Pseudomonas chlororaphis

Pseudomonas chlororaphis
clasificación cientifica
Dominio:	Bacterias
Filo:	Proteobacterias
Clase:	Gammaproteobacteria
Pedido:	Pseudomonadales
Familia:	Pseudomonadaceae
Género:	Pseudomonas
Grupo de especies :	Grupo de Pseudomonas chlororaphis
Especies:	P. chlororaphis
Nombre binomial
*Pseudomonas chlororaphis* (Guignard y Sauvageau 1894) Bergey , et al. 1930
Tipo cepa
ATCC 9446 CCUG 552 B CFBP 2132 CIP 63.22 DSM 50083 HAMBI 2011 JCM 2778 LMG 5004 NBRC 3904 NCCB 76041 y 37027 NCTC 13002 VKM B-1246
Sinónimos
Bacillus chlororaphis Guignard y Sauvageau 1894

Pseudomonas chlororaphis es una bacteria utilizada como inoculante del suelo en agricultura y horticultura . Puede actuar comoagente de control biológico contra ciertospatógenos fúngicos de las plantas mediante la producción de antibióticos de tipo fenazina. ^[1] Según el análisis de ARNr 16S, se han incluido especies similares en su grupo. ^[2]

Un estudio comparativo genómico y filogenómico realizado en 2020 analizó 494 genomas completos de todo el género Pseudomonas , 43 de los cuales eran cepas de P. chlororaphis . ^[3] En este estudio, se determinó la especie P. chlororaphis , con base en su monofilia y criterio de Identidad Nucleotídica Promedio. Esta especie se encuentra dentro del complejo de especies de P. fluorescens más amplio , según lo determinado por. ^[3]^[4]^[5] El recuento de proteínas y el contenido de GC de las cepas de esta especie oscilaron entre 5599–6401 (promedio: 6076) y entre 61,9 y 64% (promedio: 62,8%), respectivamente. ^[3] Además, el 43 P. chlororaphisLos proteomas contenían 3587 proteínas centrales (compartidas entre todas las cepas de la especie), siendo 11 proteínas centrales específicas para ese grupo y, por lo tanto, ausentes en todas las demás cepas del género Pseudomonas . ^[3] Dos de estas 11 proteínas centrales específicas de grupo son una bacteriocina de la familia holina y una proteína biosintética similar a la mitomicina y pueden conferir una ventaja competitiva frente a otros colonizadores de raíces. ^[3]

El grupo de Pseudomonas chlororaphis

Pseudomonas chlororaphis presta su nombre a un subgrupo dentro del género Pseudomonas . Los otros miembros de la P. chlororaphis subgrupo son P. aurantiaca , P. aureofaciens , P. fragi , P. lundensis , y P. taetrolens . ^[2]

Referencias

^ Chin-A-Woeng TF, et al. (2000). "La colonización de la raíz por la bacteria productora de fenazina-1-carboxamida Pseudomonas chlororaphis PCL1391 es esencial para el control biológico de la pudrición de la raíz y el pie del tomate" . Mol Plant Microbe Interact . 13 (12): 1340–5. doi : 10.1094 / MPMI.2000.13.12.1340 . PMID 11106026 .
^ a b Anzai; Kim, H; Park, JY; Wakabayashi, H; Oyaizu, H; et al. (Julio de 2000). "Afiliación filogenética de las pseudomonas basadas en la secuencia de rRNA 16S". Int J Syst Evol Microbiol . 50 (4): 1563–89. doi : 10.1099 / 00207713-50-4-1563 . PMID 10939664 .
↑ a b c d e Nikolaidis, Marios; Mossialos, Dimitris; Oliver, Stephen G .; Amoutzias, Grigorios D. (24 de julio de 2020). "El análisis comparativo de los proteomas centrales entre los principales grupos evolutivos de Pseudomonas revela adaptaciones específicas de especies para Pseudomonas aeruginosa y Pseudomonas chlororaphis" . Diversidad . 12 (8): 289. doi : 10.3390 / d12080289 . ISSN 1424-2818 .
^ Mulet, Magdalena; Lalucat, Jorge; García-Valdés, Elena (marzo de 2010). "Análisis basado en la secuencia de ADN de la especie Pseudomonas" . Microbiología ambiental . 12 (6): 1513-1530. doi : 10.1111 / j.1462-2920.2010.02181.x . PMID 20192968 .
^ Escalas, Brittan S .; Dickson, Robert P .; LiPuma, John J .; Huffnagle, Gary B. (octubre de 2014). "Microbiología, genómica y significado clínico del complejo de especies de Pseudomonas fluorescens, un colonizador de seres humanos poco apreciado" . Revisiones de microbiología clínica . 27 (4): 927–948. doi : 10.1128 / CMR.00044-14 . ISSN 0893-8512 . PMC 4187640 . PMID 25278578 .

enlaces externos

Tipo de cepa de Pseudomonas chlororaphis en Bac Dive - la base de metadatos de diversidad bacteriana

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[1] Chin-A-Woeng TF, et al. (2000). "La colonización de la raíz por la bacteria productora de fenazina-1-carboxamida Pseudomonas chlororaphis PCL1391 es esencial para el control biológico de la pudrición de la raíz y el pie del tomate" . Mol Plant Microbe Interact . 13 (12): 1340–5. doi : 10.1094 / MPMI.2000.13.12.1340 . PMID 11106026 .

[Anzai-2] Anzai; Kim, H; Park, JY; Wakabayashi, H; Oyaizu, H; et al. (Julio de 2000). "Afiliación filogenética de las pseudomonas basadas en la secuencia de rRNA 16S". Int J Syst Evol Microbiol . 50 (4): 1563–89. doi : 10.1099 / 00207713-50-4-1563 . PMID 10939664 .

[:0-3] Nikolaidis, Marios; Mossialos, Dimitris; Oliver, Stephen G .; Amoutzias, Grigorios D. (24 de julio de 2020). "El análisis comparativo de los proteomas centrales entre los principales grupos evolutivos de Pseudomonas revela adaptaciones específicas de especies para Pseudomonas aeruginosa y Pseudomonas chlororaphis" . Diversidad . 12 (8): 289. doi : 10.3390 / d12080289 . ISSN 1424-2818 .

[4] Mulet, Magdalena; Lalucat, Jorge; García-Valdés, Elena (marzo de 2010). "Análisis basado en la secuencia de ADN de la especie Pseudomonas" . Microbiología ambiental . 12 (6): 1513-1530. doi : 10.1111 / j.1462-2920.2010.02181.x . PMID 20192968 .

[5] Escalas, Brittan S .; Dickson, Robert P .; LiPuma, John J .; Huffnagle, Gary B. (octubre de 2014). "Microbiología, genómica y significado clínico del complejo de especies de Pseudomonas fluorescens, un colonizador de seres humanos poco apreciado" . Revisiones de microbiología clínica . 27 (4): 927–948. doi : 10.1128 / CMR.00044-14 . ISSN 0893-8512 . PMC 4187640 . PMID 25278578 .

[1]