Factor de transcripción silenciador de RE1

DESCANSO
Estructuras disponibles PDB Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB Lista de códigos de identificación de PDB 2CZY
Identificadores
Alias	DESCANSO , Descanso, 2610008J04Rik, AA407358, NRSF, XBR, REST4, WT6, factor de transcripción de silenciamiento RE1, GINGF5, HGF5, DFNA27
Identificaciones externas	OMIM : 600571 MGI : 104897 HomoloGene : 4099 GeneCards : REST
Ubicación de genes ( humanos ) Chr. Cromosoma 4 (humano) [1] Banda 4q12 Comienzo 56.907.876 pb [1] Fin 56,966,678 pb [1]
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Cromosoma 5 (ratón) [2] Banda 5 | 5 C3.3 Comienzo 77,265,491 pb [2] Fin 77,286,432 pb [2]
Patrón de expresión de ARN Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes Función molecular • la unión al ADN • la actividad del canal de salida de potasio rectificador • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ADN vinculante actividad del activador de la transcripción, la ARN polimerasa II-específico • de unión al factor de transcripción • unión de iones metálicos • unión a ADN específica de la secuencia del promotor central • GO: 0001948 unión a proteínas • unión a ácido nucleico • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 unión a ADN actividad represora de la transcripción, ARN polimerasa II específica • actividad histona desacetilasa • unión a cromatina • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN, ARN polimerasa II específico • GO: 0000980 ARN Unión de ADN específica de la secuencia de la región reguladora cis de la polimerasa II • Unión de ADN específica de la secuencia del promotor del núcleo de la ARN polimerasa II Componente celular • citosol • nucleoplasma • complejo represor transcripcional • núcleo celular • citoplasma • complejo de histona metiltransferasa Proceso biológico • respuesta celular al estímulo eléctrico • regulación negativa de la biogénesis de los gránulos de núcleo denso • regulación negativa de la secreción de insulina • regulación negativa del proceso biosintético del cortisol • regulación negativa de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • regulación negativa de la expresión génica • transcripción, plantilla de ADN • regulación negativa de la diferenciación de células madre amnióticas • regulación positiva de la transcripción, plantilla de ADN • regulación negativa de la diferenciación de células madre mesenquimales • desacetilación de la histona H4 • regulación positiva de la actividad endopeptidasa de tipo cisteína implicada en el proceso apoptótico • respuesta celular al fármaco • respuesta celular al estímulo glucocorticoide • regulación negativa de la exocitosis dependiente de iones calcio • diferenciación de células progenitoras hematopoyéticas • regulación positiva de la transcripción de la ARN polimerasa II promotor • regulación negativa de la proliferación celular • regulación negativa del proceso biosintético de aldosterona • regulación negativa de la transcripción, plantilla de ADN • diferenciación de mioblastos de células de músculo cardíaco • regulación negativa de la neurogénesis • transporte transmembrana de iones de potasio • regulación de la transcripción, plantilla de ADN • regulación positiva del proceso apoptótico • regulación negativa de la diferenciación neuronal • regulación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • regulación del empalme alternativo del ARNm, a través del espliceosoma • respuesta a hipoxia • regulación de la expresión génica • regulación positiva de la diferenciación neuronal • regulación de la diferenciación de los osteoblastos Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	5978	19712
Ensembl	ENSG00000084093	ENSMUSG00000029249
UniProt	Q13127	Q8VIG1
RefSeq (ARNm)	NM_001193508 NM_005612 NM_001363453	NM_011263
RefSeq (proteína)	NP_001180437 NP_005603 NP_001350382	NP_035393
Ubicación (UCSC)	Crónicas 4: 56,91 - 56,97 Mb	Crónicas 5: 77,27 - 77,29 Mb
Búsqueda en PubMed	[3]	[4]
Wikidata
Ver / editar humano Ver / Editar mouse

El factor de transcripción silenciador RE1 ( REST ), también conocido como factor silenciador restrictivo de neuronas ( NRSF ), es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen REST y actúa como represor transcripcional . ^{[5] [6] [7]} REST participa expresamente en la represión de genes neuronales en células no neuronales. ^{[7] [8]} Muchos trastornos genéticos se han relacionado con alteraciones en el patrón de expresión de REST, incluidos los carcinomas de colon y pulmón de células pequeñas que se encuentran con versiones truncadas de REST. ^[9] Además de estos cánceres, a los defectos en REST también se les ha atribuido un papel en la enfermedad de Huntington, los neuroblastomas y los efectos de las crisis epilépticas y la isquemia.

Función

Este gen codifica un represor transcripcional que reprime genes neuronales en tejidos no neuronales. Es un miembro de la familia de factores de transcripción de dedos de zinc tipo Kruppel . Reprime la transcripción al unirse a un elemento de secuencia de ADN llamado elemento silenciador restrictivo de neuronas (NRSE, también conocido como RE1). La proteína también se encuentra en células progenitoras neuronales indiferenciadas y se cree que este represor puede actuar como un regulador maestro negativo de la neurogénesis . Alternativamente, se han descrito variantes de transcripciones empalmadas ; sin embargo, no se ha determinado su naturaleza completa. ^[5] REST se encuentra regulado a la baja en personas mayores con enfermedad de Alzheimer . ^[10]

REST contiene 8 Cys ₂ His ₂ dedos de zinc y media la represión génica mediante el reclutamiento de varias enzimas modificadoras de la cromatina . ^[11]

• NRSF se unió al ADN y cofactores en cada uno de sus dos dominios de unión a cofactor.

• Se produce la remodelación de la cromatina, lo que hace que el gen se "apague".

La expresión de REST se correlaciona fuertemente con una mayor longevidad. Los niveles de REST son más altos en los cerebros de las personas que vivieron entre 90 y 100 años y permanecieron cognitivamente intactos. Los niveles se mantuvieron altos específicamente en las regiones del cerebro vulnerables a la enfermedad de Alzheimer, lo que sugiere que podrían estar protegidas de la demencia. Se supone que REST reprime los genes que promueven la muerte celular y la patología de la enfermedad de Alzheimer e induce la expresión de genes de respuesta al estrés. Además, REST protege de forma potente a las neuronas del estrés oxidativo y la toxicidad de la proteína β amiloide. ^[10]REST también es responsable de la muerte de células neuronales inducida por isquemia, en modelos de ratón de isquemia cerebral. La isquemia, que resulta de la reducción de la perfusión sanguínea de los tejidos, la disminución del suministro de nutrientes y oxígeno, induce la transcripción REST y la acumulación nuclear, lo que lleva a la represión epigenética de los genes neuronales que conducen a la muerte celular. ^[12] El mecanismo más allá de la inducción de REST en la isquemia, podría estar estrechamente relacionado con su translocación nuclear dependiente de oxígeno y la represión de genes diana en hipoxia (bajo nivel de oxígeno) donde REST cumple las funciones de un regulador maestro de la represión de genes en hipoxia. ^[13]

Interacciones

Se ha demostrado que el factor de transcripción de silenciamiento de RE1 interactúa con RCOR1 . ^[14]

Referencias

1. GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000084093 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029249 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. "Entrez Gene: factor de transcripción de silenciamiento de RE1 REST" .
6. Schoenherr CJ, Anderson DJ (marzo de 1995). "El factor silenciador restrictivo de neuronas (NRSF): un represor coordinado de múltiples genes específicos de neuronas". Ciencia . 267 (5202): 1360–3. Código Bibliográfico : 1995Sci ... 267.1360S . doi : 10.1126 / science.7871435 . PMID 7871435 . S2CID 25101475 .  
7. Chong JA, Tapia-Ramírez J, Kim S, Toledo-Aral JJ, Zheng Y, Boutros MC, Altshuller YM, Frohman MA, Kraner SD, Mandel G (marzo de 1995). "REST: una proteína silenciadora de mamíferos que restringe la expresión del gen del canal de sodio a las neuronas". Celular . 80 (6): 949–57. doi : 10.1016 / 0092-8674 (95) 90298-8 . PMID 7697725 . S2CID 6412634 .  
8. Coulson JM (septiembre de 2005). "Regulación transcripcional: cáncer, neuronas y el REST". Biología actual . 15 (17): R665–8. doi : 10.1016 / j.cub.2005.08.032 . PMID 16139198 . S2CID 11901339 .  
9. Westbrook TF, Martin ES, Schlabach MR, Leng Y, Liang AC, Feng B, Zhao JJ, Roberts TM, Mandel G, Hannon GJ, Depinho RA, Chin L, Elledge SJ (junio de 2005). "Una pantalla genética para supresores de tumores candidatos identifica REST". Celular . 121 (6): 837–48. doi : 10.1016 / j.cell.2005.03.033 . PMID 15960972 . S2CID 14082806 .  
10. Lu T, Aron L, Zullo J, Pan Y, Kim H, Chen Y, Yang TH, Kim HM, Drake D, Liu XS, Bennett DA, Colaiácovo MP, Yankner BA (marzo de 2014). "REST y resistencia al estrés en el envejecimiento y la enfermedad de Alzheimer" . Naturaleza . 507 (7493): 448–54. Código Bibliográfico : 2014Natur.507..448L . doi : 10.1038 / nature13163 . PMC 4110979 . PMID 24670762 .  
11. Ooi L, Wood IC (julio de 2007). "Diafonía de cromatina en el desarrollo y la enfermedad: lecciones de REST". Nature Reviews Genética . 8 (7): 544–54. doi : 10.1038 / nrg2100 . PMID 17572692 . S2CID 415873 .  
12. Noh KM, Hwang JY, Follenzi A, Athanasiadou R, Miyawaki T, Greally JM, Bennett MV, Zukin RS (abril de 2012). "La remodelación epigenética dependiente del factor de transcripción silenciador del elemento represor 1 (REST) ​​es fundamental para la muerte neuronal inducida por isquemia" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 109 (16): E962–71. doi : 10.1073 / pnas.1121568109 . PMC 3341013 . PMID 22371606 .  
13. Cavadas MA, Mesnieres M, Crifo B, Manresa MC, Selfridge AC, Keogh CE, Fabian Z, Scholz CC, Nolan KA, Rocha LM, Tambuwala MM, Brown S, Wdowicz A, Corbett D, Murphy KJ, Godson C, Cummins EP, Taylor CT, Cheong A (17 de agosto de 2016). "REST es un represor transcripcional sensible a la hipoxia" . Informes científicos . 6 : 31355. Código Bibliográfico : 2016NatSR ... 631355C . doi : 10.1038 / srep31355 . PMC 4987654 . PMID 27531581 .  
14. Andrés ME, Burger C, Peral-Rubio MJ, Battaglioli E, Anderson ME, Grimes J, Dallman J, Ballas N, Mandel G (agosto de 1999). "CoREST: un correpresor funcional necesario para la regulación de la expresión génica neuronal específica" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 96 (17): 9873–8. Código Bibliográfico : 1999PNAS ... 96.9873A . doi : 10.1073 / pnas.96.17.9873 . PMC 22303 . PMID 10449787 .  

Lectura adicional

• Ooi L, Wood IC (julio de 2007). "Diafonía de cromatina en el desarrollo y la enfermedad: lecciones de REST". Nature Reviews Genética . 8 (7): 544–54. doi : 10.1038 / nrg2100 . PMID  17572692 . S2CID  415873 .
• Chong JA, Tapia-Ramírez J, Kim S, Toledo-Aral JJ, Zheng Y, Boutros MC, Altshuller YM, Frohman MA, Kraner SD, Mandel G (marzo de 1995). "REST: una proteína silenciadora de mamíferos que restringe la expresión del gen del canal de sodio a las neuronas". Celular . 80 (6): 949–57. doi : 10.1016 / 0092-8674 (95) 90298-8 . PMID  7697725 . S2CID  6412634 .
• Schoenherr CJ, Anderson DJ (marzo de 1995). "El factor silenciador restrictivo de neuronas (NRSF): un represor coordinado de múltiples genes específicos de neuronas". Ciencia . 267 (5202): 1360–3. Código Bibliográfico : 1995Sci ... 267.1360S . doi : 10.1126 / science.7871435 . PMID  7871435 . S2CID  25101475 .
• Scholl T, Stevens MB, Mahanta S, Strominger JL (febrero de 1996). "Una proteína de dedo de zinc que reprime la transcripción del gen humano MHC clase II, DPA". Revista de inmunología . 156 (4): 1448–57. PMID  8568247 .
• Coulson JM (septiembre de 2005). "Regulación transcripcional: cáncer, neuronas y el REST". Biología actual . 15 (17): R665–8. doi : 10.1016 / j.cub.2005.08.032 . PMID  16139198 . S2CID  11901339 .
• Thiel G, Lietz M, Cramer M (octubre de 1998). "Actividad biológica y estructura modular del factor de transcripción silenciador de RE-1 (REST), un represor de genes neuronales" . La Revista de Química Biológica . 273 (41): 26891–9. doi : 10.1074 / jbc.273.41.26891 . PMID  9756936 .
• Andrés ME, Burger C, Peral-Rubio MJ, Battaglioli E, Anderson ME, Grimes J, Dallman J, Ballas N, Mandel G (agosto de 1999). "CoREST: un correpresor funcional necesario para la regulación de la expresión génica neuronal específica" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 96 (17): 9873–8. Código Bibliográfico : 1999PNAS ... 96.9873A . doi : 10.1073 / pnas.96.17.9873 . PMC  22303 . PMID  10449787 .
• Palm K, Metsis M, Timmusk T (septiembre de 1999). "El empalme específico de neuronas del factor de transcripción de dedos de zinc REST / NRSF / XBR es frecuente en neuroblastomas y se conserva en humanos, ratones y ratas". Investigación del cerebro. Investigación del cerebro molecular . 72 (1): 30–9. doi : 10.1016 / S0169-328X (99) 00196-5 . PMID  10521596 .
• Naruse Y, Aoki T, Kojima T, Mori N (noviembre de 1999). "El factor silenciador restrictivo neuronal recluta mSin3 y complejo de histona desacetilasa para reprimir genes diana específicos de neuronas" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 96 (24): 13691–6. Código bibliográfico : 1999PNAS ... 9613691N . doi : 10.1073 / pnas.96.24.13691 . PMC  24126 . PMID  10570134 .
• Grimes JA, Nielsen SJ, Battaglioli E, Miska EA, Speh JC, Berry DL, Atouf F, Holdener BC, Mandel G, Kouzarides T (marzo de 2000). "El correpresor mSin3A es un componente funcional del complejo represor REST-CoREST" . La Revista de Química Biológica . 275 (13): 9461–7. doi : 10.1074 / jbc.275.13.9461 . PMID  10734093 .
• Coulson JM, Edgson JL, Woll PJ, Quinn JP (abril de 2000). "Una variante de empalme del represor del factor silenciador restrictivo de neuronas se expresa en el cáncer de pulmón de células pequeñas: un papel potencial en la desrepresión de genes neuroendocrinos y un marcador clínico útil". Investigación del cáncer . 60 (7): 1840–4. PMID  10766169 .
• Kojima T, Murai K, Naruse Y, Takahashi N, Mori N (junio de 2001). "Transcripción no selectiva de tipo celular de genes humanos y de ratón que codifican el factor silenciador neural-restrictivo". Investigación del cerebro. Investigación del cerebro molecular . 90 (2): 174–86. doi : 10.1016 / S0169-328X (01) 00107-3 . PMID  11406295 .
• Battaglioli E, Andrés ME, Rose DW, Chenoweth JG, Rosenfeld MG, Anderson ME, Mandel G (octubre de 2002). "La represión REST de genes neuronales requiere componentes del complejo hSWI.SNF" . La Revista de Química Biológica . 277 (43): 41038–45. doi : 10.1074 / jbc.M205691200 . PMID  12192000 .
• Lunyak VV, Burgess R, Prefontaine GG, Nelson C, Sze SH, Chenoweth J, Schwartz P, Pevzner PA, Glass C, Mandel G, Rosenfeld MG (noviembre de 2002). "Silenciamiento dependiente de correpresores de regiones cromosómicas que codifican genes neuronales". Ciencia . 298 (5599): 1747–52. Código bibliográfico : 2002Sci ... 298.1747L . CiteSeerX  10.1.1.136.7131 . doi : 10.1126 / science.1076469 . PMID  12399542 . S2CID  13507921 .
• Lietz M, Hohl M, Thiel G (enero de 2003). "El factor de transcripción de silenciamiento RE-1 (REST) ​​regula la transcripción del gen de la sinaptofisina humana a través de un sitio de unión al ADN específico de la secuencia intrónica" . Revista Europea de Bioquímica / FEBS . 270 (1): 2–9. doi : 10.1046 / j.1432-1033.2003.03360.x . PMID  12492469 .
• Hersh LB, Shimojo M (marzo de 2003). "Regulación de la expresión génica colinérgica por el factor de transcripción silenciador del factor de silenciamiento del elemento represor / factor de silenciamiento de la neurona 1". Ciencias de la vida . 72 (18-19): 2021–8. doi : 10.1016 / S0024-3205 (03) 00065-1 . PMID  12628452 .
• Kemp DM, Lin JC, Habener JF (septiembre de 2003). "Regulación del gen homeodominio emparejado Pax4 por factor silenciador restrictivo de neuronas" . La Revista de Química Biológica . 278 (37): 35057–62. doi : 10.1074 / jbc.M305891200 . PMID  12829700 .
• Zuccato C, Tartari M, Crotti A, Goffredo D, Valenza M, Conti L, Cataudella T, Leavitt BR, Hayden MR, Timmusk T, Rigamonti D, Cattaneo E (septiembre de 2003). "Huntingtin interactúa con REST / NRSF para modular la transcripción de genes neuronales controlados por NRSE". Genética de la naturaleza . 35 (1): 76–83. doi : 10.1038 / ng1219 . PMID  12881722 . S2CID  28110381 .
• Martin D, Tawadros T, Meylan L, Abderrahmani A, Condorelli DF, Waeber G, Haefliger JA (diciembre de 2003). "Papel crítico del factor silenciador restrictivo neuronal represor transcripcional en el control específico de connexin36 en líneas celulares productoras de insulina" . La Revista de Química Biológica . 278 (52): 53082–9. doi : 10.1074 / jbc.M306861200 . PMID  14565956 .
• Kuwahara K, Saito Y, Takano M, Arai Y, Yasuno S, Nakagawa Y, Takahashi N, Adachi Y, Takemura G, Horie M, Miyamoto Y, Morisaki T, Kuratomi S, Noma A, Fujiwara H, Yoshimasa Y, Kinoshita H , Kawakami R, Kishimoto I, Nakanishi M, Usami S, Saito Y, Harada M, Nakao K (diciembre de 2003). "NRSF regula el programa de genes cardíacos fetales y mantiene la estructura y función cardíacas normales" . El diario EMBO . 22 (23): 6310-21. doi : 10.1093 / emboj / cdg601 . PMC  291842 . PMID  14633990 .
• Kuwabara T, Hsieh J, Nakashima K, Taira K, Gage FH (marzo de 2004). "Un pequeño dsRNA modulador especifica el destino de las células madre neurales adultas". Celular . 116 (6): 779–93. doi : 10.1016 / S0092-8674 (04) 00248-X . PMID  15035981 . S2CID  12656737 .
• Zullo JM, Drake D, Aron L, O'Hern P, Dhamne SC, Davidsohn N, Mao CA, Klein WH, Rotenberg A, Bennett DA, Church GM, Colaiácovo MP, Yankner BA (octubre de 2019). "Regulación de la vida útil por excitación neural y DESCANSO" . Naturaleza . 574 (7778): 359–364. Bibcode : 2019Natur.574..359Z . doi : 10.1038 / s41586-019-1647-8 . PMC  6893853 . PMID  31619788 .

Enlaces externos

• REST + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
• FactorBook NRSF

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .