IRF5

IRF5
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Identificadores
Alias	IRF5 , SLEB10, factor regulador de interferón 5
Identificaciones externas	OMIM : 607218 MGI : 1350924 HomoloGene : 8088 GeneCards : IRF5
Ubicación de genes ( humanos ) Chr. Cromosoma 7 (humano) [1] Banda 7q32.1 Comienzo 128,937,457 pb [1] Fin 128,950,038 pb [1]
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Cromosoma 6 (ratón) [2] Banda 6 A3,3 | 6 12,36 cm Comienzo 29.526.625 pb [2] Fin 29.541.871 pb [2]
Patrón de expresión de ARN Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes Función molecular • Unión al ADN • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN • GO: unión a proteínas 0001948 • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 actividad del activador de la transcripción de unión a ADN, ARN polimerasa II-específico • de unión a ADN específica de secuencia • proteína de unión idénticos • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ADN vinculante actividad del factor de transcripción, la ARN polimerasa II-específica Componente celular • citoplasma • citosol • núcleo celular Proceso biológico • regulación de la transcripción, plantilla de ADN • regulación positiva de la producción de interleucina-12 • vía de señalización mediada por interferón gamma • proceso del sistema inmunológico • regulación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • regulación positiva de la producción de interferón alfa • respuesta al dipéptido de muramil • transcripción, plantilla de ADN • respuesta de defensa al virus • vía de señalización del interferón tipo I • respuesta al peptidoglicano • regulación positiva del proceso apoptótico • sistema inmunológico innato • regulación positiva de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • regulación positiva de la producción de interferón beta • vía de señalización mediada por citocinas • transcripción del promotor de la ARN polimerasa II Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	3663	27056
Ensembl	ENSG00000128604	ENSMUSG00000029771
UniProt	Q13568	P56477
RefSeq (ARNm)	NM_001098627 NM_001098629 NM_001098630 NM_001242452 NM_032643 NM_001347928 NM_001364314	NM_001252382 NM_012057 NM_001311083
RefSeq (proteína)	NP_001092097 NP_001092099 NP_001092100 NP_001229381 NP_116032 NP_001334857 NP_001351243 NP_001092099.1	NP_001239311 NP_001298012 NP_036187
Ubicación (UCSC)	Crónicas 7: 128,94 - 128,95 Mb	Crónicas 6: 29,53 - 29,54 Mb
Búsqueda en PubMed	[3]	[4]
Wikidata
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El factor regulador de interferón 5 es una proteína que en humanos está codificada por el gen IRF5 . ^[5] La familia IRF es un grupo de factores de transcripción que participan en la señalización de respuestas de virus en mamíferos junto con la regulación de ciertas funciones celulares. ^[6]

Función

El IRF5 es un miembro de la familia del factor regulador del interferón (IRF), un grupo de factores de transcripción con diversas funciones, que incluyen la activación del interferón mediada por virus y la modulación del crecimiento celular, la diferenciación, la apoptosis y la actividad del sistema inmunológico. Los miembros de la familia IRF se caracterizan por un dominio de unión al ADN N-terminal conservado que contiene repeticiones de triptófano (W). Existen variantes de empalme alternativas que codifican diferentes isoformas. ^[5] Las regiones reguladoras y de represión de la familia IRF se encuentran principalmente en el C-terminal del IRF. ^[7]

Un estudio de 2020 mostró que una proteína adaptadora llamada TASL juega un papel regulador importante en la activación de IRF5 al ser fosforilada en el motivo pLxIS, ^[8] trazando una analogía similar a la vía de activación de IRF3 a través de las proteínas adaptadoras MAVS, STING y TRIF. ^[9]

Importancia clínica

El IRF5 actúa como un interruptor molecular que controla si los macrófagos promoverán o inhibirán la inflamación. El bloqueo de la producción de IRF5 en los macrófagos puede ayudar a tratar una amplia gama de enfermedades autoinmunes, y aumentar los niveles de IRF5 podría ayudar a tratar a las personas cuyo sistema inmunológico está débil, comprometido o dañado. El IRF5 parece funcionar "ya sea interactuando con el ADN directamente o interactuando con otras proteínas que controlan por sí mismas qué genes están activados". ^[10]

Señalización

La familia IRF regula la expresión génica de la respuesta del interferón (IFN) a las infecciones virales. ^{[6] El} IRF5 es un transductor directo de la señalización del interferón y se activa mediante la fosforilación. ^[11] La familia IRF también puede iniciar la vía de señalización JAK / STAT al unirse a los receptores transmembrana que activan JAK. ^{[12] Los} IRF, los IFN y la vía de señalización JAK / STAT trabajan juntos para combatir las infecciones virales en los mamíferos a través de señales específicas. ^[13]

Ver también

• Factores reguladores del interferón

Referencias

1. GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000128604 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029771 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. "Entrez Gene: factor regulador 5 del interferón IRF5" .
6. Negishi, Hideo; Taniguchi, Tadatsugu; Yanai, Hideyuki (1 de noviembre de 2018). "La clase de citocinas de interferón (IFN) y la familia de factores de transcripción del factor regulador de IFN (IRF)" . Perspectivas de Cold Spring Harbor en biología . 10 (11): a028423. doi : 10.1101 / cshperspect.a028423 . ISSN 1943-0264 . PMID 28963109 .  
7. Chistiakov, Dimitry A .; Myasoedova, Veronika A .; Revin, Victor V .; Orekhov, Alexander N .; Bobryshev, Yuri V. (1 de enero de 2018). "El impacto de los factores reguladores de interferón en la diferenciación y polarización de macrófagos en M1 y M2" . Inmunobiología . 223 (1): 101-111. doi : 10.1016 / j.imbio.2017.10.005 . ISSN 0171-2985 . 
8. Heinz, Leonhard X .; Lee, JangEun; Kapoor, Utkarsh; Kartnig, Felix; Sedlyarov, Vitaly; Papakostas, Konstantinos; César-Razquin, Adrian; Essletzbichler, Patrick; Goldmann, Ulrich; Stefanovic, Adrijana; Bigenzahn, Johannes W .; Scorzoni, Stefania; Pizzagalli, Mattia D .; Bensimon, Ariel; Müller, André C .; King, F. James; Li, Jun; Girardi, Enrico; Mbow, M. Lamine; Whitehurst, Charles E .; Rebsamen, Manuele; Superti-Furga, Giulio (13 de mayo de 2020). "TASL es el adaptador asociado a SLC15A4 para la activación de IRF5 mediante TLR7–9". Naturaleza . 581 (7808): 316–322. Bibcode : 2020Natur.581..316H . doi : 10.1038 / s41586-020-2282-0 . PMID 32433612 . S2CID  218625265 .
9. Liu S, Cai X, Wu J, Cong Q, Chen X, Li T, Du F, Ren J, Wu Y, Grishin N y Chen ZJ (13 de marzo de 2015). "La fosforilación de proteínas adaptadoras inmunes innatas MAVS, STING y TRIF induce la activación de IRF3" . Ciencia . 347 (6227): aaa2630. doi : 10.1126 / science.aaa2630 . PMID 25636800 . 
10. Krausgruber T, Blazek K, Smallie T, Alzabin S, Lockstone H, Sahgal N, Hussell T, Feldmann M, Udalova IA (enero de 2011). "IRF5 promueve la polarización de macrófagos inflamatorios y respuestas T (H) 1-T (H) 17". Nat Immunol . 12 (3): 231–238. doi : 10.1038 / ni.1990 . PMID 21240265 . S2CID 13730047 . Resumen de Lay - MedScape .  
11. Barnes, Betsy; Lubyova, Barbora; Pitha, Paula M. (enero de 2002). "Revisión: sobre el papel de la IRF en la defensa del anfitrión" . Revista de investigación sobre interferones y citocinas . 22 (1): 59–71. doi : 10.1089 / 107999002753452665 . ISSN 1079-9907 . 
12. Bousoik, Emira; Montazeri Aliabadi, Hamidreza (2018). " " ¿Conocemos a Jack "acerca de JAK? Una mirada más cercana a la vía de señalización JAK / STAT" . Fronteras en Oncología . 8 . doi : 10.3389 / fonc.2018.00287 . ISSN 2234-943X . 
13. Chiang, Hao-Sen; Liu, Helene Minyi (2019). "La base molecular de la inhibición viral de respuestas inmunes dependientes de IRF y STAT" . Fronteras en inmunología . 9 . doi : 10.3389 / fimmu.2018.03086 . ISSN 1664-3224 . 

Lectura adicional

• Pitha PM, Au WC, Lowther W, et al. (1999). "Papel de los factores reguladores de interferón (IRF) en la señalización mediada por virus y la regulación del crecimiento celular". Biochimie . 80 (8–9): 651–8. doi : 10.1016 / S0300-9084 (99) 80018-2 . PMID  9865487 .
• Barnes B, Lubyova B, Pitha PM (2002). "Sobre el papel de la IRF en la defensa del anfitrión". J. Interferon Cytokine Res . 22 (1): 59–71. doi : 10.1089 / 107999002753452665 . PMID  11846976 .
• Barnes BJ, Moore PA, Pitha PM (2001). "La activación específica de virus de un nuevo factor regulador de interferón, IRF-5, da como resultado la inducción de distintos genes de interferón alfa" . J. Biol. Chem . 276 (26): 23382–90. doi : 10.1074 / jbc.M101216200 . PMID  11303025 .
• Nehyba J, Hrdlicková R, Burnside J, Bose HR (2002). "Un nuevo factor regulador de interferón (IRF), IRF-10, tiene un papel único en la defensa inmunológica y es inducido por la oncoproteína v-Rel" . Mol. Celda. Biol . 22 (11): 3942–57. doi : 10.1128 / MCB.22.11.3942-3957.2002 . PMC  133824 . PMID  11997525 .
• Barnes BJ, Kellum MJ, Field AE, Pitha PM (2002). "Múltiples dominios reguladores de IRF-5 controlan la activación, la localización celular y la inducción de quimiocinas que median el reclutamiento de linfocitos T" . Mol. Celda. Biol . 22 (16): 5721–40. doi : 10.1128 / MCB.22.16.5721-5740.2002 . PMC  133975 . PMID  12138184 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH y col. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humano y de ratón de longitud completa" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Código bibliográfico : 2002PNAS ... 9916899M . doi : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
• Barnes BJ, Field AE, Pitha-Rowe PM (2003). "La formación de heterodímeros inducida por virus entre IRF-5 e IRF-7 modula el ensamblaje del potenciador de IFNA in vivo y la actividad transcripcional de los genes de IFNA" . J. Biol. Chem . 278 (19): 16630–41. doi : 10.1074 / jbc.M212609200 . PMID  12600985 .
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• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA y col. (2004). "El estado, la calidad y la expansión del proyecto de ADNc de longitud completa de los NIH: la colección de genes de mamíferos (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
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• Schoenemeyer A, Barnes BJ, Mancl ME, et al. (2005). "El factor regulador de interferón, IRF5, es un mediador central de la señalización del receptor 7 de peaje" . J. Biol. Chem . 280 (17): 17005–12. doi : 10.1074 / jbc.M412584200 . PMID  15695821 .
• Mancl ME, Hu G, Sangster-Guity N, Olshalsky SL, Hoops K, Fitzgerald-Bocarsly P, Pitha PM, Pinder K, Barnes BJ (junio de 2005). "Dos promotores discretos regulan las isoformas del factor 5 regulador de interferón humano empalmadas alternativamente. Múltiples isoformas con expresión, localización, regulación y función específicas del tipo de célula distinta" . J. Biol. Chem . 280 (22): 21078–90. doi : 10.1074 / jbc.M500543200 . PMID  15805103 .
• Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "Hacia un mapa a escala de proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Naturaleza . 437 (7062): 1173–8. Código Bibliográfico : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038 / nature04209 . PMID  16189514 . S2CID  4427026 .
• Graham RR, Kozyrev SV, Baechler EC y col. (2006). "Un haplotipo común del factor regulador de interferón 5 (IRF5) regula el empalme y la expresión y está asociado con un mayor riesgo de lupus eritematoso sistémico". Nat. Genet . 38 (5): 550–5. doi : 10.1038 / ng1782 . PMID  16642019 . S2CID  21426281 .

Enlaces externos

• IRF5 + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
• Descripción general de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q13568 (factor regulador de interferón 5) en el PDBe-KB .

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .

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