La podoplanina es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen "PDPN" . [4] [5] [6]
PDPN | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | PDPN , AGGRUS, GP36, GP40, Gp38, HT1A-1, OTS8, PA2.26, T1A, T1A-2, T1A2, TI1A, podoplanina | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 608863 MGI : 103098 HomoloGene : 4729 GeneCards : PDPN | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (ARNm) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (proteína) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ubicación (UCSC) | Crónicas 1: 13,58 - 13,62 Mb | n / A | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [2] | [3] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
|
Estructura y función
La podoplanina es una proteína de tipo mucina con una masa de 36 a 43 kDa. Está relativamente bien conservado entre especies, con homólogos en humanos, ratones, ratas, perros y hámsteres. [7]
Este gen codifica una glucoproteína de tipo I, de membrana integral, fuertemente O- glicosilada, con distribución diversa en los tejidos humanos. La función fisiológica de esta proteína puede estar relacionada con su carácter de tipo mucina. La proteína homóloga en otras especies se ha descrito como un antígeno de diferenciación y un receptor del virus de la influenza. No se ha determinado la función específica de esta proteína pero se ha propuesto como marcador de lesión pulmonar. Alternativamente, se han identificado variantes de transcripciones empalmadas que codifican diferentes isoformas. [6]
Se ha descubierto que esta proteína tiene funciones en las células alveolares pulmonares, los podocitos renales y las células endoteliales linfáticas. Más recientemente, esta proteína se ha encontrado en el tejido neural tanto en muestras humanas como de ratones. [8]
En las células endoteliales linfáticas, la experimentación ha indicado que la podoplanina desempeña un papel en la formación adecuada de enlaces entre el sistema cardiovascular y los sistemas linfáticos, causando típicamente la enfermedad del hígado graso en estos ratones. [8]
Aunque se desconoce la función exacta en muchos tejidos, la podoplanina generalmente es receptiva a la detección mediante tinción inmunofluorescente y se ha demostrado que se localiza conjuntamente con la proteína nestina , una proteína de filamento intermedio de tipo VI que se expresa casi principalmente en tejidos neurales. [9] Actualmente, la única proteína conocida que interactúa fisiológicamente con la podoplanina es CLEC-2 , una lectina 2 de tipo C expresada en plaquetas y células hematopoyéticas . [10] Ambos cumplen una función en la formación adecuada de conexiones sanguíneas / linfáticas en el desarrollo embrionario.
Significación clínica
La PDPN se ha estudiado ampliamente en el campo del cáncer. Es un marcador de vasos linfáticos específico y, dado que los niveles de linfangiogénesis se correlacionan con un mal pronóstico en pacientes con cáncer, se puede utilizar como marcador de diagnóstico. [7] A menudo se regula al alza en ciertos tipos de cáncer, incluidos varios tipos de carcinomas de células escamosas , mesotelioma maligno y tumores cerebrales . [7] Además, los fibroblastos asociados al cáncer (CAF) en el estroma tumoral pueden regularlo al alza, [7] [11] donde se ha asociado con un pronóstico precario. [12]
En los carcinomas de células escamosas, se cree que la PDPN desempeña un papel clave en la invasividad de las células cancerosas al controlar los invadopodios y, por lo tanto, mediar en la degradación eficaz de la ECM . [13]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000162493 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Zimmer G, Oeffner F, Von Messling V, Tschernig T, Gröness HJ, Klenk HD, Herrler G (julio de 1999). "Clonación y caracterización de gp36, una glicoproteína de tipo mucina humana expresada preferentemente en el endotelio vascular" . La revista bioquímica . 341 (Pt 2) (Pt 2): 277–84. doi : 10.1042 / 0264-6021: 3410277 . PMC 1220357 . PMID 10393083 .
- ^ Ma T, Yang B, Matthay MA, Verkman AS (julio de 1998). "Evidencia en contra de un papel de ratón, rata y dos isoformas t1alpha humanas clonadas como un canal de agua o un regulador de canales de agua de tipo acuaporina". Revista Estadounidense de Biología Molecular y Celular Respiratoria . 19 (1): 143–9. doi : 10.1165 / ajrcmb.19.1.2953 . PMID 9651190 .
- ^ a b "Entrez Gene: podoplanina PDPN" .
- ^ a b c d Astarita JL, Acton SE, Turley SJ (2012). "Podoplanina: funciones emergentes en el desarrollo, el sistema inmunológico y el cáncer" . Fronteras en inmunología . 3 : 283. doi : 10.3389 / fimmu.2012.00283 . PMC 3439854 . PMID 22988448 .
- ^ a b Fu J, Gerhardt H, McDaniel JM, Xia B, Liu X, Ivanciu L, Ny A, Hermans K, Silasi-Mansat R, McGee S, Nye E, Ju T, Ramirez MI, Carmeliet P, Cummings RD, Lupu F, Xia L (noviembre de 2008). "La deficiencia de O-glucanos de células endoteliales causa conexiones erróneas sanguíneas / linfáticas y la consiguiente enfermedad del hígado graso en ratones" . La Revista de Investigación Clínica . 118 (11): 3725–37. doi : 10.1172 / JCI36077 . PMC 2567837 . PMID 18924607 .
- ^ Imaizumi Y, Amano I, Tsuruga E, Kojima H, Sawa Y (octubre de 2010). "Examen inmunohistoquímico para la distribución de células que expresan podoplanina en el desarrollo de gérmenes de muelas de ratón" . Acta Histochemica et Cytochemica . 43 (5): 115-21. doi : 10.1267 / ahc.10023 . PMC 2965832 . PMID 21060740 .
- ^ Herzog BH, Fu J, Wilson SJ, Hess PR, Sen A, McDaniel JM, Pan Y, Sheng M, Yago T, Silasi-Mansat R, McGee S, May F, Nieswandt B, Morris AJ, Lupu F, Coughlin SR, McEver RP, Chen H, Kahn ML, Xia L (octubre de 2013). "Podoplanin mantiene la integridad de la vénula endotelial alta al interactuar con plaquetas CLEC-2" . Naturaleza . 502 (7469): 105–9. Código bibliográfico : 2013Natur.502..105H . doi : 10.1038 / nature12501 . PMC 3791160 . PMID 23995678 .
- ^ Kitano H, Kageyama S, Hewitt SM, Hayashi R, Doki Y, Ozaki Y, Fujino S, Takikita M, Kubo H, Fukuoka J (octubre de 2010). "La expresión de podoplanina en el estroma canceroso induce linfangiogénesis y predice la diseminación linfática y la supervivencia del paciente" . Archivos de Patología y Medicina de Laboratorio . 134 (10): 1520–7. doi : 10.5858 / 2009-0114-OA.1 . PMC 7556323 . PMID 20923309 .
- ^ Chuang WY, Yeh CJ, Chao YK, Liu YH, Chang YS, Tseng CK, Chang HK, Wan YL, Hsueh C (2014). "La expresión concordante de podoplanina en fibroblastos asociados al cáncer y células tumorales es un factor pronóstico adverso en el carcinoma de células escamosas de esófago" . Revista Internacional de Patología Clínica y Experimental . 7 (8): 4847–56. PMC 4152045 . PMID 25197355 .
- ^ Martín-Villar E, Borda-d'Agua B, Carrasco-Ramirez P, Renart J, Parsons M, Quintanilla M, Jones GE (agosto de 2015). "Podoplanin media la degradación de ECM por células de carcinoma escamoso a través del control de la estabilidad de invadopodia" . Oncogén . 34 (34): 4531–44. doi : 10.1038 / onc.2014.388 . PMC 4430312 . PMID 25486435 .
Otras lecturas
- Wicki A, Christofori G (enero de 2007). "El papel potencial de la podoplanina en la invasión tumoral" . Revista británica de cáncer . 96 (1): 1–5. doi : 10.1038 / sj.bjc.6603518 . PMC 2360213 . PMID 17179989 .
- Robertson NG, Khetarpal U, Gutiérrez-Espeleta GA, Bieber FR, Morton CC (septiembre de 1994). "Aislamiento de genes nuevos y conocidos de una biblioteca de ADNc coclear fetal humano mediante hibridación sustractiva y cribado diferencial". Genómica . 23 (1): 42–50. doi : 10.1006 / geno.1994.1457 . PMID 7829101 .
- Cross SH, Charlton JA, Nan X, Bird AP (marzo de 1994). "Purificación de islas CpG usando una columna de unión de ADN metilado". Genética de la naturaleza . 6 (3): 236–44. doi : 10.1038 / ng0394-236 . PMID 8012384 . S2CID 12847618 .
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (septiembre de 1996). "Normalización y resta: dos enfoques para facilitar el descubrimiento de genes" . Investigación del genoma . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
- Kato Y, Fujita N, Kunita A, Sato S, Kaneko M, Osawa M, Tsuruo T (diciembre de 2003). "Identificación molecular de Aggrus / T1alpha como factor inductor de agregación plaquetaria expresado en tumores colorrectales" . La revista de química biológica . 278 (51): 51599–605. doi : 10.1074 / jbc.M309935200 . PMID 14522983 . S2CID 11119751 .
- Kaneko M, Kato Y, Kunita A, Fujita N, Tsuruo T, Osawa M (septiembre de 2004). "O-glicano funcional sialilado a la agregación plaquetaria en moléculas de Aggrus (T1alpha / Podoplanin) expresadas en células de ovario de hámster chino" . La revista de química biológica . 279 (37): 38838–43. doi : 10.1074 / jbc.M407210200 . PMID 15231832 . S2CID 37651644 .
- Martín-Villar E, Scholl FG, Gamallo C, Yurrita MM, Muñoz-Guerra M, Cruces J, Quintanilla M (marzo de 2005). "Caracterización del antígeno PA2.26 humano (T1alpha-2, podoplanin), una pequeña mucina de membrana inducida en carcinomas de células escamosas orales". Revista Internacional de Cáncer . 113 (6): 899–910. doi : 10.1002 / ijc.20656 . hdl : 10261/81190 . PMID 15515019 . S2CID 2895153 .
- Schacht V, Dadras SS, Johnson LA, Jackson DG, Hong YK, Detmar M (marzo de 2005). "Regulación positiva del marcador linfático podoplanina, una glicoproteína transmembrana de tipo mucina, en carcinomas de células escamosas humanas y tumores de células germinales" . La Revista Estadounidense de Patología . 166 (3): 913–21. doi : 10.1016 / S0002-9440 (10) 62311-5 . PMC 1602360 . PMID 15743802 .
- Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, Hayashi K, Suzuki Y, Yamamoto J, Wakamatsu A, Kimura K, Sakamoto K, Hatano N, Kawai Y, Ishii S, Saito K, Kojima S, Sugiyama T, Ono T, Okano K , Yoshikawa Y, Aotsuka S, Sasaki N, Hattori A, Okumura K, Nagai K, Sugano S, Isogai T (2007). "Secuencia de señales y trampa de palabras clave in silico para la selección de ADNc humanos de longitud completa que codifican proteínas de secreción o de membrana de bibliotecas de ADNc oligocapitadas" . Investigación de ADN . 12 (2): 117–26. doi : 10.1093 / dnares / 12.2.117 . PMID 16303743 .
- Hultgård-Ekwall AK, Mayerl C, Rubin K, Wick G, Rask-Andersen H (marzo de 2006). "Una red intersticial de células que expresan podoplanina en el conducto endolinfático humano" . Revista de la Asociación para la Investigación en Otorrinolaringología . 7 (1): 38–47. doi : 10.1007 / s10162-005-0021-8 . PMC 2504586 . PMID 16408168 .
- Dumoff KL, Chu CS, Harris EE, Holtz D, Xu X, Zhang PJ, Acs G (mayo de 2006). "La baja expresión de podoplanina en el material de biopsia previa al tratamiento predice un mal pronóstico en el carcinoma de células escamosas en estadio avanzado del cuello uterino tratado con radiación primaria" . Patología moderna . 19 (5): 708–16. doi : 10.1038 / modpathol.3800580 . PMID 16528371 . S2CID 502212 .
- Omachi T, Kawai Y, Mizuno R, Nomiyama T, Miyagawa S, Ohhashi T, Nakayama J (febrero de 2007). "Demostración inmunohistoquímica de la proliferación de vasos linfáticos en el carcinoma colorrectal y su importancia clínico-patológica". Letras de cáncer . 246 (1–2): 167–72. doi : 10.1016 / j.canlet.2006.02.013 . PMID 16574316 .
- Mishima K, Kato Y, Kaneko MK, Nishikawa R, Hirose T, Matsutani M (mayo de 2006). "Mayor expresión de podoplanina en tumores astrocíticos malignos como un nuevo marcador molecular de progresión maligna". Acta Neuropathologica . 111 (5): 483–8. doi : 10.1007 / s00401-006-0063-y . PMID 16596424 . S2CID 17760421 .
- Wicki A, Lehembre F, Wick N, Hantusch B, Kerjaschki D, Christofori G (abril de 2006). "Invasión tumoral en ausencia de transición epitelio-mesenquimal: remodelación del citoesqueleto de actina mediada por podoplanina". Célula cancerosa . 9 (4): 261–72. doi : 10.1016 / j.ccr.2006.03.010 . PMID 16616332 .
- Mishima K, Kato Y, Kaneko MK, Nakazawa Y, Kunita A, Fujita N, Tsuruo T, Nishikawa R, Hirose T, Matsutani M (junio de 2006). "Expresión de podoplanina en tumores primarios de células germinales del sistema nervioso central: un marcador histológico útil para el diagnóstico de germinoma". Acta Neuropathologica . 111 (6): 563–8. doi : 10.1007 / s00401-006-0033-4 . PMID 16718353 . S2CID 25060022 .
enlaces externos
- Descripción general de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q86YL7 (podoplanina humana) en el PDBe-KB .
- Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q62011 (Mouse Podoplanin) en el PDBe-KB .