Se utiliza un marcador de color electroforético para controlar el progreso de la electroforesis en gel de agarosa y la electroforesis en gel de poliacrilamida (PAGE), ya que el ADN, el ARN y la mayoría de las proteínas son incoloros. También se denominan tintes de seguimiento y están presentes con frecuencia en los tintes de carga, así como en las escaleras de peso molecular. [1]
Ejemplos de
Los marcadores de color de uso común incluyen azul de bromofenol , rojo cresol , naranja G y xileno cianol . En términos generales, Orange G migra más rápido que el azul de bromofenol, que migra más rápido que el xileno cianol, pero los "tamaños" aparentes de estos colorantes (en comparación con las moléculas de ADN) varían con la concentración de agarosa y el sistema tampón utilizado. Por ejemplo, en un gel de agarosa al 1% elaborado en tampón TAE ( Tris - acetato - EDTA ), el xileno cianol migra a la velocidad de una molécula de ADN de 3000 pares de bases (bp) y el azul de bromofenol migra a 400 bp. Sin embargo, en un gel de 1% hecha en tampón TBE (Tris- borato -EDTA), migran a 2000 pb y 250 pb, respectivamente.
Aplicaciones
En ocasiones, se añaden marcadores de color a los tintes de carga para la electroforesis en gel en la separación de fragmentos de ADN. Los tintes de carga mantienen las muestras de ADN por debajo de la superficie del gel de agarosa, y los marcadores de color en el interior ayudan a realizar un seguimiento del frente de migración del ADN a medida que se mueve a lo largo del gel. [2]
Para PAGE, algunos marcadores de peso molecular disponibles comercialmente (también llamados "escaleras" porque se parecen a los peldaños de una escalera después de la separación) contienen proteínas pre-teñidas de diferentes colores, por lo que es posible determinar con mayor precisión dónde están las proteínas de interés. las muestras podrían ser.
Referencias
- ^ Keppler-Ross, Sabine; Noffz, Christine; Dean, Neta (2008). "Un nuevo marcador de color fluorescente púrpura para estudios genéticos en Saccharomyces cerevisiae y Candida albicans" . Genética . 179 (1): 705–10. doi : 10.1534 / genetics.108.087080 . PMC 2390648 . PMID 18493083 .
- ^ Lee, Pei Yun; Costumbrado, John; Hsu, Chih-Yuan; Kim, Yong Hoon (2012). "Electroforesis en gel de agarosa para la separación de fragmentos de ADN" . Revista de experimentos visualizados . 62 . doi : 10.3791 / 3923 . PMC 4846332 . PMID 22546956 .