La filamina A, alfa ( FLNA ) es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen FLNA . [5] [6]
FLNA |
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Estructuras disponibles |
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PDB | Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB |
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Lista de códigos de identificación de PDB |
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2AAV , 2BP3 , 2BRQ , 2J3S , 2JF1 , 2K3T , 2K7P , 2MTP , 2W0P , 2WFN , 3CNK , 3HOC , 3HOP , 3HOR , 3ISW , 3RGH , 4M9P , 4P3W |
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Identificadores |
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Alias | FLNA , ABP-280, ABPX, CSBS, CVD1, FLN, FLN-A, FLN1, FMD, MNS, NHBP, OPD, OPD1, OPD2, XLVD, XMVD, filamin A, FGS2 |
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Identificaciones externas | OMIM : 300017 MGI : 95556 HomoloGene : 1119 GeneCards : FLNA |
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Ubicación de genes ( humanos ) |
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| Chr. | Cromosoma X (humano) [1] |
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| Banda | Xq28 | Comienzo | 154,348,524 pb [1] |
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Final | 154,374,634 pb [1] |
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Ubicación de genes ( ratón ) |
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| Chr. | Cromosoma X (ratón) [2] |
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| Banda | X A7.3 | X 37.89 cm | Comienzo | 74,223,461 pb [2] |
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Final | 74.249.820 pb [2] |
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Patrón de expresión de ARN |
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| Más datos de expresión de referencia |
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Ontología de genes |
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Función molecular | • actividad homodimerización proteína • GO: 0032403 complejo de unión que contiene proteína • factor de transcripción de unión • de unión al receptor de opioides de tipo mu • actividad transductor de señal • actina de filamentos de unión • pequeña de unión a GTPasa • quinasa de unión • actina de unión • SMAD unión • receptor Fc-gamma I complejo de unión • unión G receptor acoplado a proteína • unión GTPasa • unión de ARN • regulador de la actividad del canal de potasio • canal iónico de unión • cadherina unión • GO: proteína de unión 0001948
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Componente celular | • citoplasma • membrana • adhesión focal • cortical citoesqueleto • plasma membrana • Myb complejo • dendríticas eje • región extracelular • cuerpo celular neuronal • célula corteza • nucleolo • actina filamento • citoesqueleto de actina • perinuclear región del citoplasma • extracelular exosome • citoesqueleto • núcleo • dendrita apical • actina filamentosa • GO: 0005578 matriz extracelular • unión célula-célula • citosol • disco Z
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Proceso biológico | • Reorganización del citoesqueleto de actina • Regulación negativa de la transcripción por la ARN polimerasa I • Regulación negativa del proceso catabólico de proteínas • Establecimiento de la localización de proteínas • Estabilización de proteínas • Desgranulación plaquetaria • Transcripción del ARNm por la ARN polimerasa II • Regulación negativa del proceso apoptótico • Agrupación de receptores • Regulación negativa de la actividad del factor de transcripción de unión a ADN • secuestrante citoplásmica de la proteína • plaquetas activación • mitótico husillo de montaje • regulación positiva de la adhesión celular dependiente de sustrato difusión • localización de la proteína de superficie celular • organización proyección celular • adenilato receptor de dopamina adenilato-inhibición de la señalización vía • actina formación de enlaces cruzados • regulación positiva de la señalización de I-kappaB quinasa / NF-kappaB • regulación positiva de la vía de señalización mediada por integrinas • agregación plaquetaria • ensamblaje de unión celular • regulación de la migración celular • cicatrización de heridas, diseminación de células • señalización de semaforina-plexina hway • formación de armazones gliales radiales • desarrollo de la corteza cerebral • ensamblaje del cilio • localización de proteínas en la membrana plasmática • regulación positiva del transporte transmembrana de iones de potasio • regulación de la repolarización de la membrana durante el potencial de acción de las células del músculo cardíaco auricular • regulación de la repolarización de la membrana durante la acción de las células del músculo cardíaco potencial • regulación positiva de la proliferación de células precursoras neurales • regulación positiva de la migración de neuronas
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Fuentes: Amigo / QuickGO |
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Ortólogos |
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Especies | Humano | Ratón |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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RefSeq (ARNm) | | |
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RefSeq (proteína) | | |
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Ubicación (UCSC) | Cr X: 154,35 - 154,37 Mb | Cr X: 74,22 - 74,25 Mb |
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Búsqueda en PubMed | [3] | [4] |
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Wikidata |
Ver / editar humano | Ver / Editar mouse |
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La proteína de unión a actina, o filamina , es una proteína de 280 kD que entrecruza los filamentos de actina en redes ortogonales en el citoplasma cortical y participa en el anclaje de proteínas de membrana para el citoesqueleto de actina . La remodelación del citoesqueleto es fundamental para la modulación de la forma y la migración de las células. La filamina A, codificada por el gen FLNA, es una filamina ampliamente expresada que regula la reorganización del citoesqueleto de actina al interactuar con integrinas , complejos de receptores transmembrana y mensajeros secundarios . [7]
La estructura de la proteína incluye un dominio N terminal de unión a actina , 24 repeticiones internas y 2 regiones bisagra. [8] [9]
Se ha demostrado que Filamin interactúa con:
- BRCA2 , [10]
- CD29 [11] [12]
- CASR , [13] [14]
- FBLIM1 , [15]
- FILIP1 , [16]
- FLNB , [17]
- NPHP1 , [18]
- RALA , [19]
- SH2B3 , [20]
- TRIO , [21] y
- BVS . [22] [23]
El residuo editado se registró previamente como un polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) en dbSNP .
Tipo
La edición de ARN de A a I está catalizada por una familia de adenosina desaminasas que actúan sobre el ARN (ADAR) que reconocen específicamente las adenosinas dentro de las regiones bicatenarias de pre-ARNm y las desaminan a inosina. Las inosinas son reconocidas como guanosina por la maquinaria de traducción de las células. Hay tres miembros de la familia ADAR ADAR 1-3, siendo ADAR 1 y ADAR 2 los únicos miembros enzimáticamente activos. Se cree que ADAR3 tiene un papel regulador en el cerebro. ADAR1 y ADAR 2 se expresan ampliamente en los tejidos, mientras que ADAR 3 está restringido al cerebro. Las regiones bicatenarias de ARN se forman por apareamiento de bases entre residuos en una región complementaria a la región del sitio de edición. Esta región complementaria se encuentra habitualmente en un intrón vecino, pero también se puede localizar en una secuencia exónica. La región que empareja la base con la región de edición se conoce como secuencia complementaria de edición (ECS).
Sitio
El único sitio de edición del pre-ARNm de FLNA se encuentra dentro del aminoácido 2341 de la proteína final. El codón de glutamina (Q) se altera debido a una desaminación específica del sitio de una adenosina en el sitio de edición a un codón de arginina (R). Se predice que la región de edición forma una región bicatenaria de 32 pares de bases de longitud con una secuencia complementaria de aproximadamente 200 nucleótidos cadena abajo del sitio de edición. Este ECS se encuentra en una secuencia intrónica. [24] Es probable que la edición en el sitio de Q / R involucre tanto a ADAR1 como a ADAR2. Los knockouts de ADAR2 de ratones muestran una disminución en la edición en el sitio de Q / R. Los knockouts dobles de ADAR1 no tienen ningún efecto en la edición. [25]
Estructura
La adenosina editada se localiza en la inmunoglulina 22 como repetición de la proteína. Esta región es un dominio de unión a integrina β [26] y un dominio de unión a RAC1 . [19] Es probable que el cambio de aminoácidos afecte el potencial electrostático de los dominios de unión. [24] El sitio de edición de FLNA está a 2 nucleótidos de un sitio de empalme como el sitio R / G de GluR-2. Ambas transcripciones tienen 7/8 nucleótidos idénticos alrededor de sus sitios de edición. Dado que se piensa ampliamente que la edición en el sitio GLUR-2 Q / R influye en el empalme, la similitud de la secuencia y el sitio de edición podría significar que la edición en el sitio FLNA también podría regular el empalme. Los experimentos in vitro de gluR-2 han demostrado que la presencia de ADAR2 da como resultado la inhibición del corte y empalme. [27] El análisis de los datos de EST para FLNA muestra que existe un vínculo entre la edición del último codón del exón y la retención del siguiente intrón. [24]
Función
Es probable que el cambio en el potencial electrostático afecte la unión de FLNA a las muchas proteínas con las que interactúa. [28]