HMGB2

HMGB2
Identificadores
Alias	HMGB2 , HMG2, caja de grupo de alta movilidad 2
Identificaciones externas	OMIM : 163906 MGI : 96157 HomoloGene : 37582 GeneCards : HMGB2
Ubicación de genes ( humanos ) Chr. Cromosoma 4 (humano) [1] Banda 4q34.1 Comienzo 173,331,376 pb [1] Fin 173,334,432 pb [1]
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Cromosoma 8 (ratón) [2] Banda 8 B2 | 8 29,9 cm Comienzo 57.511.907 pb [2] Fin 57.515.999 pb [2]
Patrón de expresión de ARN Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes Función molecular • la unión al ADN • unión específica de proteínas de dominio • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 actividad del factor de transcripción de unión a ADN • factor de transcripción de unión • de unión a ADN no específica de secuencia, de flexión • de unión a ADN monocatenario • unión de ADN dañada • GO: unión de proteínas 0001948 • unión de ADN de unión de cuatro vías • GO: unión de ADN específica de secuencia de la región proximal del promotor del núcleo 0001158 • unión del receptor RAGE • actividad quimioatrayente • unión de ADN de doble hebra • unión de ADN, flexión • ADN superenrollado unión • unión de drogas • ARN de unión • GO: actividad coactivador 0001105 transcripción Componente celular • citoplasma • nucleoplasma • cromosoma • región extracelular • nucleolo • región perinuclear del citoplasma • cromatina nuclear • cromosoma condensado • núcleo celular • extracelular • complejo macromolecular Proceso biológico • Cambio geométrico del ADN • Regulación positiva de la producción de interferón-beta • Ensamblaje de nucleosomas • Recombinación del ADN • Fragmentación apoptótica del ADN • Desarrollo de gónadas masculinas • Regulación de la transcripción, plantilla de ADN • Regulación positiva de la proliferación de células endoteliales • Regulación positiva de la diferenciación de eritrocitos • Respuesta inflamatoria al estímulo antigénico • proceso del sistema inmunológico • regulación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • respuesta a la hormona esteroide • organización de la cromatina • regulación negativa de la expresión génica • transcripción, plantilla de ADN • regulación positiva de la transcripción, plantilla de ADN • quimiotaxis • respuesta al lipopolisacárido • regulación positiva de la expresión génica • regulación positiva de la actividad nucleasa • respuesta de defensa a bacterias gramnegativas • regulación negativa de la vía de señalización apoptótica extrínseca a través de los receptores del dominio de la muerte • recombinación V (D) J • espermatogénesis • regulación positiva de la respuesta inmune innata • quimiotaxis celular • Ligadura de ADN involucrada en la reparación del ADN • Diferenciación del núcleo espermátido • Regulación positiva de la unión al ADN • Sistema inmunológico innato • Regulación negativa de la transcripción, plantilla de ADN • Respuesta celular al lipopolisacárido • Respuesta inflamatoria • Regulación positiva de la diferenciación de megacariocitos • Regulación de la neurogénesis • Regulación de Proliferación de células madre • Cambio topológico del ADN • Regulación positiva de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • Respuesta de defensa a bacterias Gram-positivas • quimiotaxis positiva • respuesta al fármaco • remodelación de la cromatina Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	3148	97165
Ensembl	ENSG00000164104	ENSMUSG00000054717
UniProt	P26583	P30681
RefSeq (ARNm)	NM_002129 NM_001130688 NM_001130689	NM_008252 NM_001363443 NM_001363444 NM_001363445
RefSeq (proteína)	NP_001124160 NP_001124161 NP_002120	NP_032278 NP_001350372 NP_001350373 NP_001350374
Ubicación (UCSC)	Crónicas 4: 173,33 - 173,33 Mb	Crónicas 8: 57,51 - 57,52 Mb
Búsqueda en PubMed	[3]	[4]
Wikidata
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La proteína B2 del grupo de alta movilidad, también conocida como proteína 2 del grupo de alta movilidad (HMG-2), es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen HMGB2 . ^{[5] [6]}

Función

Este gen codifica un miembro de la familia de proteínas del grupo de alta movilidad cromosómica no histona . ^[7] Las proteínas de esta familia están asociadas a la cromatina y se distribuyen de forma ubicua en el núcleo de las células eucariotas superiores. Los estudios in vitro han demostrado que esta proteína es capaz de doblar el ADN de manera eficiente y formar círculos de ADN. Estos estudios sugieren un papel en la facilitación de interacciones cooperativas entre proteínas que actúan en cis al promover la flexibilidad del ADN. También se informó Esta proteína de estar involucrados en la final ligadura de paso en ADN procesos de unión de fin de reparar el ADN de doble filamento se rompe y V (D) J recombinación . ^[6]

Referencias

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000164104 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000054717 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. Majumdar A, Brown D, Kerby S, Rudzinski I, Polte T, Randhawa Z, Seidman MM (diciembre de 1991). "Secuencia de ADNc de HMG2 humano" . Investigación de ácidos nucleicos . 19 (23): 6643. doi : 10.1093 / nar / 19.23.6643 . PMC 329240 . PMID 1754403 .  
6. "Entrez Gene: cuadro de grupo de alta movilidad HMGB2 2" .
7. Murugesapillai D, McCauley MJ, Maher LJ, Williams MC (15 de noviembre de 2016). "Estudios de molécula única de proteínas de flexión del ADN arquitectónico del grupo B de alta movilidad" . Revisiones biofísicas . 9 (1): 17–40. doi : 10.1007 / s12551-016-0236-4 . PMC 5331113 . PMID 28303166 .  

Lectura adicional

• Alexandre S, Li WW, Lee AS (diciembre de 1992). "Un ADNc de HMG2 humano con una nueva región 3 'sin traducir" . Investigación de ácidos nucleicos . 20 (23): 6413. doi : 10.1093 / nar / 20.23.6413 . PMC  334538 . PMID  1475204 .
• Shirakawa H, Yoshida M (abril de 1992). "Estructura de un gen que codifica la proteína HMG2 humana". La Revista de Química Biológica . 267 (10): 6641–5. PMID  1551873 .
• Bernués J, Espel E, Querol E (mayo de 1986). "Identificación de los dominios de unión al núcleo de histonas de HMG1 y HMG2". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Estructura y expresión génica . 866 (4): 242–51. doi : 10.1016 / 0167-4781 (86) 90049-7 . PMID  3697355 .
• Zwilling S, König H, Wirth T (marzo de 1995). "La proteína 2 del grupo de alta movilidad interactúa funcionalmente con los dominios POU de los factores de transcripción del octamer" . El diario EMBO . 14 (6): 1198–208. doi : 10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07103.x . PMC  398197 . PMID  7720710 .
• Shykind BM, Kim J, Sharp PA (junio de 1995). "Activación del complejo TFIID-TFIIA con HMG-2" . Genes y desarrollo . 9 (11): 1354–65. doi : 10.1101 / gad.9.11.1354 . PMID  7797075 .
• Paull TT, Haykinson MJ, Johnson RC (agosto de 1993). "Las proteínas de unión y flexión de ADN inespecíficas HMG1 y HMG2 promueven el ensamblaje de estructuras de nucleoproteínas complejas" . Genes y desarrollo . 7 (8): 1521–34. doi : 10.1101 / gad.7.8.1521 . PMID  8339930 .
• Wanschura S, Schoenmakers EF, Huysmans C, Bartnitzke S, Van de Ven WJ, Bullrdiek J (enero de 1996). "Mapeo del gen humano HMG2 a 4q31". Genómica . 31 (2): 264–5. doi : 10.1006 / geno.1996.0046 . PMID  8824816 .
• Nagaki S, Yamamoto M, Yumoto Y, Shirakawa H, Yoshida M, Teraoka H (mayo de 1998). "Las proteínas cromosómicas no histonas HMG1 y 2 mejoran la reacción de ligación de roturas de doble hebra de ADN". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 246 (1): 137–41. doi : 10.1006 / bbrc.1998.8589 . PMID  9600082 .
• Boonyaratanakornkit V, Melvin V, Prendergast P, Altmann M, Ronfani L, Bianchi ME, Taraseviciene L, Nordeen SK, Allegretto EA, Edwards DP (agosto de 1998). "Las proteínas 1 y 2 de la cromatina del grupo de alta movilidad interactúan funcionalmente con los receptores de hormonas esteroides para mejorar su unión al ADN in vitro y la actividad transcripcional en células de mamíferos" . Biología Molecular y Celular . 18 (8): 4471–87. doi : 10.1128 / mcb.18.8.4471 . PMC  109033 . PMID  9671457 .
• Yumoto Y, Shirakawa H, Yoshida M, Suwa A, Watanabe F, Teraoka H (septiembre de 1998). "Las proteínas del grupo de alta movilidad 1 y 2 pueden funcionar como componentes reguladores de unión al ADN para la proteína quinasa dependiente del ADN in vitro". Revista de bioquímica . 124 (3): 519–27. doi : 10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022143 . PMID  9722660 .
• Aidinis V, Bonaldi T, Beltrame M, Santagata S, Bianchi ME, Spanopoulou E (octubre de 1999). "El homeodominio de RAG1 recluta a HMG1 y HMG2 para facilitar la unión de la secuencia señal de recombinación y mejorar la actividad intrínseca de flexión del ADN de RAG1-RAG2" . Biología Molecular y Celular . 19 (10): 6532–42. doi : 10.1128 / mcb.19.10.6532 . PMC  84623 . PMID  10490593 .
• Butteroni C, De Felici M, Schöler HR, Pesce M (diciembre de 2000). "El cribado de visualización de fagos revela una asociación entre el factor de transcripción específico de la línea germinal Oct-4 y múltiples proteínas celulares". Revista de Biología Molecular . 304 (4): 529–40. doi : 10.1006 / jmbi.2000.4238 . PMID  11099378 .
• Stros M, Ozaki T, Bacikova A, Kageyama H, Nakagawara A (marzo de 2002). "Las células HMGB1 y HMGB2 regulan negativamente específicamente la transactivación específica de secuencia dependiente de p53 y p73 del promotor del gen Bax humano" . La Revista de Química Biológica . 277 (9): 7157–64. doi : 10.1074 / jbc.M110233200 . PMID  11748232 .
• Fan Z, Beresford PJ, Zhang D, Lieberman J (abril de 2002). "HMG2 interactúa con la proteína de ensamblaje del nucleosoma SET y es un objetivo de la granzima A de proteasa de linfocitos T citotóxicos" . Biología Molecular y Celular . 22 (8): 2810–20. doi : 10.1128 / MCB.22.8.2810-2820.2002 . PMC  133744 . PMID  11909973 .
• Dubois T, Howell S, Zemlickova E, Aitken A (abril de 2002). "Identificación de socios de proteína de interacción de la caseína quinasa Ialpha" . Cartas FEBS . 517 (1–3): 167–71. doi : 10.1016 / S0014-5793 (02) 02614-5 . PMID  12062430 . S2CID  84792445 .
• Fan Z, Beresford PJ, Zhang D, Xu Z, Novina CD, Yoshida A, Pommier Y, Lieberman J (febrero de 2003). "La escisión de la proteína de reparación oxidativa Ape1 mejora la muerte celular mediada por la granzima A". Inmunología de la naturaleza . 4 (2): 145–53. doi : 10.1038 / ni885 . PMID  12524539 . S2CID  29433133 .
• Lv X, Xu DD, Liu DP, Li L, Hao DL, Liang CC (2003). "La proteína 2 del grupo de alta movilidad puede estar involucrada en la regulación de la región de control del locus del grupo de genes de la beta-globina". Bioquímica y Biología Celular . 80 (6): 765–70. doi : 10.1139 / o02-164 . PMID  12555809 .
• Pallier C, Scaffidi P, Chopineau-Proust S, Agresti A, Nordmann P, Bianchi ME, Marechal V (agosto de 2003). "Asociación de la caja de grupo de alta movilidad de proteínas de cromatina (HMGB) 1 y HMGB2 con cromosomas mitóticos" . Biología molecular de la célula . 14 (8): 3414-26. doi : 10.1091 / mbc.E02-09-0581 . PMC  181577 . PMID  12925773 .
• Aird KM, Iwasaki O, Kossenkov AV, Tanizawa H, Fatkhutdinov N, Bitler BG, Le L, Alicea G, Yang TL, Johnson FB, Noma K, Zhang R (octubre de 2016). "HMGB2 orquesta el paisaje de la cromatina de los loci de genes del fenotipo secretor asociado a la senescencia" (PDF) . The Journal of Cell Biology . 215 (3): 325–334. doi : 10.1083 / jcb.201608026 . PMC  5100296 . PMID  27799366 . La pérdida de HMGB2 (cuadro de proteína 2 del grupo de alta movilidad) durante la senescencia embota la expresión del gen SASP (fenotipo secretor asociado a la senescencia) al permitir la propagación de la heterocromatina represiva en los loci del gen SASP. Esto se correlaciona con la incorporación de loci del gen SASP en SAHF (focos de heterocromatina asociados a la senescencia), que a su vez reprime la expresión del gen SASP.

Enlaces externos

• HMGB2 + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

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