En biología molecular , bioquímica y señalización celular, el cinoma de un organismo es el conjunto completo de proteína quinasas codificadas en su genoma . Las quinasas suelen ser enzimas que catalizan reacciones de fosforilación (de aminoácidos) y se dividen en varios grupos y familias, por ejemplo, las que fosforilan los aminoácidos serina y treonina , las que fosforilan la tirosina.y algunos que pueden fosforilar ambos, como las familias MAP2K y GSK. El término fue utilizado por primera vez en 2002 por Gerard Manning y sus colegas en artículos de gemelos que analizan las 518 proteína quinasas humanas, y se refiere tanto a proteína quinasas como a proteína pseudokinasas [1] y su evolución de proteína quinasas en los eucariotas. [2] Se han determinado otros kinomas para el arroz, [3] varios hongos, nematodos e insectos, erizos de mar , [4] Dictyostelium discoideum , [5] y el proceso de infección por Mycobacterium tuberculosis . [6] Aunque la secuencia primaria de proteína quinasas muestra una divergencia sustancial entre eucariotas no emparentados, y las diferencias de aminoácidos en motivos catalíticos han permitido su separación de kinomas en subtipos canónicos y pseudoquinasa , [7] la variación encontrada en los motivos de aminoácidos adyacentes a la el sitio de fosforilación real de sustratos por quinasas eucariotas es mucho más pequeño. [8]
Como las quinasas son un objetivo importante de los fármacos y un punto de control importante en el comportamiento celular, el quinoma también ha sido el objetivo de la genómica funcional a gran escala con pantallas de ARNi y de los esfuerzos de descubrimiento de fármacos, especialmente en la terapéutica del cáncer. [9]
En los animales, el quinoma incluye quinasas que fosforilan solo tirosina (tirosina quinasas), aquellas que actúan sobre la serina o treonina, y algunas clases, como GSK3 y MAP2K, que pueden actuar sobre ambas. [ cita requerida ] La investigación ha demostrado que existen dominios de proteínas especializados que se unen a residuos de serina y treonina fosforilados, como los dominios BRCA y FHA . [ cita requerida ]
Ver también
Referencias
- ^ Manning G, Whyte DB, Martinez R, Hunter T, Sudarsanam S (diciembre de 2002). "El complemento de la proteína quinasa del genoma humano". Ciencia . 298 (5600): 1912–34. doi : 10.1126 / science.1075762 . PMID 12471243 .
- ^ Manning G, Ploughman GD, Hunter T, Sudarsanam S (octubre de 2002). "Evolución de la señalización de la proteína quinasa de la levadura al hombre". Trends Biochem. Sci . 27 (10): 514-20. doi : 10.1016 / S0968-0004 (02) 02179-5 . PMID 12368087 .
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- ^ Reiterer V, Eyers PA, Farhan H (2014). "Día de muertos: pseudokinasas y pseudofosfatasas en fisiología y enfermedad". Tendencias en biología celular . 24 (9): 489–505. doi : 10.1016 / j.tcb.2014.03.008 . PMID 24818526 .
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enlaces externos
- KinBase
- Base de datos de Rice Kinome