• regulación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • respuesta celular al estímulo del cortisol • regulación de la transcripción, plantilla de ADN • ritmo circadiano • regulación negativa de la proliferación de queratinocitos • transcripción, plantilla de ADN • respuesta celular al estímulo de la hormona tiroidea • proceso rítmico
Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies
Humano
Ratón
Entrez
687
16601
Ensembl
ENSG00000119138
ENSMUSG00000033863
UniProt
Q13886
O35739 Q8CEC4
RefSeq (ARNm)
NM_001206
NM_010638
RefSeq (proteína)
NP_001197
NP_034768
Ubicación (UCSC)
Crónicas 9: 70,38 - 70,41 Mb
Crónicas 19: 23,14 - 23,17 Mb
Búsqueda en PubMed
[3]
[4]
Wikidata
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El factor 9 similar a Krueppel es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen KLF9 . [5] [6] Anteriormente conocida como proteína de unión a elementos de transcripción básica 1 (proteína 1 de BTEB), Klf9 es parte de la familia de factores de transcripción de dedos de zinc tipo Sp1 C2H2 . Varios estudios anteriores mostraron la regulación del desarrollo animal relacionada con Klf9, incluida la diferenciación celular de células B , queratinocitos y neuronas. [7] Klf9 también es un regulador transcripcional clave para el endometrio uterinoproliferación, adhesión y diferenciación celular, todos factores que son esenciales durante el proceso de embarazo y se desactivan durante la tumorigénesis . [8]
Contenido
1 función
2 estudios con animales
3 Interacciones
4 referencias
5 Lecturas adicionales
6 Enlaces externos
Función [ editar ]
La proteína codificada por este gen es un factor de transcripción que se une a los elementos de la caja GC ubicados en el promotor. La unión de la proteína codificada a una única caja de GC inhibe la expresión de ARNm mientras que la unión a elementos de la caja de GC repetidos en tándem activa la transcripción. [6]
El estrés oxidativo aumenta la expresión de Klf9 y la sobreexpresión del gen Klf9 sensibiliza a la célula al estrés oxidativo y las especies reactivas de oxígeno (ROS)]. ,
El uso de un ARN en horquilla corto (ARNhc) para silenciar la expresión de Klf9 proporciona resistencia a la célula al estrés oxidativo y la muerte celular relacionada con ROS. Klf9 está regulado positivamente por ROS y promueve la muerte celular relacionada con ROS. [7]
Klf9 exhibe similitudes con otros genes conocidos de estrés oxidativo como NQO1 y HMOX1 . Cuando se exponen a la misma cantidad de peróxido de hidrógeno, tanto las células embrionarias de ratón como las células humanas producen cantidades similares de Klf9 y NQO1 / HMOX. [7] También ocurre lo contrario de este efecto; La sobreexpresión de Klf9 dentro de la célula conduce a un aumento de las ROS intracelulares. El resultado final del aumento de ROS intracelulares y Klf9 es un aumento de la muerte celular; con el gen Klf9 sobreexpresado, mueren más células. Se encontró una muerte celular similar in vivo cuando los ratones de tipo salvaje se expusieron al agente de estrés oxidativo paraquat por vía intranasal, que validó la expresión de Klf9 dependiente del estrés oxidativo que se encuentra solo en las líneas celulares. [7]
Las regiones alrededor de 10 kb corriente arriba y 1 kb corriente abajo del sitio de inicio de la transcripción de Klf9 contienen elementos de respuesta antioxidante conservados (ARE), que son sitios de unión para Nrf2. [7] Nrf2 es un importante regulador de la respuesta antioxidante a ROS dentro de la célula. Klf9 está regulado al alza por Nrf2; cuando el estrés oxidativo es alto y la concentración de ROS intracelulares es alta, Nrf2 se une al promotor Klf9, lo que aumenta la cantidad de ROS intracelulares, lo que conduce a la muerte celular. Cuando el estrés oxidativo es bajo, Nrf2 sigue su ruta normal aumentando la cantidad de especies antioxidantes dentro de la célula y disminuyendo la cantidad de ROS intracelulares. [7]
Estudios con animales [ editar ]
Una deficiencia de Klf9 suprime la fibrosis inducida por bleomicina en los pulmones de ratones. Al introducir bleomicina en el tejido pulmonar, el tejido producirá ROS y desarrollará tejido pulmonar fibrótico para combatir el daño causado por la bleomicina. Cuando se eliminó Klf9 en estos ratones, no se formó tanto tejido pulmonar fibrótico. [7] Debido a este hallazgo, los investigadores propusieron que las manipulaciones de los niveles de Klf9 dentro del cuerpo también pueden ser un tratamiento válido para otras enfermedades, incluidos ciertos tipos de cáncer. [7]
Interacciones [ editar ]
Se ha demostrado que KLF9 interactúa con el receptor de progesterona . [9]
Referencias [ editar ]
^ a b c GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000119138 - Ensembl , mayo de 2017
^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000033863 - Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ Imataka H, Sogawa K, Yasumoto K, Kikuchi Y, Sasano K, Kobayashi A, Hayami M, Fujii-Kuriyama Y (noviembre de 1992). "Dos proteínas reguladoras que se unen al elemento básico de transcripción (BTE), una secuencia de caja GC en la región promotora del gen P-4501A1 de rata" . EMBO J . 11 (10): 3663–71. doi : 10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05451.x . PMC 556826 . PMID 1356762 .
^ a b "Entrez Gene: KLF9 Kruppel-like factor 9" .
^ a b c d e f g h Zucker SN, Fink EE, Bagati A, Mannava S, Bianchi-Smiraglia A, Bogner PN, Wawrzyniak JA, Foley C, Leonova KI, Grimm MJ, Moparthy K, Ionov Y, Wang J, Liu S, Sexton S, Kandel ES, Bakin AV, Zhang Y, Kaminski N, Segal BH, Nikiforov MA (2014). "Nrf2 amplifica el estrés oxidativo mediante la inducción de Klf9" . Mol. Celular . 53 (6): 916-28. doi : 10.1016 / j.molcel.2014.01.033 . PMC 4049522 . PMID 24613345 .
^ Simmen FA, Su Y, Xiao R, Zeng Z, Simmen RC (2008). "La red de factor de tipo Krüppel 9 (KLF9) en las células de carcinoma de endometrio HEC-1-A sugiere el potencial carcinogénico de la expresión de KLF9 dis-regulada" . Reprod. Biol. Endocrinol . 6 : 41. doi : 10.1186 / 1477-7827-6-41 . PMC 2542371 . PMID 18783612 .
^ Zhang XL, Zhang D, Michel FJ, Blum JL, Simmen FA, Simmen RC (junio de 2003). "Las interacciones selectivas del factor de tipo Kruppel 9 / proteína de unión al elemento de transcripción básica con las isoformas A y B del receptor de progesterona determinan la actividad transcripcional de los genes que responden a la progesterona en las células epiteliales endometriales" . J. Biol. Chem . 278 (24): 21474–82. doi : 10.1074 / jbc.M212098200 . PMID 12672823 .
Lectura adicional [ editar ]
Kobayashi A, Sogawa K, Imataka H, Fujii-Kuriyama Y (1995). "Análisis de dominios funcionales de una proteína de unión a caja GC, BTEB". J. Biochem . 117 (1): 91–5. doi : 10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a124727 . PMID 7775404 .
Imataka H, Nakayama K, Yasumoto K, Mizuno A, Fujii-Kuriyama Y, Hayami M (1994). "Control de traducción específico de la célula de la expresión del factor de transcripción BTEB. El papel de un AUG aguas arriba en la región 5 'sin traducir". J. Biol. Chem . 269 (32): 20668–73. PMID 8051167 .
Imataka H, Mizuno A, Fujii-Kuriyama Y, Hayami M (1994). "Activación de la repetición terminal larga del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 por BTEB, un factor de transcripción de unión a caja GC". AIDS Res. Tararear. Retrovirus . 9 (9): 825–31. doi : 10.1089 / aid.1993.9.825 . PMID 8257632 .
Hashimoto H, Toide K, Kitamura R, Fujita M, Tagawa S, Itoh S, Kamataki T (diciembre de 1993). "Estructura genética de CYP3A4, una forma específica de adultos de citocromo P450 en hígados humanos y su control transcripcional" . EUR. J. Biochem . 218 (2): 585–95. doi : 10.1111 / j.1432-1033.1993.tb18412.x . PMID 8269949 .
Ohe N, Yamasaki Y, Sogawa K, Inazawa J, Ariyama T, Oshimura M, Fujii-Kuriyama Y (septiembre de 1993). "Localización cromosómica y secuencia de ADNc de BTEB humano, una proteína de unión a caja GC". Somat. Cell Mol. Genet . 19 (5): 499–503. doi : 10.1007 / BF01233255 . PMID 8291025 . S2CID 45624023 .
Zhang XL, Zhang D, Michel FJ, Blum JL, Simmen FA, Simmen RC (2003). "Las interacciones selectivas del factor de tipo Kruppel 9 / proteína de unión al elemento de transcripción básica con las isoformas A y B del receptor de progesterona determinan la actividad transcripcional de los genes que responden a la progesterona en las células epiteliales endometriales" . J. Biol. Chem . 278 (24): 21474–82. doi : 10.1074 / jbc.M212098200 . PMID 12672823 .
Velarde MC, Iruthayanathan M, Eason RR, Zhang D, Simmen FA, Simmen RC (abril de 2006). "La transactivación del receptor de progesterona del gen inhibidor de la proteasa leucocitaria secretor en las células epiteliales del endometrio de Ishikawa implica el reclutamiento del factor 9 similar a Krüppel / proteína de unión al elemento de transcripción básico-1" . Endocrinología . 147 (4): 1969–78. doi : 10.1210 / en.2005-1419 . PMID 16384861 .
Enlaces externos [ editar ]
KLF9 + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .
vtmiFactores de transcripción y receptores intracelulares
(1) Dominios básicos
(1.1) Cremallera básica de leucina ( bZIP )
Factor de transcripción activador
AATF
1
2
3
4
5
6
7
AP-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
c-jun
JUNB
JunD
LLEVAR UNA VIDA DE SOLTERO
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
DBP
DDIT3
GABPA
GCN4
HLF
MAF
B
F
GRAMO
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Hélice-bucle-hélice básica ( bHLH )
Grupo A
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
MANO
1
2
MESP2
Factores reguladores miogénicos
MyoD
Miogenina
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Neurogeninas
1
2
3
OLIG
1
2
Paraxis
TCF15
Escleraxis
SLC
LYL1
TAL
1
2
Giro
Grupo B
FIGLA
Mi c
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Grupo C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
RELOJ
HIF
1A
EPAS1
3A
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Grupo D
BHLH
2
3
9
Pho4
IDENTIFICACIÓN
1
2
3
4
Grupo E
ÉL ES
1
2
3
4
5
6
7
OYE
1
2
L
Grupo F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
AP-4
MAX
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Mi c
SREBP
1
2
USF1
(1,4) NF-1
NFI
A
B
C
X
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
ESTÁ LOCO
6
7
4 )
(1,5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
ANK
(1.6) Hélice-tramo-hélice básica (bHSH)
AP-2
α
β
γ
δ
ε
(2) Dominios de unión al ADN con dedos de zinc
(2.1) Receptor nuclear (Cys 4 )
subfamilia 1
Hormona tiroidea
α
β
AUTO
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
subfamilia 2
GOLPE-TF
( Yo
II
Oreja-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Receptor testicular
2
4
TLX
subfamilia 3
Hormona esteroide
Andrógino
Estrógeno
α
β
Glucocorticoide
Mineralocorticoide
Progesterona
Relacionado con el estrógeno
α
β
γ
subfamilia 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
subfamilia 5
LRH-1
SF1
subfamilia 6
GCNF
subfamilia 0
DAX1
SHP
(2.2) Otras Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Factores de transcripción generales
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
TFIIF
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3A
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11A
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Familia Krüppel
1
2
3
DESCANSO
S1
S2
YY1
HIC
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
VENDER
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7A
7B
ZBTB
11
dieciséis
17
20
32
33
40
dedo de zinc
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35
41
43
44
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Composición alternante
AIRE
DIDO1
GRLF1
EN G
1
2
4
JARID
1A
1B
1C
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Dominios de hélice-vuelta-hélice
(3.1) Homeodominio
Clase ANTP de Antennapedia
protoHOX Hox-like
ParaHox
Gsx
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
Hox extendido: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
B2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
tipo metaHOX NK
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
ES
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
OTAN
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
otro
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1A
1B
SIN CAJA
CUENTO
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
MEIS
1
2
PBX
1
2
3
PKNOX
1
2
SEIS
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
dieciséis
17
20
21A
Dominio de POU
PIT-1
BRN-3 : A
B
C
Factor de transcripción de octamer : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Caja emparejada
PAZ
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
PHOX
2A
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Bicoide
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Cabeza de horquilla / hélice alada
E2F
1
2
3
4
5
Proteínas FOX
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Factores de choque térmico
HSF
1
2
4
(3.5) Clústeres de triptófano
DUENDE
2
4
5
EGF
ALCE
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ERGIO
SPIB
ETV
1
4
5
6
FLI1
Factores reguladores del interferón
1
2
3
4
5
6
7
8
MI B
MYBL2
(3.6) dominio TEA
factor potenciador transcripcional
1
2
3
4
(4) factores β-andamio con contactos de ranura menores
(4.1) Región de homología rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
RELA
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) ESTADÍSTICA
ESTADÍSTICA
1
2
3
4
5
6
(4.3) similar a p53
p53 p63 p73 familia
p53
TP63
p73
TBX
1
2
3
5
19
21
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Caja MADS
Mef2
A
B
C
D
SRF
(4.6) Proteínas de unión a TATA
TBP
TBPL1
(4.7) Grupo de alta movilidad
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1A
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
TOX
1
2
3
4
(4.9) Granulado
TFCP2
(4.10) Dominio de choque frío
CSDA
YBX1
(4.11) Enano
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Otros factores de transcripción
(0,2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Dominio de bolsillo
Rb
RBL1
RBL2
(0.5) Factores relacionados con AP-2 / EREBP
Apetala 2
EREBP
B3
(0.6) Varios
ÁRIDO
1A
1B
2
3A
3B
4A
GORRA
SI YO
dieciséis
35
MLL
2
3
T1
MNDA
NFY
A
B
C
Rho / Sigma
ver también deficiencias de factor de transcripción / corregulador