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PDGFA
Estructuras disponibles
PDBBúsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Lista de códigos de identificación de PDB

3MJK

Identificadores
AliasPDGFA , PDGF-A, PDGF1, subunidad A del factor de crecimiento derivado de plaquetas
Identificaciones externasOMIM : 173430 MGI : 97527 HomoloGene : 32055 GeneCards : PDGFA
Ubicación de genes ( humanos )
Chromosome 7 (human)
Chr.Chromosome 7 (human)[1]
Chromosome 7 (human)
Genomic location for PDGFA
Genomic location for PDGFA
Band7p22.3Start497,258 bp[1]
End520,296 bp[1]
Ubicación de genes ( ratón )
Chromosome 5 (mouse)
Chr.Chromosome 5 (mouse)[2]
Chromosome 5 (mouse)
Genomic location for PDGFA
Genomic location for PDGFA
Band5 G2|5 77.65 cMStart138,976,014 bp[2]
End138,997,370 bp[2]
Patrón de expresión de ARN
PBB GE PDGFA 216867 s at fs.png

PBB GE PDGFA 205463 s at fs.png
More reference expression data
Ontología de genes
Molecular function• collagen binding
• protein homodimerization activity
• platelet-derived growth factor receptor binding
• GO:0001948 protein binding
• platelet-derived growth factor binding
• protein heterodimerization activity
• growth factor activity
• phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity
• identical protein binding
Cellular component• endoplasmic reticulum lumen
• membrane
• Golgi membrane
• extracellular region
• microvillus
• cell surface
• platelet alpha granule lumen
• extracellular space
• Golgi lumen
Biological process• hair follicle development
• embryonic lung development
• positive regulation of metanephric mesenchymal cell migration by platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway
• negative chemotaxis
• regulation of actin cytoskeleton organization
• positive regulation of MAP kinase activity
• regulation of branching involved in salivary gland morphogenesis by epithelial-mesenchymal signaling
• positive regulation of cell migration
• positive regulation of fibroblast proliferation
• cell-cell signaling
• platelet degranulation
• extracellular matrix organization
• regulation of DNA biosynthetic process
• cell activation
• MAPK cascade
• negative regulation of platelet activation
• multicellular organism development
• positive regulation of mesenchymal cell proliferation
• response to wounding
• cell projection assembly
• negative regulation of phosphatidylinositol biosynthetic process
• angiogenesis
• positive regulation of protein autophosphorylation
• positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
• regulation of smooth muscle cell migration
• animal organ morphogenesis
• positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling
• platelet-derived growth factor receptor signaling pathway
• lung alveolus development
• positive regulation of cell division
• actin cytoskeleton organization
• positive regulation of MAPK cascade
• skin development
• regulation of glomerular mesangial cell proliferation
• regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation
• wound healing
• phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process
• positive regulation of cell population proliferation
• regulation of signaling receptor activity
• positive regulation of protein kinase B signaling
Sources:Amigo / QuickGO
Ortólogos
EspeciesHumanoRatón
Entrez

5154

18590

Ensembl

ENSG00000197461

ENSMUSG00000025856

UniProt

P04085

P20033

RefSeq (ARNm)
NM_002607
NM_033023
NM_001395363
NM_001395364
NM_001395365

NM_001395366

NM_008808
NM_001363271

RefSeq (proteína)

NP_002598
NP_148983

NP_032834
NP_001350200

Ubicación (UCSC)Crónicas 7: 0,5 - 0,52 MbCrónicas 5: 138,98 - 139 Mb
Búsqueda en PubMed[3][4]
Wikidata
Ver / editar humanoVer / Editar mouse

La subunidad A del factor de crecimiento derivado de plaquetas es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen PDGFA . [5] [6]

La proteína codificada por este gen es un miembro de la familia de factores de crecimiento derivados de plaquetas . Los cuatro miembros de esta familia son factores mitogénicos para células de origen mesenquimatoso y se caracterizan por un motivo de ocho cisteínas. Este producto génico puede existir como homodímero o como heterodímero con el polipéptido beta del factor de crecimiento derivado de plaquetas, donde los dímeros están conectados por enlaces disulfuro . Los estudios con ratones knock-out han mostrado defectos celulares en oligodendrocitos , células del músculo liso alveolar y células de Leydig en los testículos ; ratones knockout mueren comoembriones o poco después del nacimiento. Se han identificado dos variantes de corte y empalme para este gen. [7]

Referencias

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000197461 - Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000025856 - Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  5. ^ Stenman G, Rorsman F, Huebner K, Betsholtz C (septiembre de 1992). "El gen de la cadena alfa del factor de crecimiento derivado de plaquetas humano (PDGFA) se asigna al cromosoma 7p22". Gen de células citogenéticas . 60 (3–4): 206–7. doi : 10.1159 / 000133337 . PMID 1505216 . 
  6. ^ Matsui T, Heidaran M, Miki T, Popescu N, La Rochelle W, Kraus M, Pierce J, Aaronson S (marzo de 1989). "El aislamiento de un nuevo cDNA de receptor establece la existencia de dos genes de receptor de PDGF" . Ciencia . 243 (4892): 800–4. doi : 10.1126 / science.2536956 . PMID 2536956 . 
  7. ^ "Entrez Gene: polipéptido alfa del factor de crecimiento derivado de plaquetas PDGFA" .

Lectura adicional

  • Nath K, Gogi R, Khan AA, Hameed S (1978). "Hamartoma vascular y tumores vasculares de órbita". Revista India de Oftalmología . 25 (1): 18-23. PMID  612586 .
  • Ishibashi T, Bottaro DP, Chan A y col. (1993). "Clonación de expresión de una fosfatasa de doble especificidad humana" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 89 (24): 12170–4. doi : 10.1073 / pnas.89.24.12170 . PMC  50720 . PMID  1281549 .
  • Raines EW, Lane TF, Iruela-Arispe ML, et al. (1992). "La glicoproteína extracelular SPARC interactúa con el factor de crecimiento derivado de plaquetas (PDGF) -AB y -BB e inhibe la unión de PDGF a sus receptores" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 89 (4): 1281–5. doi : 10.1073 / pnas.89.4.1281 . PMC  48433 . PMID  1311092 .
  • Andersson M, Ostman A, Bäckström G, et al. (1992). "Asignación de enlaces disulfuro entre cadenas en factor de crecimiento derivado de plaquetas (PDGF) y evidencia de actividad agonista de PDGF monomérico". J. Biol. Chem . 267 (16): 11260–6. PMID  1317862 .
  • Rorsman F, Leveen P, Betsholtz C (1993). "Heterogeneidad de ARNm de cadena A del factor de crecimiento derivado de plaquetas (PDGF) generada por el uso de promotores alternativos y sitios de poliadenilación alternativos". Factores de crecimiento . 7 (3): 241–51. doi : 10.3109 / 08977199209046928 . PMID  1360804 .
  • Wang Z, Lin XH, Qiu QQ, Deuel TF (1992). "Modulación de la transcripción del gen de la cadena A del factor de crecimiento derivado de plaquetas por una región promotora sensible a la nucleasa S1". J. Biol. Chem . 267 (24): 17022–31. PMID  1512241 .
  • Bonthron D, Collins T, Grzeschik KH, et al. (1992). "Cadena del factor de crecimiento derivado de plaquetas A: confirmación de la localización de PDGFA en el cromosoma 7p22 y descripción de un minisatélite inusual". Genómica . 13 (2): 257–63. doi : 10.1016 / 0888-7543 (92) 90240-S . PMID  1612586 .
  • Takimoto Y, Wang ZY, Kobler K, Deuel TF (1991). "Región promotora del gen de la cadena A del factor de crecimiento derivado de plaquetas humano" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 88 (5): 1686–90. doi : 10.1073 / pnas.88.5.1686 . PMC  51089 . PMID  1848007 .
  • Fabisiak JP, Evans JN, Absher M y col. (1991). "Expresión de ARNm de cadena A del factor de crecimiento derivado de plaquetas (PDGF-A) en células y tejido pulmonar. Regulación compleja durante la remodelación". Pecho . 99 (Supl. 3): 52S – 54S. doi : 10.1378 / chest.99.3_Supplement.52S . PMID  1997274 .
  • Mendoza AE, Young R, Orkin SH, Collins T (1990). "Aumento de la expresión de la cadena A del factor de crecimiento derivado de plaquetas en las células del músculo liso uterino humano durante la hipertrofia fisiológica del embarazo" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 87 (6): 2177–81. doi : 10.1073 / pnas.87.6.2177 . PMC  53649 . PMID  2315311 .
  • Claesson-Welsh L, Eriksson A, Westermark B, Heldin CH (1989). "La clonación de ADNc y la expresión del receptor del factor de crecimiento derivado de plaquetas (PDGF) de tipo A humano establece una similitud estructural con el receptor de PDGF de tipo B" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 86 (13): 4917–21. doi : 10.1073 / pnas.86.13.4917 . PMC  297526 . PMID  2544881 .
  • Rorsman F, Bywater M, Knott TJ y col. (1988). "Caracterización estructural del gen y el ADNc de la cadena A del factor de crecimiento derivado de plaquetas humano: el uso de exón alternativo predice dos proteínas precursoras diferentes" . Mol. Celda. Biol . 8 (2): 571–7. doi : 10.1128 / MCB.8.2.571 . PMC  363182 . PMID  2832727 .
  • Beckmann MP, Betsholtz C, Heldin CH, et al. (1988). "Comparación de propiedades biológicas y potencial transformador de cadenas humanas de PDGF-A y PDGF-B" . Ciencia . 241 (4871): 1346–9. doi : 10.1126 / science.2842868 . PMID  2842868 .
  • Bonthron DT, Morton CC, Orkin SH, Collins T (1988). "Cadena de factor de crecimiento derivado de plaquetas A: estructura genética, ubicación cromosómica y base para el empalme de ARNm alternativo" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 85 (5): 1492–6. doi : 10.1073 / pnas.85.5.1492 . PMC  279797 . PMID  3422746 .
  • Tong BD, Auer DE, Jaye M y col. (1987). "Los clones de ADNc revelan diferencias entre las cadenas A del factor de crecimiento derivado de plaquetas de células gliales y endoteliales humanas". Naturaleza . 328 (6131): 619–21. doi : 10.1038 / 328619a0 . PMID  3614363 . S2CID  4362771 .
  • Collins T, Bonthron DT, Orkin SH (1987). "El empalme de ARN alternativo afecta la función de la cadena A del factor de crecimiento derivado de plaquetas codificado". Naturaleza . 328 (6131): 621–4. doi : 10.1038 / 328621a0 . PMID  3614364 . S2CID  4268696 .
  • Hoppe J, Schumacher L, Eichner W, Weich HA (1987). "Las regiones largas sin traducir 3 'de los ARNm de PDGF-A y -B están relacionadas sólo de forma distante". FEBS Lett . 223 (2): 243–6. doi : 10.1016 / 0014-5793 (87) 80297-1 . PMID  3666150 . S2CID  46032767 .
  • Betsholtz C, Johnsson A, Heldin CH y col. (1986). "Secuencia de ADNc y localización cromosómica de la cadena A del factor de crecimiento derivado de plaquetas humano y su expresión en líneas de células tumorales". Naturaleza . 320 (6064): 695–9. doi : 10.1038 / 320695a0 . PMID  3754619 . S2CID  4281536 .
  • Takimoto Y, Li WY, Wang ZY y col. (1993). "Secuencia de nucleótidos de la región 5 'del gen de la cadena A del factor de crecimiento derivado de plaquetas humano". Hiroshima J. Med. Sci . 42 (1): 47–52. PMID  8486521 .
  • v
  • t
  • e