SPI1

SPI1
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Identificadores
Alias	Protooncogén SPI1 , OF, PU.1, SFPI1, SPI-1, SPI-A, Spi-1
Identificaciones externas	OMIM : 165170 MGI : 98282 HomoloGene : 2346 GeneCards : SPI1
Ubicación de genes ( humanos ) Chr. Cromosoma 11 (humano) [1] Banda 11p11.2 Comienzo 47 354 860 pb [1] Final 47.378.547 pb [1]
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Cromosoma 2 (ratón) [2] Banda 2 E1 | 2 50,44 cm Comienzo 91.082.390 pb [2] Final 91,115,756 pb [2]
Patrón de expresión de ARN Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes Función molecular • la unión al ADN • de unión a ADN específica de secuencia • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ADN vinculante actividad del activador de la transcripción, la ARN polimerasa II-específico • GO: 0000980 ARN polimerasa II cis- Unión de ADN específica de la secuencia de la región reguladora • Actividad del factor de transcripción , Unión específica de la secuencia de la región proximal del promotor del núcleo de la ARN polimerasa II • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Unión de ADN Actividad represora de la transcripción, ARN polimerasa II específica • GO: 0001948 unión a proteínas • unión a ARN • actividad del factor de transcripción, unión específica de secuencia del potenciador distal de ARN polimerasa II • Unión del factor de transcripción de la ARN polimerasa II • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN • Unión de proteínas NFAT • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN , RNA polimerasa II específico • unión al factor de transcripción Componente celular • cromatina nuclear • núcleo celular • nucleoplasma • complejo regulador de la transcripción Proceso biológico • diferenciación de leucocitos mieloides • regulación de la transcripción, plantilla de ADN • respuesta celular al etanol • mantenimiento de la población de células madre somáticas • diferenciación de linfocitos • regulación de la diferenciación de eritrocitos • diferenciación de células dendríticas mieloides • regulación negativa de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • regulación negativa de Proceso biosintético del MHC de clase II • diferenciación de células progenitoras linfoides • transcripción, plantilla de ADN • diferenciación de macrófagos • regresión de la estructura anatómica • regulación negativa de la acetilación de la histona H4 • regulación negativa de la expresión génica, epigenética • desarrollo de la vasculatura • diferenciación de granulocitos • proceso apoptótico implicado en la morfogénesis de los vasos sanguíneos • acetilación de histona H3 • diferenciación de eritrocitos • hipermetilación de la isla CpG • regulación positiva de la transcripción de pri-miARN de Promotor de ARN polimerasa II • regulación positiva de la transcripción del promotor de ARN polimerasa II • regulación negativa de la transcripción, plantilla de ADN • regulación positiva de la transcripción, plantilla de ADN • regulación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • transcripción del pri-miARN del promotor de la ARN polimerasa II • diferenciación celular • vía de señalización mediada por interleucina-6 Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	6688	20375
Ensembl	ENSG00000066336	ENSMUSG00000002111
UniProt	P17947	P17433
RefSeq (ARNm)	NM_001080547 NM_003120	NM_011355 NM_001378898 NM_001378899
RefSeq (proteína)	NP_001074016 NP_003111	NP_035485 NP_001365827 NP_001365828
Ubicación (UCSC)	Crónicas 11: 47,35 - 47,38 Mb	Crónicas 2: 91,08 - 91,12 Mb
Búsqueda en PubMed	[3]	[4]
Wikidata
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El factor de transcripción PU.1 es una proteína que en humanos está codificada por el gen SPI1 . ^[5]

Función

Este gen codifica un factor de transcripción del dominio ETS que activa la expresión génica durante el desarrollo de las células mieloides y linfoides B. ^[6] La proteína nuclear se une a una secuencia rica en purina conocida como PU-box que se encuentra en potenciadores de genes diana y regula su expresión en coordinación con otros factores de transcripción y cofactores. La proteína también puede regular el empalme alternativo de genes diana. Se han encontrado múltiples variantes de transcripción que codifican diferentes isoformas para este gen. ^[7]

Estructura

El dominio ETS es el módulo de unión al ADN de PU.1 y otros factores de transcripción de la familia ETS.

Interacciones

Se ha demostrado que SPI1 interactúa con:

• FUS , ^[8]
• GATA2 , ^[9]
• IRF4 , ^{[10] [11]} y
• NONO . ^[12]

Referencias

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000066336 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000002111 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. Ray D, Culine S, Tavitain A, Moreau-Gachelin F (julio de 1990). "El homólogo humano del protooncogén putativo Spi-1: caracterización y expresión en tumores". Oncogén . 5 (5): 663–668. PMID 1693183 . 
6. Oikawa, T; Yamada, T; Kihara-Negishi, F; Yamamoto, H; Kondoh, N; Hitomi, Y; Hashimoto, Y (julio de 1999). "El papel del factor de transcripción PU.1 de la familia Ets en la diferenciación, proliferación y apoptosis de células hematopoyéticas" . Diferencia de muerte celular . 6 (7): 599–608. doi : 10.1038 / sj.cdd.4400534 . PMID 10453070 . 
7. "Entrez Gene: SPI1 bazo foco formador de virus (SFFV) oncogén de integración proviral spi1" .
8. Hallier M, Lerga A, Barnache S, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (febrero de 1998). "El factor de transcripción Spi-1 / PU.1 interactúa con el factor de empalme potencial TLS" . J. Biol. Chem . 273 (9): 4838–4842. doi : 10.1074 / jbc.273.9.4838 . PMID 9478924 . 
9. Zhang P, Behre G, Pan J, Iwama A, Wara-Aswapati N, Radomska HS, Auron PE, Tenen DG, Sun Z (julio de 1999). "Interferencia negativa entre reguladores hematopoyéticos: proteínas GATA reprimen PU.1" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (15): 8705–8710. Código bibliográfico : 1999PNAS ... 96.8705Z . doi : 10.1073 / pnas.96.15.8705 . PMC 17580 . PMID 10411939 .  
10. Brass AL, Zhu AQ, Singh H (febrero de 1999). "Requisitos de ensamblaje de complejos activadores PU.1-Pip (IRF-4): función inhibidora in vivo utilizando dímeros fusionados" . EMBO J . 18 (4): 977–991. doi : 10.1093 / emboj / 18.4.977 . PMC 1171190 . PMID 10022840 .  
11. Escalante CR, Shen L, Escalante MC, Brass AL, Edwards TA, Singh H, Aggarwal AK (julio de 2002). "Cristalización y caracterización del complejo ternario PU.1 / IRF-4 / ADN". J. Struct. Biol . 139 (1): 55–59. doi : 10.1016 / s1047-8477 (02) 00514-2 . PMID 12372320 . 
12. Hallier M, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (mayo de 1996). "El factor de transcripción Spi-1 / PU.1 se une al ARN e interfiere con la proteína de unión al ARN p54nrb" . J. Biol. Chem . 271 (19): 11177–11181. doi : 10.1074 / jbc.271.19.11177 . PMID 8626664 . 

Lectura adicional

• Klemsz MJ, McKercher SR, Celada A, Van Beveren C, Maki RA (1990). "El factor de transcripción específico de macrófagos y células B PU.1 está relacionado con el oncogén ets". Celular . 61 (1): 113–124. doi : 10.1016 / 0092-8674 (90) 90219-5 . PMID  2180582 . S2CID  27819155 .
• Nguyen VC, Ray D, Gross MS, de Tand MF, Frézal J, Moreau-Gachelin F (1990). "Localización del oncogén humano SPI1 en el cromosoma 11, región p11.22". Tararear. Genet . 84 (6): 542–546. doi : 10.1007 / bf00210807 . PMID  2338340 . S2CID  22337200 .
• Chen H, Ray-Gallet D, Zhang P, Hetherington CJ, Gonzalez DA, Zhang DE, Moreau-Gachelin F, Tenen DG (1995). "PU.1 (Spi-1) autorregula su expresión en células mieloides". Oncogén . 11 (8): 1549-1560. PMID  7478579 .
• Nagulapalli S, Pongubala JM, Atchison ML (1995). "Múltiples proteínas interactúan físicamente con PU.1. Sinergia transcripcional con NF-IL6 beta (C / EBP delta, CRP3)". J. Immunol . 155 (9): 4330–4338. PMID  7594592 .
• Pongubala JM, Atchison ML (1995). "La activación del factor de transcripción 1 y el modulador del elemento de respuesta de AMP cíclico pueden modular la actividad del potenciador de inmunoglobulina kappa 3 '" . J. Biol. Chem . 270 (17): 10304–10313. doi : 10.1074 / jbc.270.17.10304 . PMID  7730336 .
• Hromas R, Orazi A, Neiman RS, Maki R, Van Beveran C, Moore J, Klemsz M (1993). "Expresión restringida por linaje hematopoyético y etapa del miembro de la familia de oncogén ETS PU.1" . Sangre . 82 (10): 2998–3004. doi : 10.1182 / blood.V82.10.2998.2998 . PMID  8219191 .
• Hagemeier C, Bannister AJ, Cook A, Kouzarides T (1993). "El dominio de activación del factor de transcripción PU.1 se une a la proteína del retinoblastoma (RB) y al factor de transcripción TFIID in vitro: RB muestra similitud de secuencia con TFIID y TFIIB" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 90 (4): 1580-1584. Código Bibliográfico : 1993PNAS ... 90.1580H . doi : 10.1073 / pnas.90.4.1580 . PMC  45918 . PMID  8434021 .
• Hallier M, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (1996). "El factor de transcripción Spi-1 / PU.1 se une al ARN e interfiere con la proteína de unión al ARN p54nrb" . J. Biol. Chem . 271 (19): 11177–11181. doi : 10.1074 / jbc.271.19.11177 . PMID  8626664 .
• Bassuk AG, Anandappa RT, Leiden JM (1997). "Las interacciones físicas entre Ets y las proteínas NF-kappaB / NFAT juegan un papel importante en su activación cooperativa del potenciador del virus de la inmunodeficiencia humana en las células T" . J. Virol . 71 (5): 3563–3573. doi : 10.1128 / JVI.71.5.3563-3573.1997 . PMC  191503 . PMID  9094628 .
• Li SL, Valente AJ, Zhao SJ, Clark RA (1997). "PU.1 es esencial para la actividad promotora de p47 (phox) en células mieloides" . J. Biol. Chem . 272 (28): 17802-17809. doi : 10.1074 / jbc.272.28.17802 . PMID  9211934 .
• Tsukada J, Misago M, Serino Y, Ogawa R, Murakami S, Nakanishi M, Tonai S, Kominato Y, Morimoto I, Auron PE, Eto S (1997). "El impuesto del virus de la leucemia de células T humanas tipo I transactiva el promotor del gen de la prointerleucina-1beta humana mediante la asociación con dos factores de transcripción, el factor nuclear-interleucina-6 y Spi-1" . Sangre . 90 (8): 3142–3153. doi : 10.1182 / sangre.V90.8.3142 . PMID  9376596 .
• Hallier M, Lerga A, Barnache S, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (1998). "El factor de transcripción Spi-1 / PU.1 interactúa con el factor de empalme potencial TLS" . J. Biol. Chem . 273 (9): 4838–4842. doi : 10.1074 / jbc.273.9.4838 . PMID  9478924 .
• Suzuki S, Kumatori A, Haagen IA, Fujii Y, Sadat MA, Jun HL, Tsuji Y, Roos D, Nakamura M (1998). "PU.1 como activador esencial para la expresión del gen gp91 (phox) en neutrófilos, monocitos y linfocitos B periféricos humanos" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (11): 6085–6090. Código Bibliográfico : 1998PNAS ... 95.6085S . doi : 10.1073 / pnas.95.11.6085 . PMC  27589 . PMID  9600921 .
• Carrère S, Verger A, Flourens A, Stehelin D, Duterque-Coquillaud M (1998). "Las proteínas Erg, factores de transcripción de la familia Ets, forman homo, heterodímeros y complejos ternarios a través de dos dominios distintos" . Oncogén . 16 (25): 3261–3268. doi : 10.1038 / sj.onc.1201868 . PMID  9681824 .
• Sato M, Morii E, Takebayashi-Suzuki K, Yasui N, Ochi T, Kitamura Y, Nomura S (1999). "Factor de transcripción asociado a microftalmia interactúa con PU.1 y c-Fos: determinación de su localización subcelular". Biochem. Biophys. Res. Comun . 254 (2): 384–387. doi : 10.1006 / bbrc.1998.9918 . PMID  9918847 .
• Latón AL, Zhu AQ, Singh H (1999). "Requisitos de ensamblaje de complejos activadores PU.1-Pip (IRF-4): función inhibidora in vivo utilizando dímeros fusionados" . EMBO J . 18 (4): 977–991. doi : 10.1093 / emboj / 18.4.977 . PMC  1171190 . PMID  10022840 .
• Yamamoto H, Kihara-Negishi F, Yamada T, Hashimoto Y, Oikawa T (1999). "Interacciones físicas y funcionales entre el factor de transcripción PU.1 y el coactivador CBP" . Oncogén . 18 (7): 1495–1501. doi : 10.1038 / sj.onc.1202427 . PMID  10050886 .
• Rao S, Matsumura A, Yoon J, Simon MC (1999). "SPI-B activa la transcripción a través de un dominio único de prolina, serina y treonina y exhibe diferencias de afinidad de unión al ADN de PU.1" . J. Biol. Chem . 274 (16): 11115-11124. doi : 10.1074 / jbc.274.16.11115 . PMID  10196196 .
• Mao S, Frank RC, Zhang J, Miyazaki Y, Nimer SD (1999). "Interacciones funcionales y físicas entre las proteínas AML1 y una proteína ETS, MEF: implicaciones para la patogénesis de las leucemias t (8; 21) positivas" . Mol. Célula. Biol . 19 (5): 3635–3644. doi : 10.1128 / mcb.19.5.3635 . PMC  84165 . PMID  10207087 .

Enlaces externos

• FactorBook PU.1

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