Un outron es una secuencia de nucleótidos en el extremo 5 'de la transcripción primaria de un gen que se elimina mediante una forma especial de empalme de ARN durante la maduración del producto de ARN final. [1] Mientras que las secuencias de intrones se encuentran dentro del gen, las secuencias de outron se encuentran fuera del gen. [2]
Características [ editar ]
El outron es una secuencia similar a un intrón que posee características similares, como el contenido de G + C [3] y un sitio aceptor de empalme que es la señal para el empalme trans . [4] [5] Tal sitio trans- empalme se define esencialmente como un sitio de empalme aceptor (3 ') sin un sitio de empalme donante corriente arriba (5').
En eucariotas como euglenozoos , dinoflagelados , esponjas , nematodos , cnidarios , ctenóforos , gusanos planos , crustáceos , quetognatos , rotíferos y tunicados , la longitud de los outrones líderes empalmados (SL) varía de 30 a 102 nucleótidos (nt) , con el exón SL la longitud varía de 16 a 51 nt, y la longitud total del ARN de SL varía de 46 a 141 nt. [3]
Procesando [ editar ]
En el empalme en cis estándar , se requiere el sitio de empalme donante en la posición aguas arriba junto con un sitio aceptor ubicado en la posición aguas abajo en la misma molécula de pre-ARN. Por el contrario, el empalme trans SL se basa en un sitio de empalme aceptor 3 'en el outron, y un sitio de empalme donante 5' (dinucleótido GU) ubicado en una molécula de ARN separada, el ARN SL. [3] Además, el outrón del ARNm prematuro contiene una adenosina ramificada , seguida de un tracto de polipirimidina aguas abajo , que interactúa con la porción similar a un intrón del ARN SL para formar un subproducto ramificado en 'Y', que recuerda al lazo.estructura formada durante el empalme de intrones. Entonces, la maquinaria nuclear resuelve esta estructura de ramificación en 'Y' empalmando en trans la secuencia de ARN de SL en el sitio aceptor de la división en 3 ' trans (dinucleótido AG) del pre-ARNm. [2]
Cuando se procesan los outrones, el exón SL se empalma en trans en sitios aceptores aguas abajo distintos, no apareados, adyacentes a cada marco de lectura abierto del pre-ARNm policistrónico, lo que conduce a transcritos con capuchón maduros distintos.[6] [7] [8]
Ver también [ editar ]
- Exón
- ARN mensajero
Referencias [ editar ]
- ^ Conrad, Richard; Fen Liou, Ruey; Blumenthal, Thomas (25 de febrero de 1993). "Análisis funcional de un aceptor de empalme trans de C. elegans " . Investigación de ácidos nucleicos . 21 (4): 913–919. doi : 10.1093 / nar / 21.4.913 . ISSN 0305-1048 . PMC 309224 . PMID 8451190 .
- ^ a b Stover, Nicholas A .; Kaye, Michelle S .; Cavalcanti, Andre RO (10 de enero de 2006). "Empalme trans de líder empalmado" . Biología actual . 16 (1): R8 – R9. doi : 10.1016 / j.cub.2005.12.019 . ISSN 0960-9822 . PMID 16401417 .
- ^ a b c Lasda, Erika L .; Blumenthal, Thomas (1 de mayo de 2011). " Trans- empalme". Revisiones interdisciplinarias de Wiley: ARN . 2 (3): 417–434. doi : 10.1002 / wrna.71 . PMID 21957027 .
- ^ "Referencia de Oxford - Outron" . Consultado el 26 de septiembre de 2019 .
- ^ "El navegador de ontología de secuencia de MISO - Outron (SO: 0001475)" . Consultado el 26 de septiembre de 2019 .
- ↑ Clayton, Christine E. (15 de abril de 2002). "¿Vida sin control transcripcional? De volar a hombre y viceversa" . El diario EMBO . 21 (8): 1881–1888. doi : 10.1093 / emboj / 21.8.1881 . ISSN 1460-2075 . PMC 125970 . PMID 11953307 .
- ^ Blumenthal, Thomas; Gleason, Kathy Seggerson (febrero de 2003). " Caenorhabditis elegans operons: forma y función". Nature Reviews Genética . 4 (2): 110-118. doi : 10.1038 / nrg995 . ISSN 1471-0056 . PMID 12560808 .
- ^ Lei Q, Li C, Zuo Z, Huang C, Cheng H, Zhou R (marzo de 2016). "Perspectivas evolutivas en el empalme trans de ARN en vertebrados" . Biología y evolución del genoma . 8 (3): 562–77. doi : 10.1093 / gbe / evw025 . PMC 4824033 . PMID 26966239 .
