FOXA2

FOXA2
Identificadores
Alias	FOXA2 , HNF3B, TCF3B, caja de horquilla A2, HNF-3-beta
Identificaciones externas	OMIM : 600288 MGI : 1347476 HomoloGene : 7762 GeneCards : FOXA2
Ubicación de genes ( humanos ) Chr. Cromosoma 20 (humano) [1] Banda 20p11.21 Comienzo 22.581.005 pb [1] Fin 22.585.455 pb [1]
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Cromosoma 2 (ratón) [2] Banda 2 G3 | 2 73,38 cm Comienzo 148.042.877 pb [2] Fin 148.046.969 pb [2]
Ontología de genes Función molecular • de unión a ADN • específica de la secuencia de ADN de unión • dominio de la proteína de unión específica • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 DNA-binding factor de transcripción actividad • factor de transcripción de unión • GO: 0000980 ARN polimerasa II reguladora en cis Unión de ADN específica de secuencia de región • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Actividad del factor de transcripción de unión a ADN, ARN polimerasa II específico Componente celular • citoplasma • nucleoplasma • unión celular • núcleo celular Proceso biológico • diferenciación de neuronas dopaminérgicas • regulación de la secreción de insulina implicada en la respuesta celular al estímulo de la glucosa • regulación de la transcripción, plantilla de ADN • regulación positiva de la gastrulación • respuesta a la interleucina-6 • regulación positiva de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II por la glucosa • regulación de transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • especificación del destino celular • comportamiento locomotor adulto • regulación negativa de la actividad del factor de transcripción de unión al ADN específico de secuencia • transcripción, plantilla de ADN • regulación positiva de la transcripción, plantilla de ADN • desarrollo de organismos multicelulares • regulación negativa de la actividad de la glucocinasa • regulación negativa de la detección de glucosa • regulación de la coagulación sanguínea • regulación positiva del desarrollo embrionario • formación de estrías primitivas • regulación negativa de la transición epitelial a mesenquimal • endocrino desarrollo del páncreas • regulación positiva de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • regulación positiva de la adhesión célula-célula mediada por cadherina • morfogénesis de la estructura anatómica • organización de la cromatina • regulación negativa de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II por glucosa • diferenciación celular Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	3170	15376
Ensembl	ENSG00000125798	ENSMUSG00000037025
UniProt	Q9Y261	P35583
RefSeq (ARNm)	NM_021784 NM_153675	NM_001291065 NM_001291067 NM_010446
RefSeq (proteína)	NP_068556 NP_710141	NP_001277994 NP_001277996 NP_034576
Ubicación (UCSC)	20 de Cr .: 22,58 - 22,59 Mb	Cr 2: 148,04 - 148,05 Mb
Búsqueda en PubMed	[3]	[4]
Wikidata
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La proteína de caja de cabeza de bifurcación A2 (FOXA2) , también conocida como factor nuclear de hepatocitos 3-beta (HNF-3B) , es un factor de transcripción que juega un papel importante durante el desarrollo, en tejidos maduros y, cuando está desregulado o mutado, también en el cáncer. ^[5]

Estructura

FOXA2 pertenece a una subfamilia de factores de transcripción de la caja Forkhead (FOX), siendo los otros miembros FOXA1 y FOXA3. Esta subfamilia de proteínas FOX de mamíferos se identificó por primera vez debido a su capacidad para unirse al ADN en extractos nucleares de hígado de rata. Por lo tanto, las proteínas se denominaron originalmente factor nuclear de hepatocitos 3 alfa, beta y gamma. ^[6] Estos factores de transcripción contienen un dominio forkhead (también conocido como dominio de hélice alada) flanqueado por secuencias necesarias para la localización nuclear ^[7] Sus extremos N y C también se conservan y sirven como dominios de transactivación. ^{[8] [9]}

Funciones

Los factores de transcripción FOXA tienen una propiedad "pionera", es decir, pueden unirse directamente a la cromatina condensada. ^[5] Esta característica se ha observado tanto in vitro como in vivo , donde los factores de transcripción FOXA pueden unirse a secuencias de ADN diana unidas a nucleosomas. ^{[10] [11]} La propiedad pionera es conferida por el dominio de unión al ADN altamente conservado de los factores, que es estructuralmente similar a las histonas enlazadoras H1 y H5 ^{[12] [13]} Esta característica permite a FOXA2 acceder a la cromatina cerrada y desplazar al enlazador histonas. De esta manera, FOXA2 promueve la apertura local de la cromatina, permite el reclutamiento de histonas alternativas y facilita la posterior unión de otros factores de transcripción. ^{[10][14] [15]} Por lo tanto, FOXA2 tiene funciones importantes en la especificación del tipo celular al promover la accesibilidad a la cromatina para la unión de factores específicos de linaje o tejido ^[16] Los factores FOXA también facilitan el mantenimiento de la identidad celular al marcar como favoritos el tipo celular específico genes para que estos genes puedan reactivarse rápidamente después de la citocinesis. ^[17] Un ejemplo es que la expresión ectópica de FOXA2 junto con HNF4A impulsa la transdiferenciación de fibroblastos a células similares a hepatocitos. ^[18]

De acuerdo con su papel como factor de transcripción pionero, FOXA2 se expresa en el desarrollo temprano y es esencial para el desarrollo y la homeostasis de varios tipos de células y tejidos. En ratones, la expresión de Foxa2 emerge en la línea primitiva y el nodo en el día embrionario (E) 6.5, y en el mesodermo y el endodermo definitivo en E7.5. ^{[19] [20]} Su expresión se mantiene posteriormente en los tejidos derivados del endodermo, incluidos el páncreas, el hígado, la próstata, la tiroides y los pulmones, durante todo el desarrollo y en los tejidos maduros. ^[7] Además, Foxa2 se expresa en tejidos neurales derivados del ectodermo . ^[21] Foxa2la eliminación es embrionariamente letal para los ratones, que mueren entre E10 y E11 y muestran defectos en las tres capas germinales. ^{[22] [23] Los} ratones con heterocigosidad para el knockout de Foxa2 son viables y exhiben un fenotipo similar a la enfermedad de Parkinson al envejecer. ^[24] Los estudios de knockout condicionales muestran que Foxa2 es importante para la formación de islotes pancreáticos y la maduración de las células alfa y beta, por lo que es esencial para la homeostasis de la glucosa. ^{[25] [26]}

La desregulación de los factores de transcripción FOXA se ha relacionado con varios tipos de cánceres humanos, incluida la leucemia mieloide aguda y el cáncer de esófago, pulmón, tiroides, páncreas, mama y próstata. ^[27] Los polimorfismos de un solo nucleótido en el gen FOXA2 se relacionan con el carcinoma hepatocelular, especialmente en los hombres. Esta asociación se ha replicado en ratones y puede depender de la regulación mediada por receptores de andrógenos ^[28].

Referencias

1. GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000125798 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000037025 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. Golson ML, Kaestner KH (diciembre de 2016). "Factores de transcripción de Fox: desde el desarrollo hasta la enfermedad" . Desarrollo . 143 (24): 4558–4570. doi : 10.1242 / dev.112672 . PMC 5201025 . PMID 27965437 .  
6. Costa RH, Grayson DR, Darnell JE (abril de 1989). "Múltiples factores nucleares enriquecidos en hepatocitos funcionan en la regulación de genes de transtiretina y alfa 1-antitripsina" . Biología Molecular y Celular . 9 (4): 1415–25. doi : 10.1128 / mcb.9.4.1415 . PMC 362558 . PMID 2786140 .  
7. Friedman JR, Kaestner KH (octubre de 2006). "La familia Foxa de factores de transcripción en desarrollo y metabolismo". Ciencias de la vida celular y molecular . 63 (19-20): 2317-28. doi : 10.1007 / s00018-006-6095-6 . PMID 16909212 . S2CID 12385486 .  
8. Pani L, Quian XB, Clevidence D, Costa RH (febrero de 1992). "La actividad promotora restringida del factor de transcripción hepático hepatocito factor nuclear 3 beta implica un factor específico de célula y autoactivación positiva" . Biología Molecular y Celular . 12 (2): 552–62. doi : 10.1128 / mcb.12.2.552 . PMC 364229 . PMID 1732730 .  
9. Qian X, Costa RH (abril de 1995). "Análisis de los dominios de la proteína beta del factor nuclear 3 de los hepatocitos necesarios para la activación transcripcional y la focalización nuclear" . Investigación de ácidos nucleicos . 23 (7): 1184–91. doi : 10.1093 / nar / 23.7.1184 . PMC 306829 . PMID 7739897 .  
10. Cirillo LA, Lin FR, Cuesta I, Friedman D, Jarnik M, Zaret KS (febrero de 2002). "Apertura de cromatina compactada por factores de transcripción de desarrollo temprano HNF3 (FoxA) y GATA-4". Célula molecular . 9 (2): 279–89. doi : 10.1016 / s1097-2765 (02) 00459-8 . PMID 11864602 . 
11. Cirillo LA, Zaret KS (diciembre de 1999). "Un complejo de factores de transcripción de desarrollo temprano que es más estable en las partículas del núcleo del nucleosoma que en el ADN libre". Célula molecular . 4 (6): 961–9. doi : 10.1016 / s1097-2765 (00) 80225-7 . PMID 10635321 . 
12. Clark KL, Halay ED, Lai E, Burley SK (julio de 1993). "La estructura cocristalina del motivo de reconocimiento de ADN de la cabeza de horquilla / HNF-3 se asemeja a la histona H5". Naturaleza . 364 (6436): 412-20. doi : 10.1038 / 364412a0 . PMID 8332212 . S2CID 4363526 .  
13. Zaret KS, Caravaca JM, Tulin A, Sekiya T (2010). "Movilidad nuclear y unión de cromosomas mitóticos: similitudes entre el factor de transcripción pionero FoxA y la histona enlazadora H1" . Simposios de Cold Spring Harbor sobre biología cuantitativa . 75 : 219-26. doi : 10.1101 / sqb.2010.75.061 . PMID 21502411 . 
14. Li Z, Gadue P, Chen K, Jiao Y, Tuteja G, Schug J, et al. (Diciembre 2012). "Foxa2 y H2A.Z median el agotamiento del nucleosoma durante la diferenciación de células madre embrionarias" . Celular . 151 (7): 1608–16. doi : 10.1016 / j.cell.2012.11.018 . PMC 3530164 . PMID 23260146 .  
15. Updike DL, Mango SE (septiembre de 2006). "Regulación temporal del desarrollo del intestino anterior por HTZ-1 / H2A.Z y PHA-4 / FoxA" . PLOS Genetics . 2 (9): e161. doi : 10.1371 / journal.pgen.0020161 . PMC 1584275 . PMID 17009877 .  
16. Iwafuchi-Doi M, Zaret KS (junio de 2016). "Control del destino celular por factores de transcripción pioneros" . Desarrollo . 143 (11): 1833–7. doi : 10.1242 / dev.133900 . PMC 6514407 . PMID 27246709 .  
17. Caravaca JM, Donahue G, Becker JS, He X, Vinson C, Zaret KS (febrero de 2013). "Marcado por unión específica e inespecífica del factor pionero de FoxA1 a los cromosomas mitóticos" . Genes y desarrollo . 27 (3): 251–60. doi : 10.1101 / gad.206458.112 . PMC 3576511 . PMID 23355396 .  
18. Sekiya S, Suzuki A (junio de 2011). "Conversión directa de fibroblastos de ratón en células similares a hepatocitos por factores definidos". Naturaleza . 475 (7356): 390–3. doi : 10.1038 / nature10263 . PMID 21716291 . S2CID 205225695 .  
19. Monaghan AP, Kaestner KH, Grau E, Schütz G (noviembre de 1993). "Los patrones de expresión postimplantación indican un papel para los genes de ratón forkhead / HNF-3 alfa, beta y gamma en la determinación del endodermo definitivo, cordamesodermo y neuroectodermo". Desarrollo . 119 (3): 567–78. PMID 8187630 . 
20. Ang SL, Wierda A, Wong D, Stevens KA, Cascio S, Rossant J, Zaret KS (diciembre de 1993). "La formación y mantenimiento del linaje endodermo definitivo en el ratón: participación de proteínas HNF3 / forkhead". Desarrollo . 119 (4): 1301–15. PMID 8306889 . 
21. Besnard V, Wert SE, Hull WM, Whitsett JA (diciembre de 2004). "Localización inmunohistoquímica de Foxa1 y Foxa2 en embriones de ratón y tejidos adultos". Patrones de expresión genética . 5 (2): 193-208. doi : 10.1016 / j.modgep.2004.08.006 . PMID 15567715 . 
22. Weinstein DC, Ruiz i Altaba A, Chen WS, Hoodless P, Prezioso VR, Jessell TM, Darnell JE (agosto de 1994). "El factor de transcripción de hélice alada HNF-3 beta es necesario para el desarrollo de la notocorda en el embrión de ratón". Celular . 78 (4): 575–88. doi : 10.1016 / 0092-8674 (94) 90523-1 . PMID 8069910 . S2CID 21650241 .  
23. Ang SL, Rossant J (agosto de 1994). "HNF-3 beta es esencial para la formación de nodo y notocorda en el desarrollo del ratón". Celular . 78 (4): 561–74. doi : 10.1016 / 0092-8674 (94) 90522-3 . PMID 8069909 . S2CID 54291913 .  
24. Kittappa R, Chang WW, Awatramani RB, McKay RD (diciembre de 2007). "El gen foxa2 controla el nacimiento y la degeneración espontánea de las neuronas de dopamina en la vejez" . PLOS Biología . 5 (12): e325. doi : 10.1371 / journal.pbio.0050325 . PMC 2121110 . PMID 18076286 .  
25. Sund NJ, Ang SL, Sackett SD, Shen W, Daigle N, Magnuson MA, Kaestner KH (julio de 2000). "El factor nuclear de hepatocitos 3beta (Foxa2) es prescindible para mantener el estado diferenciado del hepatocito adulto" . Biología Molecular y Celular . 20 (14): 5175–83. doi : 10.1128 / mcb.20.14.5175-5183.2000 . PMC 85966 . PMID 10866673 .  
26. Lantz KA, Vatamaniuk MZ, Brestelli JE, Friedman JR, Matschinsky FM, Kaestner KH (agosto de 2004). "Foxa2 regula múltiples vías de secreción de insulina" . La Revista de Investigación Clínica . 114 (4): 512-20. doi : 10.1172 / JCI21149 . PMC 503770 . PMID 15314688 .  
27. Lau HH, Ng NH, Loo LS, Jasmen JB, Teo AK (mayo de 2018). "Las funciones moleculares de los factores nucleares de los hepatocitos - En y más allá del hígado" . Revista de Hepatología . 68 (5): 1033–1048. doi : 10.1016 / j.jhep.2017.11.026 . PMID 29175243 . 
28. Li Z, Tuteja G, Schug J, Kaestner KH (enero de 2012). "Foxa1 y Foxa2 son esenciales para el dimorfismo sexual en el cáncer de hígado" . Celular . 148 (1–2): 72–83. doi : 10.1016 / j.cell.2011.11.026 . PMC 3266536 . PMID 22265403 .  

Enlaces externos

• FactorBook FOXA2

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