NLRP1

NLRP1
Estructuras disponibles PDB Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB Lista de códigos de identificación de PDB 1PN5 , 3KAT , 4IFP , 4IM6
Identificadores
Alias	NLRP1 , CARD7, CIDED, CLR17.1, DEFCAP, DEFCAP-L / S, NAC, NALP1, PP1044, SLEV1, VAMAS1, familia NLR, dominio de pirina que contiene 1, dominio de pirina de la familia NLR que contiene 1, MSPC, AIADK, JRRP
Identificaciones externas	OMIM : 606636 MGI : 3582959 HomoloGene : 19080 GeneCards : NLRP1
Ubicación de genes ( humanos ) Chr. Cromosoma 17 (humano) [1] Banda 17p13.2 Comienzo 5.499.427 pb [1] Fin 5.619.424 pb [1]
Ubicación del gen ( ratón ) Chr. Cromosoma 11 (ratón) [2] Banda 11 | 11 B4 Comienzo 71.153.102 pb [2] Fin 71,230,733 pb [2]
Patrón de expresión de ARN Bgee Top expresado en glándula pituitaria circunvolución temporal media médula espinal pituitaria anterior hipotálamo circunvolución frontal superior hipocampo propiamente dicho Medula oblonga Núcleo vestibular superior Más datos de expresión de referencia BioGPS Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes Función molecular unión específica de dominio de proteína unión de nucleótidos Actividad activadora de endopeptidasa de tipo cisteína involucrada en el proceso apoptótico Unión de ATP unión enzimática GO: 0001948 unión a proteínas Componente celular citoplasma complejo inflamasoma núcleo estructura anatómica intracelular nucleoplasma citosol Complejo inflamasoma NLRP1 Proceso biológico proceso apoptótico neuronal regulación del proceso apoptótico activación de la actividad endopeptidasa de tipo cisteína implicada en el proceso apoptótico respuesta al dipéptido de muramilo proceso apoptótico respuesta de defensa a la bacteria regulación de la respuesta inflamatoria proceso del sistema inmunológico respuesta inflamatoria respuesta inmune innata GO: 0022415 proceso viral Ensamblaje del complejo inflamasoma NLRP1 regulación positiva de la actividad endopeptidasa de tipo cisteína implicada en el proceso apoptótico Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	22861	637515
Ensembl	ENSG00000091592	ENSMUSG00000070390
UniProt	Q9C000	Q2LKV5 Q2LKV2 Q2LKW6 Q0GKD5
RefSeq (ARNm)	NM_033007 NM_001033053 NM_014922 NM_033004 NM_033006	NM_001039680 NM_001040696 NM_001162414
RefSeq (proteína)	NP_001028225 NP_055737 NP_127497 NP_127499 NP_127500	NP_001035786 NP_001155886
Ubicación (UCSC)	Crónicas 17: 5,5 - 5,62 Mb	Crónicas 11: 71,15 - 71,23 Mb
Búsqueda en PubMed	[3]	[4]
Wikidata
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NLRP1 codifica NACHT, LRR, FIIND, dominio CARD y dominios PYD que contienen la proteína 1 en humanos. ^{[5] [6] [7]} NLRP1 fue la primera proteína que se demostró que forma un inflamasoma . ^[8] NLRP1 se expresa mediante una variedad de tipos de células , que son predominantemente epiteliales o hematopoyéticas . La expresión también se observa dentro de las estructuras epiteliales glandulares, incluido el revestimiento del intestino delgado , el estómago , el epitelio de las vías respiratorias y en la piel lampiña o glabra. ^[9] Los polimorfismos de NLRP1 se relacionan con manifestaciones cutáneas extraintestinales en la EC.^[9] Su máxima expresión se detectó en piel humana, en psoriasis y en vitiligo. Se encontraron polimorfismos de NLRP1 en el lupus eritematoso y la diabetes tipo 1. ^[10] Se encontró que las variantes de NLRP1 de ratón se activaban tras la escisión N-terminal por la proteasa en elfactor letal del ántrax . ^[8]

Función

Este gen codifica un miembro de la familia Ced-4 de proteínas de apoptosis . Los miembros de la familia Ced contienen un dominio de reclutamiento de caspasas (CARD) y se sabe que son mediadores clave de la muerte celular programada . La proteína codificada contiene un motivo de tipo pirina N-terminal distinto , que posiblemente esté involucrado en interacciones proteína-proteína . La proteína NLRP1 interactúa fuertemente con la caspasa 2 y débilmente con la caspasa 9 . Se demostró que la sobreexpresión de este gen induce piroptosis en las células. Múltiples empalmados alternativamenteSe han encontrado variantes de transcripción que codifican distintas isoformas para este gen, pero no se ha determinado la validez biológica de algunas variantes. ^[7]

Mecanismo de activación

NLRP1 activa una respuesta inmune antibacteriana o antiviral . La respuesta inmune antibacteriana compensa la pérdida de la respuesta MAP quinasa . Los seres humanos producen NLRP1, pero el factor letal no activa la NLRP1 humana. ^{[8] La} NLRP1 podría activarse mediante escisión proteolítica, lo que resultaría en la eliminación de un PYD autoinhibidor y la liberación del dominio CARD, responsable del reclutamiento y activación de pro-caspasa-1 en la forma activa de caspasa-1. ^[8] La activación de NLRP1 humana se puede provocar por varios medios, incluidas las proteasas 3C enterovirales . ^[11] Su función en la inmunidad apenas comienza a entenderse. ^[8]

Interacciones

Se ha demostrado que NLRP1 interactúa con caspasa 9 ^{[12] [13]} y APAF1 . ^{[12] A} través de su dominio FIIND, NLRP1 interactúa directamente con DPP9 y DPP8, que son necesarios para evitar la activación de NLRP1. ^[14]

La pérdida de DPP9 en humanos y ratones da como resultado la activación de NLRP1. ^[15]

Variantes de NLRP1 en humanos

Según lo publicado por Bruno Reversade y sus colegas, se han descrito varias enfermedades mendelianas causadas por mutaciones de la línea germinal NLRP1. ^[16] Estos incluyen el carcinoma palmoplantar autocurativo múltiple, la enfermedad de Nikam familiar y la autoinflamación con artritis y disqueratosis. Las mutaciones en NLRP1, ya sean dominantes o recesivas, tienden a ser alelos de ganancia de función que desencadenan la señalización del inflamasoma con liberación de IL1B e IL18 .

Variantes de NLRP1 en ratones

Los ratones tienen tres parálogos de la Nlrp1 gen ( Nlrp1a, b, c ). Nlrp1c es un pseudogén. ^{[17] El} ratón NLRP1B no se activa mediante un mecanismo de tipo receptor-ligando. Las variantes de NLRP1B de ciertas cepas de ratón endogámicas, BALB / cy 129, pueden ser activadas por la proteasa del factor letal (LF) . El factor letal proteasa es producido y secretado por Bacillus anthracis , el agente del ántrax . ^[18] Junto con el antígeno protector (PA), LF forma una toxina bipartita, la toxina letal. La función de la PA es formar un canal de translocación que libera LF al citosol de la célula huésped., donde LF juega un papel en la respuesta inmune al escindir e inactivar las MAP quinasas. ^{[19] [20]} LF también escinde directamente NLRP1B proximal a su extremo N-terminal , es necesario y suficiente para la formación del inflamasoma NLRP1B y la activación de CASP1. ^[21] La activación de NLRP1B-dependientes inflamasoma respuestas aparece en la defensa del huésped con mecanismo como IL-1β y neutrófilos . ^{[22] [23]} NLRP1B puede funcionar como un sensor de proteasas bacterianas , las respuestas inmunitarias se activan específicamente por factores de virulencia . ^{[24] [25]}

No está claro qué estímulos podrían activar NLRP1A, el otro parálogo de NLRP1 murino funcional conocido. El estudio identificó un ratón que portaba una mutación de ganancia de función sin sentido en NLRP1A (Q593P) que activa las respuestas del inflamasoma . El mecanismo de activación de NLRP1A de tipo salvaje no está claro. ^[26]

Referencias

1. GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000091592 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000070390 - Ensembl , mayo de 2017
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Otras lecturas

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enlaces externos

• Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q9C000 (proteína 1 que contiene dominios NACHT, LRR y PYD) en PDBe-KB .