Alphaproteobacteria es una clase de bacterias del filo Proteobacteria (ver también taxonomía bacteriana ). [7] Sus miembros son muy diversos y poseen pocos puntos en común, pero sin embargo comparten un ancestro común. Como todas las proteobacterias , sus miembros son gramnegativos y algunos de sus miembros parásitos intracelulares carecen de peptidoglicano y, en consecuencia, son gram variables. [7] [6]
Alfaproteobacterias | |
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Micrografía electrónica de transmisión de Wolbachia dentro de una célula de insecto. Crédito: Biblioteca Pública de Ciencias / Scott O'Neill | |
clasificación cientifica | |
Dominio: | Bacterias |
Filo: | Proteobacterias |
Clase: | Alphaproteobacteria Garrity et al . 2006 |
Subclases [1] y Órdenes [6] | |
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Sinónimos [6] | |
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Caracteristicas
Las Alphaproteobacteria son un taxón diverso y comprende varios géneros fototróficos , varios géneros que metabolizan compuestos C1 ( por ejemplo , Methylobacterium spp.), Simbiontes de plantas ( por ejemplo , Rhizobium spp.), Endosimbiontes de artrópodos ( Wolbachia ) y patógenos intracelulares ( por ejemplo, Rickettsia ) . Además, la clase incluye (como miembro extinto) la protomitocondria , la bacteria que fue engullida por el ancestro eucariota y dio lugar a las mitocondrias , que son orgánulos en las células eucariotas (Ver teoría endosimbiótica ). [1] Una especie de interés tecnológico es Rhizobium radiobacter (antes Agrobacterium tumefaciens ): los científicos suelen utilizar esta especie para transferir ADN extraño a los genomas de las plantas. [8] Las bacterias fototróficas aeróbicas anoxigénicas , como Pelagibacter ubique , son alfaproteobacterias que están ampliamente distribuidas y pueden constituir más del 10% de la comunidad microbiana del océano abierto.
Evolución y genómica
Existe cierto desacuerdo sobre la filogenia de las órdenes , especialmente para la ubicación de los Pelagibacterales , pero en general hay cierto consenso. La discordia se debe a la gran diferencia en el contenido de genes ( por ejemplo, la racionalización del genoma en Pelagibacter ubique ) y la gran diferencia en el contenido de GC entre miembros de varios órdenes. [1] Específicamente, Pelagibacterales , Rickettsiales y Holosporales contienen especies con genomas ricos en AT. [ jerga ] Se ha argumentado [¿ por quién? ] que podría ser un caso de evolución convergente que resultaría en un agrupamiento artefactual. [9] [10] [11] Sin embargo, varios estudios no están de acuerdo. [1] [12] [13] [14]
Además, se ha encontrado que el contenido de GC del ARN ribosómico (el marcador filogenético tradicional para procariotas) refleja poco el contenido de GC del genoma. Un ejemplo de esta descorrelación atípica del contenido de GC ribosómico con la filogenia es que los miembros de Holosporales tienen un contenido de GC ribosómico mucho más alto que los miembros de Pelagibacterales y Rickettsiales , aunque están más estrechamente relacionados con especies con alto contenido de GC genómico. que a los miembros de las dos últimas órdenes. [1]
La clase Alphaproteobacteria se divide en tres subclases Magnetococcidae , Rickettsidae y Caulobacteridae . [1] El grupo basal es Magnetococcidae , que está compuesto por una gran diversidad de bacterias magnetotácticas , pero solo se describe una, Magnetococcus marinus . [15] El Rickettsidae se compone de Rickettsiales intracelulares y Pelagibacterales de vida libre . La Caulobacteridae está compuesta por Holosporales , Rhodospirillales , Sphingomonadales , Rhodobacterales , Caulobacterales , Kiloniellales , Kordiimonadales , Parvularculales y Sneathiellales .
Los análisis comparativos de los genomas secuenciados también han llevado al descubrimiento de muchas inserciones-deleciones conservadas (indels) en proteínas ampliamente distribuidas y proteínas completas (es decir, proteínas de firma ) que son características distintivas de todas las Alphaproteobacteria o de sus diferentes órdenes principales (a saber, Rhizobiales , Rhodobacterales , Rhodospirillales , Rickettsiales , Sphingomonadales y Caulobacterales ) y familias (a saber , Rickettsiaceae , Anaplasmataceae , Rhodospirillaceae , Acetobacteraceae , Bradyrhiozobiaceae , Brucellaceae y Bartonellaceae ).
Estas firmas moleculares proporcionan un medio novedoso para la circunscripción de estos grupos taxonómicos y para la identificación / asignación de nuevas especies en estos grupos. [16] Los análisis filogenéticos y los indeles conservados en un gran número de otras proteínas proporcionan evidencia de que Alphaproteobacteria se ha ramificado más tarde que la mayoría de los demás phyla y clases de bacterias excepto Betaproteobacteria y Gammaproteobacteria . [17] [18]
Filogenia
La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procarióticos con posición en la nomenclatura (LPSN). [6] La filogenia se basa en el análisis del genoma completo. [19] [a] Los nombres de las subclases se basan en Ferla et al . (2013). [1]
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Transformación genética natural
Aunque sólo se han informado unos pocos estudios sobre la transformación genética natural en Alphaproteobacteria , este proceso se ha descrito en Agrobacterium tumefaciens , [21] Methylobacterium organophilum , [22] y Bradyrhizobium japonicum . [23] La transformación genética natural es un proceso sexual que implica la transferencia de ADN de una célula bacteriana a otra a través del medio intermedio y la integración de la secuencia del donante en el genoma del receptor mediante recombinación homóloga .
Notas
- ↑ Holosporales y Minwuiales no se incluyen en este árbol filogenético.
Referencias
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enlaces externos
- Alphaproteobacteria en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- Página web de filogenia bacteriana (procariota): Alpha Proteobacteria.