• proteólisis • retinoide proceso metabólico • metabolismo de los lípidos • percepción visual • transporte
Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies
Humano
Ratón
Entrez
5949
19661
Ensembl
ENSG00000265203
ENSMUSG00000041534
UniProt
P10745
P49194
RefSeq (ARNm)
NM_002900
NM_015745
RefSeq (proteína)
NP_002891
NP_056560
Ubicación (UCSC)
10: 47,35 - 47,36 Mb
Crónicas 14: 33,95 - 33,96 Mb
Búsqueda en PubMed
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Wikidata
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La proteína 3 de unión al retinol, intersticial ( RBP3 ), también conocida como IRBP, es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen RBP3 . [5] Se han identificado ortólogos de RBP3 [6] en la mayoría de los euterios, excepto en los tenrecs y armadillos .
Contenido
1 función
2 gen
3 Estructura
4 Aplicación
5 referencias
6 Lecturas adicionales
7 Enlaces externos
Función
La proteína de unión a retinoides inter- fotorreceptores es una glicoproteína grande que se sabe que se une a retinoides y que se encuentra principalmente en la matriz interfotorreceptora de la retina entre el epitelio pigmentario de la retina y las células fotorreceptoras. Se cree que transporta retinoides entre el epitelio pigmentario de la retina y los fotorreceptores, un papel fundamental en el proceso visual.
Gene
El gen IRBP humano tiene aproximadamente 9,5 kpb de longitud y consta de cuatro exones separados por tres intrones . Los intrones tienen una longitud de 1,6 a 1,9 kpb. El gen es transcrito por fotorreceptores y células de retinoblastoma en un ARNm de aproximadamente 4,3 kilobase que se traduce y procesa en una proteína glicosilada de 135.000 Da.
Estructura
La secuencia de aminoácidos de la IRBP humana se puede dividir en cuatro dominios de homología contiguos con una identidad del 33-38%, lo que sugiere una serie de eventos de duplicación de genes. En el gen, los límites de estos dominios no están definidos por uniones exón-intrón, como era de esperar. Los primeros tres dominios de homología y parte del cuarto están codificados por el primer exón grande, que tiene una longitud de 3.180 pares de bases. El resto del cuarto dominio está codificado en los últimos tres exones, que tienen 191, 143 y aproximadamente 740 pares de bases, respectivamente. [5]
Solicitud
El gen rbp3 se usa comúnmente en animales como marcador filogenético de ADN nuclear . [6] El exón 1 se utilizó por primera vez en un estudio pionero para proporcionar evidencia de monofilia de Chiroptera . [7] Luego, se ha utilizado para inferir la filogenia de los órdenes de mamíferos placentarios , [8] [9] y de los principales clados de Rodentia , [10] Macroscelidea , [11] y Primates . [12] RBP3 también es útil en niveles taxonómicos más bajos,por ejemplo , en roedores muroides [13] y primates malgaches, [14] a nivel filogeográfico en roedores Geomys y Apodemus , [15] [16] e incluso con fines de identificación de especies carnívoras . [17]
Tenga en cuenta que el intrón 1 de RBP3 también se ha utilizado para investigar la filogenética de los primates platyrrhine . [18]
Referencias
^ a b c GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000265203 - Ensembl , mayo de 2017
^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000041534 - Ensembl , mayo de 2017
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Otras lecturas
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enlaces externos
Entrada de GeneReviews / NCBI / NIH / UW sobre la descripción general de la retinosis pigmentaria
"Descripción general de los alineamientos de secuencias de proteínas y ADN codificantes del marcador RBP3" . OrthoMaM: una base de datos biológica de marcadores de mamíferos ortólogos . Se puede encontrar el marcador evolutivo rbp3, junto con la filogenia del gen correspondiente
