Jakoba es un género en el taxón Excavata [1] [2] y actualmente tiene una sola especie descrita, Jakoba libera descrita por Patterson en 1990, [3] y nombrada en honor al protistólogo holandés Jakoba Ruinen. ( Jakoba incarcerata anteriormente descritaha sido rebautizada como Andalucia incarcerata , y Jakoba bahamensis / Jakoba bahamiensis no se describe formalmente). [4]
Jakoba | |
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Cuatro especies de jakobid , mostrando surco y flagelos: Jakoba libera (vista ventral), Stygiella incarcerata (vista ventral), Reclinomonas americana (vista dorsal) e Histiona aroides (vista ventral) | |
clasificación cientifica | |
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Familia: | Patterson 1990 |
Género: | Jakoba Patterson 1990 |
Especies | |
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Sinónimos | |
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Apariencia y características
Jakoba son pequeños zooflagellates bacterivorous ( jakobids ) encontrado en marina [5] ambientes hipersalinos y. [4] Son células tróficas que nadan libremente con dos flagelos y miden entre cinco y diez micrómetros de longitud. Las células giran a lo largo de su eje longitudinal para permitir nadar en línea recta [5], a menos que se produzcan deformaciones y “retorcimientos” debido a la compresión de los escombros. Durante la alimentación, las bacterias se eliminan de la columna de agua mediante una corriente creada por el flagelo posterior . Esta corriente hace que las bacterias se acumulen en el surco [6] en el lado ventral derecho de la célula [5] , lo que ayuda a la ingestión y la creación de vacuolas de alimentos . [6]
Ultraestructura
Los componentes celulares de Jakoba no son particularmente únicos. Contienen un solo núcleo que se encuentra cerca de las bases flagelares , un solo cuerpo de Golgi y las crestas mitocondriales están aplanadas, lo que sugiere una relación con otros taxones de platicristato. Las mitocondrias de Jakoba son de particular interés evolutivo debido a sus genomas mitocondriales similares a bacterias . Se ha encontrado que sus genomas mitocondriales contienen considerablemente más genes funcionales que los de otros grupos eucariotas y parece que han retenido la ARN polimerasa eubacteriana ancestral , que ha sido reemplazada por polimerasa de tipo viral en todos los demás eucariotas mitocondriales. En general, los genomas mitocondriales jakobid son primitivamente complejos en el sentido de que se parecen a sus ancestros proteobacterianos más que a cualquier otra mitocondria . [7]
Ciclo vital
Jakoba se reproduce asexualmente por fisión binaria . No se ha observado reproducción sexual ni formación de quistes . [5]
Datos de secuencia molecular
“El genoma mitocondrial circular de la cepa ATCC 50422 de Jakoba libera tiene un tamaño de 96,6 kpb. La secuenciación está casi completa. En la actualidad, se han identificado 77 genes, ninguno de ellos incluye un intrón. Las regiones intergénicas representan ~ 30% del genoma y contienen grupos de repeticiones en tándem cuya longitud unitaria es ~ 20 pb. Los genes transcritos se encuentran en ambas cadenas de ADN . El código genético estándar se utiliza para la traducción . Los genes codificados incluyen los que se encuentran comúnmente en el mtDNA , incluidos los genes que codifican proteínas nad1,2,3,4,4L, 5,6, cob, cox1,2,3 y atp6,8,9, así como la subunidad grande ( rnl) y genes de ARNr de subunidades pequeñas (rns) y> 22 genes de ARNt . También están presentes un número de genes de proteínas típicas de protista, pero no de animales o fúngicas ADNmts . Estos incluyen nad7,9,11, atp1, rpl2,5,6,14,16 y rps2-4,11-14,19. Varios ORF únicos también están codificados por el ADNmt de J. libera ". “Varios genes mitocondriales de J. libera son raros o están ausentes en otros genomas mitocondriales, pero están presentes en bacterias . Entre estos genes codificados por mtDNA raros o únicos se encuentran dpo, rpoB, C, rrn5, rnpB, tufA, yejU-W y varios de los genes de las proteínas ribosómicas ". “Una comparación del orden de los genes en los ADNmt de J. libera …” muestra “grupos que de otra manera no se encuentran en bacterias pero que evidentemente aparecieron durante la evolución del genoma mitocondrial después de la divergencia de la proto-mitocondria del linaje bacteriano. Algunos ejemplos son los grupos sdh3 a nad5, (que comprenden 5 genes), atp8- [trn] -rps4-atp9 y nad11-nad1-cox11-cox3-tufA ”. [8]
Culturas
Actualmente hay tres cepas de Jakoba libera disponibles para cultivo. No se pueden cultivar axénicamente , pero se cultivan fácilmente en un medio mínimo con bacterias añadidas ( Klebsiella aerogenes ) [5].
Géneros similares
Jakobids ( Jakobida o Jakobea )
- Histiona : 2-3 especies
- Reclinomonas : 1 especie [9]
Malawimonas : 1 especie descrita
Réplica a mónadas :
- Retortamonas
- Chilomastix [5]
Organismos similares a las carpediemonas :
- Carpediemonas
- Dysnectes
- Hicanonectes
- Ergobibamus
- Kipferlia
Referencias
- ^ Rodríguez-Ezpeleta, Naiara; Henner Brinkmann; Gertraud Burger; Andrew J. Roger; Michael W. Gray; Herve Philippe; B. Franz Lang (agosto de 2007). "Hacia la resolución del árbol eucariota: las posiciones filogenéticas de Jakobids y Cercozoans". Biología actual . 17 (16): 1420-1425. doi : 10.1016 / j.cub.2007.07.036 . PMID 17689961 .
- ^ Simpson, AGB y Patterson, DJ 2001. Sobre jakobids centrales y taxones excavados: la ultraestructura de Jakoba incarcerata. J. Euk. Microbial., 48: 480-492. https://doi.org/10.1111/j.1550-7408.2001.tb00183.x
- ^ Patterson, DJ 1990. Jakoba libera (Ruinen, 1938) un flagelado heterotrófico de sedimentos oceánicos profundos. Revista de la Asociación de Biología Marina, Reino Unido 70: 381-393
- ^ a b "Jakoba libera" . Proyecto web El árbol de la vida . Consultado el 3 de abril de 2012 .
- ^ a b c d e f "Jakoba" . Base de datos de imágenes de Protist . Consultado el 3 de abril de 2012 .
- ^ a b "Jakoba libera" . Enciclopedia de la vida . Consultado el 3 de abril de 2012 .
- ^ "Jakobida" . Proyecto web El árbol de la vida.
- ^ "Organización del genoma de Jakoba libera Mitochondria, contenido genético, código genético" . Consultado el 3 de abril de 2012 .
- ^ "Introducción a los flagelados jakobid" . Base de datos de imágenes de Protist . Consultado el 12 de abril de 2012 .