Motivo de ARN gamma-150


El motivo de ARN gamma-150 es una estructura de ARN conservada que se encuentra en bacterias dentro del orden Pseudomonadales . [1] Debido a que los ARN gamma-150 no están consistentemente en 5'UTR , se supone que el motivo gamma-150 corresponde a un ARN no codificante .

Los experimentos realizados con transcritos de ARN en Pseudomonas syringae DC3000 revelaron que dos ARN gamma-150 en ese organismo se transcriben como moléculas de ARN separadas. [2] La longitud de la transcripción es de aproximadamente 380 nucleótidos , que es casi el doble del tamaño del motivo gamma-150 en sí. Es probable que sean transcritas por RpoN , una proteína que también se conoce como sigma 54.

Estructuralmente, el motivo gamma-150 consta de cuatro bucles de tallo independientes . El primer bucle de tallo (el bucle de tallo más cercano al extremo 5 'del ARN) tiene una covariación significativa que respalda su identidad como ARN (ver predicción de estructura secundaria ). El segundo y el cuarto tienen evidencia más modesta, mientras que el tercer bucle de tallo podría estar mal conservado o no ser genuino. Varias regiones de alta conservación de la identidad de nucleótidos están presentes en todo el motivo de ARN, y muchas contienen series cortas de adenosinas .