EGR-1 (proteína de respuesta de crecimiento temprano 1) también conocida como ZNF268 (proteína 268 con dedo de zinc) o NGFI-A (proteína A inducida por el factor de crecimiento nervioso) es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen EGR1 .
EGR1 |
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![Complejo de ADN con dedos de zinc.png](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///yH5BAEAAAAALAAAAAABAAEAAAIBRAA7) |
Estructuras disponibles |
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PDB | Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB |
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Lista de códigos de identificación de PDB |
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4R2A , 4R2C , 4R2D , 4X9J |
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Identificadores |
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Alias | EGR1 , AT225, G0S30, KROX-24, NGFI-A, TIS8, ZIF-268, ZNF225, respuesta de crecimiento temprano 1 |
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Identificaciones externas | OMIM : 128990 MGI : 95295 HomoloGene : 56394 GeneCards : EGR1 |
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Ubicación de genes ( humanos ) |
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![Cromosoma 5 (humano)](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///yH5BAEAAAAALAAAAAABAAEAAAIBRAA7) | Chr. | Cromosoma 5 (humano) [1] |
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| Banda | 5q31.2 | Comienzo | 138.465.479 pb [1] |
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Final | 138.469.303 pb [1] |
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Ontología de genes |
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Función molecular | • la unión al ADN • de unión a ADN específica de secuencia • ARN polimerasa II transcripción regulador región de unión a ADN específica de secuencia • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 DNA-binding factor de transcripción actividad • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 actividad del activador de la transcripción de unión a ADN, ARN polimerasa II-específico • GO: región de unión 0000975 transcripción reguladora en cis • unión de iones metálicos • la actividad del factor de transcripción, la ARN polimerasa II núcleo promotor proximal región de unión a secuencia específica • GO: proteína 0001948 unión • histona acetiltransferasa de unión • unión de ácidos nucleicos • hemi-metilado de unión a ADN • unión de doble cadena de ADN metilado • zinc ion de unión • unión de la cromatina-promotor específico • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN, específico de la ARN polimerasa II
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Componente celular | • nucleoplasma • núcleo • citoplasma
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Proceso biológico | • Regulación del proceso apoptótico • Respuesta celular a la sustancia orgánica • Regulación de la transcripción, plantilla de ADN • Proliferación de células mesangiales glomerulares • Regulación negativa de la transcripción por la ARN polimerasa II • Respuesta a la glucosa • Transcripción por la ARN polimerasa II • Vía de señalización de BMP • Transcripción, Plantilla de ADN • Regulación positiva de la transcripción, Plantilla de ADN • Respuesta a la insulina • Vía de señalización mediada por interleucina-1 • Respuesta celular al ácido micofenólico • Diferenciación de células T • Vía de señalización de interferón tipo I • Regulación positiva de la proliferación de células mesangiales metanéfricas glomerulares • respuesta celular a la radiación gamma • regulación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II en respuesta a la hipoxia • diferenciación de las células del músculo esquelético • respuesta celular a la heparina • regulación de la sumoilación de proteínas • regulación negativa de la vía de señalización canónica de Wnt • regulación positiva de la transcripción por la ARN polimerasa II • respuesta celular se a la interleucina-8 • respuesta a la hipoxia • respuesta a la isquemia • ciclo estral • regulación positiva del proceso biosintético hormonal • regulación del proceso biosintético de la progesterona • regulación de la transcripción por la ARN polimerasa II • regulación positiva de la expresión génica • regulación circadiana de la expresión génica • ritmo locomotor • proceso rítmico • homeostasis de la temperatura circadiana • regulación positiva de la muerte neuronal • regulación positiva de la actividad de la proteína tau quinasa
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Fuentes: Amigo / QuickGO |
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Ortólogos |
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Especies | Humano | Ratón |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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RefSeq (ARNm) | | |
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RefSeq (proteína) | | |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 5: 138,47 - 138,47 Mb | n / A |
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Búsqueda en PubMed | [2] | [3] |
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Wikidata |
Ver / editar humano | Ver / Editar mouse |
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EGR-1 es un factor de transcripción de mamíferos . También se denominó Krox-24, TIS8 y ZENK . Originalmente se descubrió en ratones .
La proteína codificada por este gen pertenece a la familia EGR de proteínas con dedos de zinc de tipo Cys 2 His 2 . Es una proteína nuclear y funciona como regulador transcripcional. Los productos de los genes diana que activa son necesarios para la diferenciación y la mitogénesis . Los estudios sugieren que este es un gen supresor de tumores . [4]
Tiene un patrón de expresión distinto en el cerebro y se ha demostrado que su inducción está asociada con la actividad neuronal. Varios estudios sugieren que tiene un papel en la plasticidad neuronal . [5]
EGR-1 es un factor de transcripción importante en la formación de la memoria . Tiene un papel fundamental en la reprogramación epigenética de las neuronas cerebrales . EGR-1 recluta la proteína TET1 que inicia una vía de desmetilación del ADN . [6] La eliminación de las marcas de metilación del ADN permite la activación de genes posteriores. EGR-1, junto con TET1, se emplea en la programación de la distribución de los sitios de metilación en el ADN del cerebro durante el desarrollo del cerebro, en el aprendizaje y en la plasticidad neuronal a largo plazo . También se ha encontrado que EGR-1 regula la expresión de VAMP2 (una proteína importante para la exocitosis sináptica ). [7]
Además de su función en el sistema nervioso, existe evidencia significativa de que EGR-1 junto con su parálogo EGR-2 se induce en enfermedades fibróticas tiene funciones clave en la fibrinogénesis y es necesaria para la fibrosis inducida experimentalmente en ratones. [8]
También puede estar involucrado en la función ovárica [9]
El dominio de unión al ADN de EGR-1 consta de tres dominios con dedos de zinc del tipo Cys 2 His 2 . La estructura de aminoácidos del dominio de dedos de zinc EGR-1 se da en esta tabla, utilizando el código de aminoácidos de una sola letra. Los dedos 1 a 3 están indicados por f1 - f3. Los números se refieren a los residuos (aminoácidos) de la hélice alfa (no hay cero). Los residuos marcados con 'x' no son parte de los dedos de zinc, sino que sirven para conectarlos todos juntos.
| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | -1 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | | | X | X | X | X | X |
f1 | METRO | A | mi | mi | R | PAG | Y | A | C | PAG | V | mi | S | C | D | R | R | F | S | R | S | D | mi | L | T | R | H | I | R | I | H | T | GRAMO | Q | K | PAG |
f2 | | | | | | | F | Q | C | A | I | - | - | C | METRO | R | norte | F | S | R | S | D | H | L | T | T | H | I | A | T | H | T | GRAMO | mi | K | PAG |
f3 | | | | | | | F | A | C | D | I | - | - | C | GRAMO | R | K | F | A | R | S | D | mi | R | K | R | H | T | K | I | H | L | R | Q | K | D | |
Clave de aminoácidos: Alanina (Ala, A), Arginina (Arg, R), Asparagina (Asn, N), Ácido aspártico (Asp, D), Cisteína (Cys, C), Ácido glutámico (Glu, E), Glutamina ( Gln, Q), glicina (Gly, G), histidina (His, H), isoleucina (Ile, I), leucina (Leu, L), lisina (Lys, K), metionina (Met, M), fenilalanina (Phe , F), prolina (Pro, P), serina (Ser, S), treonina (Thr, T), triptófano (Trp, W), tirosina (Tyr, Y), valina (Val, V)
La estructura cristalina del ADN unido por el dominio de dedos de zinc de EGR-1 se resolvió en 1991, lo que ayudó en gran medida a las primeras investigaciones sobre los dominios de unión al ADN con dedos de zinc. [10]
La proteína EGR-1 humana contiene (en su forma no procesada) 543 aminoácidos con un peso molecular de 57,5 kDa y el gen se encuentra en el cromosoma 5 .
EGR-1 se une a la secuencia de ADN 5'-GCG TGG GCG-3 '(y similares como 5'-GCG GGG GCG-3'). [11] [12] La posición 6 de f1 une al 5 'G (la cuenta de la primera base desde la izquierda); la posición 3 de f1 a la segunda base (C); f1 posición -1 se une a la tercera posición (G); f2 posición 6 a la cuarta base (T); y así.
Se ha demostrado que EGR-1 interactúa con:
- CEBPB , [13]
- Proteína de unión a CREB , [14]
- EP300 , [14]
- NAB1 , [15]
- P53 , [16] y
- PSMA3 [17]