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KLF3
Proteína KLF3 PDB 1p7a.png
Estructuras disponibles
PDBBúsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Lista de códigos de identificación de PDB

1P7A , 1U85 , 1U86

Identificadores
AliasKLF3 , BKLF, factor 3 similar a Kruppel (básico), factor 3 similar a Kruppel
Identificaciones externasOMIM : 609392 MGI : 1342773 HomoloGene : 7396 GeneCards : KLF3
Ubicación de genes ( humanos )
Cromosoma 4 (humano)
Chr.Cromosoma 4 (humano) [1]
Cromosoma 4 (humano)
Ubicación genómica para KLF3
Ubicación genómica para KLF3
Banda4p14Comienzo38,664,197 pb [1]
Fin38,701,517 pb [1]
Ubicación de genes ( ratón )
Cromosoma 5 (ratón)
Chr.Cromosoma 5 (ratón) [2]
Cromosoma 5 (ratón)
Ubicación genómica para KLF3
Ubicación genómica para KLF3
Banda5 | 5 C3.1Comienzo64,803,388 pb [2]
Fin64.832.901 pb [2]
Patrón de expresión de ARN
PBB GE KLF3 219657 s en fs.png
Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes
Función molecular• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 actividad del factor de transcripción de unión a ADN
• unión a ADN
• GO: proteína de unión 0001948
• unión de iones metálicos
• unión de ácidos nucleicos
• unión de ARN polimerasa II región reguladora de ADN específica de secuencia
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN, específico de la ARN polimerasa II
Componente celular• núcleo celular
• nucleoplasma
Proceso biológico• desarrollo de organismos multicelulares
• respuesta celular al péptido
• regulación de la transcripción, plantilla de ADN
• transcripción, plantilla de ADN
• regulación negativa de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II
• regulación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II
Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
EspeciesHumanoRatón
Entrez

51274

16599

Ensembl

ENSG00000109787

ENSMUSG00000029178

UniProt

P57682

Q60980

RefSeq (ARNm)

NM_016531

NM_008453

RefSeq (proteína)

NP_057615

NP_032479

Ubicación (UCSC)Crónicas 4: 38,66 - 38,7 MbCrónicas 5: 64,8 - 64,83 Mb
Búsqueda en PubMed[3][4]
Wikidata
Ver / editar humanoVer / Editar mouse

El factor 3 similar a Krüppel es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen KLF3 .

Estructura [ editar ]

KLF3, originalmente denominado Factor básico similar a Krüppel (BKLF), fue el tercer miembro de la familia de factores similares a Krüppel de factores de transcripción con dedos de zinc que se descubrió. [5] Los factores de transcripción en esta familia se unen al ADN en virtud de tres dedos de zinc C 2 H 2 característicos en sus extremos C-terminales . Dado que sus dominios de unión al ADN están muy conservados dentro de la familia, todas las proteínas KLF reconocen cajas CACCC o CGCCC de la forma general NCR CRC CCN, (donde N es cualquier base y R es una purina ).

Función [ editar ]

Si bien los extremos C son similares en diferentes KLF, los extremos N varían y, en consecuencia, diferentes KLF pueden activar o reprimir la transcripción o ambas cosas. KLF3 parece funcionar predominantemente como represor de la transcripción. Apaga los genes. Lo hace reclutando los correpresores CTBP1 y CTBP2 de la proteína de unión C-terminal . [6] [7] CtBP se acopla a un motivo corto (residuos 61-65) en el extremo N-terminal de KLF3, de la forma general Prolina - Isoleucina - Aspartato - Leucina - Serina (el motivo PIDLS). [6] [7] CtBP, a su vez, recluta enzimas modificadoras de histonas para alterar la cromatina y reprimir la expresión génica.

KLF3 se expresa mucho en el linaje de glóbulos rojos o eritroides. Aquí es impulsado por otro KLF, Erythroid KLF o KLF1 , y su expresión aumenta a medida que maduran las células eritroides. Los estudios en ratones knockout revelan una anemia leve en ausencia de KLF3 funcional y la des-represión de varios genes diana que contienen cajas CACCC en sus regiones reguladoras. [8] Muchos de estos genes son activados por KLF1, por lo que parece que KLF3 opera en un circuito de retroalimentación negativa para equilibrar el potencial de activación de KLF1. KLF3 también regula otro KLF represivo, KLF8 . [9]Por tanto, KLF1, KLF3 y KLF8 operan en una estrecha red reguladora. KLF3 y KLF8 pueden tener funciones redundantes, ya que los ratones que carecen de KLF3 y KLF8 muestran defectos que son más graves que en cualquiera de los dos knockout. Mueren en el útero alrededor del día 14 de gestación. [10]

Además de ser expresada en células eritroides, KLF3 está presente en otros tipos y análisis de la célula de ratones knockout ha revelado defectos que afectan el tejido adiposo [11] y las células B . [12] Los ratones deficientes en KLF3 tienen menos tejido adiposo e indicaciones de salud metabólica que pueden atribuirse a la desrepresión del gen adipolina de la hormona adipoquina . [13] La función de KLF3 en los linfocitos B es compleja, pero parece operar en red con KLF2 y KLF4 para influir en el cambio entre la zona marginal del bazo y las células B foliculares . [14]

Interacciones [ editar ]

Se ha demostrado que KLF3 interactúa con:

  • CTBP2 [6] [7] y
  • FHL3 . [6]

Referencias [ editar ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000109787 - Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029178 - Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  5. ^ Crossley M (abril de 1996). "Aislamiento y caracterización del ADNc que codifica BKLF / TEF-2, una proteína de unión a caja CACCC principal en células eritroides y otras células seleccionadas" . Mol. Celda. Biol . 16 (4): 1695–705. doi : 10.1128 / mcb.16.4.1695 . PMC 231156 . PMID 8657145 .  
  6. ↑ a b c d Turner J, Nicholas H, Obispo D, Matthews JM, Crossley M (2003). "La proteína LIM FHL3 se une al factor básico similar a Krüppel / factor similar a Krüppel 3 y su proteína correpresora de unión al terminal C 2" . J. Biol. Chem . 278 (15): 12786–95. doi : 10.1074 / jbc.M300587200 . PMID 12556451 . 
  7. ↑ a b c Turner J, Crossley M (1998). "Clonación y caracterización de mCtBP2, un correpresor que se asocia con factor básico similar a Krüppel y otros reguladores transcripcionales de mamíferos" . EMBO J . 17 (17): 5129–40. doi : 10.1093 / emboj / 17.17.5129 . PMC 1170841 . PMID 9724649 .  
  8. ^ Funnell AP, Norton LJ, Mak KS, Burdach J, Artuz CM, Twine NA, Wilkins MR, Power CA, Hung TT, Perdomo J, Koh P, Bell-Anderson KS, Orkin SH, Fraser ST, Perkins AC, Pearson RC , Crossley M (agosto de 2012). "La proteína de unión a CACCC KLF3 / BKLF reprime un subconjunto de genes diana KLF1 / EKLF y es necesaria para la maduración eritroide adecuada in vivo" . Mol. Celda. Biol . 32 (16): 3281–92. doi : 10.1128 / MCB.00173-12 . PMC 3434552 . PMID 22711990 .  
  9. ^ Eaton SA, Funnell AP, Sue N, Nicholas H, Pearson RC, Crossley M (agosto de 2008). "Una red de factores similares a Krüppel (Klfs). Klf8 es reprimido por Klf3 y activado por Klf1 in vivo" . J. Biol. Chem . 283 (40): 26937–47. doi : 10.1074 / jbc.M804831200 . PMC 2556010 . PMID 18687676 .  
  10. ^ Funnell AP, Mak KS, Twine NA, Pelka GJ, Norton LJ, Radziewic T, Power M, Wilkins MR, Bell-Anderson KS, Fraser ST, Perkins AC, Tam PP, Pearson RC, Crossley M (agosto de 2013). "La generación de ratones deficientes en KLF3 / BKLF y KLF8 revela una interacción genética y un papel de estos factores en el silenciamiento del gen de la globina embrionaria" . Mol. Celda. Biol . 33 (15): 2976–87. doi : 10.1128 / MCB.00074-13 . PMC 3719677 . PMID 23716600 .  
  11. ^ Sue N, Jack BH, Eaton SA, Pearson RC, Funnell AP, Turner J, Czolij R, Denyer G, Bao S, Molero-Navajas JC, Perkins A, Fujiwara Y, Orkin SH, Bell-Anderson K, Crossley M ( Junio ​​de 2008). "La alteración dirigida del gen del factor básico tipo Kruppel (Klf3) revela un papel en la adipogénesis" . Mol Cell Biol . 28 (12): 3967–78. doi : 10.1128 / MCB.01942-07 . PMC 2423134 . PMID 18391014 .  
  12. ^ Vu TT, Gatto D, Turner V, Funnell AP, Mak KS, Norton LJ, Kaplan W, Cowley MJ, Agenès F, Kirberg J, Brink R, Pearson RC, Crossley M (noviembre de 2011). "Deterioro del desarrollo de células B en ausencia de factor 3 similar a Krüppel" . J. Immunol . 187 (10): 5032–42. doi : 10.4049 / jimmunol.1101450 . PMID 22003205 . 
  13. ^ Bell-Anderson KS, Funnell AP, Williams H, Mat Jusoh H, Scully T, Lim WF, Burdach JG, Mak KS, Knights AJ, Hoy AJ, Nicholas HR, Sainsbury A, Turner N, Pearson RC, Crossley M (abril 2013). "La pérdida de factor de tipo Kruppel 3 (KLF3 / BKLF) conduce a la regulación positiva del factor de sensibilización a la insulina adipolina (FAM132A / CTRP12 / C1qdc2)" . Diabetes . 62 (8): 2728–37. doi : 10.2337 / db12-1745 . PMC 3717849 . PMID 23633521 .  
  14. ^ Pearson RC, Funnell AP, Crossley M (febrero de 2011). "El factor de transcripción de dedos de zinc de mamíferos factor 3 similar a Krüppel (KLF3 / BKLF)" . IUBMB Life . 63 (2): 86–93. doi : 10.1002 / iub.422 . PMID 21360637 . S2CID 38842040 .  

Lectura adicional [ editar ]

  • Turner J, Crossley M (2000). "Funciones básicas del factor similar a Krüppel dentro de una red de factores de transcripción hematopoyéticos que interactúan". En t. J. Biochem. Cell Biol . 31 (10): 1169–74. doi : 10.1016 / S1357-2725 (99) 00067-9 . PMID  10582345 .
  • Wang MJ, Qu XH, Wang LS, Zhai Y, Wu SL, He FC (2003). "Clonación de ADNc, localización subcelular y expresión tisular de un nuevo factor de transcripción similar a Krüppel humano: factor similar a Krüppel básico humano (hBKLF)". Yi Chuan Xue Bao . 30 (1): 1–9. PMID  12812068 .
  • Perdomo J, Verger A, Turner J, Crossley M (2005). "Papel de la modificación de SUMO en la facilitación de la represión transcripcional por BKLF" . Mol. Celda. Biol . 25 (4): 1549–59. doi : 10.1128 / MCB.25.4.1549-1559.2005 . PMC  548027 . PMID  15684403 .
  • Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . "Diversificación de la modulación transcripcional: identificación y caracterización a gran escala de supuestos promotores alternativos de genes humanos" . Genome Res . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101 / gr.4039406 . PMC  1356129 . PMID  16344560 .
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). "Dinámica de fosforilación global, in vivo y específica del sitio en redes de señalización". Celular . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983 . S2CID  7827573 .

Enlaces externos [ editar ]

  • Proteína KLF3, humana en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .