Inspirándose en los términos genoma y genómica , se han acuñado otras palabras para describir conjuntos de datos biológicos completos , en su mayoría conjuntos de biomoléculas procedentes de un organismo , con el sufijo -ome y - ómicas . Algunos de estos términos están relacionados entre sí de forma jerárquica . Por ejemplo, el genoma contiene el ORFeome , que da lugar al transcriptoma , que se traduce en proteoma . Otros términos se superponen y se refieren a la estructura y / o función de un subconjunto de proteínas (por ejemplo , glicoma ,kinome ).
Un omicista es un científico que estudia omeómica, catalogando todos los subcampos "ómicos". [1]
Omics.org es un Wiki que recopila y enumera alfabéticamente todos los "omics" y "ómicos" conocidos. [2]
Lista de temas
-ome | Campo de estudio (-ómica) | Colección de | Asunto padre | Notas |
---|---|---|---|---|
Alergenoma | Alergenómica [3] | Proteómica de alérgenos | ||
Bibliome | Bibliomics | Datos bibliográficos científicos | ||
Trialome | Medicamento | Los datos de los ensayos de intervención en humanos de los registros de ensayos clínicos se ampliaron con los resultados de los ensayos y los enlaces a las publicaciones resultantes | ||
Connectome | Conectividad | Conectividad cerebral estructural y funcional a diferentes escalas espacio-temporales | Neurociencia | |
Citoma | Cytomics | Sistemas celulares de un organismo. | Citología | |
Editome | Sitios de edición de ARN | |||
Embrión | Embriómica | Linajes celulares de células embrionarias, genes expresados y antígenos presentes durante el desarrollo. | Embriología | |
Medio ambiente | Medio ambiente | Factores ambientales relacionados con los genes (medio ambiente) | ||
Epigenoma | Epigenómica | Modificaciones epigenéticas | Genética molecular | La epigenómica es el estudio del conjunto completo de modificaciones epigenéticas en el material genético de una célula, conocido colectivamente como epigenoma. |
Exposoma (2005) | Exposómica | Las exposiciones ambientales de un individuo , incluso en el entorno prenatal. | Genética molecular | Término propuesto y campo de estudio de los efectos causantes de enfermedades de los factores ambientales (el componente de " crianza " de " naturaleza versus crianza "). [4] |
Exposoma (2009) | Exposiciones ocupacionales compuestas y problemas de salud ocupacional | Seguridad y salud ocupacional | Los proponentes de este término conocían el término anterior como se usó anteriormente, pero propusieron aplicar el término a un nuevo campo. [5] [6] | |
Exoma | Exómica | Exones en un genoma | Genética molecular | |
Foodome | Foodómica | Problemas de alimentación y nutrición relacionados con la bioactividad, la calidad, la seguridad y la trazabilidad de los alimentos mediante la aplicación e integración de tecnologías ómicas avanzadas para mejorar el bienestar, la salud y la confianza del consumidor. | Nutrición | El término se definió por primera vez en 2009 [7]. |
Genoma | Genómica ( genética clásica ) | Genes ( secuencias de ADN / cromosomas ) | Genética | "Genoma" se refiere al conjunto de todos los genes de un organismo. Sin embargo, el "genoma" se acuñó décadas antes de que se descubriera que la mayor parte del ADN " no codifica " y no forma parte de un gen; por tanto, "genoma" se refería originalmente a la colección completa de ADN dentro de un organismo. Hoy en día, se utilizan ambas definiciones, según el contexto. [8] |
Glycome | Glicomicos | Glicanos | Glicobiología | |
Hologenoma | Hologenómica | Genomas de miembros de la comunidad (es decir, holobiontes ) | Metagenómica | |
Interferoma | Interferómica | Interferones | Inmunología | También una base de datos del mismo nombre. [9] |
Interactome | Interactómica | Todas las interacciones | El término "interactómica" generalmente no se usa. En cambio, los interactomas se consideran el estudio de la biología de sistemas . [10] [11] | |
Ionome | Ionómica | Biomoléculas inorgánicas | Biología Molecular | |
Kinome | Cinómica | Quinasas | Biología Molecular | Proteínas que agregan un grupo fosfato |
Lipidoma | Lipidómica [12] | Lípidos | Bioquímica | |
Mechanome | Mecánica | Los sistemas mecánicos dentro de un organismo. | ||
Metaboloma | Metabolómica | Metabolitos | Todos los productos de una reacción biológica (incluidos los intermedios) | |
Metagenoma | Metagenómica | Material genético encontrado en una muestra ambiental. | Biología Molecular | Se asume que el material genético contiene ADN de múltiples organismos y por lo tanto múltiples genomas, de ahí la inclusión del prefijo meta- . |
Metalome | Metalómica | Metales y metaloides | ||
Microbioma | microbiomica | Colección de microorganismos en otro organismo como un animal | Microbiología | |
Obesidome | Obesidómica | Proteínas relacionadas con la obesidad | Proteómica | Acuñado por Pardo et al., 2012. [13] |
O Feome | ORFeomics | Marcos de lectura abiertos (ORF) | Genética molecular | |
Organome | Organómica | Interacciones de órganos | Señalización celular / Señalización celular e ingeniería de tejidos | El estudio de la diafonía entre órganos utilizando modelos in vitro fisiológicamente relevantes |
Parvome | Parvomics | Metabolitos secundarios | Bioquímica | Acuñado por Mark Martin e introducido por Julian Davies en 2008, refiriéndose al latín parvus para "pequeño", y describiendo el "gigantesco mundo microbiano de moléculas pequeñas (secretadas) de gran diversidad estructural". [14] Véase también [15]. |
Farmacogenética | Farmacogenética | SNP y su efecto sobre la farmacocinética y la farmacodinámica | Farmacogenómica Genómica | |
Farmacogenoma | Farmacogenómica | El efecto de los cambios en el genoma sobre la farmacología. | Farmacogenética Genómica | |
Fenoma | Fenomica | Fenotipos | Genética | |
Physiome | Fisiomica | Fisiología de un organismo | ||
Fitoquimoma | Fitoquímica | Fitoquímicos | El término ha sido acuñado por del Castillo et al., 2013, Food Research International, [4] . La fitoquímica es un concepto integral destinado a aumentar el conocimiento de la bioactividad de los fitoquímicos, que es de creciente importancia en las ciencias agrícolas, alimentarias, médicas y cosméticas. | |
Proteoma | Proteómica | Proteínas | Biología Molecular | |
Regulome | Regulómica | Factores de transcripción y otras moléculas involucradas en la regulación de la expresión génica. | Biología Molecular | |
Investigando | Áreas de investigación cubiertas por un investigador o institución individual | Investigar | Acuñado por Ivan Erill en la reunión de la EBM de 2011 [16] | |
Secretome | Secretomics | Proteínas secretadas | Proteómica | Subconjunto del proteoma que consta de proteínas exportadas activamente de las células. [17] |
Speechome | Speecheomics | Influencias en la adquisición del lenguaje | Acuñado por Human Speechome Project [18] | |
Sintético | Un conjunto de genes artificiales en un organismo. | [19] [ referencia circular ] | ||
Transcriptoma | Transcriptómica | Todas las moléculas de ARN, incluidos ARNm , ARNr , ARNt y otros ARNc | Biología Molecular | |
Toponoma | Toponómica | Estructura celular y tisular | Biología Molecular | |
Volatilome | Volatilómica | colección completa de metabolitos volátiles | Biomarcadores |
Jerarquía de temas
En aras de la claridad, algunos temas se enumeran más de una vez.
- Bibliome
- Connectome
- Citoma
- Editome
- Embrión
- Epigenoma
- Metiloma [20]
- Exposoma
- Medio ambiente [21]
- Toxoma [22]
- Foodome
- Microbioma
- Sociome
- Medio ambiente [21]
- Genoma
- Variome
- Exoma
- O Feome
- Transcriptoma
- Proteoma
- Kinome
- Secretome
- Chaperome
- Alergenoma
- Proteoma
- Transcriptoma
- O Feome
- Farmacogenoma
- Regulome
- Hologenoma
- Interactome
- Interferoma
- Ionome
- Fluxome
- Membranome
- Metagenoma
- Metalome
- Microbioma
- Moleculoma
- Glycome
- Ionome
- Lipidoma
- Metaboloma
- Volatilome
- Metalome
- Proteoma
- Obesidome
- Organome
- Fenoma
- Physiome
- Connectome
- Sinaptoma [23]
- Dinomo [24]
- Mechanome
- Connectome
- Regulome
- Investigando
- Toponoma
- Trialome
- Anticuerpo [25]
Referencias
- ^ Yadav SP. (2007). "La totalidad en el sufijo -omics, -omes y la palabra Om" . J Biomol Tech . 18 (5): 277. PMC 2392988 . PMID 18166670 .
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- ^ Faisandier, Laurie; Bonneterre, Vincent; De Gaudemaris, Régis; Bicout, Dominique J. (2009). "Un enfoque basado en la red para la vigilancia de las exposiciones a la salud ocupacional". arXiv : 0907.3355 [ stat.ME ].
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