El factor regulador de interferón 6, también conocido como IRF6, es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen IRF6 . [5]
IRF6 |
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Identificadores |
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Alias | IRF6 , LPS, OFC6, PIT, PPS, PPS1, VWS, VWS1, factor regulador de interferón 6 |
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Identificaciones externas | OMIM : 607199 MGI : 1859211 HomoloGene : 4479 GeneCards : IRF6 |
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Ubicación de genes ( humanos ) |
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| Chr. | Cromosoma 1 (humano) [1] |
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| Banda | 1q32.2 | Comienzo | 209.785.617 pb [1] |
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Final | 209.806.175 pb [1] |
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Ubicación de genes ( ratón ) |
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| Chr. | Cromosoma 1 (ratón) [2] |
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| Banda | 1 H6 | 1 97,6 cM | Comienzo | 193.153.111 pb [2] |
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Final | 193.172.023 pb [2] |
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Ontología de genes |
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Función molecular | • Unión al ADN • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN • GO: unión a proteínas 0001948 • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Actividad activadora de la transcripción de unión al ADN, específica de la ARN polimerasa II • Unión de ADN específica de la secuencia • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN, específica de la ARN polimerasa II
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Componente celular | • citoplasma • exosoma extracelular • núcleo • citosol • unión celular
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Proceso biológico | • diferenciación celular • regulación de la transcripción, plantilla de ADN • desarrollo celular • vía de señalización mediada por interferón-gamma • transcripción, plantilla de ADN • diferenciación de células epiteliales de la glándula mamaria • diferenciación de queratinocitos • regulación positiva de la transcripción, plantilla de ADN • proliferación de queratinocitos • vía de señalización del interferón tipo I • desarrollo de la piel • regulación negativa de la proliferación de la población celular • transcripción por la ARN polimerasa II • regulación positiva de la transcripción por la ARN polimerasa II • proceso del sistema inmunológico • desarrollo del paladar
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Fuentes: Amigo / QuickGO |
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Ortólogos |
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Especies | Humano | Ratón |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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RefSeq (ARNm) | | |
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RefSeq (proteína) | | |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 1: 209,79 - 209,81 Mb | Crónicas 1: 193,15 - 193,17 Mb |
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Búsqueda en PubMed | [3] | [4] |
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Wikidata |
Ver / editar humano | Ver / Editar mouse |
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Este gen codifica un miembro de la familia del factor de transcripción regulador del interferón (IRF). Los miembros de la familia comparten un dominio de unión a ADN de hélice-giro-hélice N-terminal altamente conservado y un dominio de unión a proteína C-terminal menos conservado . [6] La función de IRF6 está relacionada con la formación de tejido conectivo , por ejemplo, el del paladar . [7] Este gen codifica un miembro de la familia del factor de transcripción regulador del interferón (IRF). Además, se ha observado que el gen IRF6 se encuentra bajo regulación epigenética por metilación del promotor . [8]
Una mutación del gen IRF6 puede conducir al síndrome de van der Woude autosómico dominante (VWS) [9] o al síndrome de pterigión poplíteo relacionado (PPS). [10] El síndrome de Van der Woude puede incluir características de labio leporino y paladar hendido junto con anomalías dentales y fístulas labiales. Además, los alelos comunes en IRF6 también se han asociado con casos no sindrómicos de labio leporino y / o paladar hendido a través de estudios de asociación de todo el genoma y en muchos estudios de genes candidatos. [11] Estos trastornos son causados por mutaciones en el gen IRF6 y parte de la heterogeneidad fenotípica se debe a diferentes tipos de mutaciones de IRF6. [5] Una explicación de esta variación fenotípica entre síndromes se basa en un impacto diferencial en la estructura de las proteínas mutantes dimerizadas. Las mutaciones de VWS parecen dar como resultado una haploinsuficiencia, mientras que las mutaciones de PPS pueden ser de naturaleza dominante negativa . [12] Recientemente se ha resumido el espectro de mutaciones en VWS y PPS. [13] Se ha demostrado que el IRF6 desempeña un papel fundamental en el desarrollo de queratinocitos. [14] [15] También se ha demostrado una función de IRF6 en las formas comunes de labio leporino y paladar hendido [16] y puede explicar ~ 20% de los casos de labio leporino solamente. [17] Variantes en IRF6 han arrojado evidencia consistente de asociación con hendidura sindrómica y / o paladar a través de múltiples estudios. Un estudio realizado por Birnbaum y sus colegas en 2009 confirmó el impacto de este gen en la etiología del labio leporino y / o paladar hendido, y el estudio GENEVA Cleft Consortium, que estudió familias de múltiples poblaciones, reconfirmó los hallazgos de que las mutaciones de IRF6 están fuertemente asociadas con la fisura. y / o paladar. El papel de IRF6 en la aparición de labio leporino y / o paladar hendido se ve reforzado por el análisis de ratones mutantes de IRF6 que exhiben una epidermis hiperproliferativa que no experimenta una diferenciación terminal, lo que da lugar a múltiples adherencias epiteliales que pueden ocluir la cavidad oral y dar como resultado una hendidura. paladar. La investigación en modelos animales indica que el IRF6 determina la proliferación de queratinocitos y también tiene un papel clave en la formación del peridermo oral. Recientemente, mediante la utilización de genética de ratón, análisis de expresión génica, estudios de inmunoprecipitación de cromatina y ensayos de indicador de luciferasa, se ha demostrado que IRF6 es un objetivo directo de p63, que subyace a varios síndromes de malformación que incluyen características de hendidura, y p63 activa la transcripción de IRF6 a través de la Elemento potenciador de IRF6. La variación en el elemento potenciador aumenta la susceptibilidad al labio leporino solamente. Tanto el labio leporino con o sin paladar hendido como las características del paladar hendido solo se han visto en familias con una mutación de IRF6. Además, los diferentes tipos de hendiduras pueden segregarse dentro de la misma familia. [11]
La hipermetilación del ADN del promotor aberrante de IRF6 se ha observado asociada con la aparición / progresión del cáncer. De hecho, este inadecuada epigenética fenómeno se ha observado en las mujeres afectadas por el carcinoma de células escamosas de la vulva se levantó de escleroso Vulver líquenes . [18] La metilación del promotor IRF6 puede ser un marcador de riesgo de cáncer en pacientes afectados por esta enfermedad. [8]
El gen IRF6 se ha observado progresivamente regulado a la baja en queratinocitos neoplásicos positivos para el virus del papiloma humano derivados de lesiones preneoplásicas del cuello uterino en diferentes niveles de malignidad. [19] Por esta razón, es probable que este gen esté asociado con la tumorigénesis y puede ser un marcador pronóstico potencial para la progresión de las lesiones preneoplásicas del cuello uterino . [19] De manera similar, se ha descubierto que el IRF6 está desregulado genética y epigenéticamente en el cáncer de vulva . [8]
- Entrada de GeneReview / NIH / UW sobre trastornos relacionados con IRF6
- IRF6 + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- Ubicación del gen humano IRF6 en UCSC Genome Browser .
- Detalles del gen humano IRF6 en UCSC Genome Browser .
Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .