La peptidil arginina deiminasa, tipo IV , también conocida como PADI4 , es una proteína humana que en los seres humanos está codificada por el gen PADI4 . [5] [6]
PADI4 | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | PADI4 , PAD, PAD4, PADI5, PDI4, PDI5, peptidil arginina deiminasa 4 | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 605347 MGI : 1338898 HomoloGene : 7883 GeneCards : PADI4 | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 1: 17,31 - 17,36 Mb | Crónicas 4: 140,75 - 140,77 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Biología Molecular
El gen humano se encuentra en el brazo corto del cromosoma 1 cerca del telómero (1p36.13). Se encuentra en la cadena Watson (plus) y tiene 55,806 bases de largo. La proteína tiene 663 aminoácidos de longitud con un peso molecular de 74.095 Da. [5]
Función
Este gen es miembro de una familia de genes que codifica las enzimas responsables de la conversión de arginina en residuos de citrulina . Este gen puede desempeñar un papel en el desarrollo de granulocitos y macrófagos , lo que provoca inflamación y respuesta inmunitaria. [6] PADI4 juega un papel en la epigenética, la desiminación de las argininas en las histonas 3 y 4 puede actuar de manera antagónica a la metilación de la arginina (modificaciones de la cromatina y su función, Kouzarides 2007, Cell, revisión)
La proteína se puede encontrar en oligómeros y se une a 5 iones de calcio por subunidad. Cataliza la reacción:
- Proteína L-arginina + H 2 O = proteína L-citrulina + NH 3
Distribución subcelular y tisular
Normalmente se encuentra en el citoplasma , núcleo y gránulos citoplasmáticos de eosinófilos y neutrófilos . No se expresa en monocitos o linfocitos periféricos . También se expresa en los tejidos sinoviales de la artritis reumatoide.
Referencias
- ^ a b c ENSG00000159339 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000280908, ENSG00000159339 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000025330 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
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- ^ a b "Entrez Gene: PADI4 peptidil arginina deiminasa, tipo IV" .
Otras lecturas
- Nakashima K, Hagiwara T, Ishigami A y col. (1999). "Caracterización molecular de peptidilarginina deiminasa en células HL-60 inducida por ácido retinoico y 1 alfa, 25-dihidroxivitamina D (3)" . J. Biol. Chem . 274 (39): 27786–92. doi : 10.1074 / jbc.274.39.27786 . PMID 10488123 .
- Zhang QH, Ye M, Wu XY y col. (2001). "Clonación y análisis funcional de ADNc con marcos de lectura abiertos para 300 genes previamente indefinidos expresados en células madre / progenitoras hematopoyéticas CD34 +" . Genome Res . 10 (10): 1546–60. doi : 10.1101 / gr.140200 . PMC 310934 . PMID 11042152 .
- Asaga H, Nakashima K, Senshu T, et al. (2001). "Localización inmunocitoquímica de peptidilarginina deiminasa en eosinófilos y neutrófilos humanos". J. Leukoc. Biol . 70 (1): 46–51. PMID 11435484 .
- Nakashima K, Hagiwara T, Yamada M (2003). "Localización nuclear de peptidilarginina deiminasa V y deiminación de histonas en granulocitos" . J. Biol. Chem . 277 (51): 49562–8. doi : 10.1074 / jbc.M208795200 . PMID 12393868 .
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