En genética molecular , un ORFeome se refiere al conjunto completo de marcos de lectura abiertos (ORF) en un genoma . El término también puede usarse para describir un conjunto de ORF clonados . [1] Los ORF corresponden a las secuencias de codificación de proteínas (CDS) de los genes . Los ORF se pueden encontrar en las secuencias del genoma mediante programas informáticos como GENSCAN y luego amplificarse mediante PCR . Si bien esto es relativamente trivial en las bacterias , el problema no es trivial en los genomas eucariotas debido a la presencia de intrones y exones , así como avariantes de empalme .
El uso de ORFeomes completos refleja una nueva tendencia en biología que puede resumirse sucintamente como ómicas . Los ORFeomes se utilizan para el estudio de interacciones proteína-proteína, [2] [3] micromatrices de proteínas , el estudio de antígenos, [4] y otros campos de estudio.
Se han clonado conjuntos ORF completos para varios organismos, incluidos Brucella melitensis , [5] Chlamydia pneumoniae , [6] Escherichia coli , [7] Neisseria gonorrhoeae , [8] Pseudomonas aeruginosa , [9] Schizosaccharomyces pombe , Staphylococcus aureus [10] y herpesvirus humanos [11]