El Mouse Genetics Project (MGP) es un programa de fenotipado y producción de ratones mutantes a gran escala destinado a identificar nuevos organismos modelo de enfermedades. [1] [2] [3] [4]
Basado en el Wellcome Trust Sanger Institute , el proyecto utiliza ratones knockout, la mayoría de los cuales fueron generados por el International Knockout Mouse Consortium . Para cada línea mutante, grupos de siete ratones machos y siete hembras se mueven a través de una línea de análisis estándar destinada a detectar rasgos que difieren de los ratones C57BL / 6 sanos . [1] La tubería recopila muchas medidas de viabilidad, fertilidad, peso corporal, infección, audición, morfología, hematología, comportamiento, química sanguínea e inmunidad y las compara con controles de tipo salvaje utilizando un modelo mixto estadístico . [5]Estos datos se comparten inmediatamente entre la comunidad de investigación científica y médica a través de una base de datos de acceso abierto a medida , [6] y los resúmenes se muestran en otros recursos en línea, incluida la base de datos Mouse Genome Informatics y el Gene Wiki basado en Wikipedia . [4]
En julio de 2013, el MGP informa que tiene más de 900 líneas mutantes disponibles abiertamente para la comunidad de investigación internacional, [4] y tiene un análisis "sustancialmente completo" para más de 650 líneas mutantes, [6] de las cuales más del 75% tienen al menos una fenotipo anormal. [1] Entre estos se encuentran nuevos descubrimientos de genes implicados en enfermedades, que incluyen el hallazgo:
- La mutación de SLX4 provoca un nuevo tipo de anemia de Fanconi . [3] [7] [8]
- Nueve genes nuevos que influyen en la fuerza ósea. [9]
- Mutación de modelos CENPJ síndrome de Seckel . [10]
- SPNS2 es importante en la función del sistema inmunológico de los mamíferos. [11]
- MYSM1 es importante para la hematopoyesis y la diferenciación de linfocitos . [12]
Ver también
Referencias
- ^ a b c Ayadi A, Birling MC, Bottomley J, et al. (Octubre 2012). "Iniciativas de fenotipado a gran escala de ratón: descripción general de la Clínica Europea de Enfermedad del Ratón (EUMODIC) y del Proyecto de Genética del Ratón del Instituto Wellcome Trust Sanger" . Mamm. Genoma . 23 (9-10): 600-10. doi : 10.1007 / s00335-012-9418-y . PMC 3463797 . PMID 22961258 .
- ^ Gerdin AK (2010). "El programa de genética del ratón Sanger: caracterización de alto rendimiento de ratones knockout". Acta Ophthalmologica . 88 (S248). doi : 10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x . S2CID 85911512 .
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- ^ a b c White JK, Gerdin AK, Karp NA, et al. (Julio 2013). "Generación de todo el genoma y fenotipado sistemático de ratones knockout revela nuevos roles para muchos genes" . Celular . 154 (2): 452–64. doi : 10.1016 / j.cell.2013.06.022 . PMC 3717207 . PMID 23870131 .
- ^ Karp NA, Melvin D, Mott RF (2012). "Análisis robusto y sensible de fenotipos knockout de ratón" . PLoS ONE . 7 (12): e52410. Código bibliográfico : 2012PLoSO ... 752410K . doi : 10.1371 / journal.pone.0052410 . PMC 3530558 . PMID 23300663 .
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enlaces externos
- El portal del ratón Sanger , que contiene todos los datos de MGP
- El MGP Biomart , para la extracción de datos fenotípicos