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Factor de terminación de la transcripción Rho
PDB 1pv4 EBI.jpg
Homohexámero del factor Rho
Identificadores
OrganismoE. coli
Símbolorho
UniProtP0AG30
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EstructurasModelo suizo
DominiosInterPro

Un factor ρ ( factor Rho ) es una proteína procariota involucrada en la terminación de la transcripción . [1] El factor Rho se une al sitio de pausa del terminador de la transcripción, una región expuesta de ARN monocatenario (un tramo de 72 nucleótidos) después del marco de lectura abierto en secuencias ricas en C / pobres en G que carecen de una estructura secundaria obvia. [2]

El factor Rho es una proteína de transcripción esencial en procariotas. [3] En Escherichia coli , es un hexámero de ~ 274,6 kD de subunidades idénticas. Cada subunidad tiene un dominio de unión a ARN y un ATP - hidrólisis de dominio. Rho es un miembro de la familia RecA / SF5 de helicasas hexámeras dependientes de ATP que funcionan envolviendo ácidos nucleicos alrededor de una sola hendidura que se extiende alrededor de todo el hexámero. Rho funciona como factor auxiliar de la ARN polimerasa .

Hay dos tipos de terminación transcripcional en procariotas, terminación dependiente de rho y terminación intrínseca (también llamada terminación independiente de Rho). Los terminadores dependientes de Rho representan aproximadamente la mitad de los terminadores dependientes del factor de E. coli . Otros factores de terminación descubiertos en E. coli incluyen Tau y nusA. Los terminadores dependientes de Rho se descubrieron por primera vez en genomas de bacteriófagos .

Función [ editar ]

Un factor Rho actúa sobre un sustrato de ARN. La función clave de Rho es su actividad helicasa , para la cual se proporciona energía mediante una hidrólisis de ATP dependiente de ARN. El sitio de unión inicial de Rho es una región monocatenaria extendida (~ 70 nucleótidos, a veces 80-100 nucleótidos), rica en citosina y pobre en guanina , denominada sitio de r ho ut ilización ( rutina ), en el ARN que se sintetiza. aguas arriba de la secuencia del terminador real. Se han descubierto varias secuencias de unión a rho. No se encuentra consenso entre estos, pero las diferentes secuencias parecen específicas, ya que pequeñas mutaciones en la secuencia interrumpen su función. Rho se une al ARN y luego usa su ATPasaactividad para proporcionar la energía para translocar a lo largo del ARN hasta que alcanza la región helicoidal ARN-ADN, donde desenrolla la estructura dúplex híbrida. La ARN polimerasa se detiene en la secuencia de terminación, que se debe a que hay un sitio específico a unos 100 nt del sitio de unión de Rho llamado sitio de pausa sensible a Rho. Entonces, aunque la ARN polimerasa es aproximadamente 40 nt por segundo más rápida que Rho, no representa un problema para el mecanismo de terminación Rho, ya que la ARN polimerasa permite que el factor Rho se ponga al día. [ cita requerida ]

En resumen, el factor Rho actúa como una enzima de desenrollado dependiente de ATP, que se mueve a lo largo de la molécula de ARN recién formada hacia su extremo 3 ' y lo desenrolla de la plantilla de ADN a medida que avanza.

Mutaciones [ editar ]

Una mutación sin sentido en un gen de un operón impide la traducción de genes posteriores en la unidad. Este efecto se llama polaridad mutacional. Una causa común es la ausencia del ARNm correspondiente a las partes posteriores (distales) de la unidad. Supongamos que hay terminadores dependientes de Rho dentro de la unidad de transcripción, es decir, antes del terminador que se usa habitualmente. Normalmente, estos terminadores anteriores no se utilizan, porque el ribosomaevita que Rho alcance la ARN polimerasa. Pero una mutación sin sentido libera el ribosoma, por lo que Rho es libre de unirse y / o moverse a lo largo del ARN, lo que le permite actuar sobre la ARN polimerasa en el terminador. Como resultado, se libera la enzima y las regiones distales de la unidad de transcripción nunca se transcriben. [ cita requerida ]

Ver también [ editar ]

  • Factor de terminación

Referencias [ editar ]

  1. ^ Said N, Hilal T, Sunday ND, Khatri A, Bürger J, Mielke T, et al. (Enero de 2021). "Pasos hacia la inactivación de la ARN polimerasa independiente de la translocación por el terminador ATPasa ρ". Ciencia . Nueva York, NY 371 (6524). doi : 10.1126 / science.abd1673 . hdl : 21.11116 / 0000-0007-AD1D-7 . PMID  33243850 . Resumen de laicos - Phys.org .
  2. ^ Slonczewski J, Foster JW (2009). Microbiología: una ciencia en evolución . Nueva York: WW Norton &, Incorporated. ISBN 978-0-393-11332-7.
  3. ^ Pradeepkiran JA, Kumar KK, Kumar YN, Bhaskar M (2015). "Modelado, dinámica molecular y evaluación de acoplamiento del factor de transcripción rho: un objetivo de fármaco potencial en Brucella melitensis 16M" . Diseño, desarrollo y terapia de fármacos . 9 : 1897–912. doi : 10.2147 / DDDT.S77020 . PMC 4386771 . PMID 25848225 .  

Enlaces externos [ editar ]

  • Rho + Factor en los encabezados de materias médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .