IRF1

IRF1
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Identificadores
Alias	IRF1 , IRF-1, MAR, factor regulador de interferón 1
Identificaciones externas	OMIM : 147575 MGI : 96590 HomoloGene : 1658 GeneCards : IRF1
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Cromosoma 11 (ratón) [1] Banda 11 B1,3 | 11 32,0 cm Comienzo 53,770,014 pb [1] Fin 53.778.374 pb [1]
Patrón de expresión de ARN Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes Función molecular • la unión al ADN • de unión a ADN específica de secuencia • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 DNA-binding factor de transcripción actividad • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Actividad activadora de la transcripción de unión al ADN, específica de la ARN polimerasa II • GO: 0000980 Unión de ADN específica de la secuencia de la región reguladora cis de la ARN polimerasa II • GO: 0001948 unión a proteínas • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 unión al ADN actividad del factor de transcripción, específico de la ARN polimerasa II Componente celular • citoplasma • citosol • nucleoplasma • cromatina nuclear • núcleo celular Proceso biológico • proceso apoptótico • regulación de CD8-positivas, la proliferación de células T alfa-beta • CD8-positivas, la diferenciación de células T alfa-beta • regulación de la respuesta inmune innata • regulación negativa de la diferenciación de células T reguladoras • regulación de la transcripción, de plantilla de ADN • respuesta celular al interferón-beta • vía de señalización mediada por interferón-gamma • proceso del sistema inmunológico • regulación de la respuesta inmunitaria adaptativa • coagulación sanguínea • regulación de la vía de señalización del receptor tipo peaje dependiente de MyD88 • transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • transcripción, plantilla de ADN • regulación del ciclo celular • regulación positiva de la transcripción, plantilla de ADN • respuesta celular al estímulo mecánico • respuesta de defensa al virus • vía de señalización del interferón tipo I • detención del ciclo celular • regulación de respuesta inmune • regulación de la expresión génica • sistema inmune innato • regulación negativa de la transcripción, plantilla de ADN • regulación positiva de la producción de interferón tipo I • regulación positiva de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • regulación negativa de la proliferación celular • regulación positiva de la producción de interferón beta Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	3659	16362
Ensembl	ENSG00000125347	ENSMUSG00000018899
UniProt	P10914	P15314
RefSeq (ARNm)	NM_002198	NM_001159393 NM_001159396 NM_008390
RefSeq (proteína)	NP_002189 NP_001341853 NP_001341854	NP_001152865 NP_001152868 NP_032416
Ubicación (UCSC)	n / A	Crónicas 11: 53,77 - 53,78 Mb
Búsqueda en PubMed	[2]	[3]
Wikidata
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El factor regulador de interferón 1 es una proteína que en humanos está codificada por el gen IRF1 . ^{[4] [5]}

Función

El factor regulador de interferón 1 fue el primer miembro de la familia del factor de transcripción regulador de interferón (IRF) identificado. Descrito inicialmente como un factor de transcripción capaz de activar la expresión de la citoquina Interferón beta , ^[6] se demostró posteriormente que el IRF-1 funciona como un activador o represor transcripcional de una variedad de genes diana. IRF-1 regula la expresión de genes diana uniéndose a un elemento de respuesta estimulado por interferón (ISRE) en sus promotores . La proteína IRF-1 se une al ISRE a través de un dominio de unión de ADN de hélice-giro-hélice N-terminal , ^[7] que está altamente conservado entre todas las proteínas IRF.

Más allá de su función como factor de transcripción, también se ha demostrado que el IRF-1 trans-activa la proteína supresora de tumores p53 mediante el reclutamiento de su cofactor p300 . ^[8]

Se ha demostrado que el IRF-1 desempeña un papel en la respuesta inmunitaria , regulando la apoptosis , el daño del ADN y la supresión de tumores . ^[9]

Reglamento

Se ha demostrado que el extremo C-terminal de IRF-1 regula su capacidad para activar la transcripción, los nanocuerpos que se dirigen a este dominio (MF1) son capaces de aumentar la actividad de IRF-1. ^[10]

Organismos modelo

Fenotipo de ratón knockout para Irf1

Característica	Fenotipo
Viabilidad homocigota	Normal
Fertilidad	Normal
Peso corporal	Normal
Ansiedad	Normal
Evaluación neurológica	Normal
La fuerza de prensión	Normal
Plato caliente	Normal
Dismorfología	Normal
Calorimetría indirecta	Normal
Prueba de tolerancia a la glucosa	Normal
Respuesta auditiva del tronco encefálico	Normal
DEXA	Normal
Radiografía	Normal
Temperatura corporal	Normal
Morfología ocular	Normal
Química Clínica	Normal
Hematología	Normal
Linfocitos de sangre periférica	Anormal
Prueba de micronúcleos	Normal
Peso del corazón	Normal
Epidermis de la cola Wholemount	Anormal
Histopatología de la piel	Normal
Histopatología cerebral	Normal
Histopatología ocular	Normal
Infección por Citrobacter	Normal [11]
Todas las pruebas y análisis de [12] [13]

Se han utilizado organismos modelo en el estudio de la función de IRF1. Una línea de ratones knockout condicional , llamada Irf1 ^{tm1a (EUCOMM) Wtsi [14] [15]} se generó como parte del programa International Knockout Mouse Consortium , un proyecto de mutagénesis de alto rendimiento para generar y distribuir modelos animales de enfermedades a los científicos interesados, en el Instituto Wellcome Trust Sanger . ^{[16] [17] [18]}

Los animales machos y hembras se sometieron a un cribado fenotípico estandarizado para determinar los efectos de la deleción. ^{[12] [19]} Se llevaron a cabo veinticinco pruebas y se informaron dos fenotipos . Los animales mutantes homocigotos tenían linfocitos de sangre periférica anormales , específicamente una disminución en el número de células T CD8 positivas y células NK y un aumento en las células T CD4 positivas. Los ratones también tenían un fenotipo de tegumento anormal determinado por un estudio de la epidermis de la cola . ^[12]

Interacciones

Se ha demostrado que IRF1 interactúa con:

• CHIP ^[20]
• GAGE ^[21]
• HSP70 / HSP90 ^[22]
• IRF8 ^{[23] [24]}
• KPNA2 ^[25]
• MYD88 ^[26]
• PCAF ^[27]
• STAT1 ^[28]
• TAT ^[29]
• VEGFR2 ^[30]
• REDD2 ^[31]

Ver también

• IRF2
• Factores reguladores del interferón

Referencias

1. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000018899 - Ensembl , mayo de 2017
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3. "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
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8. Dornan D, Eckert M, Wallace M, Shimizu H, Ramsay E, Hupp TR, Ball KL (noviembre de 2004). "La unión del factor regulador de interferón 1 a p300 estimula la acetilación dependiente de ADN de p53" . Mol. Celda. Biol . 24 (22): 10083–98. doi : 10.1128 / MCB.24.22.10083-10098.2004 . PMC 525491 . PMID 15509808 .  
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Lectura adicional

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Enlaces externos

Wikimedia Commons tiene medios relacionados con el factor regulador de interferón 1 (IRF-1) .

• IRF1 + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
• FactorBook IRF1

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .