El gen 1 que activa la recombinación, también conocido como RAG-1, es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen RAG1 . [5]
RAG1 |
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Identificadores |
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Alias | RAG1 , RAG-1, RNF74, gen de activación de recombinación 1, activación de recombinación 1 |
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Identificaciones externas | OMIM : 179615 MGI : 97848 HomoloGene : 387 GeneCards : RAG1 |
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Ubicación de genes ( humanos ) |
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| Chr. | Cromosoma 11 (humano) [1] |
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| Banda | 11p12 | Comienzo | 36.510.709 pb [1] |
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Final | 36.593.156 pb [1] |
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Ubicación de genes ( ratón ) |
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| Chr. | Cromosoma 2 (ratón) [2] |
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| Banda | 2 E2 | 2 53,88 cm | Comienzo | 101,638,282 pb [2] |
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Final | 101.649.501 pb [2] |
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Ontología de genes |
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Función molecular | • la unión al ADN • de unión a ADN específica de secuencia • actividad homodimerización proteína • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 ubiquitina proteína ligasa actividad • histona unión • zinc ion de unión • unión de iones metálicos • ubiquitina-proteína transferasa • GO: proteína de unión 0001948 • actividad catalítica • actividad nucleasa • actividad endonucleasa • actividad hidrolasa • actividad de transferasa • proteína de unión idénticos • actividad endodesoxirribonucleasa de ADN bicatenario
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Componente celular | • nucleoplasma • núcleo • complejo de ADN recombinasa • complejo de endodesoxirribonucleasa
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Proceso biológico | • Regulación positiva de la diferenciación de células T • Monoubiquitinación de histonas • Recombinación de ADN • Regulación negativa de la actividad endopeptidasa de tipo cisteína involucrada en el proceso apoptótico • Respuesta inmune adaptativa • Diferenciación de células T en el timo • Hidrólisis del enlace fosfodiéster del ácido nucleico • Desarrollo del timo • Regulación negativa del timocito proceso apoptótico • homeostasis de células T • regulación negativa del proceso apoptótico de células T • respuesta inmune • recombinación V (D) J • exclusión alélica de células pre-B • diferenciación de células B • metabolismo • regulación de la diferenciación de células T • autoubiquitinación de proteínas • aprendizaje visual • regulación de la respuesta conductual al miedo • organización de la cromatina
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Fuentes: Amigo / QuickGO |
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Ortólogos |
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Especies | Humano | Ratón |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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RefSeq (ARNm) | | |
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RefSeq (proteína) | |
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NP_000439 NP_001364206 NP_001364207 NP_001364208 NP_001364209 |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 11: 36,51 - 36,59 Mb | Cr 2: 101,64 - 101,65 Mb |
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Búsqueda en PubMed | [3] | [4] |
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Wikidata |
Ver / editar humano | Ver / Editar mouse |
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Los genes RAG1 y RAG2 se conservan en gran medida en humanos. El 55,99% y el 55,98% de los aminoácidos codificados no contienen variantes informadas, respectivamente. [6]
La proteína codificada por este gen está implicado en el anticuerpo y receptor de células T V (D) J recombinación . RAG-1 está involucrado en el reconocimiento del sustrato de ADN, pero la actividad de unión y escisión estable también requiere RAG-2 . El complejo RAG-1/2 reconoce secuencias señal de recombinación (RSS) que flanquean las regiones V, D y J en los genes que codifican las cadenas pesada y ligera de anticuerpos y componentes de receptores de células T. El complejo se une a los RSS y corta el ADN. Esto conduce a la eliminación del ADN que interviene y, finalmente, a la ligadura de las secuencias V, D y J. [7] Los defectos en este gen pueden causar varias enfermedades diferentes. [5]
Debido a estos efectos, la deleción de Rag1 se usa en modelos de ratón de enfermedad para afectar el desarrollo de las células T y B , y elimina funcionalmente las células T y B maduras del sistema inmunológico. [8]
En los seres humanos, la deficiencia de RAG se reconoció por primera vez como una forma de desregulación inmunitaria conocida como síndrome de Omenn . La deficiencia de RAG se considera una enfermedad autosómica recesiva . El trastorno generalmente se identifica en bebés. La pérdida completa de función en RAG1 / 2, los principales componentes responsables de la actividad de recombinación de V (D) J, produce una inmunodeficiencia grave en humanos. Las variantes de RAG hipomórficas pueden conservar la actividad de recombinación parcial [9] y dar como resultado un fenotipo distinto de inmunodeficiencia combinada con granuloma y / o autoinmunidad (CID-G / A). [10] [11] [12] La deficiencia de RAG se puede medir mediante la cuantificación in vitro de la actividad de recombinación. [13] [14] [15] 71 RAG1 y 39 variantes de RAG2 se han ensayado funcionalmente hasta la fecha (2019) (menos del 10% de las mutaciones puntuales potenciales que pueden causar enfermedad). Sin embargo, las principales variantes candidatas se han clasificado según su relevancia clínica prevista. [6]