La familia NhaB ( TC # 2.A.34 ) pertenece a la superfamilia de transportadores de iones (IT) . [1] Se puede encontrar una lista representativa de proteínas que pertenecen a la familia NhaB en la base de datos de clasificación de transportadores .
Los homólogos de NhaB suelen tener aproximadamente 500 residuos de aminoacilo (aas) de longitud y poseen aproximadamente 12 llaves de hélice alfa transmembrana (TMS), aunque algunos miembros difieren en su número de TMS. Los homólogos de NhaB también exhiben una región con similitud de secuencia limitada con una proteína de membrana de 46 kDa de función desconocida de Mycobacterium leprae (spP46838) que también es homóloga a un miembro de las bombas de resistencia al arsenato de bacterias , arqueas y eucariotas ( CT # 3.A.4) ). Solo se han caracterizado funcionalmente proteínas bacterianas gramnegativas .
El E. coli NhaB es 58% idéntico al antiportador Ortólogo Vibrio alginolyticus Na + / H + . [2] Aunque se predice que la última proteína exhibe 10 TMS, la construcción de fusiones NhaB-phoA condujo a la evidencia de un modelo de 9 TMS con el extremo N en el citoplasma y el extremo C en el periplasma . [3] Un residuo de aspartilo ubicado en el centro de la 3ª TMS se conserva en todos los miembros de la familia y es importante para la actividad. [4]
La reacción de transporte generalizada catalizada por NhaB de E. coli es:
2 Na + (entrada) + 3 H + (salida) ⇌ 2 Na + (salida) + 3 H + (entrada).
Ver también
Referencias
- ^ Prakash, Shraddha; Cooper, Garret; Singhi, Soumya; Saier, Milton H. (3 de diciembre de 2003). "La superfamilia de transportadores de iones". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranas . 1618 (1): 79–92. doi : 10.1016 / j.bbamem.2003.10.010 . ISSN 0006-3002 . PMID 14643936 .
- ^ Pinner, E .; Padan, E .; Schuldiner, S. (5 de junio de 1992). "Clonación, secuenciación y expresión del gen nhaB, que codifica un antiportador Na + / H + en Escherichia coli". La revista de química biológica . 267 (16): 11064–11068. ISSN 0021-9258 . PMID 1317851 .
- ^ Enomoto, H .; Unemoto, T .; Nishibuchi, M .; Padan, E .; Nakamura, T. (6 de marzo de 1998). "Estudio topológico del antiportador Vibrio alginolyticus NhaB Na + / H + usando fusiones de genes en células de Escherichia coli". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranas . 1370 (1): 77–86. doi : 10.1016 / s0005-2736 (97) 00245-9 . ISSN 0006-3002 . PMID 9518558 .
- ^ Nakamura, T .; Fujisaki, Y .; Enomoto, H .; Nakayama, Y .; Takabe, T .; Yamaguchi, N .; Uozumi, N. (1 de octubre de 2001). "El residuo aspartato-147 de la tercera región transmembrana del antiportador Na (+) / H (+) NhaB de Vibrio alginolyticus juega un papel en su actividad" . Revista de bacteriología . 183 (19): 5762–5767. doi : 10.1128 / JB.183.19.5762-5767.2001 . ISSN 0021-9193 . PMC 95471 . PMID 11544242 .
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