El empalme trans es una forma especial de procesamiento de ARN donde los exones de dos transcripciones de ARN primarias diferentesse unen de un extremo a otro y se ligan . Por lo general, se encuentra en eucariotas y está mediado por el espliceosoma , aunque algunas bacterias y arqueas también tienen "medios genes" para los ARNt . [1]
Génica trans -empalme
Mientras que el empalme "normal" ( cis -) procesa una sola molécula, el empalme en trans genera una única transcripción de ARN a partir de múltiples pre-ARNm separados . Este fenómeno se puede aprovechar para la terapia molecular para abordar los productos génicos mutados. [2]
Oncogénesis
Si bien algunas transcripciones de fusión se producen a través del empalme trans en células humanas normales, [1] el empalme trans también puede ser el mecanismo detrás de ciertas transcripciones de fusión oncogénicas . [3] [4]
Empalme trans SL
Empalmado líder (SL) trans -empalme es utilizado por ciertos microorganismos, especialmente los protistas de la clase Kinetoplastae para expresar genes. En estos organismos, se transcribe un ARN líder de empalme protegido y, simultáneamente, los genes se transcriben en policistrones largos. [5] El líder de empalme bloqueado se empalma en trans en cada gen para generar transcripciones monocistrónicas bloqueadas y poliadeniladas. [6] Estos eucariotas de divergencia temprana usan pocos intrones , y el espliceosoma que poseen muestra algunas variaciones inusuales en el ensamblaje de su estructura. [6] [7] También poseen múltiples isoformas de eIF4E con funciones especializadas en la protección. [8]
Algunos otros eucariotas, sobre todo entre los dinoflagelados , esponjas , nematodos , cnidarios , ctenóforos , gusanos planos , crustáceos , quetognatos , rotíferos y tunicados también utilizan con mayor o menor frecuencia el trans- empalme SL . [1] [9] En los tunicado Ciona intestinalis , la extensión de SL trans -empalme se describe mejor por un punto de vista cuantitativo reconocer con frecuencia y con poca frecuencia trans genes -spliced en lugar de un binario y categorización convencional de trans -spliced frente a no trans - genes empalmados. [10]
Una función del empalme trans SL es la resolución de las transcripciones policistrónicas de operones en ARNm individuales con terminación en 5 '. Este procesamiento se logra cuando los outrones se empalman en trans a sitios aceptores aguas abajo, no apareados, adyacentes a los marcos de lectura abiertos del cistrón . [11] [12]
Ver también
Referencias
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Otras lecturas
- Dixon RJ, Eperon IC, Samani NJ (enero de 2007). "Motivos complementarios de la secuencia del intrón asociados con la repetición del exón humano: un papel para las interacciones intragénicas, entre transcripciones en la expresión génica" . Bioinformática . 23 (2): 150–5. doi : 10.1093 / bioinformatics / btl575 . PMID 17105720 .
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