RFC4

RFC4
Identificadores
Alias	RFC4 , A1, RFC37, subunidad 4 del factor de replicación C
Identificaciones externas	OMIM : 102577 MGI : 2146571 HomoloGene : 6288 GeneCards : RFC4
Ubicación de genes ( humanos ) Chr. Cromosoma 3 (humano) [1] Banda 3q27.3 Comienzo 186.789.880 pb [1] Fin 186,807,058 pb [1]
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Cromosoma 16 (ratón) [2] Banda 16 | 16 B1 Comienzo 23,113,943 pb [2] Fin 23.127.737 pb [2]
Patrón de expresión de ARN Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes Función molecular • de nucleótidos de unión • unión a ADN • GO: 0043142 actividad helicasa de ADN monocatenario • GO: proteína de unión 0001948 • unión enzima • de unión de ATP • actividad abrazadera ADN loader Componente celular • factor de replicación del ADN C complejo • CTF18 RFC-como complejo • núcleo • nucleoplasma • Elg1 RFC-como complejo Proceso biológico • reparación de nucleótidos-escisión, DNA relleno de espacios • síntesis translesion libre de errores • ADN de cadena de elongación que participan en la replicación del ADN • síntesis translesion propenso a errores • la replicación del ADN • regulación positiva de la actividad de la ADN polimerasa dirigida por ADN • translesion síntesis • transcripción de acoplamiento de nucleótidos -reparación por escisión • reparación por escisión de nucleótidos, incisión de ADN • respuesta al daño del ADN, detección de daño por escisión del ADN • reparación por escisión de nucleótidos, incisión del ADN, lesión 5'-to • Reparación del ADN • mantenimiento de los telómeros mediante replicación semiconservadora • Replicación del ADN dependiente del ADN. • Regulación de la transducción de señales por el mediador de la clase p53. Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	5984	106344
Ensembl	ENSG00000163918	ENSMUSG00000022881
UniProt	P35249	Q99J62
RefSeq (ARNm)	NM_181573 NM_002916	NM_145480
RefSeq (proteína)	NP_002907 NP_853551	NP_663455
Ubicación (UCSC)	Cr 3: 186,79 - 186,81 Mb	Crónicas 16: 23.11 - 23.13 Mb
Búsqueda en PubMed	[3]	[4]
Wikidata
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La subunidad 4 del factor de replicación C es una proteína que en humanos está codificada por el gen RFC4 . ^{[5] [6]}

Función

El alargamiento de las plantillas de ADN cebadas por la ADN polimerasa delta y la ADN polimerasa épsilon requiere las proteínas accesorias que proliferan el antígeno nuclear celular (PCNA) y el factor de replicación C (RFC). RFC, también llamado activador 1, es un complejo de proteínas que consta de cinco subunidades distintas de 140, 40, 38, 37 y 36 kD. Este gen codifica la subunidad de 37 kD. Esta subunidad forma un complejo central con las subunidades de 36 y 40 kDa. El complejo central posee actividad ATPasa dependiente de ADN , que se encontró que es estimulada por PCNA en un sistema in vitro. Se han informado variantes de transcripción empalmadas alternativamente que codifican la misma proteína. ^[6]

Interacciones

Se ha demostrado que RFC4 interactúa con:

• BRD4 , ^[7]
• CHTF18 , ^[8]
• PCNA , ^{[9] [10]}
• RFC2 , ^{[9] [11]}
• RFC3 , ^{[12] [13]} y
• RFC5 . ^{[9] [11] [12] [14]}

Referencias

1. GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000163918 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022881 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. Okumura K, Nogami M, Taguchi H, Dean FB, Chen M, Pan ZQ, Hurwitz J, Shiratori A, Murakami Y, Ozawa K (enero de 1995). "Asignación de los genes de las subunidades de 36,5 kDa (RFC5), 37 kDa (RFC4), 38 kDa (RFC3) y 40 kDa (RFC2) del factor de replicación humano C a las bandas cromosómicas 12q24.2-q24.3, 3q27, 13q12.3-q13 y 7q11.23 ". Genómica . 25 (1): 274–8. doi : 10.1016 / 0888-7543 (95) 80135-9 . PMID 7774928 . 
6. "Gen Entrez: factor de replicación RFC4 C (activador 1) 4, 37kDa" .
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8. Bermudez VP, Maniwa Y, Tappin I, Ozato K, Yokomori K, Hurwitz J (septiembre de 2003). "El complejo Ctf18-Dcc1-Ctf8-factor de replicación C alternativo requerido para la cohesión de la cromátida hermana carga el antígeno nuclear celular en proliferación en el ADN" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 100 (18): 10237–42. doi : 10.1073 / pnas.1434308100 . PMC 193545 . PMID 12930902 .  
9. Cai J, Gibbs E, Uhlmann F, Phillips B, Yao N, O'Donnell M, Hurwitz J (julio de 1997). "Un complejo que consta de las subunidades p40, p37 y p36 del factor de replicación humano C es una ATPasa dependiente de ADN y un intermediario en el ensamblaje de la holoenzima" . La revista de química biológica . 272 (30): 18974–81. doi : 10.1074 / jbc.272.30.18974 . PMID 9228079 . 
10. Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (octubre de 2002). "Un enfoque proteómico para identificar proteínas de unión al antígeno nuclear celular proliferante (PCNA) en lisados ​​de células humanas. Identificación del complejo CHL12 / RFCs2-5 humano como una nueva proteína de unión a PCNA" . La revista de química biológica . 277 (43): 40362–7. doi : 10.1074 / jbc.M206194200 . PMID 12171929 . 
11. Cai J, Yao N, Gibbs E, Finkelstein J, Phillips B, O'Donnell M, Hurwitz J (septiembre de 1998). "La hidrólisis de ATP catalizada por el factor de replicación humano C requiere la participación de múltiples subunidades" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 95 (20): 11607–12. doi : 10.1073 / pnas.95.20.11607 . PMC 21688 . PMID 9751713 .  
12. Ellison V, Stillman B (marzo de 1998). "Reconstitución del factor de replicación humano recombinante C (RFC) e identificación de un subcomplejo de RFC que posee actividad de ATPasa dependiente de ADN" . La revista de química biológica . 273 (10): 5979–87. doi : 10.1074 / jbc.273.10.5979 . PMID 9488738 . 
13. Uhlmann F, Cai J, Flores-Rozas H, Dean FB, Finkelstein J, O'Donnell M, Hurwitz J (junio de 1996). "Reconstitución in vitro del factor de replicación humano C a partir de sus cinco subunidades" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 93 (13): 6521–6. doi : 10.1073 / pnas.93.13.6521 . PMC 39056 . PMID 8692848 .  
14. Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S , Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (octubre de 2005). "Hacia un mapa a escala de proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Naturaleza . 437 (7062): 1173–8. doi : 10.1038 / nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .  

Otras lecturas

• Chen M, Pan ZQ, Hurwitz J (junio de 1992). "Estudios de la subunidad clonada de 37 kDa del activador 1 (factor de replicación C) de las células HeLa" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 89 (12): 5211–5. doi : 10.1073 / pnas.89.12.5211 . PMC  49261 . PMID  1351677 .
• Uhlmann F, Cai J, Flores-Rozas H, Dean FB, Finkelstein J, O'Donnell M, Hurwitz J (junio de 1996). "Reconstitución in vitro del factor de replicación humano C a partir de sus cinco subunidades" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 93 (13): 6521–6. doi : 10.1073 / pnas.93.13.6521 . PMC  39056 . PMID  8692848 .
• Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (abril de 1997). "El transactivador Tat del virus de la inmunodeficiencia humana interactúa con la holoenzima de la ARN polimerasa II" . Biología Molecular y Celular . 17 (4): 1817–23. doi : 10.1128 / MCB.17.4.1817 . PMC  232028 . PMID  9121429 .
• Cai J, Gibbs E, Uhlmann F, Phillips B, Yao N, O'Donnell M, Hurwitz J (julio de 1997). "Un complejo que consta de las subunidades p40, p37 y p36 del factor de replicación humano C es una ATPasa dependiente de ADN y un intermediario en el ensamblaje de la holoenzima" . La revista de química biológica . 272 (30): 18974–81. doi : 10.1074 / jbc.272.30.18974 . PMID  9228079 .
• Loor G, Zhang SJ, Zhang P, Toomey NL, Lee MY (diciembre de 1997). "Identificación de proteínas de replicación de ADN y ciclo celular que interactúan con PCNA" . Investigación de ácidos nucleicos . 25 (24): 5041–6. doi : 10.1093 / nar / 25.24.5041 . PMC  147130 . PMID  9396813 .
• Ellison V, Stillman B (marzo de 1998). "Reconstitución del factor de replicación humano recombinante C (RFC) e identificación de un subcomplejo de RFC que posee actividad de ATPasa dependiente de ADN" . La revista de química biológica . 273 (10): 5979–87. doi : 10.1074 / jbc.273.10.5979 . PMID  9488738 .
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• Maruyama T, Farina A, Dey A, Cheong J, Bermudez VP, Tamura T, Sciortino S, Shuman J, Hurwitz J, Ozato K (septiembre de 2002). "Una proteína de bromodominio de mamíferos, brd4, interactúa con el factor de replicación C e inhibe la progresión a la fase S" . Biología Molecular y Celular . 22 (18): 6509-20. doi : 10.1128 / MCB.22.18.6509-6520.2002 . PMC  135621 . PMID  12192049 .
• Anderson LA, Perkins ND (enero de 2003). "Regulación de la función RelA (p65) por la gran subunidad del factor de replicación C" . Biología Molecular y Celular . 23 (2): 721–32. doi : 10.1128 / MCB.23.2.721-732.2003 . PMC  151544 . PMID  12509469 .
• Nagata T, Takahashi Y, Ishii Y, Asai S, Sugahara M, Nishida Y, Murata A, Chin M, Schichino H, Koshinaga T, Fukuzawa M, Mugishima H (junio de 2003). "Perfilado de genes expresados ​​diferencialmente entre el hígado fetal y el hígado posnatal utilizando una matriz de ADN de oligonucleótidos de alta densidad". Revista Internacional de Medicina Molecular . 11 (6): 713-21. doi : 10.3892 / ijmm.11.6.713 . PMID  12736711 .