RasMol es un programa informático escrito para la visualización de gráficos moleculares destinado y utilizado principalmente para representar y explorar estructuras de macromoléculas biológicas , como las que se encuentran en el Banco de datos de proteínas . Fue desarrollado originalmente por Roger Sayle a principios de la década de 1990. [1]
Históricamente, fue una herramienta importante para los biólogos moleculares ya que el programa extremadamente optimizado permitía que el software se ejecutara en (entonces) computadoras personales modestamente poderosas . Antes de RasMol, el software de visualización se ejecutaba en estaciones de trabajo gráficas que, debido a su costo, eran menos accesibles para los académicos. RasMol sigue siendo importante para la investigación en biología estructural y se ha vuelto importante en la educación.
RasMol tiene un historial de versiones de licencias complejo . A partir de la serie de la versión 2.7, [2] el código fuente de RasMol tiene una licencia doble bajo una Licencia pública general GNU (GPL) o una licencia personalizada RASLIC . [3] A partir de la versión 2.7.5, una GPL es la única licencia válida para distribuciones binarias.
RasMol incluye un lenguaje de scripting , para realizar multitud de funciones como seleccionar determinadas cadenas de proteínas , cambiar colores, etc. El software Jmol y Sirius han incorporado este lenguaje a sus comandos.
Los archivos del Banco de datos de proteínas (PDB) se pueden descargar para visualizarlos de los miembros del Banco mundial de datos de proteínas (wwPDB). Estos han sido subidos por investigadores que han caracterizado la estructura de las moléculas , generalmente mediante cristalografía de rayos X , espectroscopia de RMN de proteínas o microscopía crioelectrónica .
Rasmol puede comunicarse con otros programas a través de Tcl / Tk en plataformas Unix y a través de Dynamic Data Exchange (DDE) en Microsoft Windows .