Este artículo ha sido publicado en la revista revisada por pares PLOS Genetics (2019). Haga clic para ver la versión publicada.
De Wikipedia, la enciclopedia libre
Saltar a navegación Saltar a búsqueda
Modelos para el inicio de la replicación del ADN bacteriano ( A ) y eucariota ( B ). A ) Los cromosomas bacterianos circulares contienen un elemento que actúa en cis , el replicador, que se encuentra en o cerca de los orígenes de replicación. i ) El replicador recluta proteínas iniciadoras de una manera específica de secuencia de ADN, lo que da como resultado la fusión de la hélice de ADN y la carga de la helicasa replicativa en cada una de las hebras de ADN individuales ( ii ). iii ) Los replisomas ensamblados replican bidireccionalmente el ADN para producir dos copias del cromosoma bacteriano. B ) Los cromosomas eucariotas lineales contienen muchos orígenes de replicación. Vinculación del iniciador ( i) facilita la carga de helicasa replicativa ( ii ) en ADN dúplex para autorizar los orígenes. iii ) Se activa un subconjunto de helicasas cargadas para ensamblaje de replisoma. La replicación procede bidireccionalmente desde los orígenes y termina cuando las bifurcaciones de replicación de los orígenes activos adyacentes se encuentran ( iv ).

El origen de la replicación (también llamado origen de la replicación ) es una secuencia particular en un genoma en la que se inicia la replicación. [1] La propagación del material genético entre generaciones requiere la duplicación precisa y oportuna del ADN mediante la replicación semiconservadora antes de la división celular para garantizar que cada célula hija reciba el complemento completo de cromosomas . [2] Esto puede implicar la replicación de ADN en organismos vivos como procariotas y eucariotas, o la de ADN o ARN en virus, como virus de ARN bicatenario .[3] La síntesis de hebras hijas comienza en sitios discretos, denominados orígenes de replicación, y prosigue de manera bidireccional hasta que se replica todo el ADN genómico. A pesar de la naturaleza fundamental de estos eventos, los organismos han desarrollado estrategias sorprendentemente divergentes que controlan el inicio de la replicación. [2] Aunque la estructura de la organización del origen de la replicación y el reconocimiento específicos varían de una especie a otra, se comparten algunas características comunes.

Historia [ editar ]

En la segunda mitad del siglo XIX, el trabajo pionero de Gregor Mendel sobre la herencia de rasgos en plantas de guisantes sugirió que "factores" específicos (hoy establecidos como genes) son responsables de la transferencia de rasgos de organismos entre generaciones. [4] Aunque inicialmente se asumió que las proteínas servían como material hereditario, Avery, MacLeod y McCarty establecieron un siglo después el ADN, que había sido descubierto por Friedrich Miescher , como portador de información genética. [5] Estos hallazgos allanaron el camino para la investigación que descubrió la naturaleza química del ADN y las reglas para codificar la información genética, y finalmente llevaron a la propuesta de la estructura de doble hélice del ADN por Watson.y Crick . [6] Este modelo tridimensional de ADN iluminó los posibles mecanismos mediante los cuales la información genética podría copiarse de una manera semiconservadora antes de la división celular, una hipótesis que más tarde fue apoyada experimentalmente por Meselson y Stahl utilizando la incorporación de isótopos para distinguir entre los padres y los recién sintetizados. ADN. [7] [8] El posterior aislamiento de las ADN polimerasas, las enzimas que catalizan la síntesis de nuevas cadenas de ADN, por parte de Kornberg y sus colegas, fue pionero en la identificación de muchos componentes diferentes de la maquinaria biológica de replicación del ADN, primero en el organismo modelo bacteriano E. coli , pero más tarde también en formas de vida eucariotas.[2] [9]

Funciones [ editar ]

Un requisito previo clave para la replicación del ADN es que debe ocurrir con una fidelidad y eficiencia extremadamente altas exactamente una vez por ciclo celular para evitar la acumulación de alteraciones genéticas con consecuencias potencialmente perjudiciales para la supervivencia celular y la viabilidad del organismo. [10] Los eventos de replicación del ADN incompletos, erróneos o inoportunos pueden dar lugar a mutaciones, poliploidía o aneuploidía cromosómica y variaciones en el número de copias de genes, cada una de las cuales a su vez puede provocar enfermedades, incluido el cáncer. [11] [12]Para garantizar la duplicación completa y precisa de todo el genoma y el flujo correcto de información genética a las células de la progenie, todos los eventos de replicación del ADN no solo están estrictamente regulados con señales del ciclo celular, sino que también están coordinados con otros eventos celulares como la transcripción y la reparación del ADN . [2] [13] [14] [15] Además, las secuencias de origen comúnmente tienen un alto contenido de AT en todos los reinos, ya que las repeticiones de adenina y timina son más fáciles de separar porque sus interacciones de apilamiento de bases no son tan fuertes como las de guanina y citosina. [dieciséis]

La replicación del ADN se divide en diferentes etapas. Durante la iniciación, los mecanismos de replicación, denominados replisomas , se ensamblan en el ADN de forma bidireccional. Estos loci de ensamblaje constituyen los sitios de inicio de la replicación del ADN o los orígenes de la replicación. En la fase de elongación, los replisomas viajan en direcciones opuestas con las horquillas de replicación, desenrollando la hélice de ADN y sintetizando hebras de ADN hijas complementarias utilizando ambas hebras parentales como plantillas. Una vez que se completa la replicación, los eventos de terminación específicos conducen al desensamblaje de los replisomas. Siempre que se duplique todo el genoma antes de la división celular, se podría suponer que la ubicación de los sitios de inicio de la replicación no importa; sin embargo, se ha demostrado que muchos organismos utilizan regiones genómicas preferidas como orígenes. [17][18] La necesidad de regular la ubicación del origen probablemente surge de la necesidad de coordinar la replicación del ADN con otros procesos que actúan sobre la plantilla de cromatina compartida para evitar roturas de la cadena de ADN y daños en el ADN. [2] [12] [15] [19] [20] [21] [22] [23]

Modelo de replicón [ editar ]

Hace más de cinco décadas, Jacob , Brenner y Cuzin propusieron la hipótesis del replicón para explicar la regulación de la síntesis de ADN cromosómico en E. coli . [24] El modelo postula que un factor de acción trans difusible, un llamado iniciador, interactúa con un elemento de ADN que actúa en cis , el replicador, para promover el inicio de la replicación en un origen cercano. Una vez unidos a los replicadores, los iniciadores (a menudo con la ayuda de proteínas co-cargadoras) depositan helicasas replicativasen el ADN, que posteriormente impulsa el reclutamiento de componentes replisomas adicionales y el ensamblaje de toda la maquinaria de replicación. Por tanto, el replicador especifica la ubicación de los eventos de iniciación de la replicación, y la región cromosómica que se replica a partir de un solo origen o evento de iniciación se define como el replicón. [2]

Una característica fundamental de la hipótesis del replicón es que se basa en la regulación positiva para controlar el inicio de la replicación del ADN, lo que puede explicar muchas observaciones experimentales en sistemas bacterianos y fagos. [24] Por ejemplo, explica el fracaso de los ADN extracromosómicos sin origen para replicarse cuando se introducen en las células huésped. Además, racionaliza las incompatibilidades de plásmidos en E. coli, donde ciertos plásmidos desestabilizan la herencia de los demás debido a la competencia por la misma maquinaria de iniciación molecular. [25] Por el contrario, un modelo de regulación negativa (análogo al modelo de operador de replicón para la transcripción) no explica los hallazgos anteriores. [24]No obstante, la investigación posterior a la propuesta del modelo de replicón de Jacob, Brenner y Cuzin ha descubierto muchas capas adicionales de control de replicación en bacterias y eucariotas que comprenden elementos reguladores tanto positivos como negativos, destacando tanto la complejidad como la importancia de restringir la replicación del ADN temporal y espacialmente. . [2] [26] [27] [28]

El concepto de replicador como entidad genética ha demostrado ser muy útil en la búsqueda de identificar secuencias de ADN replicador y proteínas iniciadoras en procariotas , y hasta cierto punto también en eucariotas , aunque la organización y complejidad de los replicadores difieren considerablemente entre los dominios de la vida. [29] [30] Si bien los genomas bacterianos generalmente contienen un solo replicador que se especifica mediante elementos de secuencia de ADN de consenso y que controla la replicación de todo el cromosoma, la mayoría de los replicadores eucariotas, con la excepción de la levadura en ciernes, no están definidos a nivel de ADN. secuencia; en cambio, parecen estar especificadas combinatoriamente por señales de cromatina y estructurales del ADN local . [31] [32][33] [34] [35] [36] [37] [38] [39] [40] Los cromosomas eucariotas también son mucho más grandes que sus homólogos bacterianos, lo que aumenta la necesidad de iniciar la síntesis de ADN de muchos orígenes simultáneamente para garantizar la replicación oportuna de todo el genoma. Además, se cargan muchas más helicasas replicativas de las que se activan para iniciar la replicación en un ciclo celular dado. La definición de replicadores basada en el contexto y la selección de orígenes sugiere un modelo de replicón relajado en sistemas eucariotas que permite flexibilidad en el programa de replicación del ADN. [29]Aunque los replicadores y los orígenes se pueden espaciar físicamente en los cromosomas, a menudo se co-localizan o se encuentran muy cerca; Por simplicidad, nos referiremos a ambos elementos como "orígenes" a lo largo de esta revisión. En conjunto, el descubrimiento y aislamiento de secuencias de origen en varios organismos representa un hito significativo hacia la obtención de una comprensión mecanicista de la iniciación de la replicación. Además, estos logros tuvieron profundas implicaciones biotecnológicas para el desarrollo de vectores lanzadera que pueden propagarse en células bacterianas, de levadura y de mamíferos. [2] [41] [42] [43]

Bacteriano [ editar ]

Organización de origen y reconocimiento en bacterias. A ) Esquema de la arquitectura del origen de E. coli oriC , Thermotoga maritima oriC y el origen bipartito en Helicobacter pylori . El DUE está flanqueado en un lado por varias cajas de DnaA de alta y débil afinidad, como se indica para E. coli oriC . B ) Organización del dominio del iniciador de E. coli DnaA. El círculo magenta indica el sitio de unión del ADN monocatenario. C) Modelos para reconocimiento de origen y fusión por DnaA. En el modelo de dos estados (panel izquierdo), los protómeros de DnaA pasan de un modo de unión de dsDNA (mediado por los dominios HTH que reconocen cajas de DnaA) a un modo de unión de ssDNA (mediado por los dominios AAA +). En el modelo de bucle invertido, el ADN se dobla bruscamente hacia atrás sobre el filamento de DnaA (facilitado por la proteína reguladora IHF) [44] de modo que un solo protómero se une a las regiones dúplex y monocatenarias. En cualquier caso, el filamento de DnaA funde el dúplex de ADN y estabiliza la burbuja de iniciación antes de la carga de la helicasa replicativa (DnaB en E. coli ). HTH: dominio de hélice-giro-hélice, DUE: elemento de desenrollado del ADN, IHF: factor de integración del huésped.

La mayoría de los cromosomas bacterianos son circulares y contienen un solo origen de replicación cromosómica ( oriC ). Las regiones bacterianas oriC son sorprendentemente diversas en tamaño (que van desde 250 pb a 2 kpb), secuencia y organización; [45] [46] no obstante, su capacidad para impulsar el inicio de la replicación generalmente depende de la lectura específica de la secuencia de los elementos de ADN de consenso por parte del iniciador bacteriano, una proteína llamada DnaA. [47] [48] [49] [50] Los orígenes de las bacterias son continuos o bipartitos y contienen tres elementos funcionales que controlan la actividad del origen: repeticiones de ADN conservadas que son reconocidas específicamente por DnaA (llamadas cajas de DnaA), un Elemento de desenrollado de ADN(DUE) y sitios de unión para proteínas que ayudan a regular el inicio de la replicación. [17] [51] [52] Las interacciones de DnaA tanto con las regiones de la caja de DnaA de cadena doble (ds) como con el ADN de cadena sencilla (ss) en el DUE son importantes para la activación del origen y están mediadas por diferentes dominios en el proteína iniciadora: un elemento de unión al ADN Helix-turn-helix (HTH) y una ATPasa asociada con varias actividades celulares ( AAA + ) de dominio, respectivamente. [53] [54] [55] [56] [57] [58] [59]Si bien la secuencia, el número y la disposición de las cajas de DnaA asociadas al origen varían en todo el reino bacteriano, su ubicación y espaciamiento específicos en una especie dada son críticos para la función oriC y para la formación del complejo de iniciación productiva. [2] [45] [46] [60] [61] [62] [63] [64]

Entre las bacterias, E. coli es un sistema modelo particularmente poderoso para estudiar la organización, el reconocimiento y el mecanismo de activación de los orígenes de la replicación. E. coli oriC comprende una región de aproximadamente ~ 260 pb que contiene cuatro tipos de elementos de unión del iniciador que difieren en sus afinidades por DnaA y sus dependencias en el cofactor ATP . Las cajas de DnaA R1, R2 y R4 constituyen sitios de alta afinidad que están unidos por el dominio HTH de DnaA independientemente del estado de unión a nucleótidos del iniciador. [47] [65] [66] [67] [68] [69]Por el contrario, los sitios I, τ y C, que están intercalados entre los sitios R, son cajas de DnaA de baja afinidad y se asocian preferentemente con DnaA unido a ATP, aunque ADP-DnaA puede sustituir a ATP-DnaA en determinadas condiciones. condiciones. [70] [71] [72] [63] La unión de los dominios HTH a los elementos de reconocimiento de DnaA de alta y baja afinidad promueve la oligomerización de orden superior dependiente de ATP de los módulos AAA + de DnaA en un filamento derecho que envuelve el ADN dúplex alrededor de su superficie exterior, generando así una torsión superhelical que facilita la fusión del DUE rico en AT adyacente. [53] [73] [74] [75]La separación de la hebra de ADN también se ve favorecida por las interacciones directas del dominio AAA + ATPasa de DnaA con repeticiones de tripletes, las denominadas tríos de DnaA, en la región DUE proximal. [76] El acoplamiento de los segmentos de trinucleótidos monocatenarios por el filamento iniciador estira el ADN y estabiliza la burbuja de iniciación al evitar el recocido. [57] El elemento de origen DnaA-trio se conserva en muchas especies bacterianas, lo que indica que es un elemento clave para la función de origen. [76] Después de la fusión, el DUE proporciona un sitio de entrada para la helicasa replicativa DnaB de E. coli , que se deposita en cada una de las cadenas individuales de ADN por su proteína cargadora DnaC. [2]

Aunque las diferentes actividades de unión al ADN del DnaA se han estudiado ampliamente bioquímicamente y se han determinado varias estructuras unidas a apo , ssDNA o dsDNA, [56] [57] [58] [74] la arquitectura exacta del DnaA de orden superior - El montaje de iniciación de oriC sigue sin estar claro. Se han propuesto dos modelos para explicar la organización de los elementos de origen esenciales y la fusión de oriC mediada por DnaA . El modelo de dos estados asume un filamento de DnaA continuo que cambia de un modo de unión de dsDNA (el complejo organizador) a un modo de unión de ssDNA en el DUE (el complejo de fusión). [74] [77] Por el contrario, en el modelo de bucle invertido , el ADN está muy doblado en oriCy se pliega sobre el filamento iniciador de modo que los protómeros de DnaA se acoplan simultáneamente a regiones de ADN de hebra doble y simple. [78] Elucidar cómo exactamente el ADN oriC está organizado por DnaA sigue siendo, por tanto, una tarea importante para estudios futuros. Los conocimientos sobre la arquitectura del complejo de iniciación ayudarán a explicar no solo cómo se funde el ADN de origen, sino también cómo se carga direccionalmente una helicasa replicativa en cada una de las hebras de ADN individuales expuestas en el DUE desenrollado, y cómo estos eventos son ayudados por las interacciones de la helicasa con las proteínas iniciadoras y cargadoras específicas. [2]

Archaeal [ editar ]

Organización de origen y reconocimiento en arqueas. A ) El cromosoma circular de Sulfolobus solfataricus contiene tres orígenes diferentes. B ) Disposición de los sitios de unión del iniciador en dos orígenes de S. solfataricus , oriC1 y oriC2. La asociación de Orc1-1 con elementos ORB se muestra para oriC1. También se indican elementos de reconocimiento para parámetros adicionales de Orc1 / Cdc6, mientras que se han omitido los sitios de unión WhiP. C ) Arquitectura de dominio de los parálogos archaeal Orc1 / Cdc6. La orientación de los elementos ORB en los orígenes conduce a la unión direccional de Orc1 / Cdc6 y carga MCM entre ORB opuestos (en B). (m) ORB - (mini-) casilla de reconocimiento de origen, DUE - elemento de desenrollado de ADN, WH - dominio de hélice alada.

Los orígenes de la replicación de las arqueas comparten algunas, pero no todas, las características organizativas del oriC bacteriano . A diferencia de las bacterias, las arqueas a menudo inician la replicación a partir de múltiples orígenes por cromosoma (se han informado de uno a cuatro); [79] [80] [81] [82] [83] [84] [85] [86] [46] Sin embargo, los orígenes de las arqueas también tienen regiones de secuencia especializadas que controlan la función del origen. [87] [88] [89] Estos elementos incluyen tanto cajas de reconocimiento de origen de secuencias de ADN específicas (ORB o miniORB) como un DUE rico en AT que está flanqueado por una o varias regiones ORB. [85] [90]Los elementos ORB muestran un grado considerable de diversidad en términos de su número, disposición y secuencia, tanto entre diferentes especies de arqueas como entre diferentes orígenes dentro de una sola especie. [80] [85] [91] El iniciador, Orc1 / Cdc6, introduce un grado adicional de complejidad en las arqueas, que se une a las regiones ORB. Los genomas de Archaeal típicamente codifican múltiples parálogos de Orc1 / Cdc6 que varían sustancialmente en sus afinidades por distintos elementos ORB y que contribuyen de manera diferente a las actividades de origen. [85] [92] [93] [94] En Sulfolobus solfataricus, por ejemplo, se han cartografiado tres orígenes cromosómicos (oriC1, oriC2 y oriC3), y los estudios bioquímicos han revelado patrones de unión complejos de iniciadores en estos sitios. [85] [86] [95] [96] El iniciador afín de oriC1 es Orc1-1, que se asocia con varios ORB en este origen. [85] [93] OriC2 y oriC3 están unidos por Orc1-1 y Orc1-3. [85] [93] [96] Por el contrario, un tercer parálogo, Orc1-2, imprime huellas en los tres orígenes, pero se ha postulado que regula negativamente el inicio de la replicación. [85] [96]Además, se ha demostrado que la proteína WhiP, un iniciador no relacionado con Orc1 / Cdc6, se une a todos los orígenes y también impulsa la actividad del origen de oriC3 en el Sulfolobus islandicus estrechamente relacionado . [93] [95] Debido a que los orígenes de las arqueas a menudo contienen varios elementos ORB adyacentes, múltiples parálogos Orc1 / Cdc6 pueden reclutarse simultáneamente en un origen y oligomerizar en algunos casos; [94] [97] sin embargo, en contraste con el DnaA bacteriano, la formación de un ensamblaje iniciador de orden superior no parece ser un prerrequisito general para la función de origen en el dominio de las arqueas. [2]

Los estudios estructurales han proporcionado información sobre cómo el arqueal Orc1 / Cdc6 reconoce los elementos ORB y remodela el ADN de origen. [97] [98] Los parálogos Orc1 / Cdc6 son proteínas de dos dominios y están compuestos por un módulo AAA + ATPasa fusionado a un pliegue de hélice alada C-terminal. [99] [100] [101] Las estructuras complejadas con ADN de Orc1 / Cdc6 revelaron que los ORB están unidos por un monómero Orc1 / Cdc6 a pesar de la presencia de secuencias repetidas invertidas dentro de los elementos ORB. [97] [98] Tanto la ATPasa como las regiones de hélice alada interactúan con el dúplex de ADN pero contactan asimétricamente la secuencia de repetición del ORB palindrómico, lo que orienta a Orc1 / Cdc6 en una dirección específica en la repetición. [97] [98]Curiosamente, los elementos ORB o miniORB que flanquean DUE a menudo tienen polaridades opuestas, [80] [85] [94] [102] [103] lo que predice que los subdominios de la tapa AAA + y los dominios de hélice alada de Orc1 / Cdc6 se colocan en a ambos lados del DUE de manera que se enfrenten entre sí. [97] [98] Dado que ambas regiones de Orc1 / Cdc6 se asocian con una helicasa replicativa de mantenimiento de minicromosomas (MCM), [104] [105] esta disposición específica de elementos ORB y Orc1 / Cdc6 es probablemente importante para cargar dos complejos MCM simétricamente en el DUE. [85]Sorprendentemente, mientras que la secuencia de ADN de ORB determina la direccionalidad de la unión de Orc1 / Cdc6, el iniciador hace relativamente pocos contactos específicos de secuencia con el ADN. [97] [98] Sin embargo, Orc1 / Cdc6 se enrolla y dobla severamente el ADN, lo que sugiere que se basa en una mezcla de secuencia de ADN y características estructurales de ADN dependientes del contexto para reconocer los orígenes. [97] [98] [106] En particular, el emparejamiento de bases se mantiene en el dúplex de ADN distorsionado tras la unión de Orc1 / Cdc6 en las estructuras cristalinas, [97] [98] mientras que los estudios bioquímicos han arrojado hallazgos contradictorios sobre si los iniciadores de arqueas pueden derretirse ADN de manera similar al ADN bacteriano. [93] [94] [107]Aunque el parentesco evolutivo de iniciadores de arqueas y eucariotas y helicasas replicativas indica que es probable que la MCM de arqueas se cargue en el ADN dúplex (ver la siguiente sección), el orden temporal de fusión de origen y la carga de helicasa, así como el mecanismo para la fusión del ADN de origen, en la Por lo tanto, queda por establecer claramente los sistemas. Del mismo modo, en estudios futuros se debe abordar exactamente cómo se carga exactamente la helicasa MCM en el ADN. [2]

Eucariota [ editar ]

Organización de origen y reconocimiento en eucariotas. Los elementos específicos del ADN y las características epigenéticas implicadas en el reclutamiento de ORC y la función de origen se resumen para los orígenes de S. cerevisiae , S. pombe y metazoos. También se muestra un esquema de la arquitectura ORC, destacando la disposición de los dominios AAA + y de hélice alada en un anillo pentamérico que rodea el ADN de origen. Se incluyen los dominios auxiliares de varias subunidades de ORC implicadas en la orientación de ORC a los orígenes. Otras regiones de las subunidades de ORC también pueden participar en el reclutamiento del iniciador, ya sea asociándose directa o indirectamente con proteínas asociadas. Se enumeran algunos ejemplos. Tenga en cuenta que el dominio BAH en S. cerevisiae Orc1 se une a nucleosomas [108]pero no reconoce H4K20me2. [109] BAH - dominio de homología adyacente al bromo, WH - dominio de hélice alada, TFIIB - dominio de tipo B del factor de transcripción II en Orc6, G4 - G cuádruplex, OGRE - elemento repetido rico en G de origen.

La organización, especificación y activación del origen en eucariotas son más complejas que en dominios bacterianos o arqueales y se desvían significativamente del paradigma establecido para el inicio de la replicación procariota. Los grandes tamaños del genoma de las células eucariotas, que van desde 12 Mbp en S. cerevisiae a 3 Gbp en humanos, requieren que la replicación del ADN comience en varios cientos (en levaduras en ciernes) hasta decenas de miles (en humanos) orígenes para completar la replicación del ADN de todos los cromosomas durante cada ciclo celular. [27] [36] Con la excepción de S. cerevisiae y Saccharomycotina relacionadaespecies, los orígenes eucariotas no contienen elementos de secuencia de ADN de consenso, pero su ubicación está influenciada por señales contextuales como la topología del ADN local, las características estructurales del ADN y el entorno de la cromatina. [110] [35] [37] No obstante, la función de origen eucariota todavía depende de un complejo proteico iniciador conservado para cargar helicasas replicativas en el ADN durante las fases tardías M y G1 del ciclo celular, un paso conocido como licencia de origen. [111] A diferencia de sus contrapartes bacterianas, las helicasas replicativas en eucariotas se cargan en el ADN dúplex de origen en una forma inactiva, doble hexamérica y solo un subconjunto de ellas (10-20% en células de mamíferos) se activa durante cualquier fase S determinada., eventos que se conocen como activación de origen. [112] [113] [114] Por lo tanto, la ubicación de los orígenes eucariotas activos se determina en al menos dos niveles diferentes, la concesión de licencias de origen para marcar todos los orígenes potenciales y la activación de origen para seleccionar un subconjunto que permita el ensamblaje de la maquinaria de replicación y el inicio de Síntesis de ADN. Los orígenes con licencia adicional sirven como respaldo y se activan solo al ralentizar o estancar las horquillas de replicación cercanas, lo que garantiza que la replicación del ADN se pueda completar cuando las células se encuentren con estrés de replicación. [115] [116]Juntos, el exceso de orígenes autorizados y el estricto control del ciclo celular de las licencias de origen y el despido incorporan dos estrategias importantes para prevenir la replicación insuficiente y excesiva y para mantener la integridad de los genomas eucariotas. [2]

Los primeros estudios en S. cerevisiae indicaron que los orígenes de replicación en eucariotas podrían reconocerse de una manera específica de secuencia de ADN de forma análoga a los de procariotas. En la levadura en gemación, la búsqueda de replicadores genéticos conduce a la identificación de secuencias de replicación autónoma (ARS) que apoyan la iniciación eficiente de la replicación del ADN del ADN extracromosómico. [117] [118] [119] Estas regiones ARS tienen aproximadamente 100-200 pb de largo y exhiben una organización multipartita, que contiene elementos A, B1, B2 y, a veces, B3 que juntos son esenciales para la función de origen. [120] [121] El elemento A abarca la secuencia consenso ARS (ACS) de 11 pb conservada, [122] [123]que, junto con el elemento B1, constituye el sitio de unión primario para el complejo de reconocimiento de origen heterohexámero (ORC), el iniciador de la replicación eucariota. [124] [125] [126] [127] Dentro de ORC, cinco subunidades se basan en AAA + ATPasa conservada y pliegues de hélice alada y se ensamblan conjuntamente en un anillo pentamérico que rodea el ADN. [127] [128] [129] En el ORC de levadura en ciernes, los elementos de unión al ADN en los dominios de la ATPasa y la hélice alada, así como las regiones del parche básico adyacente en algunas de las subunidades del ORC, se colocan en el poro central del anillo ORC de manera que ayuden al reconocimiento específico de la secuencia de ADN del ACS de una manera dependiente de ATP. [127] [130]Por el contrario, los roles de los elementos B2 y B3 son menos claros. La región B2 es similar a la ACS en secuencia y se ha sugerido que funciona como un segundo sitio de unión a ORC bajo ciertas condiciones, o como un sitio de unión para el núcleo de helicasa replicativo. [131] [132] [133] [134] [135] A la inversa, el elemento B3 recluta el factor de transcripción Abf1, aunque B3 no se encuentra en todos los orígenes de levadura en gemación y la unión de Abf1 no parece ser estrictamente esencial para la función de origen. [2] [120] [136] [137]

El reconocimiento de origen en eucariotas distintos de S. cerevisiae o sus parientes cercanos no se ajusta a la lectura específica de secuencia de los elementos de ADN de origen conservados. Las búsquedas para aislar secuencias replicadoras cromosómicas específicas de manera más general en especies eucariotas, ya sea genéticamente o mediante el mapeo de todo el genoma de la unión del iniciador o los sitios de inicio de la replicación, no han logrado identificar secuencias de consenso claras en los orígenes. [138] [139] [140] [141] [142] [143] [144] [145] [146] [147] [148] [149]Por lo tanto, las interacciones ADN-iniciador de secuencia específica en la levadura en gemación significan un modo especializado para el reconocimiento del origen en este sistema en lugar de un modo arquetípico para la especificación del origen en el dominio eucariota. No obstante, la replicación del ADN se inicia en sitios discretos que no están distribuidos aleatoriamente entre los genomas eucariotas, argumentando que los medios alternativos determinan la ubicación cromosómica de los orígenes en estos sistemas. Estos mecanismos implican una interacción compleja entre la accesibilidad del ADN, el sesgo de la secuencia de nucleótidos (tanto la riqueza de AT como las islas CpG se han relacionado con los orígenes), el posicionamiento de los nucleosomas , las características epigenéticas , la topología del ADN y ciertas características estructurales del ADN (por ejemplo, motivos G4), así como como proteínas reguladoras e interferencia transcripcional. [17][18] [34] [35] [37] [150] [151] [143] [152] Es importante señalar que las propiedades de origen varían no solo entre los diferentes orígenes de un organismo y entre las especies, sino que algunas también pueden cambiar durante el desarrollo y la célula. diferenciación. El locus del corion en lascélulas del folículo de Drosophila constituye un ejemplo bien establecido para el control espacial y del desarrollo de los eventos de iniciación. Esta región experimenta una amplificación genética dependiente de la replicación del ADN en una etapa definida durante la ovogénesis y se basa en la activación oportuna y específica de los orígenes del corion, que a su vez está regulada por elementos cis específicos del origen y varios factores proteicos, incluido el complejo Myb, E2F1 y E2F2. [153] [154] [155][156] [157] Esta especificación combinatoria y regulación multifactorial de los orígenes de los metazoos ha complicado la identificación de características unificadoras que determinan la ubicación de los sitios de inicio de replicación en eucariotas de manera más general. [2]

Para facilitar el inicio de la replicación y el reconocimiento del origen, los ensamblajes de ORC de varias especies han desarrollado dominios auxiliares especializados que se cree que ayudan a que el iniciador se dirija a los orígenes cromosómicos o cromosomas en general. Por ejemplo, la subunidad Orc4 en S. pombe ORC contiene varios AT-hooks que se unen preferentemente a ADN rico en AT, [158] mientras que en metazoan ORC se cree que el dominio TFIIB de Orc6 realiza una función similar. [159] Las proteínas Metazoan Orc1 también albergan un dominio de homología bromo-adyacente (BAH) que interactúa con los nucleosomas H4K20me2. [109]Particularmente en células de mamíferos, se ha informado que la metilación de H4K20 es necesaria para un inicio de replicación eficaz, y el dominio Orc1-BAH facilita la asociación de ORC con cromosomas y la replicación dependiente del origen del virus de Epstein-Barr. [160] [161] [162] [163] [164] Por lo tanto, es intrigante especular que ambas observaciones están vinculadas mecánicamente al menos en un subconjunto de metazoos, pero esta posibilidad debe explorarse más en estudios futuros. Además del reconocimiento de ciertas características epigenéticas o de ADN, ORC también se asocia directa o indirectamente con varias proteínas asociadas que podrían ayudar al reclutamiento del iniciador, incluidas LRWD1, PHIP (o DCAF14), HMGA1a, entre otras. [33] [165] [166][167] [168] [169] [170] [171] Curiosamente, Drosophila ORC, como su contraparte de levadura en ciernes, dobla el ADN y se ha informado que el superenrollamiento negativo mejora la unión del ADN de este complejo, lo que sugiere que la forma y maleabilidad del ADN podrían influir la ubicación de los sitios de unión de ORC a través de los genomas de metazoos. [31] [127] [172] [173] [174] Una comprensión molecular de cómo las regiones de unión al ADN de ORC podrían respaldar la lectura de las propiedades estructurales del dúplex de ADN en metazoos en lugar de secuencias de ADN específicas como en S. cerevisiaeespera información estructural de alta resolución de conjuntos iniciadores de metazoos unidos al ADN. Del mismo modo, si los diferentes factores epigenéticos contribuyen al reclutamiento del iniciador en los sistemas de metazoos, y cómo, está mal definido y es una cuestión importante que debe abordarse con más detalle. [2]

Una vez reclutados en los orígenes, ORC y sus cofactores Cdc6 y Cdt1 impulsan la deposición del complejo de mantenimiento de minicromosomas 2-7 (Mcm2-7) en el ADN. [111] [175] Al igual que el núcleo de helicasa replicativa de arqueas, Mcm2-7 se carga como un doble hexámero de cabeza a cabeza en el ADN para autorizar los orígenes. [112] [113] [114] En la fase S, la quinasa dependiente de Dbf4 (DDK) y la quinasa dependiente de ciclina (CDK) fosforilan varias subunidades de Mcm2-7 y factores de iniciación adicionales para promover el reclutamiento de los coactivadores de helicasa Cdc45 y GINS, fusión de ADN y, en última instancia, ensamblaje de replisoma bidireccional en un subconjunto de los orígenes autorizados. [28] [176]Tanto en la levadura como en los metazoos, los orígenes están libres o sin nucleosomas, una propiedad que es crucial para la carga de Mcm2-7, lo que indica que el estado de la cromatina en los orígenes regula no solo el reclutamiento del iniciador sino también la carga de helicasa. [144] [177] [178] [179] [180] [181] Un entorno de cromatina permisivo es aún más importante para la activación del origen y se ha implicado en la regulación tanto de la eficiencia del origen como del tiempo de activación del origen. Los orígenes eucromáticos contienen típicamente marcas de cromatina activas, se replican temprano y son más eficientes que los orígenes heterocromáticos de replicación tardía , que a la inversa se caracterizan por marcas represivas. [27] [179] [182]No es sorprendente que varios remodeladores de la cromatina y enzimas modificadoras de la cromatina se ha encontrado que se asocian con orígenes y factores cierta iniciación, [183] [184] , pero cómo sus actividades de impacto diferentes eventos de iniciación de la replicación en gran medida sigue siendo oscuro. Sorprendentemente, los "elementos de control de la replicación temprana" (ECRE) que actúan en cis también se han identificado recientemente para ayudar a regular el tiempo de replicación e influir en la arquitectura del genoma 3D en células de mamíferos. [185] Comprender los mecanismos moleculares y bioquímicos que orquestan esta compleja interacción entre la organización del genoma en 3D, la estructura de la cromatina local y de orden superior y la iniciación de la replicación es un tema interesante para futuros estudios. [2]

¿Por qué los orígenes de la replicación de los metazoos han divergido del paradigma de reconocimiento específico de la secuencia de ADN que determina los sitios de inicio de la replicación en procariotas y levaduras en gemación? Las observaciones de que los orígenes de los metazoos a menudo se co-localizan con regiones promotoras en Drosophila y células de mamíferos y que los conflictos de replicación-transcripción debidos a colisiones de las maquinarias moleculares subyacentes pueden provocar daños en el ADN sugieren que la coordinación adecuada de la transcripción y replicación es importante para mantener la estabilidad del genoma. [139] [141] [143] [146] [186] [20] [187] [188]Los hallazgos recientes también apuntan a un papel más directo de la transcripción al influir en la ubicación de los orígenes, ya sea inhibiendo la carga de Mcm2-7 o reposicionando la Mcm2-7 cargada en los cromosomas. [189] [152] La unión del iniciador independiente de la secuencia (pero no necesariamente al azar) al ADN permite además flexibilidad para especificar los sitios de carga de helicasa y, junto con la interferencia transcripcional y la variabilidad en las eficiencias de activación de los orígenes autorizados, probablemente determina la ubicación del origen y contribuye a la co-regulación de la replicación del ADN y los programas de transcripción durante el desarrollo y las transiciones del destino celular. Modelado computacional de eventos de iniciación en S. pombe, así como la identificación de orígenes específicos de tipo celular y regulados por el desarrollo en metazoos, están de acuerdo con esta noción. [140] [148] [190] [191] [192] [193] [194] [152] Sin embargo, también existe un gran grado de flexibilidad en la elección del origen entre diferentes células dentro de una misma población, [143] [149] [191] aunque los mecanismos moleculares que conducen a la heterogeneidad en el uso del origen siguen estando mal definidos. Mapear los orígenes en células individuales en sistemas de metazoos y correlacionar estos eventos de iniciación con la expresión génica unicelular y el estado de la cromatina será importante para dilucidar si la elección del origen es puramente estocástica o está controlada de una manera definida.[2]

Viral [ editar ]

Genoma del herpesvirus-6 humano , miembro de la familia Herpesviridae . El origen de la replicación se etiqueta como "OOR".

Los virus a menudo poseen un solo origen de replicación.

Se ha descrito una variedad de proteínas implicadas en la replicación viral. Por ejemplo, los virus de polioma utilizan ADN polimerasas de la célula huésped , que se adhieren a un origen viral de replicación si el antígeno T está presente.

Variaciones [ editar ]

Aunque la replicación del ADN es esencial para la herencia genética, los orígenes de replicación definidos y específicos del sitio no son técnicamente un requisito para la duplicación del genoma siempre que todos los cromosomas se copien en su totalidad para mantener el número de copias de genes. Ciertos bacteriófagos y virus, por ejemplo, pueden iniciar la replicación del ADN mediante recombinación homóloga independiente de los orígenes dedicados. [195] Del mismo modo, el arqueón Haloferax volcanii utiliza la iniciación dependiente de la recombinación para duplicar su genoma cuando se eliminan sus orígenes endógenos. [81] Se han informado eventos de iniciación no canónicos similares a través de la replicación inducida por ruptura o iniciada por transcripción en E. coli y S. cerevisiae . [196][197] [198] [199] [200] No obstante, a pesar de la capacidad de las células para mantener la viabilidad en estas circunstancias excepcionales, la iniciación dependiente del origen es una estrategia común adoptada universalmente en diferentes dominios de la vida. [2]

Además, los estudios detallados de la iniciación de la replicación se han centrado en un número limitado de sistemas modelo. Los hongos y metazoos ampliamente estudiados son miembros del supergrupo de opistocontes y ejemplifican solo una pequeña fracción del paisaje evolutivo en el dominio eucariota. [201] Comparativamente, se han dirigido pocos esfuerzos a otros sistemas modelo eucariotas, como cinetoplastidos o tetrahymena. [202] [203] [204] [205] [206] [207] [208] Sorprendentemente, estos estudios han revelado diferencias interesantes tanto en las propiedades de origen como en la composición del iniciador en comparación con la levadura y los metazoos. [2]

Ver también [ editar ]

  • OriDB, la base de datos de origen de la replicación de ADN
  • Origen de la transferencia

Referencias [ editar ]

Este artículo fue adaptado de la siguiente fuente bajo una licencia CC BY 4.0 ( 2019 ) ( informes de los revisores ): Babatunde Ekundayo; Franziska Bleichert (12 de septiembre de 2019). "Orígenes de la replicación del ADN" . PLOS Genetics . 15 (9): e1008320. doi : 10.1371 / JOURNAL.PGEN.1008320 . ISSN  1553-7390 . PMC  6742236 . PMID  31513569 . Wikidata  Q86320168 .

  1. ^ Glosario técnico Edward K. Wagner, Martinez Hewlett, David Bloom y David Camerini Virología básica Tercera edición, Blackwell publishing, 2007 ISBN 1-4051-4715-6 
  2. ^ a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u Ekundayo B, Bleichert F (septiembre de 2019). "Orígenes de la replicación del ADN" . PLOS Genetics . 15 (9): e1008320. doi : 10.1371 / journal.pgen.1008320 . PMC 6742236 . PMID 31513569 .   El material se copió de esta fuente, que está disponible bajo una licencia internacional Creative Commons Attribution 4.0 .
  3. ^ Hulo C, de Castro E, Masson P, Bougueleret L, Bairoch A, Xenarios I, Le Mercier P (enero de 2011). "ViralZone: un recurso de conocimiento para comprender la diversidad de virus" . Investigación de ácidos nucleicos . 39 (Problema de la base de datos): D576-82. doi : 10.1093 / nar / gkq901 . PMC 3013774 . PMID 20947564 .  
  4. ^ Mendel JG (1866). "Versuche über Pflanzenhybriden" . Verhandlungen des naturforschenden Vereines en Brünn . Im Verlage des Vereines. págs. 3-47.Para la traducción al inglés, ver: Druery C, Bateson W (1901). "Experimentos en hibridación de plantas" (PDF) . Revista de la Royal Horticultural Society . 26 : 1–32 . Consultado el 9 de octubre de 2009 .
  5. ^ Avery OT, Macleod CM, McCarty M (febrero de 1944). "Estudios sobre la naturaleza química de la sustancia que induce la transformación de tipos neumocócicos: inducción de la transformación por una fracción de ácido desoxirribonucleico aislada de neumococo tipo III" . La Revista de Medicina Experimental . 79 (2): 137–58. doi : 10.1084 / jem.79.2.137 . PMC 2135445 . PMID 19871359 .  
  6. ^ Watson JD, Crick FH (1953). "La estructura del ADN". Simposios de Cold Spring Harbor sobre biología cuantitativa . 18 : 123–31. doi : 10.1101 / sqb.1953.018.01.020 . PMID 13168976 . 
  7. ^ Meselson M, Stahl FW (julio de 1958). "La replicación del ADN en Escherichia coli" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 44 (7): 671–82. Código Bibliográfico : 1958PNAS ... 44..671M . doi : 10.1073 / pnas.44.7.671 . PMC 528642 . PMID 16590258 .  
  8. ↑ Meselson M, Stahl FW (1958). "La replicación del ADN". Simposios de Cold Spring Harbor sobre biología cuantitativa . 23 : 9-12. doi : 10.1101 / sqb.1958.023.01.004 . PMID 13635537 . 
  9. ^ Lehman IR, Bessman MJ, Simms ES, Kornberg A (julio de 1958). "Síntesis enzimática de ácido desoxirribonucleico. I. Preparación de sustratos y purificación parcial de una enzima de Escherichia coli" . La Revista de Química Biológica . 233 (1): 163–70. doi : 10.1016 / S0021-9258 (19) 68048-8 . PMID 13563462 . 
  10. ^ O'Donnell M, Langston L, Stillman B (julio de 2013). "Principios y conceptos de la replicación del ADN en bacterias, arqueas y eukarya" . Perspectivas de Cold Spring Harbor en biología . 5 (7): a010108. doi : 10.1101 / cshperspect.a010108 . PMC 3685895 . PMID 23818497 .  
  11. ^ Abbas T, Keaton MA, Dutta A (marzo de 2013). "Inestabilidad genómica en cáncer" . Perspectivas de Cold Spring Harbor en biología . 5 (3): a012914. doi : 10.1101 / cshperspect.a012914 . PMC 3578360 . PMID 23335075 .  
  12. ↑ a b Barlow JH, Nussenzweig A (diciembre de 2014). "Iniciación de la replicación e inestabilidad del genoma: una encrucijada para la síntesis de ADN y ARN" . Ciencias de la vida celular y molecular . 71 (23): 4545–59. doi : 10.1007 / s00018-014-1721-1 . PMC 6289259 . PMID 25238783 .  
  13. ^ Siddiqui K, On KF, Diffley JF (septiembre de 2013). "Regulación de la replicación del ADN en eukarya" . Perspectivas de Cold Spring Harbor en biología . 5 (9): a012930. doi : 10.1101 / cshperspect.a012930 . PMC 3753713 . PMID 23838438 .  
  14. ^ Sclafani RA, Holzen TM (2007). "Regulación del ciclo celular de la replicación del ADN" . Revisión anual de genética . 41 : 237–80. doi : 10.1146 / annurev.genet.41.110306.130308 . PMC 2292467 . PMID 17630848 .  
  15. ↑ a b García-Muse T, Aguilera A (septiembre de 2016). "Conflictos transcripción-replicación: cómo ocurren y cómo se resuelven" . Reseñas de la naturaleza. Biología celular molecular . 17 (9): 553–63. doi : 10.1038 / nrm.2016.88 . hdl : 11441/101680 . PMID 27435505 . S2CID 7617164 .  
  16. ^ Yakovchuk P, Protozanova E, Frank-Kamenetskii MD (2006). "Contribuciones de apilamiento y emparejamiento de bases en la estabilidad térmica de la doble hélice del ADN" . Investigación de ácidos nucleicos . 34 (2): 564–74. doi : 10.1093 / nar / gkj454 . PMC 1360284 . PMID 16449200 .  
  17. ↑ a b c Leonard AC, Méchali M (octubre de 2013). "Orígenes de la replicación del ADN" . Perspectivas de Cold Spring Harbor en biología . 5 (10): a010116. doi : 10.1101 / cshperspect.a010116 . PMC 3783049 . PMID 23838439 .  
  18. ^ a b Creager RL, Li Y, MacAlpine DM (abril de 2015). "Instantánea: orígenes de la replicación del ADN" . Celular . 161 (2): 418–418.e1. doi : 10.1016 / j.cell.2015.03.043 . PMID 25860614 . 
  19. ^ Knott SR, Viggiani CJ, Aparicio OM (agosto de 2009). "Promover y proteger: coordinar la replicación y la transcripción del ADN para la estabilidad del genoma" . Epigenética . 4 (6): 362–5. doi : 10.4161 / epi.4.6.9712 . PMID 19736523 . 
  20. ^ a b Deshpande AM, Newlon CS (mayo de 1996). "Sitios de pausa de horquilla de replicación de ADN dependientes de la transcripción". Ciencia . 272 (5264): 1030–3. Código Bibliográfico : 1996Sci ... 272.1030D . doi : 10.1126 / science.272.5264.1030 . PMID 8638128 . S2CID 38817771 .  
  21. ^ Sankar TS, Wastuwidyaningtyas BD, Dong Y, Lewis SA, Wang JD (julio de 2016). "La naturaleza de las mutaciones inducidas por colisiones de replicación-transcripción" . Naturaleza . 535 (7610): 178–81. Código bibliográfico : 2016Natur.535..178S . doi : 10.1038 / nature18316 . PMC 4945378 . PMID 27362223 .  
  22. ^ Liu B, Alberts BM (febrero de 1995). "Colisión frontal entre un aparato de replicación de ADN y el complejo de transcripción de la ARN polimerasa". Ciencia . 267 (5201): 1131–7. Código Bibliográfico : 1995Sci ... 267.1131L . doi : 10.1126 / science.7855590 . PMID 7855590 . S2CID 6835136 .  
  23. ^ Azvolinsky A, Giresi PG, Lieb JD, Zakian VA (junio de 2009). "Los genes de la ARN polimerasa II altamente transcritos son impedimentos para la progresión de la horquilla de replicación en Saccharomyces cerevisiae" . Célula molecular . 34 (6): 722–34. doi : 10.1016 / j.molcel.2009.05.022 . PMC 2728070 . PMID 19560424 .  
  24. ↑ a b c Jacob F, Brenner S, Cuzin F (1 de enero de 1963). "Sobre la regulación de la replicación del ADN en bacterias". Simposios de Cold Spring Harbor sobre biología cuantitativa . 28 : 329–348. doi : 10.1101 / sqb.1963.028.01.048 . ISSN 0091-7451 . 
  25. ^ Novick RP (diciembre de 1987). "Incompatibilidad de plásmidos" . Revisiones microbiológicas . 51 (4): 381–95. doi : 10.1128 / MMBR.51.4.381-395.1987 . PMC 373122 . PMID 3325793 .  
  26. ^ Skarstad K, Katayama T (abril de 2013). "Regulación de la replicación del ADN en bacterias" . Perspectivas de Cold Spring Harbor en biología . 5 (4): a012922. doi : 10.1101 / cshperspect.a012922 . PMC 3683904 . PMID 23471435 .  
  27. ↑ a b c Marks AB, Fu H, Aladjem MI (2017). "Regulación de los orígenes de la replicación" . Avances en Medicina y Biología Experimental . 1042 : 43–59. doi : 10.1007 / 978-981-10-6955-0_2 . ISBN 978-981-10-6954-3. PMC  6622447 . PMID  29357052 .
  28. ^ a b Parker MW, Botchan MR, Berger JM (abril de 2017). "Mecanismos y regulación de la iniciación de la replicación del ADN en eucariotas" . Revisiones críticas en bioquímica y biología molecular . 52 (2): 107-144. doi : 10.1080 / 10409238.2016.1274717 . PMC 5545932 . PMID 28094588 .  
  29. ↑ a b Gilbert DM (octubre de 2004). "En busca del santo replicador" . Reseñas de la naturaleza. Biología celular molecular . 5 (10): 848–55. doi : 10.1038 / nrm1495 . PMC 1255919 . PMID 15459665 .  
  30. ^ Aladjem MI, Fanning E (julio de 2004). "El replicón revisitado: un modelo antiguo aprende nuevos trucos en los cromosomas metazoarios" . Informes EMBO . 5 (7): 686–91. doi : 10.1038 / sj.embor.7400185 . PMC 1299096 . PMID 15229645 .  
  31. ^ a b Remus D, Beall EL, Botchan MR (febrero de 2004). "La topología del ADN, no la secuencia del ADN, es un determinante crítico para la unión del ADN-ORC de Drosophila" . El diario EMBO . 23 (4): 897–907. doi : 10.1038 / sj.emboj.7600077 . PMC 380993 . PMID 14765124 .  
  32. ^ Vashee S, Cvetic C, Lu W, Simancek P, Kelly TJ, Walter JC (agosto de 2003). "Unión de ADN independiente de secuencia e iniciación de la replicación por el complejo de reconocimiento de origen humano" . Genes y desarrollo . 17 (15): 1894–908. doi : 10.1101 / gad.1084203 . PMC 196240 . PMID 12897055 .  
  33. ^ a b Shen Z, Sathyan KM, Geng Y, Zheng R, Chakraborty A, Freeman B, et al. (Octubre de 2010). "Una proteína de repetición WD estabiliza la unión de ORC a la cromatina" . Célula molecular . 40 (1): 99-111. doi : 10.1016 / j.molcel.2010.09.021 . PMC 5201136 . PMID 20932478 .  
  34. ^ a b Dorn ES, Cook JG (mayo de 2011). "Nucleosomas en el vecindario: nuevas funciones para las modificaciones de la cromatina en el control del origen de la replicación" . Epigenética . 6 (5): 552–9. doi : 10.4161 / epi.6.5.15082 . PMC 3230546 . PMID 21364325 .  
  35. ^ a b c Aladjem MI, Redon CE (febrero de 2017). "Orden del desorden: interacciones selectivas en los orígenes de replicación de mamíferos" . Reseñas de la naturaleza. Genética . 18 (2): 101-116. doi : 10.1038 / nrg.2016.141 . PMC 6596300 . PMID 27867195 .  
  36. ↑ a b Fragkos M, Ganier O, Coulombe P, Méchali M (junio de 2015). "Activación del origen de la replicación del ADN en el espacio y el tiempo". Reseñas de la naturaleza. Biología celular molecular . 16 (6): 360–74. doi : 10.1038 / nrm4002 . PMID 25999062 . S2CID 37108355 .  
  37. ^ a b c Prioleau MN, MacAlpine DM (agosto de 2016). "Orígenes de la replicación del ADN: ¿por dónde empezamos?" . Genes y desarrollo . 30 (15): 1683–97. doi : 10.1101 / gad.285114.116 . PMC 5002974 . PMID 27542827 .  
  38. ^ Cayrou C, Coulombe P, Puy A, Rialle S, Kaplan N, Segal E, Méchali M (febrero de 2012). "Nuevos conocimientos sobre las características del origen de la replicación en metazoos" . Ciclo celular . 11 (4): 658–67. doi : 10.4161 / cc.11.4.19097 . PMC 3318102 . PMID 22373526 .  
  39. ^ Lombraña R, Almeida R, Álvarez A, Gómez M (2015). "Bucles R e inicio de la replicación del ADN en células humanas: ¿un eslabón perdido?" . Fronteras en genética . 6 : 158. doi : 10.3389 / fgene.2015.00158 . PMC 4412123 . PMID 25972891 .  
  40. ^ Jang SM, Zhang Y, Utani K, Fu H, Redon CE, Marks AB, et al. (Julio de 2018). "La proteína determinante de iniciación de la replicación (RepID) modula la replicación mediante el reclutamiento de CUL4 a la cromatina" . Comunicaciones de la naturaleza . 9 (1): 2782. Bibcode : 2018NatCo ... 9.2782J . doi : 10.1038 / s41467-018-05177-6 . PMC 6050238 . PMID 30018425 .  
  41. ^ Zakian VA, Scott JF (marzo de 1982). "Construcción, replicación y estructura de cromatina del círculo TRP1 RI, un plásmido sintético de copia múltiple derivado del ADN cromosómico de Saccharomyces cerevisiae" . Biología Molecular y Celular . 2 (3): 221–32. doi : 10.1128 / mcb.2.3.221 . PMC 369780 . PMID 6287231 .  
  42. ^ Rhodes N, Company M, Errede B (marzo de 1990). "Un vector lanzadera de levadura-Escherichia coli que contiene el origen de replicación M13". Plásmido . 23 (2): 159–62. doi : 10.1016 / 0147-619x (90) 90036-c . PMID 2194231 . 
  43. ^ Paululat A, Heinisch JJ (diciembre de 2012). "Nuevos vectores de triple lanzadera de levadura / E. Coli / Drosophila para la generación eficiente de construcciones de transformación del elemento P de Drosophila". Gene . 511 (2): 300–5. doi : 10.1016 / j.gene.2012.09.058 . PMID 23026211 . 
  44. ^ Ryan VT, Grimwade JE, Camara JE, Crooke E, Leonard AC (marzo de 2004). "El ensamblaje del complejo de prerreplicación de Escherichia coli está regulado por la interacción dinámica entre Fis, IHF y DnaA". Microbiología molecular . 51 (5): 1347–59. doi : 10.1046 / j.1365-2958.2003.03906.x . PMID 14982629 . S2CID 22598422 .  
  45. ↑ a b Mackiewicz P, Zakrzewska-Czerwinska J, Zawilak A, Dudek MR, Cebrat S (2004). "¿Dónde comienza la replicación bacteriana? Reglas para predecir la región oriC" . Investigación de ácidos nucleicos . 32 (13): 3781–91. doi : 10.1093 / nar / gkh699 . PMC 506792 . PMID 15258248 .  
  46. ^ a b c Luo H, Gao F (enero de 2019). "DoriC 10.0: una base de datos actualizada de los orígenes de la replicación en los genomas procarióticos, incluidos los cromosomas y plásmidos" . Investigación de ácidos nucleicos . 47 (D1): D74 – D77. doi : 10.1093 / nar / gky1014 . PMC 6323995 . PMID 30364951 .  
  47. ↑ a b Fuller RS, Funnell BE, Kornberg A (octubre de 1984). "El complejo de proteína dnaA con el origen de replicación cromosómica de E. coli (oriC) y otros sitios de ADN". Celular . 38 (3): 889–900. doi : 10.1016 / 0092-8674 (84) 90284-8 . PMID 6091903 . S2CID 23316215 .  
  48. ^ Fuller RS, Kornberg A (octubre de 1983). "Proteína dnaA purificada en el inicio de la replicación en el origen cromosómico de replicación de Escherichia coli" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 80 (19): 5817–21. Código Bibliográfico : 1983PNAS ... 80.5817F . doi : 10.1073 / pnas.80.19.5817 . PMC 390166 . PMID 6310593 .  
  49. ^ Jakimowicz D, Majka J, Messer W, Speck C, Fernandez M, Martin MC, et al. (Mayo de 1998). "Elementos estructurales de la región de Streptomyces oriC y sus interacciones con la proteína DnaA" . Microbiología . 144 (Parte 5) (5): 1281–90. doi : 10.1099 / 00221287-144-5-1281 . PMID 9611803 . 
  50. ^ Tsodikov OV, Biswas T (julio de 2011). "Firmas estructurales y termodinámicas del reconocimiento de ADN por Mycobacterium tuberculosis DnaA". Revista de Biología Molecular . 410 (3): 461–76. doi : 10.1016 / j.jmb.2011.05.007 . PMID 21620858 . 
  51. ↑ Costa A, Hood IV, Berger JM (2013). "Mecanismos para iniciar la replicación del ADN celular" . Revisión anual de bioquímica . 82 : 25–54. doi : 10.1146 / annurev-biochem-052610-094414 . PMC 4696014 . PMID 23746253 .  
  52. ↑ Wolański M, Donczew R, Zawilak-Pawlik A, Zakrzewska-Czerwińska J (2014). "Instrucciones codificadas por oriC para el inicio de la replicación del cromosoma bacteriano" . Fronteras en microbiología . 5 : 735. doi : 10.3389 / fmicb.2014.00735 . PMC 4285127 . PMID 25610430 .  
  53. ^ a b Messer W, Blaesing F, Majka J, Nardmann J, Schaper S, Schmidt A, et al. (1999). "Dominios funcionales de las proteínas DnaA". Biochimie . 81 (8–9): 819–25. doi : 10.1016 / s0300-9084 (99) 00215-1 . PMID 10572294 . 
  54. ^ Sutton MD, Kaguni JM (diciembre de 1997). "El gen dnaA de Escherichia coli: cuatro dominios funcionales". Revista de Biología Molecular . 274 (4): 546–61. doi : 10.1006 / jmbi.1997.1425 . PMID 9417934 . 
  55. ^ Speck C, Messer W (marzo de 2001). "Mecanismo de desenrollado de origen: unión secuencial de DnaA a ADN bicatenario y monocatenario" . El diario EMBO . 20 (6): 1469–76. doi : 10.1093 / emboj / 20.6.1469 . PMC 145534 . PMID 11250912 .  
  56. ↑ a b Fujikawa N, Kurumizaka H, ​​Nureki O, Terada T, Shirouzu M, Katayama T, Yokoyama S (abril de 2003). "Base estructural del reconocimiento del origen de replicación por la proteína DnaA" . Investigación de ácidos nucleicos . 31 (8): 2077–86. doi : 10.1093 / nar / gkg309 . PMC 153737 . PMID 12682358 .  
  57. ↑ a b c Duderstadt KE, Chuang K, Berger JM (octubre de 2011). "El estiramiento del ADN por iniciadores bacterianos promueve la apertura del origen de la replicación" . Naturaleza . 478 (7368): 209–13. Código Bibliográfico : 2011Natur.478..209D . doi : 10.1038 / nature10455 . PMC 3192921 . PMID 21964332 .  
  58. ↑ a b Erzberger JP, Pirruccello MM, Berger JM (septiembre de 2002). "La estructura del DnaA bacteriano: implicaciones para los mecanismos generales subyacentes al inicio de la replicación del ADN" . El diario EMBO . 21 (18): 4763–73. doi : 10.1093 / emboj / cdf496 . PMC 126292 . PMID 12234917 .  
  59. ^ Sutton MD, Kaguni JM (septiembre de 1997). "La treonina 435 de la proteína DnaA de Escherichia coli confiere actividad de unión al ADN de secuencia específica" . La Revista de Química Biológica . 272 (37): 23017–24. doi : 10.1074 / jbc.272.37.23017 . PMID 9287298 . 
  60. ^ Bramhill D, Kornberg A (septiembre de 1988). "Un modelo para la iniciación en los orígenes de la replicación del ADN". Celular . 54 (7): 915–8. doi : 10.1016 / 0092-8674 (88) 90102-x . PMID 2843291 . S2CID 1705480 .  
  61. ^ Rozgaja TA, Grimwade JE, Iqbal M, Czerwonka C, Vora M, Leonard AC (octubre de 2011). "Dos matrices orientadas opuestamente de sitios de reconocimiento de baja afinidad en oriC guían la unión progresiva de DnaA durante el ensamblaje pre-RC de Escherichia coli" . Microbiología molecular . 82 (2): 475–88. doi : 10.1111 / j.1365-2958.2011.07827.x . PMC 3192301 . PMID 21895796 .  
  62. ^ Zawilak-Pawlik A, Kois A, Majka J, Jakimowicz D, Smulczyk-Krawczyszyn A, Messer W, Zakrzewska-Czerwińska J (julio de 2005). "Arquitectura de complejos de iniciación de replicación bacteriana: orisomas de cuatro bacterias no relacionadas" . La revista bioquímica . 389 (Parte 2): 471–81. doi : 10.1042 / BJ20050143 . PMC 1175125 . PMID 15790315 .  
  63. ^ a b Grimwade JE, Rozgaja TA, Gupta R, Dyson K, Rao P, Leonard AC (julio de 2018). "El reconocimiento del origen es el papel predominante de DnaA-ATP en el inicio de la replicación cromosómica" . Investigación de ácidos nucleicos . 46 (12): 6140–6151. doi : 10.1093 / nar / gky457 . PMC 6158602 . PMID 29800247 .  
  64. ^ Sakiyama Y, Kasho K, Noguchi Y, Kawakami H, Katayama T (diciembre de 2017). "Dinámica reguladora en el complejo ternario DnaA para el inicio de la replicación cromosómica en Escherichia coli" . Investigación de ácidos nucleicos . 45 (21): 12354-12373. doi : 10.1093 / nar / gkx914 . PMC 5716108 . PMID 29040689 .  
  65. ^ Matsui M, Oka A, Takanami M, Yasuda S, Hirota Y (agosto de 1985). "Sitios de unión a la proteína dnaA en el origen de replicación del cromosoma K-12 de Escherichia coli". Revista de Biología Molecular . 184 (3): 529–33. doi : 10.1016 / 0022-2836 (85) 90299-2 . PMID 2995681 . 
  66. ^ Margulies C, Kaguni JM (julio de 1996). "Unión ordenada y secuencial de la proteína DnaA a oriC, el origen cromosómico de Escherichia coli" . La Revista de Química Biológica . 271 (29): 17035–40. doi : 10.1074 / jbc.271.29.17035 . PMID 8663334 . 
  67. ^ Schaper S, Messer W (julio de 1995). "Interacción de la proteína iniciadora DnaA de Escherichia coli con su ADN diana" . La Revista de Química Biológica . 270 (29): 17622–6. doi : 10.1074 / jbc.270.29.17622 . PMID 7615570 . 
  68. ^ Weigel C, Schmidt A, Rückert B, Lurz R, Messer W (noviembre de 1997). "Unión de proteína DnaA a cajas de DnaA individuales en el origen de replicación de Escherichia coli, oriC" . El diario EMBO . 16 (21): 6574–83. doi : 10.1093 / emboj / 16.21.6574 . PMC 1170261 . PMID 9351837 .  
  69. ^ Samitt CE, Hansen FG, Miller JF, Schaechter M (marzo de 1989). "Estudios in vivo de la unión de DnaA al origen de la replicación de Escherichia coli" . El diario EMBO . 8 (3): 989–93. doi : 10.1002 / j.1460-2075.1989.tb03462.x . PMC 400901 . PMID 2542031 .  
  70. ^ McGarry KC, Ryan VT, Grimwade JE, Leonard AC (marzo de 2004). "Se requieren dos sitios de unión discriminatorios en el origen de replicación de Escherichia coli para la apertura de la cadena de ADN por el iniciador DnaA-ATP" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (9): 2811–6. Código Bibliográfico : 2004PNAS..101.2811M . doi : 10.1073 / pnas.0400340101 . PMC 365702 . PMID 14978287 .  
  71. ^ Kawakami H, Keyamura K, Katayama T (julio de 2005). "La formación de un complejo de iniciación específico de ATP-DnaA requiere DnaA Arginina 285, un motivo conservado en la familia de proteínas AAA +" . La Revista de Química Biológica . 280 (29): 27420–30. doi : 10.1074 / jbc.M502764200 . PMID 15901724 . 
  72. ^ Speck C, Weigel C, Messer W (noviembre de 1999). "Proteína ATP y ADP-dnaA, un interruptor molecular en la regulación de genes" . El diario EMBO . 18 (21): 6169–76. doi : 10.1093 / emboj / 18.21.6169 . PMC 1171680 . PMID 10545126 .  
  73. ^ Miller DT, Grimwade JE, Betteridge T, Rozgaja T, Torgue JJ, Leonard AC (noviembre de 2009). "Complejos de reconocimiento de origen bacteriano ensamblaje directo de estructuras oligoméricas de DnaA de orden superior" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 106 (44): 18479–84. Código bibliográfico : 2009PNAS..10618479M . doi : 10.1073 / pnas.0909472106 . PMC 2773971 . PMID 19833870 .  
  74. ↑ a b c Erzberger JP, Mott ML, Berger JM (agosto de 2006). "Base estructural para el ensamblaje de DnaA dependiente de ATP y remodelación del origen de replicación". Naturaleza Biología Molecular y Estructural . 13 (8): 676–83. doi : 10.1038 / nsmb1115 . PMID 16829961 . S2CID 23586302 .  
  75. ^ Zorman S, Seitz H, Sclavi B, Strick TR (agosto de 2012). "Caracterización topológica del complejo DnaA-oriC mediante nanomanipulación de una sola molécula" . Investigación de ácidos nucleicos . 40 (15): 7375–83. doi : 10.1093 / nar / gks371 . PMC 3424547 . PMID 22581769 .  
  76. ↑ a b Richardson TT, Harran O, Murray H (junio de 2016). "El elemento de origen de replicación de DnaA-trio bacteriano especifica la unión del iniciador de ADN monocatenario" . Naturaleza . 534 (7607): 412–6. Código Bibliográfico : 2016Natur.534..412R . doi : 10.1038 / nature17962 . PMC 4913881 . PMID 27281207 .  
  77. ^ Duderstadt KE, Mott ML, Crisona NJ, Chuang K, Yang H, Berger JM (septiembre de 2010). "La remodelación del origen y la apertura de las bacterias se basan en distintos estados de ensamblaje del iniciador de DnaA" . La Revista de Química Biológica . 285 (36): 28229–39. doi : 10.1074 / jbc.M110.147975 . PMC 2934688 . PMID 20595381 .  
  78. ^ Ozaki S, Katayama T (febrero de 2012). "Complejos DnaA-oriC altamente organizados reclutan el ADN monocatenario para el inicio de la replicación" . Investigación de ácidos nucleicos . 40 (4): 1648–65. doi : 10.1093 / nar / gkr832 . PMC 3287180 . PMID 22053082 .  
  79. ^ Myllykallio H, Lopez P, López-García P, Heilig R, Saurin W, Zivanovic Y, et al. (Junio ​​de 2000). "Modo de replicación bacteriana con maquinaria de tipo eucariota en una arqueona hipertermofílica". Ciencia . 288 (5474): 2212–5. Código Bibliográfico : 2000Sci ... 288.2212M . doi : 10.1126 / science.288.5474.2212 . PMID 10864870 . 
  80. ↑ a b c Norais C, Hawkins M, Hartman AL, Eisen JA, Myllykallio H, Allers T (mayo de 2007). "Mapeo genético y físico de los orígenes de la replicación del ADN en Haloferax volcanii" . PLOS Genetics . 3 (5): e77. doi : 10.1371 / journal.pgen.0030077 . PMC 1868953 . PMID 17511521 .  
  81. ↑ a b Hawkins M, Malla S, Blythe MJ, Nieduszynski CA, Allers T (noviembre de 2013). "Crecimiento acelerado en ausencia de orígenes de replicación del ADN" . Naturaleza . 503 (7477): 544–547. Código bibliográfico : 2013Natur.503..544H . doi : 10.1038 / nature12650 . PMC 3843117 . PMID 24185008 .  
  82. ^ Wu Z, Liu J, Yang H, Liu H, Xiang H (febrero de 2014). "Múltiples orígenes de replicación con diversos mecanismos de control en Haloarcula hispanica" . Investigación de ácidos nucleicos . 42 (4): 2282–94. doi : 10.1093 / nar / gkt1214 . PMC 3936714 . PMID 24271389 .  
  83. ^ Pelve EA, Martens-Habbena W, Stahl DA, Bernander R (noviembre de 2013). "Mapeo de los orígenes de la replicación activa in vivo en replicones thaum y euryarchaeal" . Microbiología molecular . 90 (3): 538–50. doi : 10.1111 / mmi.12382 . PMID 23991938 . 
  84. ^ Pelve EA, Lindås AC, Knöppel A, Mira A, Bernander R (septiembre de 2012). "Cuatro orígenes de replicación de cromosomas en el archaeon Pyrobaculum calidifontis" . Microbiología molecular . 85 (5): 986–95. doi : 10.1111 / j.1365-2958.2012.08155.x . PMID 22812406 . 
  85. ^ a b c d e f g h i j Robinson NP, Dionne I, Lundgren M, Marsh VL, Bernander R, Bell SD (enero de 2004). "Identificación de dos orígenes de replicación en el cromosoma único del archaeon Sulfolobus solfataricus". Celular . 116 (1): 25–38. doi : 10.1016 / s0092-8674 (03) 01034-1 . PMID 14718164 . S2CID 12777774 .  
  86. ↑ a b Lundgren M, Andersson A, Chen L, Nilsson P, Bernander R (mayo de 2004). "Tres orígenes de replicación en especies de Sulfolobus: iniciación sincrónica de la replicación cromosómica y terminación asincrónica" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (18): 7046–51. Código Bib : 2004PNAS..101.7046L . doi : 10.1073 / pnas.0400656101 . PMC 406463 . PMID 15107501 .  
  87. ^ Bell SD (2017). "Inicio de la replicación del ADN en las arqueas". Avances en Medicina y Biología Experimental . 1042 : 99-115. doi : 10.1007 / 978-981-10-6955-0_5 . ISBN 978-981-10-6954-3. PMID  29357055 .
  88. ^ Ausiannikava D, Allers T (enero de 2017). "Diversidad de la replicación del ADN en las arqueas" . Genes . 8 (2): 56. doi : 10.3390 / genes8020056 . PMC 5333045 . PMID 28146124 .  
  89. ^ Wu Z, Liu J, Yang H, Xiang H (2014). "Orígenes de la replicación del ADN en arqueas" . Fronteras en microbiología . 5 : 179. doi : 10.3389 / fmicb.2014.00179 . PMC 4010727 . PMID 24808892 .  
  90. ^ Matsunaga F, Forterre P, Ishino Y, Myllykallio H (septiembre de 2001). "Interacciones in vivo de archaeal Cdc6 / Orc1 y proteínas de mantenimiento de minicromosomas con el origen de replicación" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 98 (20): 11152–7. Código Bib : 2001PNAS ... 9811152M . doi : 10.1073 / pnas.191387498 . PMC 58699 . PMID 11562464 .  
  91. ^ Wu Z, Liu H, Liu J, Liu X, Xiang H (septiembre de 2012). "Diversidad y evolución de múltiples orígenes de replicación adyacentes orc / cdc6 en haloarchaea" . BMC Genomics . 13 : 478. doi : 10.1186 / 1471-2164-13-478 . PMC 3528665 . PMID 22978470 .  
  92. ^ Bell SD (2012). "Proteínas Archaeal orc1 / cdc6". El replisoma eucariota: una guía para la estructura y función de las proteínas . Bioquímica subcelular. 62 . págs. 59–69. doi : 10.1007 / 978-94-007-4572-8_4 . ISBN 978-94-007-4571-1. PMID  22918580 .
  93. ^ a b c d e Samson RY, Xu Y, Gadelha C, Stone TA, Faqiri JN, Li D, et al. (Febrero de 2013). "Especificidad y función de las proteínas iniciadoras de la replicación del ADN de arqueas" . Informes de celda . 3 (2): 485–96. doi : 10.1016 / j.celrep.2013.01.002 . PMC 3607249 . PMID 23375370 .  
  94. ^ a b c d Grainge I, Gaudier M, Schuwirth BS, Westcott SL, Sandall J, Atanassova N, Wigley DB (octubre de 2006). "Análisis bioquímico de un origen de replicación del ADN en el archaeon Aeropyrum pernix". Revista de Biología Molecular . 363 (2): 355–69. doi : 10.1016 / j.jmb.2006.07.076 . PMID 16978641 . 
  95. ^ a b Robinson NP, Bell SD (abril de 2007). "Captura de elementos extracromosómicos y evolución de múltiples orígenes de replicación en cromosomas de arqueo" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 104 (14): 5806-11. Código Bibliográfico : 2007PNAS..104.5806R . doi : 10.1073 / pnas.0700206104 . PMC 1851573 . PMID 17392430 .  
  96. ^ a b c Robinson NP, Blood KA, McCallum SA, Edwards PA, Bell SD (febrero de 2007). "Hermanas de las uniones cromátidas en el arqueo hipertermofílico Sulfolobus solfataricus" . El diario EMBO . 26 (3): 816–24. doi : 10.1038 / sj.emboj.7601529 . PMC 1794387 . PMID 17255945 .  
  97. ^ a b c d e f g h Dueber EL, Corn JE, Bell SD, Berger JM (agosto de 2007). "Reconocimiento del origen de la replicación y deformación por un complejo arqueal heterodimérico Orc1". Ciencia . 317 (5842): 1210–3. Código Bibliográfico : 2007Sci ... 317.1210D . doi : 10.1126 / science.1143690 . PMID 17761879 . S2CID 45665434 .  
  98. ^ a b c d e f g Gaudier M, Schuwirth BS, Westcott SL, Wigley DB (agosto de 2007). "Base estructural del reconocimiento del origen de la replicación del ADN por una proteína ORC" . Ciencia . 317 (5842): 1213–6. Código Bibliográfico : 2007Sci ... 317.1213G . doi : 10.1126 / science.1143664 . PMID 17761880 . 
  99. ^ Capaldi SA, Berger JM (2004). "Caracterización bioquímica de la unión de Cdc6 / Orc1 al origen de replicación de la euryarchaeon Methanothermobacter thermoautotrophicus" . Investigación de ácidos nucleicos . 32 (16): 4821–32. doi : 10.1093 / nar / gkh819 . PMC 519113 . PMID 15358831 .  
  100. ^ Liu J, Smith CL, DeRyckere D, DeAngelis K, Martin GS, Berger JM (septiembre de 2000). "Estructura y función de Cdc6 / Cdc18: implicaciones para el reconocimiento de origen y control de puntos de control". Célula molecular . 6 (3): 637–48. doi : 10.1016 / s1097-2765 (00) 00062-9 . PMID 11030343 . 
  101. ^ Singleton MR, Morales R, Grainge I, Cook N, Isupov MN, Wigley DB (octubre de 2004). "Cambios conformacionales inducidos por la unión de nucleótidos en Cdc6 / ORC de Aeropyrum pernix". Revista de Biología Molecular . 343 (3): 547–57. doi : 10.1016 / j.jmb.2004.08.044 . PMID 15465044 . 
  102. ^ Matsunaga F, Norais C, Forterre P, Myllykallio H (febrero de 2003). "Identificación de fragmentos cortos de Okazaki 'eucariotas' sintetizados a partir de un origen de replicación procariota" . Informes EMBO . 4 (2): 154–8. doi : 10.1038 / sj.embor.embor732 . PMC 1315830 . PMID 12612604 .  
  103. ^ Berquist BR, DasSarma S (octubre de 2003). "Un elemento de secuencia de replicación autónoma cromosómica archaeal de un halófilo extremo, Halobacterium sp. Cepa NRC-1" . Revista de bacteriología . 185 (20): 5959–66. doi : 10.1128 / jb.185.20.5959-5966.2003 . PMC 225043 . PMID 14526006 .  
  104. ^ Kasiviswanathan R, Shin JH, Kelman Z (2005). "Las interacciones entre las proteínas archaeal Cdc6 y MCM modulan sus propiedades bioquímicas" . Investigación de ácidos nucleicos . 33 (15): 4940–50. doi : 10.1093 / nar / gki807 . PMC 1201339 . PMID 16150924 .  
  105. ^ Samson RY, Abeyrathne PD, Bell SD (enero de 2016). "Mecanismo de reclutamiento de Archaeal MCM Helicase a orígenes de replicación de ADN" . Célula molecular . 61 (2): 287–96. doi : 10.1016 / j.molcel.2015.12.005 . PMC 4724246 . PMID 26725007 .  
  106. ^ Dueber EC, Costa A, Corn JE, Bell SD, Berger JM (mayo de 2011). "Determinantes moleculares de la discriminación de origen por iniciadores Orc1 en arqueas" . Investigación de ácidos nucleicos . 39 (9): 3621–31. doi : 10.1093 / nar / gkq1308 . PMC 3089459 . PMID 21227921 .  
  107. ^ Matsunaga F, Takemura K, Akita M, Adachi A, Yamagami T, Ishino Y (enero de 2010). "Fusión localizada de ADN dúplex por Cdc6 / Orc1 en el origen de la replicación del ADN en el archaeon hipertermófilo Pyrococcus furiosus". Extremófilos . 14 (1): 21–31. doi : 10.1007 / s00792-009-0284-9 . PMID 19787415 . S2CID 21336802 .  
  108. ^ Onishi M, Liou GG, Buchberger JR, Walz T, Moazed D (diciembre de 2007). "Papel del dominio Sir3-BAH conservado en la unión de nucleosomas y ensamblaje de cromatina silenciosa". Célula molecular . 28 (6): 1015–28. doi : 10.1016 / j.molcel.2007.12.004 . PMID 18158899 . 
  109. ^ a b Kuo AJ, Song J, Cheung P, Ishibe-Murakami S, Yamazoe S, Chen JK, et al. (Marzo de 2012). "El dominio BAH de ORC1 vincula H4K20me2 a las licencias de replicación del ADN y el síndrome de Meier-Gorlin" . Naturaleza . 484 (7392): 115–9. Código Bibliográfico : 2012Natur.484..115K . doi : 10.1038 / nature10956 . PMC 3321094 . PMID 22398447 .  
  110. ^ Gilbert DM (octubre de 2004). "En busca del santo replicador" . Reseñas de la naturaleza. Biología celular molecular . 5 (10): 848–55. doi : 10.1038 / nrm1495 . PMC 1255919 . PMID 15459665 .  
  111. ^ a b Bleichert F, Botchan MR, Berger JM (febrero de 2017). "Mecanismos para iniciar la replicación del ADN celular" . Ciencia . 355 (6327): eaah6317. doi : 10.1126 / science.aah6317 . PMID 28209641 . 
  112. ^ a b Gambus A, Khoudoli GA, Jones RC, Blow JJ (abril de 2011). "MCM2-7 forman hexámeros dobles en orígenes autorizados en extracto de huevo de Xenopus" . La Revista de Química Biológica . 286 (13): 11855–64. doi : 10.1074 / jbc.M110.199521 . PMC 3064236 . PMID 21282109 .  
  113. ^ a b Remus D, Beuron F, Tolun G, Griffith JD, Morris EP, Diffley JF (noviembre de 2009). "Carga concertada de hexámeros dobles Mcm2-7 alrededor del ADN durante la concesión de licencias de origen de replicación del ADN" . Celular . 139 (4): 719-30. doi : 10.1016 / j.cell.2009.10.015 . PMC 2804858 . PMID 19896182 .  
  114. ^ a b Evrin C, Clarke P, Zech J, Lurz R, Sun J, Uhle S, et al. (Diciembre de 2009). "Un complejo MCM2-7 de doble hexámero se carga en el ADN de origen durante la autorización de la replicación del ADN eucariota" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 106 (48): 20240–5. Código Bibliográfico : 2009PNAS..10620240E . doi : 10.1073 / pnas.0911500106 . PMC 2787165 . PMID 19910535 .  
  115. ^ Ge XQ, Jackson DA, Blow JJ (diciembre de 2007). "Se requieren orígenes inactivos autorizados por exceso de Mcm2-7 para que las células humanas sobrevivan al estrés replicativo" . Genes y desarrollo . 21 (24): 3331–41. doi : 10.1101 / gad.457807 . PMC 2113033 . PMID 18079179 .  
  116. ^ Ibarra A, Schwob E, Méndez J (julio de 2008). "El exceso de proteínas MCM protege las células humanas del estrés replicativo al otorgar licencias de origen de replicación de respaldo" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 105 (26): 8956–61. Código bibliográfico : 2008PNAS..105.8956I . doi : 10.1073 / pnas.0803978105 . PMC 2449346 . PMID 18579778 .  
  117. ^ Stinchcomb DT, Struhl K, Davis RW (noviembre de 1979). "Aislamiento y caracterización de un replicador cromosómico de levadura". Naturaleza . 282 (5734): 39–43. Código Bibliográfico : 1979Natur.282 ... 39S . doi : 10.1038 / 282039a0 . PMID 388229 . S2CID 4326901 .  
  118. ^ Huberman JA, Spotila LD, Nawotka KA, el-Assouli SM, Davis LR (noviembre de 1987). "El origen de replicación in vivo del plásmido de levadura de 2 micrones". Celular . 51 (3): 473–81. doi : 10.1016 / 0092-8674 (87) 90643-x . PMID 3311385 . S2CID 54385402 .  
  119. ^ Brewer BJ, Fangman WL (noviembre de 1987). "La localización de los orígenes de replicación en plásmidos ARS en S. cerevisiae". Celular . 51 (3): 463–71. doi : 10.1016 / 0092-8674 (87) 90642-8 . PMID 2822257 . S2CID 20152681 .  
  120. ↑ a b Marahrens Y, Stillman B (febrero de 1992). "Un origen cromosómico de levadura de la replicación del ADN definido por múltiples elementos funcionales". Ciencia . 255 (5046): 817–23. Código Bibliográfico : 1992Sci ... 255..817M . doi : 10.1126 / science.1536007 . PMID 1536007 . 
  121. ^ Rao H, Marahrens Y, Stillman B (noviembre de 1994). "Conservación funcional de múltiples elementos en replicadores cromosómicos de levadura" . Biología Molecular y Celular . 14 (11): 7643–51. doi : 10.1128 / mcb.14.11.7643 . PMC 359300 . PMID 7935478 .  
  122. ^ Broach JR, Li YY, Feldman J, Jayaram M, Abraham J, Nasmyth KA, Hicks JB (1983). "Localización y análisis de secuencia de los orígenes de la replicación del ADN en levaduras". Simposios de Cold Spring Harbor sobre biología cuantitativa . 47 Pt 2: 1165–73. doi : 10.1101 / sqb.1983.047.01.132 . PMID 6345070 . 
  123. ^ Celniker SE, Sweder K, Srienc F, Bailey JE, Campbell JL (noviembre de 1984). "Mutaciones de deleción que afectan la secuencia de replicación autónoma ARS1 de Saccharomyces cerevisiae" . Biología Molecular y Celular . 4 (11): 2455–66. doi : 10.1128 / mcb.4.11.2455 . PMC 369077 . PMID 6392851 .  
  124. ^ Rao H, Stillman B (marzo de 1995). "El complejo de reconocimiento de origen interactúa con un sitio de unión de ADN bipartito dentro de los replicadores de levadura" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 92 (6): 2224–8. Código Bibliográfico : 1995PNAS ... 92.2224R . doi : 10.1073 / pnas.92.6.2224 . PMC 42456 . PMID 7892251 .  
  125. ^ Rowley A, Cocker JH, Harwood J, Diffley JF (junio de 1995). "El ensamblaje del complejo de iniciación en los orígenes de replicación de la levadura en gemación comienza con el reconocimiento de una secuencia bipartita limitando cantidades del iniciador, ORC" . El diario EMBO . 14 (11): 2631–41. doi : 10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07261.x . PMC 398377 . PMID 7781615 .  
  126. ^ Bell SP, Stillman B (mayo de 1992). "Reconocimiento dependiente de ATP de los orígenes eucariotas de la replicación del ADN por un complejo multiproteico". Naturaleza . 357 (6374): 128–34. Código Bibliográfico : 1992Natur.357..128B . doi : 10.1038 / 357128a0 . PMID 1579162 . S2CID 4346767 .  
  127. ^ a b c d Li N, Lam WH, Zhai Y, Cheng J, Cheng E, Zhao Y, et al. (Julio de 2018). "Estructura del complejo de reconocimiento de origen unido al origen de replicación del ADN". Naturaleza . 559 (7713): 217–222. Código Bib : 2018Natur.559..217L . doi : 10.1038 / s41586-018-0293-x . PMID 29973722 . S2CID 49577101 .  
  128. ^ Bleichert F, Botchan MR, Berger JM (marzo de 2015). "Estructura cristalina del complejo de reconocimiento de origen eucariota" . Naturaleza . 519 (7543): 321–6. Código Bibliográfico : 2015Natur.519..321B . doi : 10.1038 / nature14239 . PMC 4368505 . PMID 25762138 .  
  129. ^ Sun J, Evrin C, Samel SA, Fernández-Cid A, Riera A, Kawakami H, et al. (Agosto 2013). "Estructura Cryo-EM de un intermedio de carga de helicasa que contiene ORC-Cdc6-Cdt1-MCM2-7 unido al ADN" . Naturaleza Biología Molecular y Estructural . 20 (8): 944–51. doi : 10.1038 / nsmb.2629 . PMC 3735830 . PMID 23851460 .  
  130. ^ Kawakami H, Ohashi E, Kanamoto S, Tsurimoto T, Katayama T (octubre de 2015). "La unión específica de ORC eucariotas a los orígenes de la replicación del ADN depende de residuos básicos altamente conservados" . Informes científicos . 5 : 14929. Código Bibliográfico : 2015NatSR ... 514929K . doi : 10.1038 / srep14929 . PMC 4601075 . PMID 26456755 .  
  131. ^ Palzkill TG, Newlon CS (mayo de 1988). "Un origen de replicación de levadura consta de múltiples copias de una pequeña secuencia conservada". Celular . 53 (3): 441–50. doi : 10.1016 / 0092-8674 (88) 90164-x . PMID 3284655 . S2CID 7534654 .  
  132. ^ Wilmes GM, Bell SP (enero de 2002). "El elemento B2 del origen de replicación de Saccharomyces cerevisiae ARS1 requiere secuencias específicas para facilitar la formación de pre-RC" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 99 (1): 101–6. Código Bibliográfico : 2002PNAS ... 99..101W . doi : 10.1073 / pnas.012578499 . PMC 117521 . PMID 11756674 .  
  133. ^ Coster G, Diffley JF (julio de 2017). "La replicación bidireccional del ADN eucariótico se establece mediante carga de helicasa cuasi-simétrica" . Ciencia . 357 (6348): 314–318. Código bibliográfico : 2017Sci ... 357..314C . doi : 10.1126 / science.aan0063 . PMC 5608077 . PMID 28729513 .  
  134. ^ Zou L, Stillman B (mayo de 2000). "Ensamblaje de un complejo que contiene Cdc45p, proteína de replicación A y Mcm2p en orígenes de replicación controlados por quinasas dependientes de ciclina en fase S y quinasa Cdc7p-Dbf4p" . Biología Molecular y Celular . 20 (9): 3086–96. doi : 10.1128 / mcb.20.9.3086-3096.2000 . PMC 85601 . PMID 10757793 .  
  135. ^ Lipford JR, Bell SP (enero de 2001). "Los nucleosomas posicionados por ORC facilitan el inicio de la replicación del ADN". Célula molecular . 7 (1): 21–30. doi : 10.1016 / s1097-2765 (01) 00151-4 . PMID 11172708 . 
  136. ^ Diffley JF, Cocker JH (mayo de 1992). "Interacciones proteína-ADN en un origen de replicación de levadura". Naturaleza . 357 (6374): 169–72. Código Bibliográfico : 1992Natur.357..169D . doi : 10.1038 / 357169a0 . PMID 1579168 . S2CID 4354585 .  
  137. ^ Diffley JF, Stillman B (abril de 1988). "Purificación de una proteína de levadura que se une a los orígenes de la replicación del ADN y un silenciador transcripcional" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 85 (7): 2120–4. Código bibliográfico : 1988PNAS ... 85.2120D . doi : 10.1073 / pnas.85.7.2120 . PMC 279940 . PMID 3281162 .  
  138. ^ Miotto B, Ji Z, Struhl K (agosto de 2016). "Selectividad de los sitios de unión de ORC y la relación con el tiempo de replicación, los sitios frágiles y las deleciones en los cánceres" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 113 (33): E4810-9. doi : 10.1073 / pnas.1609060113 . PMC 4995967 . PMID 27436900 .  
  139. ↑ a b MacAlpine HK, Gordân R, Powell SK, Hartemink AJ, MacAlpine DM (febrero de 2010). "Drosophila ORC se localiza para abrir la cromatina y marca los sitios de carga del complejo de cohesina" . Investigación del genoma . 20 (2): 201-11. doi : 10.1101 / gr.097873.109 . PMC 2813476 . PMID 19996087 .  
  140. ↑ a b Eaton ML, Prinz JA, MacAlpine HK, Tretyakov G, Kharchenko PV, MacAlpine DM (febrero de 2011). "Firmas de cromatina del programa de replicación de Drosophila" . Investigación del genoma . 21 (2): 164–74. doi : 10.1101 / gr.116038.110 . PMC 3032920 . PMID 21177973 .  
  141. ^ a b Dellino GI, Cittaro D, Piccioni R, Luzi L, Banfi S, Segalla S, et al. (Enero 2013). "Mapeo de todo el genoma de los orígenes de la replicación del ADN humano: los niveles de transcripción en los sitios ORC1 regulan la selección del origen y el tiempo de replicación" . Investigación del genoma . 23 (1): 1–11. doi : 10.1101 / gr.142331.112 . PMC 3530669 . PMID 23187890 .  
  142. ^ Cayrou C, Ballester B, Peiffer I, Fenouil R, Coulombe P, Andrau JC, et al. (Diciembre de 2015). "El entorno de la cromatina da forma a la organización del origen de la replicación del ADN y define las clases de origen" . Investigación del genoma . 25 (12): 1873–85. doi : 10.1101 / gr.192799.115 . PMC 4665008 . PMID 26560631 .  
  143. ^ a b c d Cayrou C, Coulombe P, Vigneron A, Stanojcic S, Ganier O, Peiffer I, et al. (Septiembre de 2011). "El análisis a escala del genoma de los orígenes de la replicación de metazoos revela su organización en sitios específicos pero flexibles definidos por características conservadas" . Investigación del genoma . 21 (9): 1438–49. doi : 10.1101 / gr.121830.111 . PMC 3166829 . PMID 21750104 .  
  144. ^ a b Lubelsky Y, Sasaki T, Kuipers MA, Lucas I, Le Beau MM, Carignon S, et al. (Abril de 2011). "Las proteínas del complejo de pre-replicación se ensamblan en regiones de baja ocupación de nucleosomas dentro de la zona de iniciación de la dihidrofolato reductasa de hámster chino" . Investigación de ácidos nucleicos . 39 (8): 3141–55. doi : 10.1093 / nar / gkq1276 . PMC 3082903 . PMID 21148149 .  
  145. ^ Hayashi M, Katou Y, Itoh T, Tazumi A, Tazumi M, Yamada Y, et al. (Marzo de 2007). "Localización de todo el genoma de los sitios pre-RC e identificación de los orígenes de replicación en la levadura de fisión" . El diario EMBO . 26 (5): 1327–39. doi : 10.1038 / sj.emboj.7601585 . PMC 1817633 . PMID 17304213 .  
  146. ^ a b Martin MM, Ryan M, Kim R, Zakas AL, Fu H, Lin CM, et al. (Noviembre de 2011). "Agotamiento de todo el genoma de los eventos de iniciación de la replicación en regiones altamente transcritas" . Investigación del genoma . 21 (11): 1822–32. doi : 10.1101 / gr.124644.111 . PMC 3205567 . PMID 21813623 .  
  147. ^ Pourkarimi E, Bellush JM, Whitehouse I (diciembre de 2016). "C. elegans" . eLife . 5 . doi : 10.7554 / eLife.21728 . PMC 5222557 . PMID 28009254 .  
  148. ↑ a b Rodríguez-Martínez M, Pinzón N, Ghommidh C, Beyne E, Seitz H, Cayrou C, Méchali M (marzo de 2017). "La transición de gástrula reorganiza la selección del origen de replicación en Caenorhabditis elegans". Naturaleza Biología Molecular y Estructural . 24 (3): 290–299. doi : 10.1038 / nsmb.3363 . PMID 28112731 . S2CID 7445974 .  
  149. ^ a b Besnard E, Babled A, Lapasset L, Milhavet O, Parrinello H, Dantec C, et al. (Agosto 2012). "Desentrañar firmas de origen de replicación humana reprogramables y específicas de tipo celular asociadas con motivos de consenso G-quadruplex". Naturaleza Biología Molecular y Estructural . 19 (8): 837–44. doi : 10.1038 / nsmb.2339 . PMID 22751019 . S2CID 20710237 .  
  150. ^ Delgado S, Gómez M, Bird A, Antequera F (abril de 1998). "Inicio de la replicación del ADN en islas CpG en cromosomas de mamíferos" . El diario EMBO . 17 (8): 2426–35. doi : 10.1093 / emboj / 17.8.2426 . PMC 1170585 . PMID 9545253 .  
  151. ^ Sequeira-Mendes J, Díaz-Uriarte R, Apedaile A, Huntley D, Brockdorff N, Gómez M (abril de 2009). "La actividad de inicio de la transcripción establece la eficiencia del origen de replicación en células de mamífero" . PLOS Genetics . 5 (4): e1000446. doi : 10.1371 / journal.pgen.1000446 . PMC 2661365 . PMID 19360092 .  
  152. ↑ a b c Kelly T, Callegari AJ (marzo de 2019). "Dinámica de la replicación del ADN en una célula eucariota" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 116 (11): 4973–4982. doi : 10.1073 / pnas.1818680116 . PMC 6421431 . PMID 30718387 .  
  153. ^ Austin RJ, Orr-Weaver TL, Bell SP (octubre de 1999). "Drosophila ORC se une específicamente a ACE3, un elemento de control del origen de la replicación del ADN" . Genes y desarrollo . 13 (20): 2639–49. doi : 10.1101 / gad.13.20.2639 . PMC 317108 . PMID 10541550 .  
  154. ^ Beall EL, Manak JR, Zhou S, Bell M, Lipsick JS, Botchan MR (2002). "Papel de un complejo proteico que contiene Drosophila Myb en la replicación del ADN específico del sitio". Naturaleza . 420 (6917): 833–7. Código bibliográfico : 2002Natur.420..833B . doi : 10.1038 / nature01228 . PMID 12490953 . S2CID 4425307 .  
  155. ^ Beall EL, Bell M, Georlette D, Botchan MR (julio de 2004). "La letalidad del mutante Dm-myb en Drosophila depende de mip130: regulación positiva y negativa de la replicación del ADN" . Genes y desarrollo . 18 (14): 1667–80. doi : 10.1101 / gad.1206604 . PMC 478189 . PMID 15256498 .  
  156. ^ Lewis PW, Beall EL, Fleischer TC, Georlette D, Link AJ, Botchan MR (diciembre de 2004). "Identificación de un complejo represor transcripcional Drosophila Myb-E2F2 / RBF" . Genes y desarrollo . 18 (23): 2929–40. doi : 10.1101 / gad.1255204 . PMC 534653 . PMID 15545624 .  
  157. ^ Bosco G, Du W, Orr-Weaver TL (marzo de 2001). "Control de la replicación del ADN mediante la interacción de E2F-RB y el complejo de reconocimiento de origen". Biología celular de la naturaleza . 3 (3): 289–95. doi : 10.1038 / 35060086 . PMID 11231579 . S2CID 24942902 .  
  158. ^ Chuang RY, Kelly TJ (marzo de 1999). "El homólogo de levadura de fisión de Orc4p se une al ADN de origen de replicación a través de múltiples AT-hooks" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 96 (6): 2656–61. Código Bibliográfico : 1999PNAS ... 96.2656C . doi : 10.1073 / pnas.96.6.2656 . PMC 15824 . PMID 10077566 .  
  159. ^ Balasov M, Huijbregts RP, Chesnokov I (abril de 2007). "Papel de la proteína Orc6 en la unión y replicación del ADN dependiente del complejo de reconocimiento de origen en Drosophila melanogaster" . Biología Molecular y Celular . 27 (8): 3143–53. doi : 10.1128 / MCB.02382-06 . PMC 1899928 . PMID 17283052 .  
  160. ^ Tardat M, Brustel J, Kirsh O, Lefevbre C, Callanan M, Sardet C, Julien E (noviembre de 2010). "La histona H4 Lys 20 metiltransferasa PR-Set7 regula los orígenes de replicación en células de mamíferos". Biología celular de la naturaleza . 12 (11): 1086–93. doi : 10.1038 / ncb2113 . PMID 20953199 . S2CID 6710289 .  
  161. ^ Beck DB, Burton A, Oda H, Ziegler-Birling C, Torres-Padilla ME, Reinberg D (diciembre de 2012). "El papel de PR-Set7 en la replicación de licencias depende de Suv4-20h" . Genes y desarrollo . 26 (23): 2580–9. doi : 10.1101 / gad.195636.112 . PMC 3521623 . PMID 23152447 .  
  162. ^ Brustel J, Kirstein N, Izard F, Grimaud C, Prorok P, Cayrou C, et al. (Septiembre de 2017). "La trimetilación de la histona H4K20 en los orígenes de disparo tardío asegura la replicación oportuna de la heterocromatina" . El diario EMBO . 36 (18): 2726–2741. doi : 10.15252 / embj.201796541 . PMC 5599798 . PMID 28778956 .  
  163. ^ Shoaib M, Walter D, Gillespie PJ, Izard F, Fahrenkrog B, Lleres D, et al. (Septiembre de 2018). "El umbral de compactación de la cromatina mediada por metilación de la histona H4K20 garantiza la integridad del genoma al limitar las licencias de replicación del ADN" . Comunicaciones de la naturaleza . 9 (1): 3704. Bibcode : 2018NatCo ... 9.3704S . doi : 10.1038 / s41467-018-06066-8 . PMC 6135857 . PMID 30209253 .  
  164. ^ Noguchi K, Vassilev A, Ghosh S, Yates JL, DePamphilis ML (noviembre de 2006). "El dominio BAH facilita la capacidad de la proteína Orc1 humana para activar los orígenes de replicación in vivo" . El diario EMBO . 25 (22): 5372–82. doi : 10.1038 / sj.emboj.7601396 . PMC 1636626 . PMID 17066079 .  
  165. ^ Shen Z, Chakraborty A, Jain A, Giri S, Ha T, Prasanth KV, Prasanth SG (agosto de 2012). "La asociación dinámica de ORCA con componentes complejos prerreplicativos regula el inicio de la replicación del ADN" . Biología Molecular y Celular . 32 (15): 3107–20. doi : 10.1128 / MCB.00362-12 . PMC 3434513 . PMID 22645314 .  
  166. ^ Wang Y, Khan A, Marks AB, Smith OK, Giri S, Lin YC, et al. (Marzo de 2017). "La asociación temporal de ORCA / LRWD1 a los orígenes de disparo tardío durante G1 dicta la replicación y la organización de la heterocromatina" . Investigación de ácidos nucleicos . 45 (5): 2490–2502. doi : 10.1093 / nar / gkw1211 . PMC 5389698 . PMID 27924004 .  
  167. ^ Bartke T, Vermeulen M, Xhemalce B, Robson SC, Mann M, Kouzarides T (octubre de 2010). "Proteínas que interactúan con nucleosomas reguladas por metilación de histonas y ADN" . Celular . 143 (3): 470–84. doi : 10.1016 / j.cell.2010.10.012 . PMC 3640253 . PMID 21029866 .  
  168. ^ Vermeulen M, Eberl HC, Matarese F, Marks H, Denissov S, Butter F, et al. (Septiembre de 2010). "Proteómica de interacción cuantitativa y perfiles de todo el genoma de las marcas de histonas epigenéticas y sus lectores". Celular . 142 (6): 967–80. doi : 10.1016 / j.cell.2010.08.020 . PMID 20850016 . S2CID 7926456 .  
  169. ^ Hein MY, Hubner NC, Poser I, Cox J, Nagaraj N, Toyoda Y, et al. (Octubre de 2015). "Un interactoma humano en tres dimensiones cuantitativas organizado por estequiometrías y abundancias" . Celular . 163 (3): 712-23. doi : 10.1016 / j.cell.2015.09.053 . PMID 26496610 . 
  170. ^ Thomae AW, Pich D, Brocher J, Spindler MP, Berens C, Hock R, et al. (Febrero de 2008). "La interacción entre HMGA1a y el complejo de reconocimiento de origen crea orígenes de replicación específicos del sitio" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 105 (5): 1692–7. Código Bibliográfico : 2008PNAS..105.1692T . doi : 10.1073 / pnas.0707260105 . PMC 2234206 . PMID 18234858 .  
  171. ^ Zhang Y, Huang L, Fu H, Smith OK, Lin CM, Utani K, et al. (Junio ​​de 2016). "Una proteína de unión específica del replicador esencial para el inicio específico del sitio de la replicación del ADN en células de mamíferos" . Comunicaciones de la naturaleza . 7 : 11748. Bibcode : 2016NatCo ... 711748Z . doi : 10.1038 / ncomms11748 . PMC 4899857 . PMID 27272143 .  
  172. ^ Bleichert F, Leitner A, Aebersold R, Botchan MR, Berger JM (junio de 2018). "Control conformacional y mecanismo de unión al ADN del complejo de reconocimiento de origen metazoario" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 115 (26): E5906 – E5915. doi : 10.1073 / pnas.1806315115 . PMC 6042147 . PMID 29899147 .  
  173. ^ Clarey MG, Botchan M, Nogales E (diciembre de 2008). "Estudios de EM de una sola partícula del complejo de reconocimiento de origen de Drosophila melanogaster y evidencia de envoltura de ADN" . Revista de Biología Estructural . 164 (3): 241–9. doi : 10.1016 / j.jsb.2008.08.006 . PMC 2640233 . PMID 18824234 .  
  174. ^ Lee DG, Bell SP (diciembre de 1997). "Arquitectura del complejo de reconocimiento del origen de la levadura unido a los orígenes de la replicación del ADN" . Biología Molecular y Celular . 17 (12): 7159–68. doi : 10.1128 / mcb.17.12.7159 . PMC 232573 . PMID 9372948 .  
  175. ^ Riera A, Barbon M, Noguchi Y, Reuter LM, Schneider S, Speck C (junio de 2017). "De la estructura al inicio de la comprensión del mecanismo de la replicación del ADN" . Genes y desarrollo . 31 (11): 1073–1088. doi : 10.1101 / gad.298232.117 . PMC 5538431 . PMID 28717046 .  
  176. ^ Tognetti S, Riera A, Speck C (marzo de 2015). "Encienda el motor: cómo se activa la helicasa replicativa eucariota MCM2-7". Cromosoma . 124 (1): 13-26. doi : 10.1007 / s00412-014-0489-2 . hdl : 10044/1/27085 . PMID 25308420 . S2CID 175510 .  
  177. ^ Berbenetz NM, Nislow C, Brown GW (septiembre de 2010). "Diversidad de los orígenes de la replicación del ADN eucariota revelada por el análisis de todo el genoma de la estructura de la cromatina" . PLOS Genetics . 6 (9): e1001092. doi : 10.1371 / journal.pgen.1001092 . PMC 2932696 . PMID 20824081 .  
  178. ^ Eaton ML, Galani K, Kang S, Bell SP, MacAlpine DM (abril de 2010). "El posicionamiento conservado del nucleosoma define los orígenes de la replicación" . Genes y desarrollo . 24 (8): 748–53. doi : 10.1101 / gad.1913210 . PMC 2854390 . PMID 20351051 .  
  179. ^ a b Azmi IF, Watanabe S, Maloney MF, Kang S, Belsky JA, MacAlpine DM, et al. (Marzo de 2017). "Los nucleosomas influyen en múltiples pasos durante el inicio de la replicación" . eLife . 6 . doi : 10.7554 / eLife.22512 . PMC 5400510 . PMID 28322723 .  
  180. ^ Miotto B, Struhl K (enero de 2010). "La actividad de la histona acetilasa HBO1 es esencial para la concesión de licencias de replicación del ADN e inhibida por Geminin" . Célula molecular . 37 (1): 57–66. doi : 10.1016 / j.molcel.2009.12.012 . PMC 2818871 . PMID 20129055 .  
  181. ^ Liu J, Zimmer K, Rusch DB, Paranjape N, Podicheti R, Tang H, Calvi BR (octubre de 2015). "Plantillas de secuencia de ADN adyacentes a sitios de nucleosoma y ORC en los orígenes de amplificación de genes en Drosophila" . Investigación de ácidos nucleicos . 43 (18): 8746–61. doi : 10.1093 / nar / gkv766 . PMC 4605296 . PMID 26227968 .  
  182. ^ Zhao PA, Rivera-Mulia JC, Gilbert DM (2017). "Dominios de replicación: compartimentación del genoma en unidades funcionales de replicación". Avances en Medicina y Biología Experimental . 1042 : 229-257. doi : 10.1007 / 978-981-10-6955-0_11 . ISBN 978-981-10-6954-3. PMID  29357061 .
  183. ↑ Sugimoto N, Fujita M (2017). "Mecanismo molecular para la regulación de la cromatina durante la carga de MCM en células de mamíferos". Avances en Medicina y Biología Experimental . 1042 : 61–78. doi : 10.1007 / 978-981-10-6955-0_3 . ISBN 978-981-10-6954-3. PMID  29357053 .
  184. ^ MacAlpine DM, Almouzni G (agosto de 2013). "Replicación de cromatina y ADN" . Perspectivas de Cold Spring Harbor en biología . 5 (8): a010207. doi : 10.1101 / cshperspect.a010207 . PMC 3721285 . PMID 23751185 .  
  185. ^ Sima J, Chakraborty A, Dileep V, Michalski M, Klein KN, Holcomb NP, et al. (Febrero de 2019). "Identificación de elementos cis para el control espacio-temporal de la replicación del ADN de mamíferos" . Celular . 176 (4): 816–830.e18. doi : 10.1016 / j.cell.2018.11.036 . PMC 6546437 . PMID 30595451 .  
  186. ^ Cadoret JC, Meisch F, Hassan-Zadeh V, Luyten I, Guillet C, Duret L, et al. (Octubre de 2008). "Los estudios de todo el genoma destacan los vínculos indirectos entre los orígenes de la replicación humana y la regulación de los genes" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 105 (41): 15837–42. Código Bibliográfico : 2008PNAS..10515837C . doi : 10.1073 / pnas.0805208105 . PMC 2572913 . PMID 18838675 .  
  187. ^ Sankar TS, Wastuwidyaningtyas BD, Dong Y, Lewis SA, Wang JD (julio de 2016). "La naturaleza de las mutaciones inducidas por colisiones de replicación-transcripción" . Naturaleza . 535 (7610): 178–81. Código bibliográfico : 2016Natur.535..178S . doi : 10.1038 / nature18316 . PMC 4945378 . PMID 27362223 .  
  188. ^ Azvolinsky A, Giresi PG, Lieb JD, Zakian VA (junio de 2009). "Los genes de la ARN polimerasa II altamente transcritos son impedimentos para la progresión de la horquilla de replicación en Saccharomyces cerevisiae" . Célula molecular . 34 (6): 722–34. doi : 10.1016 / j.molcel.2009.05.022 . PMC 2728070 . PMID 19560424 .  
  189. ^ Gros J, Kumar C, Lynch G, Yadav T, Whitehouse I, Remus D (diciembre de 2015). "Especificación posterior a la licencia de los orígenes de la replicación eucariota por Mcm2-7 facilitado deslizándose a lo largo del ADN" . Célula molecular . 60 (5): 797–807. doi : 10.1016 / j.molcel.2015.10.022 . PMC 4680849 . PMID 26656162 .  
  190. ^ Letessier A, Millot GA, Koundrioukoff S, Lachagès AM, Vogt N, Hansen RS, et al. (Febrero de 2011). "Los programas de iniciación de la replicación específicos del tipo de célula establecen la fragilidad del sitio frágil FRA3B". Naturaleza . 470 (7332): 120–3. Código Bibliográfico : 2011Natur.470..120L . doi : 10.1038 / nature09745 . PMID 21258320 . S2CID 4302940 .  
  191. ^ a b Smith OK, Kim R, Fu H, Martin MM, Lin CM, Utani K, et al. (2016). "Distintas características epigenéticas de los orígenes de replicación regulados por diferenciación" . Epigenética y cromatina . 9 : 18. doi : 10.1186 / s13072-016-0067-3 . PMC 4862150 . PMID 27168766 .  
  192. ^ Sher N, Bell GW, Li S, Nordman J, Eng T, Eaton ML, et al. (Enero de 2012). "Control del desarrollo del número de copias del gen mediante la represión del inicio de la replicación y la progresión de la bifurcación" . Investigación del genoma . 22 (1): 64–75. doi : 10.1101 / gr.126003.111 . PMC 3246207 . PMID 22090375 .  
  193. ^ Comoglio F, Schlumpf T, Schmid V, Rohs R, Beisel C, Paro R (mayo de 2015). "El perfil de alta resolución de los sitios de inicio de replicación de Drosophila revela una forma de ADN y una firma de cromatina de los orígenes de los metazoos" . Informes de celda . 11 (5): 821–34. doi : 10.1016 / j.celrep.2015.03.070 . PMC 4562395 . PMID 25921534 .  
  194. ^ Calvi BR, Lilly MA, Spradling AC (marzo de 1998). "Control del ciclo celular de la amplificación del gen corion" . Genes y desarrollo . 12 (5): 734–44. doi : 10.1101 / gad.12.5.734 . PMC 316579 . PMID 9499407 .  
  195. ^ Mosig G (1998). "Recombinación y replicación de ADN dependiente de recombinación en bacteriófago T4". Revisión anual de genética . 32 : 379–413. doi : 10.1146 / annurev.genet.32.1.379 . PMID 9928485 . 
  196. ^ Ravoitytė B, Wellinger RE (enero de 2017). "Iniciación de replicación no canónica: ¡Estás despedido!" . Genes . 8 (2): 54. doi : 10.3390 / genes8020054 . PMC 5333043 . PMID 28134821 .  
  197. ^ Asai T, Sommer S, Bailone A, Kogoma T (agosto de 1993). "Iniciación homóloga dependiente de la recombinación de la replicación del ADN a partir de orígenes inducibles por daños en el ADN en Escherichia coli" . El diario EMBO . 12 (8): 3287–95. doi : 10.1002 / j.1460-2075.1993.tb05998.x . PMC 413596 . PMID 8344265 .  
  198. ^ Lydeard JR, Jain S, Yamaguchi M, Haber JE (agosto de 2007). "La replicación inducida por rotura y el mantenimiento de los telómeros independientes de la telomerasa requieren Pol32". Naturaleza . 448 (7155): 820–3. Código Bibliográfico : 2007Natur.448..820L . doi : 10.1038 / nature06047 . PMID 17671506 . S2CID 4373857 .  
  199. ^ Dasgupta S, Masukata H, Tomizawa J (diciembre de 1987). "Múltiples mecanismos para el inicio de la replicación del ADN ColE1: síntesis de ADN en presencia y ausencia de ribonucleasa H". Celular . 51 (6): 1113–22. doi : 10.1016 / 0092-8674 (87) 90597-6 . PMID 2446774 . S2CID 22858038 .  
  200. ^ Stuckey R, García-Rodríguez N, Aguilera A, Wellinger RE (mayo de 2015). "Papel para el ARN: híbridos de ADN en el cebado de replicación independiente del origen en un sistema eucariota" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 112 (18): 5779–84. Código bibliográfico : 2015PNAS..112.5779S . doi : 10.1073 / pnas.1501769112 . PMC 4426422 . PMID 25902524 .  
  201. ^ Burki F (mayo de 2014). "El árbol eucariota de la vida desde una perspectiva filogenómica global" . Perspectivas de Cold Spring Harbor en biología . 6 (5): a016147. doi : 10.1101 / cshperspect.a016147 . PMC 3996474 . PMID 24789819 .  
  202. ^ Lee PH, Meng X, Kapler GM (enero de 2015). "Regulación del desarrollo del complejo de reconocimiento de origen de Tetrahymena thermophila" . PLOS Genetics . 11 (1): e1004875. doi : 10.1371 / journal.pgen.1004875 . PMC 4287346 . PMID 25569357 .  
  203. ^ Mohammad MM, Donti TR, Sebastian Yakisich J, Smith AG, Kapler GM (diciembre de 2007). "Tetrahymena ORC contiene un fragmento de ARN ribosómico que participa en el reconocimiento del origen del ADNr" . El diario EMBO . 26 (24): 5048–60. doi : 10.1038 / sj.emboj.7601919 . PMC 2140106 . PMID 18007594 .  
  204. ^ Donti TR, Datta S, Sandoval PY, Kapler GM (febrero de 2009). "Orientación diferencial de Tetrahymena ORC a orígenes de replicación de ADN ribosómico y no ADNr" . El diario EMBO . 28 (3): 223–33. doi : 10.1038 / emboj.2008.282 . PMC 2637336 . PMID 19153611 .  
  205. ^ Marques CA, McCulloch R (febrero de 2018). "Conservación y variación en las estrategias para la replicación del ADN de los genomas nucleares de cinetoplasto" . Genómica actual . 19 (2): 98–109. doi : 10.2174 / 1389202918666170815144627 . PMC 5814967 . PMID 29491738 .  
  206. ^ Marques CA, Tiengwe C, Lemgruber L, Damasceno JD, Scott A, Paape D, et al. (Junio ​​de 2016). "Composición divergente y regulación del complejo de reconocimiento de origen de Trypanosoma brucei que media el inicio de la replicación del ADN" . Investigación de ácidos nucleicos . 44 (10): 4763–84. doi : 10.1093 / nar / gkw147 . PMC 4889932 . PMID 26951375 .  
  207. ^ Tiengwe C, Marcello L, Farr H, Gadelha C, Burchmore R, Barry JD, et al. (2012). "La identificación de factores que interactúan con ORC1 / CDC6 en Trypanosoma brucei revela características críticas de la arquitectura compleja de reconocimiento de origen" . PLOS ONE . 7 (3): e32674. Código bibliográfico : 2012PLoSO ... 732674T . doi : 10.1371 / journal.pone.0032674 . PMC 3297607 . PMID 22412905 .  
  208. ^ Marques CA, Dickens NJ, Paape D, Campbell SJ, McCulloch R (octubre de 2015). "El mapeo de todo el genoma revela la replicación cromosómica de origen único en Leishmania, un microbio eucariota" . Biología del genoma . 16 : 230. doi : 10.1186 / s13059-015-0788-9 . PMC 4612428 . PMID 26481451 .  

Lectura adicional [ editar ]

  • Lewin B (2004). Genes VIII . Prentice Hall. ISBN 978-0-13-144945-9.

Enlaces externos [ editar ]

  • Ori-Finder, un software en línea para la predicción de bacterias y arqueas Oric s
  • Replicación + Origen en los títulos de materias médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .