a un aumento de la hipertensión y al ictus a baja altura, con síntomas similares al mal de montaña. Las poblaciones que viven permanentemente a grandes altitudes experimentan la selección en EPAS1 por mutaciones que reducen las consecuencias negativas de la aptitud física de la producción excesiva de glóbulos rojos. [19]
Interacciones [ editar ]
Se ha demostrado que EPAS1 interactúa con el translocador nuclear del receptor de hidrocarburos arilo [24] y ARNTL . [25]
Referencias [ editar ]
^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000116016 - Ensembl , mayo de 2017
^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024140 - Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ Tian H, McKnight SL, Russell DW (enero de 1997). "Proteína 1 del dominio PAS endotelial (EPAS1), un factor de transcripción expresado selectivamente en células endoteliales" . Genes y desarrollo . 11 (1): 72–82. doi : 10.1101 / gad.11.1.72 . PMID 9000051 .
^ Hogenesch JB, Chan WK, Jackiw VH, Brown RC, Gu YZ, Pray-Grant M, Perdew GH, Bradfield CA (marzo de 1997). "Caracterización de un subconjunto de la superfamilia básica-hélice-bucle-hélice-PAS que interactúa con componentes de la vía de señalización de dioxinas" . La Revista de Química Biológica . 272 (13): 8581–93. doi : 10.1074 / jbc.272.13.8581 . PMID 9079689 .
^ Percy MJ, Beer PA, Campbell G, Dekker AW, Green AR, Oscier D, Rainey MG, van Wijk R, Wood M, Lappin TR, McMullin MF, Lee FS (junio de 2008). "Nuevas mutaciones del exón 12 en el gen HIF2A asociadas con eritrocitosis" . Sangre . 111 (11): 5400–2. doi : 10.1182 / blood-2008-02-137703 . PMC 2396730 . PMID 18378852 .
^ a b c "Gen Entrez: proteína de dominio PAS endotelial EPAS1 1" .
^ a b Yi X, Liang Y, Huerta-Sanchez E, Jin X, Cuo ZX, Pool JE, Xu X, Jiang H, Vinckenbosch N, Korneliussen TS, Zheng H, Liu T, He W, Li K, Luo R, Nie X, Wu H, Zhao M, Cao H, Zou J, Shan Y, Li S, Yang Q, Ni P, Tian G, Xu J, Liu X, Jiang T, Wu R, Zhou G, Tang M, Qin J , Wang T, Feng S, Li G, Luosang J, Wang W, Chen F, Wang Y, Zheng X, Li Z, Bianba Z, Yang G, Wang X, Tang S, Gao G, Chen Y, Luo Z, Gusang L, Cao Z, Zhang Q, Ouyang W, Ren X, Liang H, Zheng H, Huang Y, Li J, Bolund L, Kristiansen K, Li Y, Zhang Y, Zhang X, Li R, Li S, Yang H, Nielsen R, Wang J, Wang J (julio de 2010). "La secuenciación de 50 exomas humanos revela la adaptación a grandes alturas" . Ciencia . 329 (5987): 75–8. Bibcode :2010Sci ... 329 ... 75Y . doi : 10.1126 / science.1190371 . PMC 3711608 . PMID 20595611 .
↑ a b Hanaoka M, Droma Y, Basnyat B, Ito M, Kobayashi N, Katsuyama Y, Kubo K, Ota M (2012). "Las variantes genéticas en EPAS1 contribuyen a la adaptación a la hipoxia de gran altitud en Sherpas" . PLOS ONE . 7 (12): e50566. Código bibliográfico : 2012PLoSO ... 750566H . doi : 10.1371 / journal.pone.0050566 . PMC 3515610 . PMID 23227185 .
^ Algar, Jim (1 de julio de 2014). "Gen de 'súper atleta' tibetano cortesía de una especie humana extinta" . Tech Times . Consultado el 22 de julio de 2014 .
^ Tian H, Hammer RE, Matsumoto AM, Russell DW, McKnight SL (noviembre de 1998). "El factor de transcripción EPAS1 sensible a la hipoxia es esencial para la homeostasis de las catecolaminas y la protección contra la insuficiencia cardíaca durante el desarrollo embrionario" . Genes y desarrollo . 12 (21): 3320–4. doi : 10.1101 / gad.12.21.3320 . PMC 317225 . PMID 9808618 .
↑ Jeong C, Alkorta-Aranburu G, Basnyat B, Neupane M, Witonsky DB, Pritchard JK, Beall CM, Di Rienzo A (10 de febrero de 2014). "La mezcla facilita las adaptaciones genéticas a gran altitud en el Tíbet" . Comunicaciones de la naturaleza . 5 : 3281. Bibcode : 2014NatCo ... 5.3281J . doi : 10.1038 / ncomms4281 . PMC 4643256 . PMID 24513612 .
^ a b Wang MS, Wang S, Li Y, Jhala Y, Thakur M, Otecko NO, et al. (Septiembre de 2020). "La hibridación antigua con una población desconocida facilitó la adaptación de cánidos a gran altitud". Biología Molecular y Evolución . 37 (9): 2616–2629. doi : 10.1093 / molbev / msaa113 . PMID 32384152 .
^ Miao B, Wang Z, Li Y (diciembre de 2016). "El análisis genómico revela la adaptación de la hipoxia en el mastín tibetano por la introgresión del lobo gris de la meseta tibetana" . Biología Molecular y Evolución . 34 (3): 734–743. doi : 10.1093 / molbev / msw274 . PMID 27927792 . S2CID 47507546 .
^ Zhuang Z, Yang C, Lorenzo F, Merino M, Fojo T, Kebebew E, Popovic V, Stratakis CA, Prchal JT, Pacak K (septiembre de 2012). "Mutaciones somáticas de ganancia de función HIF2A en paraganglioma con policitemia" . La Revista de Medicina de Nueva Inglaterra . 367 (10): 922-30. doi : 10.1056 / NEJMoa1205119 . PMC 3432945 . PMID 22931260 .
^ Yang C, Sun MG, Matro J, Huynh TT, Rahimpour S, Prchal JT, Lechan R, Lonser R, Pacak K, Zhuang Z (marzo de 2013). "Nuevas mutaciones de HIF2A interrumpen la detección de oxígeno, lo que conduce a policitemia, paragangliomas y somatostatinomas" . Sangre . 121 (13): 2563–6. doi : 10.1182 / sangre-2012-10-460972 . PMC 3612863 . PMID 23361906 .
^ Gale DP, Harten SK, Reid CD, Tuddenham EG, Maxwell PH (agosto de 2008). "Eritrocitosis autosómica dominante e hipertensión arterial pulmonar asociada con una mutación alfa HIF2 activadora" . Sangre . 112 (3): 919–21. doi : 10.1182 / sangre-2008-04-153718 . PMID 18650473 .
^ a b Beall CM, Cavalleri GL, Deng L, Elston RC, Gao Y, Knight J, Li C, Li JC, Liang Y, McCormack M, Montgomery HE, Pan H, Robbins PA, Shianna KV, Tam SC, Tsering N , Veeramah KR, Wang W, Wangdui P, Weale ME, Xu Y, Xu Z, Yang L, Zaman MJ, Zeng C, Zhang L, Zhang X, Zhaxi P, Zheng YT (junio de 2010). "Selección natural en EPAS1 (HIF2alpha) asociada con baja concentración de hemoglobina en montañeses tibetanos" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 107 (25): 11459–64. Código Bibliográfico : 2010PNAS..10711459B . doi : 10.1073 / pnas.1002443107 . PMC 2895075 . PMID 20534544 .
^ "Cinco mitos sobre el monte Everest" . Washington Post . 24 de abril de 2014 . Consultado el 18 de mayo de 2019 . cita https://news.berkeley.edu/2010/07/01/tibetan_genome/ Los tibetanos se adaptaron a las grandes altitudes en menos de 3.000 años
^ Beall CM (febrero de 2006). "Patrones de adaptación andinos, tibetanos y etíopes a la hipoxia de altura". Biología Integrativa y Comparada . 46 (1): 18-24. CiteSeerX 10.1.1.595.7464 . doi : 10.1093 / icb / icj004 . PMID 21672719 .
^ Beall CM, Song K, Elston RC, Goldstein MC (septiembre de 2004). "Mayor supervivencia de la descendencia entre las mujeres tibetanas con genotipos de alta saturación de oxígeno que residen a 4.000 m" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (39): 14300–4. doi : 10.1073 / pnas.0405949101 . PMC 521103 . PMID 15353580 .
^ Beall CM (mayo de 2007). "Dos rutas de adaptación funcional: nativos tibetanos y andinos de altura" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 104 Suppl 1: 8655–60. doi : 10.1073 / pnas.0701985104 . PMC 1876443 . PMID 17494744 .
^ Hogenesch JB, Chan WK, Jackiw VH, Brown RC, Gu YZ, Pray-Grant M, Perdew GH, Bradfield CA (marzo de 1997). "Caracterización de un subconjunto de la superfamilia básica-hélice-bucle-hélice-PAS que interactúa con componentes de la vía de señalización de dioxinas" . La Revista de Química Biológica . 272 (13): 8581–93. doi : 10.1074 / jbc.272.13.8581 . PMID 9079689 .
^ Hogenesch JB, Gu YZ, Jain S, Bradfield CA (mayo de 1998). "El huérfano MOP3 basic-helix-loop-helix-PAS forma complejos transcripcionalmente activos con factores circadianos e hipoxia" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 95 (10): 5474–9. Código bibliográfico : 1998PNAS ... 95.5474H . doi : 10.1073 / pnas.95.10.5474 . PMC 20401 . PMID 9576906 .
Lectura adicional [ editar ]
Brahimi-Horn MC, Pouysségur J (2005). "El factor inducible por hipoxia y la progresión tumoral a lo largo de la vía angiogénica". Revista Internacional de Citología . 242 : 157–213. doi : 10.1016 / S0074-7696 (04) 42004-X . ISBN 9780123646460. PMID 15598469 .
Haase VH (agosto de 2006). "Factores inducibles por hipoxia en el riñón" . Revista estadounidense de fisiología. Fisiología renal . 291 (2): F271-81. doi : 10.1152 / ajprenal.00071.2006 . PMC 4232221 . PMID 16554418 .
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (abril de 1996). "Un método de" doble adaptador "para mejorar la construcción de bibliotecas de escopetas". Bioquímica analítica . 236 (1): 107-13. doi : 10.1006 / abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (abril de 1997). "Secuenciación de cDNA de concatenación a gran escala" . Investigación del genoma . 7 (4): 353–8. doi : 10.1101 / gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 .
Ema M, Taya S, Yokotani N, Sogawa K, Matsuda Y, Fujii-Kuriyama Y (abril de 1997). "Un nuevo factor bHLH-PAS con una estrecha similitud de secuencia con el factor 1 alfa inducible por hipoxia regula la expresión de VEGF y está potencialmente implicado en el desarrollo pulmonar y vascular" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 94 (9): 4273–8. doi : 10.1073 / pnas.94.9.4273 . PMC 20712 . PMID 9113979 .
Hogenesch JB, Gu YZ, Jain S, Bradfield CA (mayo de 1998). "El huérfano MOP3 basic-helix-loop-helix-PAS forma complejos transcripcionalmente activos con factores circadianos e hipoxia" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 95 (10): 5474–9. Código bibliográfico : 1998PNAS ... 95.5474H . doi : 10.1073 / pnas.95.10.5474 . PMC 20401 . PMID 9576906 .
Takahata S, Sogawa K, Kobayashi A, Ema M, Mimura J, Ozaki N, Fujii-Kuriyama Y (julio de 1998). "Formación de heterodímeros transcripcionalmente activos de una proteína PAS similar a Arnt, Arnt3, con HIF-1a, HLF y reloj". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 248 (3): 789–94. doi : 10.1006 / bbrc.1998.9012 . PMID 9704006 .
Ema M, Hirota K, Mimura J, Abe H, Yodoi J, Sogawa K, Poellinger L, Fujii-Kuriyama Y (abril de 1999). "Mecanismos moleculares de activación de la transcripción por HLF y HIF1alpha en respuesta a la hipoxia: su estabilización e interacción inducida por señal redox con CBP / p300" . El diario EMBO . 18 (7): 1905–14. doi : 10.1093 / emboj / 18.7.1905 . PMC 1171276 . PMID 10202154 .
Cockman ME, Masson N, Mole DR, Jaakkola P, Chang GW, Clifford SC, Maher ER, Pugh CW, Ratcliffe PJ, Maxwell PH (agosto de 2000). "Unión de factor alfa inducible por hipoxia y ubiquitilación por la proteína supresora de tumores de von Hippel-Lindau" . La Revista de Química Biológica . 275 (33): 25733–41. doi : 10.1074 / jbc.M002740200 . PMID 10823831 .
Maemura K, de la Monte SM, Chin MT, Layne MD, Hsieh CM, Yet SF, Perrella MA, Lee ME (noviembre de 2000). "CLIF, un factor novedoso similar a un ciclo, regula la oscilación circadiana de la expresión del gen inhibidor 1 del activador del plasminógeno" . La Revista de Química Biológica . 275 (47): 36847–51. doi : 10.1074 / jbc.C000629200 . PMID 11018023 .
Luo JC, Shibuya M (marzo de 2001). "Se requiere una variante de señal de localización nuclear de tipo bipartito para la translocación nuclear de factores inducibles de hipoxia (1alpha, 2alpha y 3alpha)" . Oncogén . 20 (12): 1435–44. doi : 10.1038 / sj.onc.1204228 . PMID 11313887 .
Woods SL, Whitelaw ML (marzo de 2002). "Actividades diferenciales de murino de mente única 1 (SIM1) y SIM2 en un elemento de respuesta hipóxica. Interferencia entre factores de transcripción de homología básica hélice-bucle-hélice / por-Arnt-Sim" . La Revista de Química Biológica . 277 (12): 10236–43. doi : 10.1074 / jbc.M110752200 . PMID 11782478 .
Lando D, Peet DJ, Whelan DA, Gorman JJ, Whitelaw ML (febrero de 2002). "Hidroxilación de asparagina del dominio de transactivación HIF un interruptor hipóxico". Ciencia . 295 (5556): 858–61. Código Bibliográfico : 2002Sci ... 295..858L . doi : 10.1126 / science.1068592 . PMID 11823643 . S2CID 24045310 .
Mole DR, Pugh CW, Ratcliffe PJ, Maxwell PH (2002). "Regulación de la vía HIF: hidroxilación enzimática de un residuo prolilo conservado en subunidades alfa del factor inducible por hipoxia gobierna la captura por el complejo pVHL E3 ubiquitina ligasa". Avances en la regulación de enzimas . 42 : 333–47. doi : 10.1016 / S0065-2571 (01) 00037-1 . PMID 12123724 .
Sivridis E, Giatromanolaki A, Gatter KC, Harris AL, Koukourakis MI (septiembre de 2002). "Asociación de factores inducibles por hipoxia 1 alfa y 2 alfa con vías angiogénicas activadas y pronóstico en pacientes con carcinoma de endometrio" . Cáncer . 95 (5): 1055–63. doi : 10.1002 / cncr.10774 . PMID 12209691 . S2CID 72624677 .
Elvert G, Kappel A, Heidenreich R, Englmeier U, Lanz S, Acker T, Rauter M, Plate K, Sieweke M, Breier G, Flamme I (febrero de 2003). "Interacción cooperativa de factor-2alpha inducible por hipoxia (HIF-2alpha) y Ets-1 en la activación transcripcional del receptor-2 del factor de crecimiento endotelial vascular (Flk-1)" . La Revista de Química Biológica . 278 (9): 7520-30. doi : 10.1074 / jbc.M211298200 . PMID 12464608 .
Sang N, Stiehl DP, Bohensky J, Leshchinsky I, Srinivas V, Caro J (abril de 2003). "La señalización de MAPK regula al alza la actividad de factores inducibles por hipoxia por sus efectos sobre p300" . La Revista de Química Biológica . 278 (16): 14013–9. doi : 10.1074 / jbc.M209702200 . PMC 4518846 . PMID 12588875 .
Enlaces externos [ editar ]
EPAS1 + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .
vtmiGalería PDB
1p97 : estructura de RMN del dominio PAS C-terminal de HIF2a
2a24 : Estructura HADDOCK del heterodímero HIF-2a / ARNT PAS-B
vtmiFactores de transcripción y receptores intracelulares
(1) Dominios básicos
(1.1) Cremallera básica de leucina ( bZIP )
Factor de transcripción activador
AATF
1
2
3
4
5
6
7
AP-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
c-jun
JUNB
JunD
LLEVAR UNA VIDA DE SOLTERO
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
DBP
DDIT3
GABPA
GCN4
HLF
MAF
B
F
GRAMO
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Hélice-bucle-hélice básica ( bHLH )
Grupo A
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
MANO
1
2
MESP2
Factores reguladores miogénicos
MyoD
Miogenina
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Neurogeninas
1
2
3
OLIG
1
2
Paraxis
TCF15
Escleraxis
SLC
LYL1
TAL
1
2
Giro
Grupo B
FIGLA
Mi c
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Grupo C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
RELOJ
HIF
1A
EPAS1
3A
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Grupo D
BHLH
2
3
9
Pho4
IDENTIFICACIÓN
1
2
3
4
Grupo E
ÉL ES
1
2
3
4
5
6
7
OYE
1
2
L
Grupo F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
AP-4
MAX
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Mi c
SREBP
1
2
USF1
(1,4) NF-1
NFI
A
B
C
X
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
ESTÁ LOCO
6
7
4 )
(1,5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
ANK
(1.6) Hélice-tramo-hélice básica (bHSH)
AP-2
α
β
γ
δ
ε
(2) Dominios de unión al ADN con dedos de zinc
(2.1) Receptor nuclear (Cys 4 )
subfamilia 1
Hormona tiroidea
α
β
AUTO
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
subfamilia 2
GOLPE-TF
( Yo
II
Oreja-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Receptor testicular
2
4
TLX
subfamilia 3
Hormona esteroide
Andrógino
Estrógeno
α
β
Glucocorticoide
Mineralocorticoide
Progesterona
Relacionado con el estrógeno
α
β
γ
subfamilia 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
subfamilia 5
LRH-1
SF1
subfamilia 6
GCNF
subfamilia 0
DAX1
SHP
(2.2) Otras Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Factores de transcripción generales
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
TFIIF
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3A
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11A
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Familia Krüppel
1
2
3
DESCANSO
S1
S2
YY1
HIC
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
VENDER
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7A
7B
ZBTB
11
dieciséis
17
20
32
33
40
dedo de zinc
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35
41
43
44
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Composición alternante
AIRE
DIDO1
GRLF1
EN G
1
2
4
JARID
1A
1B
1C
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Dominios de hélice-vuelta-hélice
(3.1) Homeodominio
Clase ANTP de Antennapedia
protoHOX Hox-like
ParaHox
Gsx
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
Hox extendido: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
B2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
tipo metaHOX NK
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
ES
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
OTAN
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
otro
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1A
1B
SIN CAJA
CUENTO
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
MEIS
1
2
PBX
1
2
3
PKNOX
1
2
SEIS
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
dieciséis
17
20
21A
Dominio de POU
PIT-1
BRN-3 : A
B
C
Factor de transcripción de octamer : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Caja emparejada
PAZ
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
PHOX
2A
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Bicoide
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Cabeza de horquilla / hélice alada
E2F
1
2
3
4
5
Proteínas FOX
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Factores de choque térmico
HSF
1
2
4
(3.5) Clústeres de triptófano
DUENDE
2
4
5
EGF
ALCE
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ERGIO
SPIB
ETV
1
4
5
6
FLI1
Factores reguladores del interferón
1
2
3
4
5
6
7
8
MI B
MYBL2
(3.6) dominio TEA
factor potenciador transcripcional
1
2
3
4
(4) factores β-andamio con contactos de ranura menores
(4.1) Región de homología rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
RELA
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) ESTADÍSTICA
ESTADÍSTICA
1
2
3
4
5
6
(4.3) similar a p53
p53 p63 p73 familia
p53
TP63
p73
TBX
1
2
3
5
19
21
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Caja MADS
Mef2
A
B
C
D
SRF
(4.6) Proteínas de unión a TATA
TBP
TBPL1
(4.7) Grupo de alta movilidad
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1A
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
TOX
1
2
3
4
(4.9) Granulado
TFCP2
(4.10) Dominio de choque frío
CSDA
YBX1
(4.11) Enano
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Otros factores de transcripción
(0,2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Dominio de bolsillo
Rb
RBL1
RBL2
(0.5) Factores relacionados con AP-2 / EREBP
Apetala 2
EREBP
B3
(0.6) Varios
ÁRIDO
1A
1B
2
3A
3B
4A
GORRA
SI YO
dieciséis
35
MLL
2
3
T1
MNDA
NFY
A
B
C
Rho / Sigma
ver también deficiencias de factor de transcripción / corregulador