GTPasa 5 inducible por interferón
La GTPasa 5 inducible por interferón, también conocida como GTPasa cine 1 relacionada con la inmunidad (IRGC1), es una enzima que en humanos está codificada por el gen IRGC . [5] [6] Se predice que se comportará como otras proteínas en las familias IRG y similares a p47-GTPasa . Se expresa más en los testículos. [6] [7]
IRGC se encuentra en el cromosoma 19 en la posición 19q13.31 y contiene dos exones . [5] [8] Está en la hebra directa y está aguas arriba del inhibidor de la fosfolipasa A2 y similar a la proteína que contiene el dominio Ly6/PLAUR (LOC105372412) y aguas abajo del factor de descomposición del ARNm mediado por tonterías (SMG9). [7]
Hay un parálogo para IRGC llamado IRGM . IRGM, o GTPasa M relacionada con la inmunidad, está asociada con la defensa intracelular. [9] [10] Ambos son parte de la familia p47-GTPase-like y la superfamilia de dominios P-loop NTPase. El parálogo tiene un 12% de identidad con el IRGC.
Se observó que el IRGC se conserva en todos los vertebrados . Las regiones de unión de GTP / Magnesio y polipéptido y una región transmembrana están bastante conservadas entre especies . [11]
Se predice que IRGC ha evolucionado más rápidamente que el citocromo c y la hemoglobina β al comparar el porcentaje de identidad de la misma especie para cada gen durante 500 millones de años. Es probable que IRGC e IRGM divergieran hace 350 a 375 millones de años.
Se encontró una región promotora , GXP_311825, para IRGC en el cromosoma 19. [12] Tiene 1521 pares de bases de largo y comienza en el par de bases 43714694. [12] Se conserva en las 7 secuencias ortólogas probadas y tiene la mayor asociación con los testículos. , a 8.090 tpm. [12] De las seis transcripciones potenciales, GXT_26231691 tenía la mayoría de las etiquetas CAGE . [12] Los testículos se etiquetaron en 839 de 873 etiquetas CAGE. [12]
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