En taxonomía , las Halobacteriaceae son una familia de las Halobacteriales en el dominio Archaea . [1] Halobacteriaceae representan una gran parte de Archaea halófila , junto con miembros de otras dos familias metanogénicas, Methanosarcinaceae y Methanocalculaceae . [2] La familia consta de muchos géneros diversos que pueden sobrevivir a nichos ambientales extremos. [3] Más comúnmente, las Halobacteriaceae se encuentran en lagos hipersalinos e incluso pueden tolerar sitios contaminados por metales pesados. [4] Incluyen neutrófilos., Acidófilos (ex. Halarchaeum acidiphilum ), alcalófilos (ex. Natronobacterium ), y ha habido incluso psicrotolerantes especies descubiertas (ex. Hrr. Lacusprofundi ). [3] Se sabe que algunos miembros viven aeróbicamente, así como anaeróbicamente, y tienen muchas morfologías diferentes . [3] Estas diversas morfologías incluyen bastones en el género Halobacterium , cocos en Halococcus , discos o copas aplanados en Haloferax y otras formas que van desde triángulos aplanados en Haloarcula a cuadrados en Haloquadratum y Natronorubrum . [5] [6] La mayoría de las especies de Halobacteriaceae son mejor conocidas por su alta tolerancia a la sal y miembros pigmentados de rojo-rosa (debido a los carotenoides bacterioruberin [5] ), pero también hay especies no pigmentadas y aquellas que requieren condiciones moderadas de sal. [3] [7] Se ha demostrado que algunas especies de Halobacteriaceae exhiben actividades de solubilización del fósforo que contribuyen al ciclo del fósforo en ambientes hipersalinos. [8] Técnicas como el análisis de ARNr 16S y la hibridación ADN-ADN han contribuido de manera importante a la clasificación taxonómica en Halobacteriaceae, en parte debido a la dificultad de cultivar arqueas halófilas. [7] [3] [2]
Halobacteriaceae | |
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clasificación cientifica | |
Dominio: | |
Reino: | |
Filo: | |
Clase: | Halobacteria Grant et al. 2002 |
Pedido: | Halobacteriales Grant y Larsen 1989 |
Familia: | Halobacteriaceae Gibbons 1974 |
Genera | |
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Descripción general
Las halobacteriáceas se encuentran en agua saturada o casi saturada de sal. También se les llama halófilos , aunque este nombre también se usa para otros organismos que viven en agua salada algo menos concentrada. Son comunes en la mayoría de los entornos donde se encuentran disponibles grandes cantidades de sal, humedad y material orgánico. Las flores grandes aparecen rojizas, debido al pigmento bacteriorrodopsina . Este pigmento se utiliza para absorber la luz, que proporciona energía para crear ATP . Las halobacterias también poseen un segundo pigmento, la clorhodopsina , que bombea iones de cloruro en respuesta a los fotones, creando un gradiente de voltaje y ayudando en la producción de energía a partir de la luz. El proceso no está relacionado con otras formas de fotosíntesis que implican el transporte de electrones; sin embargo, las halobacterias son incapaces de fijar carbono a partir del dióxido de carbono .
Las halobacterias pueden existir en ambientes salados porque, aunque son aerobios , tienen una forma separada y diferente de crear energía mediante el uso de la energía luminosa. Partes de las membranas de las halobacterias son de color violáceo y contienen pigmento retiniano . Esto les permite crear un gradiente de protones a través de la membrana de la célula que se puede utilizar para crear ATP para su propio uso.
Tienen ciertas adaptaciones para vivir dentro de sus ambientes salados. Por ejemplo, su maquinaria celular se adapta a altas concentraciones de sal al tener aminoácidos cargados en sus superficies, lo que permite que la célula mantenga sus moléculas de agua alrededor de estos componentes. La presión osmótica y estos aminoácidos ayudan a controlar la cantidad de sal dentro de la célula. Sin embargo, debido a estas adaptaciones, si la celda se coloca en un ambiente húmedo y menos salado, es probable que estalle inmediatamente debido a la presión osmótica.
Filogenia
La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres de procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) [9] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) [10] y la filogenia se basa en la versión 106 de LTP basada en rRNA 16S de 'The Proyecto de árboles vivos para todas las especies . [11]
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Notas:
♠ Cepas encontradas en el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) pero no incluidas en la Lista de nombres de procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN)
♣ Revista internacional de bacteriología sistemática o Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva (IJSB / IJSEM) especies publicadas que están en prensa.
Referencias
- ^ Consulte la página web del NCBI sobre Halobacteriaceae . Datos extraídos de los "recursos taxonómicos del NCBI" . Centro Nacional de Información Biotecnológica . Consultado el 19 de marzo de 2007 .
- ^ a b Oren, Aharon (septiembre de 2014). "Taxonomía de arqueas halófilas: estado actual y desafíos futuros". Extremófilos . 18 (5): 825–834. doi : 10.1007 / s00792-014-0654-9 . PMID 25102811 .
- ^ a b c d e Oren, Aharon (1 de febrero de 2012). "Taxonomía de la familia Halobacteriaceae: un paradigma para cambiar conceptos en la sistemática procariota" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 62 (2): 263–271. doi : 10.1099 / ijs.0.038653-0 . PMID 22155757 .
- ^ Naik, Sanika; Furtado, Irene (2017). Contaminación marina y remediación microbiana . Singapur: Springer Nature. págs. 143-152. ISBN 978-981-10-1044-6.
- ^ a b Oren, Aharon; Arahal, David; Ventosa, Antonio (2009). "Descripciones modificadas de géneros de la familia Halobacteriaceae" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 59 (3): 637–642. doi : 10.1099 / ijs.0.008904-0 . PMID 19244452 .
- ^ Tully, Benjamín; Emerson, Joanne; Andrade, Karen; Brocks, Jochen; Allen, Eric; Banfield, Jillian; Heidelberg, Karla (16 de septiembre de 2014). "Secuencias de novo de Haloquadratum walsbyi del lago Tyrrell, Australia, revelan un paisaje genómico variable" . Archaea . 2015 : 875784. doi : 10.1155 / 2015/875784 . PMC 4330952 . PMID 25709557 .
- ^ a b Ventosa, A .; Márquez, M .; Sánchez-Porro, C .; Haba, R. (2012). Avances en la comprensión de la biología de los microorganismos halófilos ([Ed. Actualizada]. Ed.). Dordrecht: Springer, Dordrecht. doi : 10.1007 / 978-94-007-5539-0_3 . ISBN 978-94-007-5538-3.
- ^ Yadav, Ajar Nath; Sharma, Divya; Gulati, Sneha; Singh, Surender; Dey, Rinku; Pal, Kamal Krishna; Kaushik, Rajeev; Saxena, Anil Kumar (28 de julio de 2015). "Haloarchaea dotado de atributo de solubilización de fósforo implicado en el ciclo del fósforo" . Informes científicos . 5 (1): 12293. Bibcode : 2015NatSR ... 512293Y . doi : 10.1038 / srep12293 . PMC 4516986 . PMID 26216440 .
- ^ JP Euzéby. "Halobacteriaceae" . Lista de nombres procariotas con posición en nomenclatura (LPSN). Archivado desde el original el 27 de enero de 2013 . Consultado el 17 de noviembre de 2011 .
- ^ Sayers; et al. "Halobacteriaceae" . Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 5 de junio de 2011 .
- ^ Proyecto 'El árbol vivo de todas las especies' . "Lanzamiento 106 de LTP basado en rRNA 16S (árbol completo)" (PDF) . Base de datos completa de ARN ribosómico de Silva . Consultado el 17 de noviembre de 2011 .
Otras lecturas
Revistas científicas
- Wright, A-DG (2006). "Relaciones filogenéticas dentro del orden Halobacteriales inferidas a partir de secuencias de genes de rRNA 16S" . En t. J. Syst. Evol. Microbiol . 56 (Parte 6): 1223-1227. doi : 10.1099 / ijs.0.63776-0 . PMID 16738095 .
- Judicial, Comisión del Comité Internacional de Sistemática de Procariotas (2005). "Los tipos nomenclaturales de los órdenes Acholeplasmatales, Halanaerobiales, Halobacteriales, Methanobacteriales, Methanococcales, Methanomicrobiales, Planctomycetales, Prochlorales, Sulfolobales, Thermococcales, Thermoproteales y Verrucomicrobiales, son los géneros Acholeplasma, Methanobacterium, Methanobacterium, Methanobacterium, Methanobac , Thermococcus, Thermoproteus y Verrucomicrobium, respectivamente. Opinión 79 " . En t. J. Syst. Evol. Microbiol . 55 (Parte 1): 517–518. doi : 10.1099 / ijs.0.63548-0 . PMID 15653928 .
- Euzeby JP, Tindall BJ (2001). "Tipo de nomenclatura de órdenes: correcciones necesarias de acuerdo con las Reglas 15 y 21a del Código Bacteriológico (Revisión de 1990), y designación de tipos de nomenclatura apropiada de clases y subclases. Solicitud de Opinión" . En t. J. Syst. Evol. Microbiol . 51 (Parte 2): 725–727. doi : 10.1099 / 00207713-51-2-725 . PMID 11321122 .
- Oren A, Ventosa A (2000). "Subcomité del Comité Internacional de Bacteriología Sistemática sobre la taxonomía de Halobacteriaceae. Actas de las reuniones, 16 de agosto de 1999, Sydney, Australia" . En t. J. Syst. Evol. Microbiol . 50 : 1405–1407. doi : 10.1099 / 00207713-50-3-1405 . PMID 10843089 .
Libros científicos
- Grant WD, Larsen H (1989). "Grupo III. Arqueobacterias extremadamente halófilas. Orden Halobacteriales ord. Nov.". En JT Staley, MP Bryant, N Pfennig, JG Holt (eds.). Manual de Bergey de bacteriología sistemática, volumen 3 (1ª ed.). Baltimore: Williams & Wilkins Co. pág. 169.
- Gibbons, NE (1974). "Familia V. Halobacteriaceae fam. Nov.". En RE Buchanan y NE Gibbons (ed.). Manual de Bergey de bacteriología determinante (8ª ed.). Baltimore: Williams & Wilkins Co.
- Blum P, ed. (2008). Archaea: Nuevos modelos para la biología procariota . Prensa Académica Caister . ISBN 978-1-904455-27-1. [1] .
Bases de datos científicas
- Referencias de PubMed para Halobacteriaceae
- Referencias de PubMed Central para Halobacteriaceae
- Referencias de Google Scholar para Halobacteriaceae
enlaces externos
- Página de taxonomía del NCBI para Halobacteriaceae
- Busque en las páginas de taxonomía del Árbol de la vida Halobacteriaceae
- Búsqueda de la página Species2000 para Halobacteriaceae
- Página de MicrobeWiki para Halobacteriaceae
- Página LPSN para Halobacteriaceae
- Nombres correctos de taxones dentro de la familia Halobacteriaceae