Factor sigma
Un factor sigma ( factor σ o factor de especificidad ) es una proteína necesaria para el inicio de la transcripción en bacterias . [1] [2] Es un factor de iniciación de la transcripción bacteriana que permite la unión específica de la ARN polimerasa (RNAP) a los promotores de genes . Es homólogo al factor de transcripción de arqueas B y al factor eucariota TFIIB . [3] El factor sigma específico utilizado para iniciar la transcripción de un gen determinado variará, según el gen.y sobre las señales ambientales necesarias para iniciar la transcripción de ese gen. La selección de promotores por la ARN polimerasa depende del factor sigma que se asocia con él. [4] También se encuentran en los cloroplastos de plantas como parte de la polimerasa codificada por plastidios (PEP) similar a una bacteria. [5]
El factor sigma, junto con la ARN polimerasa, se conoce como holoenzima ARN polimerasa . Cada molécula de holoenzima de ARN polimerasa contiene exactamente una subunidad de factor sigma, que en la bacteria modelo Escherichia coli es una de las que se enumeran a continuación. El número de factores sigma varía entre las especies bacterianas. [1] [6] E. coli tiene siete factores sigma. Los factores sigma se distinguen por sus pesos moleculares característicos . Por ejemplo, σ 70 es el factor sigma con un peso molecular de 70 kDa .
El factor sigma en el complejo de holoenzima de ARN polimerasa es necesario para el inicio de la transcripción, aunque una vez finalizada esa etapa, se disocia del complejo y el RNAP continúa alargándose por sí solo.
Se utilizan diferentes factores sigma en diferentes condiciones ambientales. Estos factores sigma especializados se unen a los promotores de genes apropiados para las condiciones ambientales, aumentando la transcripción de esos genes.
También existen factores anti-sigma que inhiben la función de los factores sigma y factores anti-anti-sigma que restauran la función del factor sigma.
Por similitud de secuencia, la mayoría de los factores sigma son similares a σ 70 ( InterPro : IPR000943 ). Tienen cuatro regiones principales (dominios) que generalmente se conservan:
