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SNTG1
Identificadores
AliasSNTG1 , G1SYN , SYN4, sintrofina gamma 1
Identificaciones externasOMIM : 608714 MGI : 1918346 HomoloGene : 56834 GeneCards : SNTG1
Ubicación de genes ( humanos )
Cromosoma 8 (humano)
Chr.Cromosoma 8 (humano) [1]
Cromosoma 8 (humano)
Genomic location for SNTG1
Genomic location for SNTG1
Band8q11.21Start49,909,789 bp[1]
End50,796,692 bp[1]
Ubicación de genes ( ratón )
Chromosome 1 (mouse)
Chr.Chromosome 1 (mouse)[2]
Chromosome 1 (mouse)
Genomic location for SNTG1
Genomic location for SNTG1
Band1|1 A1-A2Start8,361,475 bp[2]
End9,299,878 bp[2]
Patrón de expresión de ARN
PBB GE SNTG1 220405 at fs.png
More reference expression data
Ontología de genes
Molecular function• actin binding
• protein C-terminus binding
• structural molecule activity
Cellular component• cytoplasm
• ruffle membrane
• syntrophin complex
• cytoskeleton
• nucleus
• dystrophin-associated glycoprotein complex
Biological process• cell communication
Sources:Amigo / QuickGO
Ortólogos
EspeciesHumanoRatón
Entrez

54212

71096

Ensembl

ENSG00000147481

ENSMUSG00000025909

UniProt

Q9NSN8

Q925E1

RefSeq (ARNm)
NM_001287813
NM_001287814
NM_018967
NM_001321773
NM_001321775

NM_001321776
NM_001321777
NM_001321778

NM_001290390
NM_001290392
NM_001290393
NM_027671

RefSeq (proteína)
NP_001274742
NP_001274743
NP_001308702
NP_001308704
NP_001308705

NP_001308706
NP_001308707
NP_061840
NP_001274742.1
NP_061840.1
NP_001308702.1

NP_001277319
NP_001277321
NP_001277322
NP_081947

Ubicación (UCSC)Crónicas 8: 49,91 - 50,8 MbCrónicas 1: 8,36 - 9,3 Mb
Búsqueda en PubMed[3][4]
Wikidata
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La gamma-1-sintrofina es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen SNTG1 . [5] [6]

La proteína codificada por este gen es miembro de la familia de las sintrofinas . Las sintrofinas son proteínas citoplasmáticas de membrana periférica que típicamente contienen 2 dominios de homología de pleckstrina (PH), un dominio PDZ que biseca el primer dominio PH y un dominio C-terminal que media la unión de distrofina . Este gen se expresa específicamente en el cerebro . Se han descrito variantes de transcripción para este gen, pero no se ha determinado su naturaleza completa. [6]

Referencias

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000147481 - Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000025909 - Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  5. ^ Piluso G, Mirabella M, Ricci E, Belsito A, Abbondanza C, Servidei S, Puca AA, Tonali P, Puca GA, Nigro V (junio de 2000). "Gamma1- y gamma2-sintrofinas, dos nuevas proteínas de unión a distrofina localizadas en células neuronales" . J Biol Chem . 275 (21): 15851–60. doi : 10.1074 / jbc.M000439200 . PMID 10747910 . 
  6. ^ a b "Gen Entrez: sintrofina SNTG1, gamma 1" .

Lectura adicional

  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "Clonación de ADN mediante recombinación específica de sitio in vitro" . Genome Res . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101 / gr.143000 . PMC  310948 . PMID  11076863 .
  • Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). "Hacia un catálogo de genes y proteínas humanos: secuenciación y análisis de 500 nuevas proteínas completas que codifican ADNc humanos" . Genome Res . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101 / gr.GR1547R . PMC  311072 . PMID  11230166 .
  • Hogan A, Shepherd L, Chabot J, et al. (2001). "Interacción de gamma 1-sintrofina con diacilglicerol quinasa-zeta. Regulación de la localización nuclear por interacciones PDZ" . J. Biol. Chem . 276 (28): 26526–33. doi : 10.1074 / jbc.M104156200 . PMID  11352924 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH y col. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humano y de ratón de longitud completa" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. doi : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Widberg CH, Bryant NJ, Girotti M y col. (2003). "Tomosyn interactúa con la sintaxina4 y SNAP23 de t-SNARE y juega un papel en la translocación de GLUT4 estimulada por insulina" . J. Biol. Chem . 278 (37): 35093–101. doi : 10.1074 / jbc.M304261200 . PMID  12832401 .
  • Buxton P, Zhang XM, Walsh B y col. (2004). "Identificación y caracterización de Snapin como una proteína de unión a SNARE expresada de forma ubicua que interactúa con SNAP23 en células no neuronales" . Biochem. J . 375 (Parte 2): 433–40. doi : 10.1042 / BJ20030427 . PMC  1223698 . PMID  12877659 .
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA y col. (2004). "El estado, la calidad y la expansión del proyecto de ADNc de longitud completa de los NIH: la colección de genes de mamíferos (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Wiemann S, Arlt D, Huber W y col. (2004). "De ORFeome a la biología: una tubería de genómica funcional" . Genome Res . 14 (10B): 2136–44. doi : 10.1101 / gr.2576704 . PMC  528930 . PMID  15489336 .
  • Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B, et al. (2005). "Mapeo de alto rendimiento de una red de señalización dinámica en células de mamíferos". Ciencia . 307 (5715): 1621–5. doi : 10.1126 / science.1105776 . PMID  15761153 . S2CID  39457788 .
  • Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I y col. (2006). "La base de datos LIFEdb en 2006" . Ácidos nucleicos Res . 34 (Problema de la base de datos): D415–8. doi : 10.1093 / nar / gkj139 . PMC  1347501 . PMID  16381901 .
  • Chen Z, Hague C, Hall RA, Minneman KP (2006). "Las sintrofinas regulan los receptores adrenérgicos alfa1D a través de una interacción mediada por el dominio PDZ" . J. Biol. Chem . 281 (18): 12414-20. doi : 10.1074 / jbc.M508651200 . PMID  16533813 .


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  • e