ERG , erg-3, p55, gen relacionado con ETS, homólogo del oncogén E26 del virus de la eritroblastosis aviar v-ets, factor de transcripción ETS, factor de transcripción ETS ERG
• la unión al ADN • de unión a ADN específica de secuencia • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 actividad del factor de transcripción de unión a ADN • cromatina unión • actividad transductor de señal • GO: proteína 0001948 unión • GO: 0000980 ARN polimerasa Unión de ADN específica de secuencia de la región cisreguladora II • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Actividad activadora de la transcripción de unión al ADN, específica de la ARN polimerasa II • GO: 0001200, GO: 0001133 , GO: 0001201 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN, específico de la ARN polimerasa II
• la diferenciación celular • regulación de la transcripción, de plantilla de ADN • desarrollo de relieve endocárdico • cojín endocárdico a la transición mesenquimal involucrado en corazón formación de la válvula • transcripción, de plantilla de ADN • desarrollo organismo multicelular • regulación positiva de vaso sanguíneo remodelación • la fosforilación de proteínas • proliferación celular • migración celular • transducción de señales • regulación positiva de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • regulación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II
ERG ( gen relacionado con ETS ) es un oncogén . [5] [6] [7] ERG es un miembro de lafamilia de factores de transcripción ETS (específicos de transformación de eritroblastos). [8] Elgen ERG codifica una proteína, también llamada ERG, que funciona como un regulador transcripcional. Los genes de la familia ETS regulan el desarrollo embrionario , la proliferación celular , la diferenciación , la angiogénesis , la inflamación y la apoptosis .
Contenido
1 función
2 Cáncer
2.1 Fusión del gen TMPRSS2
2.2 Fusión de genes EWS
2.3 Fusión con TLS / FUS
3 Ubicación
4 Interacciones
5 referencias
6 Lecturas adicionales
7 Enlaces externos
Función [ editar ]
El regulador transcripcional ERG es una proteína nuclear que se une a secuencias de ADN ricas en purinas . [9] [10] El regulador transcripcional ERG es necesario para la adhesión de las plaquetas al subendotelio y regula la hematopoyesis . Tiene un dominio de unión al ADN y un dominio PNT (puntiagudo). [8] ERG se expresa en niveles más altos en los mielocitos tempranos que en los linfocitos maduros (tipos de glóbulos blancos ). Por tanto, ERG puede actuar como regulador de la diferenciación de las células hematopoyéticas tempranas. [11]
La mutación Mld2, generada a través de un cribado de mutagénesis ENU, fue el primer alelo no funcional de Erg . El homocigoto Mld2 es embrionario letal en el día 13,5. Los ratones adultos heterocigotos para la mutación Mld2 tienen defectos de células madre hematopoyéticas. [12] Esto significa que cuando el gen ERG no se transcribe de forma activa y se produce la proteína ERG, las células hematopoyéticas de un ratón no pueden funcionar correctamente. Dado que el ERG es importante para la capacidad de las células hematopoyéticas de funcionar y autorrenovarse, puede haber aplicaciones en el uso de células madre sanguíneas para la reparación de tejidos, el trasplante y otras aplicaciones terapéuticas. [13]
Cáncer [ editar ]
Este gen se puede clasificar como protooncogén . Durante las translocaciones cromosómicas que ocurren en la división celular, el ERG puede atascarse accidentalmente en un cromosoma diferente al que pertenece. Esto es análogo a otra translocación, el cromosoma Filadelfia . Esto da como resultado productos de genes de fusión, que pueden tener malas consecuencias para las células. Ejemplos de estos productos génicos de fusión serían TMPRSS2-ERG y NDRG1-ERG en el cáncer de próstata, EWS-ERG en el sarcoma de Ewing y FUS-ERG en la leucemia mieloide aguda. [14] La proteína de unión al ADN ERG se fusiona con las proteínas de unión al ARN EWS y TLS / FUS en el sarcoma de Ewing y las leucemias mieloides agudas.respectivamente y funcionan como activadores transcripcionales. [15] [16] ERG y sus proteínas de fusión EWS-ERG y TLS / FUS-ERG inhiben la apoptosis. [17] Se han utilizado oligonucleótidos de conmutación por empalme de morfolino para inducir la omisión del exón 4 en líneas celulares de cáncer de próstata , modelos de ratón y explantes de tejido , lo que lleva a efectos anticancerígenos, incluida la reducción de la proliferación y la inducción de apoptosis. [18]
Fusión del gen TMPRSS2 [ editar ]
ERG puede fusionarse con la proteína TMPRSS2 para formar un gen de fusión oncogénico que se encuentra comúnmente en el cáncer de próstata humano, especialmente en el cáncer de próstata resistente a hormonas . Esto sugiere que la sobreexpresión de ERG puede contribuir al desarrollo de la independencia de los andrógenos en el cáncer de próstata a través de la interrupción de la señalización del receptor de andrógenos . [19] El gen de fusión es fundamental para la progresión del cáncer porque inhibe la expresión del receptor de andrógenos y se une e inhibe los receptores de andrógenos ya presentes en la célula. Esencialmente, la fusión TMPRSS2-ERG altera la capacidad de las células para diferenciarse en células prostáticas adecuadas creando tejido no regulado y desorganizado.[19] En el 90% de los cánceres de próstata que sobreexpresan ERG, también poseen una proteína de fusión TMPRSS2-ERG, lo que sugiere que esta fusión es el subtipo predominante en el cáncer de próstata. [20]
Fusión de genes EWS [ editar ]
El sarcoma de Ewing se asocia con translocaciones cromosómicas, que típicamente dan como resultado genes de fusión con reguladores transcripcionales. Esto significa que la proteína que se transcribe con el gen podría producirse en exceso o producirse de forma insuficiente, lo que provocaría una actividad antinatural en las células. Normalmente, este es el primer paso en la progresión de una célula a malignidad. En aproximadamente el 10% de los casos de sarcoma de Ewing tienen una fusión EWS1-ERG. [8]
Fusión con TLS / FUS [ editar ]
En la leucemia mieloide aguda , la translocación t (16; 21) en la leucemia mieloide fusiona TLS / FUS con ERG, lo que interrumpe el dominio de unión de ARN de TLS / FUS natural y, en su lugar, inserta el dominio de unión de ADN de ERG. [21]
Ubicación [ editar ]
ERG se encuentra en el cromosoma 21. [6] La proteína ERG se expresa a un nivel similar en todo el cuerpo. [8]
Interacciones [ editar ]
Se ha demostrado que ERG interactúa con:
C-jun , [22]
ETS2 , [23]
EWSR1 , [15]
TLS , [16] y
TMPRSS2 . [19]
USP9X . [24]
Referencias [ editar ]
^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000157554 - Ensembl , mayo de 2017
^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040732 - Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ Reddy ES, Rao VN, Papas TS (septiembre de 1987). "El gen erg: un gen humano relacionado con el oncogén ets" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 84 (17): 6131–5. Código Bibliográfico : 1987PNAS ... 84.6131R . doi : 10.1073 / pnas.84.17.6131 . PMC 299022 . PMID 3476934 .
^ a b Rao VN, Papas TS, Reddy ES (agosto de 1987). "erg, un gen humano relacionado con ets en el cromosoma 21: empalme alternativo, poliadenilación y traducción" . Ciencia . 237 (4815): 635–9. Código Bibliográfico : 1987Sci ... 237..635R . doi : 10.1126 / science.3299708 . PMID 3299708 .
^ Rao VN, Modi WS, Drabkin HD, Patterson D, O'Brien SJ, Papas TS, Reddy ES (noviembre de 1988). "El gen del erg humano se asigna al cromosoma 21, banda q22: relación con la translocación 8; 21 de la leucemia mielógena aguda". Oncogén . 3 (5): 497–500. PMID 3274086 .
^ a b c d https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/2078
^ Reddy ES, Rao VN (diciembre de 1991). "erg, un gen relacionado con ets, codifica para activadores transcripcionales específicos de secuencia". Oncogén . 6 (12): 2285–9. PMID 1766675 .
^ Siddique HR, Rao VN, Lee L, Reddy ES (julio de 1993). "Caracterización de los dominios de unión al ADN y activación transcripcional de la proteína erg". Oncogén . 8 (7): 1751–5. PMID 8510921 .
^ Murakami K, Mavrothalassitis G, Bhat NK, Fisher RJ, Papas TS (junio de 1993). "La proteína humana ERG-2 es una proteína de unión al ADN fosforilada, un miembro distinto de la familia ets". Oncogén . 8 (6): 1559–66. PMID 8502479 .
^ Loughran SJ, Kruse EA, Hacking DF, de Graaf CA, Hyland CD, Willson TA, Henley KJ, Ellis S, Voss AK, Metcalf D, Hilton DJ, Alexander WS, Kile BT (julio de 2008). "El factor de transcripción Erg es esencial para la hematopoyesis definitiva y la función de las células madre hematopoyéticas adultas". Inmunología de la naturaleza . 9 (7): 810–9. doi : 10.1038 / ni.1617 . PMID 18500345 . S2CID 205361508 .
^ Taoudi S, Bee T, Hilton A, Knezevic K, Scott J, Willson TA, Collin C, Thomas T, Voss AK, Kile BT, Alexander WS, Pimanda JE, Hilton DJ (febrero de 2011). "La dependencia de ERG distingue el control del desarrollo del mantenimiento de las células madre hematopoyéticas de la especificación hematopoyética" . Genes y desarrollo . 25 (3): 251–62. doi : 10.1101 / gad.2009211 . PMC 3034900 . PMID 21245161 .
^ "Tarjetas de genes" .
^ a b Ohno T, Ouchida M, Lee L, Gatalica Z, Rao VN, Reddy ES (octubre de 1994). "El gen EWS, involucrado en la familia de tumores Ewing, melanoma maligno de partes blandas y tumores desmoplásicos de células redondas pequeñas, codifica una proteína de unión a ARN con nuevos dominios reguladores". Oncogén . 9 (10): 3087–97. PMID 8084618 .
^ a b Prasad DD, Ouchida M, Lee L, Rao VN, Reddy ES (diciembre de 1994). "El dominio de fusión TLS / FUS de la proteína quimérica TLS / FUS-erg resultante de la translocación cromosómica t (16; 21) en la leucemia mieloide humana funciona como un dominio de activación transcripcional". Oncogén . 9 (12): 3717–29. PMID 7970732 .
^ Yi H, Fujimura Y, Ouchida M, Prasad DD, Rao VN, Reddy ES (marzo de 1997). "Inhibición de la apoptosis por proteínas Fli-1 y erg normales y aberrantes involucradas en leucemias y tumores sólidos humanos" . Oncogén . 14 (11): 1259–68. doi : 10.1038 / sj.onc.1201099 . PMID 9178886 .
^ Li L, Hobson L, Perry L, Clark B, Heavey S, Haider A, et al. (25 de junio de 2020). "Dirigirse al oncogén ERG con oligonucleótidos de conmutación de empalme como una nueva estrategia terapéutica en el cáncer de próstata" . Revista británica de cáncer . 123 (6): 1024–1032. doi : 10.1038 / s41416-020-0951-2 . PMC 7493922 . PMID 32581342 . S2CID 220049871 .
^ a b c Yu J, Yu J, Mani RS, Cao Q, Brenner CJ, Cao X, Wang X, Wu L, Li J, Hu M, Gong Y, Cheng H, Laxman B, Vellaichamy A, Shankar S, Li Y, Dhanasekaran SM, Morey R, Barrette T, Lonigro RJ, Tomlins SA, Varambally S, Qin ZS, Chinnaiyan AM (mayo de 2010). "Una red integrada de fusiones de genes de receptor de andrógenos, polycomb y TMPRSS2-ERG en la progresión del cáncer de próstata" . Cancer Cell . 17 (5): 443–54. doi : 10.1016 / j.ccr.2010.03.018 . PMC 2874722 . PMID 20478527 .
^ Tomlins SA, Laxman B, Varambally S, Cao X, Yu J, Helgeson BE, Cao Q, Prensner JR, Rubin MA, Shah RB, Mehra R, Chinnaiyan AM (2008). "Papel de la fusión del gen TMPRSS2-ERG en el cáncer de próstata" . Neoplasia . 10 (2): 177–88. doi : 10.1593 / neo.07822 . PMC 2244693 . PMID 18283340 .
^ Ichikawa H, Shimizu K, Hayashi Y, Ohki M (junio de 1994). "Un gen de la proteína de unión a ARN, TLS / FUS, se fusiona con ERG en la leucemia mieloide humana con translocación cromosómica t (16; 21)". Investigación del cáncer . 54 (11): 2865–8. PMID 8187069 .
^ Verger A, Buisine E, Carrère S, Wintjens R, Flourens A, Coll J, Stéhelin D, Duterque-Coquillaud M (mayo de 2001). "Identificación de residuos de aminoácidos en el factor de transcripción ETS Erg que median la formación del complejo ternario Erg-Jun / Fos-DNA" (PDF) . La Revista de Química Biológica . 276 (20): 17181–9. doi : 10.1074 / jbc.M010208200 . PMID 11278640 . S2CID 32288807 .
^ Basuyaux JP, Ferreira E, Stéhelin D, Butticè G (octubre de 1997). "Los factores de transcripción de Ets interactúan entre sí y con el complejo c-Fos / c-Jun a través de distintos dominios proteicos de manera dependiente e independiente del ADN" . La Revista de Química Biológica . 272 (42): 26188–95. doi : 10.1074 / jbc.272.42.26188 . PMID 9334186 .
^ Wang S, Kollipara R, Srivastava N, Li R, Ravindranathan P, Hernandez E, Freeman E, Humphries C, Kapur P, Lotan Y, Fazli L, Gleave M, Plymate S, Raj G, Hsieh J, Kittler R (Mar 2014). "Ablación del factor de transcripción oncogénico ERG por inhibición de la deubiquitinasa en cáncer de próstata" . Proc Natl Acad Sci USA . 111 (11): 4251–56. Código Bibliográfico : 2014PNAS..111.4251W . doi : 10.1073 / pnas.1322198111 . PMC 3964108 . PMID 24591637 .
Lectura adicional [ editar ]
Yi H, Fujimura Y, Ouchida M, Prasad DD, Rao VN, Reddy ES (marzo de 1997). "Inhibición de la apoptosis por proteínas Fli-1 y erg normales y aberrantes involucradas en leucemias y tumores sólidos humanos" . Oncogén . 14 (11): 1259–68. doi : 10.1038 / sj.onc.1201099 . PMID 9178886 .
Rao VN, Papas TS, Reddy ES (agosto de 1987). "erg, un gen humano relacionado con ets en el cromosoma 21: empalme alternativo, poliadenilación y traducción" . Ciencia . 237 (4815): 635–9. Código Bibliográfico : 1987Sci ... 237..635R . doi : 10.1126 / science.3299708 . PMID 3299708 .
Giovannini M, Biegel JA, Serra M, Wang JY, Wei YH, Nycum L, Emanuel BS, Evans GA (agosto de 1994). "Transcripciones de fusión EWS-erg y EWS-Fli1 en sarcoma de Ewing y tumores neuroectodérmicos primitivos con translocaciones variantes" . La Revista de Investigación Clínica . 94 (2): 489–96. doi : 10.1172 / JCI117360 . PMC 295111 . PMID 8040301 .
Dunn T, Praissman L, Hagag N, Viola MV (agosto de 1994). "El gen ERG se transloca en una línea celular de sarcoma de Ewing". Genética y citogenética del cáncer . 76 (1): 19-22. doi : 10.1016 / 0165-4608 (94) 90063-9 . PMID 8076344 .
Ichikawa H, Shimizu K, Hayashi Y, Ohki M (junio de 1994). "Un gen de la proteína de unión a ARN, TLS / FUS, se fusiona con ERG en la leucemia mieloide humana con translocación cromosómica t (16; 21)". Investigación del cáncer . 54 (11): 2865–8. PMID 8187069 .
Prasad DD, Rao VN, Lee L, Reddy ES (febrero de 1994). "El producto erg-3 empalmado diferencialmente funciona como un activador de la transcripción". Oncogén . 9 (2): 669–73. PMID 8290279 .
Duterque-Coquillaud M, Niel C, Plaza S, Stehelin D (julio de 1993). "Las nuevas isoformas de erg humano generadas por empalme alternativo son activadores de la transcripción". Oncogén . 8 (7): 1865–73. PMID 8510931 .
Basuyaux JP, Ferreira E, Stéhelin D, Butticè G (octubre de 1997). "Los factores de transcripción de Ets interactúan entre sí y con el complejo c-Fos / c-Jun a través de distintos dominios proteicos de manera dependiente e independiente del ADN" . La Revista de Química Biológica . 272 (42): 26188–95. doi : 10.1074 / jbc.272.42.26188 . PMID 9334186 .
Carrère S, Verger A, Flourens A, Stehelin D, Duterque-Coquillaud M (junio de 1998). "Las proteínas Erg, factores de transcripción de la familia Ets, forman homo, heterodímeros y complejos ternarios a través de dos dominios distintos" . Oncogén . 16 (25): 3261–8. doi : 10.1038 / sj.onc.1201868 . PMID 9681824 .
McLaughlin F, Ludbrook VJ, Kola I, Campbell CJ, Randi AM (diciembre de 1999). "Caracterización del factor de necrosis tumoral (TNF) - elementos de respuesta (alfa) en el promotor ICAM-2 humano". Revista de ciencia celular . 112 (24): 4695–703. PMID 10574717 .
Mastrangelo T, Modena P, Tornielli S, Bullrich F, Testi MA, Mezzelani A, Radice P, Azzarelli A, Pilotti S, Croce CM, Pierotti MA, Sozzi G (agosto de 2000). "Un nuevo gen de dedo de zinc se fusiona con EWS en un tumor de células pequeñas y redondas" . Oncogén . 19 (33): 3799–804. doi : 10.1038 / sj.onc.1203762 . PMID 10949935 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (noviembre de 2000). "Clonación de ADN mediante recombinación específica de sitio in vitro" . Investigación del genoma . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101 / gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Verger A, Buisine E, Carrère S, Wintjens R, Flourens A, Coll J, Stéhelin D, Duterque-Coquillaud M (mayo de 2001). "Identificación de residuos de aminoácidos en el factor de transcripción ETS Erg que median la formación del complejo ternario Erg-Jun / Fos-DNA" (PDF) . La Revista de Química Biológica . 276 (20): 17181–9. doi : 10.1074 / jbc.M010208200 . PMID 11278640 . S2CID 32288807 .
Yang L, Xia L, Wu DY, Wang H, Chansky HA, Schubach WH, Hickstein DD, Zhang Y (enero de 2002). "Clonación molecular de ESET, una nueva metiltransferasa específica de histona H3 que interactúa con el factor de transcripción ERG" . Oncogén . 21 (1): 148–52. doi : 10.1038 / sj.onc.1204998 . PMID 11791185 .
Mackereth CD, Schärpf M, Gentile LN, McIntosh LP (septiembre de 2002). "Cambio químico y conservación de la estructura secundaria de los dominios PNT / SAM de la familia ets de factores de transcripción". Revista de RMN biomolecular . 24 (1): 71–2. doi : 10.1023 / A: 1020617426325 . PMID 12449421 . S2CID 80867076 .
Matsui Y, Chansky HA, Barahmand-Pour F, Zielinska-Kwiatkowska A, Tsumaki N, Myoui A, Yoshikawa H, Yang L, Eyre DR (marzo de 2003). "La transcripción del gen del colágeno COL11A2 está regulada diferencialmente por la proteína de fusión del sarcoma EWS / ERG y el ERG de tipo salvaje" . La Revista de Química Biológica . 278 (13): 11369–75. doi : 10.1074 / jbc.M300164200 . PMID 12554743 .
Enlaces externos [ editar ]
ERG + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .
vtmiGalería PDB
1fli : DOMINIO DE UNIÓN AL ADN DE FLI-1
1sxe : la estructura de la solución del dominio puntiagudo (PNT) del factor de transcripción Erg
vtmiFactores de transcripción y receptores intracelulares
(1) Dominios básicos
(1.1) Cremallera básica de leucina ( bZIP )
Factor de transcripción activador
AATF
1
2
3
4
5
6
7
AP-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
c-jun
JUNB
JunD
LLEVAR UNA VIDA DE SOLTERO
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
DBP
DDIT3
GABPA
GCN4
HLF
MAF
B
F
GRAMO
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Hélice-bucle-hélice básica ( bHLH )
Grupo A
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
MANO
1
2
MESP2
Factores reguladores miogénicos
MyoD
Miogenina
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Neurogeninas
1
2
3
OLIG
1
2
Paraxis
TCF15
Escleraxis
SLC
LYL1
TAL
1
2
Giro
Grupo B
FIGLA
Mi c
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Grupo C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
RELOJ
HIF
1A
EPAS1
3A
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Grupo D
BHLH
2
3
9
Pho4
IDENTIFICACIÓN
1
2
3
4
Grupo E
ÉL ES
1
2
3
4
5
6
7
OYE
1
2
L
Grupo F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
AP-4
MAX
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Mi c
SREBP
1
2
USF1
(1,4) NF-1
NFI
A
B
C
X
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
ESTÁ LOCO
6
7
4 )
(1,5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
ANK
(1.6) Hélice-tramo-hélice básica (bHSH)
AP-2
α
β
γ
δ
ε
(2) Dominios de unión al ADN con dedos de zinc
(2.1) Receptor nuclear (Cys 4 )
subfamilia 1
Hormona tiroidea
α
β
CARRO
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
subfamilia 2
GOLPE-TF
( Yo
II
Oreja-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Receptor testicular
2
4
TLX
subfamilia 3
Hormona esteroide
Andrógino
Estrógeno
α
β
Glucocorticoide
Mineralocorticoide
Progesterona
Relacionado con el estrógeno
α
β
γ
subfamilia 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
subfamilia 5
LRH-1
SF1
subfamilia 6
GCNF
subfamilia 0
DAX1
SHP
(2.2) Otras Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Factores de transcripción generales
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
TFIIF
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3A
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11A
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Familia Krüppel
1
2
3
DESCANSAR
S1
S2
YY1
HIC
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
VENDER
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7A
7B
ZBTB
11
dieciséis
17
20
32
33
40
dedo de zinc
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35
41
43
44
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Composición alternante
AIRE
DIDO1
GRLF1
EN G
1
2
4
JARID
1A
1B
1C
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Dominios de hélice-vuelta-hélice
(3.1) Homeodominio
Clase ANTP de Antennapedia
protoHOX Hox-like
ParaHox
Gsx
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
Hox extendido: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
B2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
tipo metaHOX NK
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
ES
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
OTAN
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
otro
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1A
1B
SIN CAJA
CUENTO
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
MEIS
1
2
PBX
1
2
3
PKNOX
1
2
SEIS
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
dieciséis
17
20
21A
Dominio de POU
PIT-1
BRN-3 : A
B
C
Factor de transcripción de octamer : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Caja emparejada
PAZ
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
PHOX
2A
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Bicoide
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Cabeza de horquilla / hélice alada
E2F
1
2
3
4
5
Proteínas FOX
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Factores de choque térmico
HSF
1
2
4
(3.5) Clústeres de triptófano
DUENDE
2
4
5
EGF
ALCE
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ERGIO
SPIB
ETV
1
4
5
6
FLI1
Factores reguladores del interferón
1
2
3
4
5
6
7
8
MI B
MYBL2
(3.6) dominio TEA
factor potenciador transcripcional
1
2
3
4
(4) factores β-andamio con contactos de ranura menores
(4.1) Región de homología rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
RELA
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) ESTADÍSTICA
ESTADÍSTICA
1
2
3
4
5
6
(4.3) similar a p53
p53 p63 p73 familia
p53
TP63
p73
TBX
1
2
3
5
19
21
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Caja MADS
Mef2
A
B
C
D
SRF
(4.6) Proteínas de unión a TATA
TBP
TBPL1
(4.7) Grupo de alta movilidad
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1A
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
TOX
1
2
3
4
(4.9) Granulado
TFCP2
(4.10) Dominio de choque frío
CSDA
YBX1
(4.11) Enano
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Otros factores de transcripción
(0,2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Dominio de bolsillo
Rb
RBL1
RBL2
(0.5) Factores relacionados con AP-2 / EREBP
Apetala 2
EREBP
B3
(0.6) Varios
ÁRIDO
1A
1B
2
3A
3B
4A
GORRA
SI YO
dieciséis
35
MLL
2
3
T1
MNDA
NFY
A
B
C
Rho / Sigma
ver también deficiencias de factor de transcripción / corregulador