La caja SOS es la región del promotor de varios genes a los que se une el represor LexA para reprimir la transcripción de proteínas inducidas por SOS. Esto ocurre en ausencia de daño en el ADN . En presencia de daño en el ADN, el activador RecA inactiva la unión de LexA . Las cajas SOS difieren en las secuencias de ADN y la afinidad de unión hacia LexA de un organismo a otro. [1] Además, las cajas SOS pueden estar presentes de forma dual, lo que indica que puede haber más de una caja SOS dentro del mismo promotor . [2]
Ejemplos de
Clado filogenético | Secuencia | Referencia |
---|---|---|
Alfaproteobacterias | GAAC (N) 7 GAAC GTTC (N) 7 GTTC | [3] [4] |
Betaproteobacteria Gammaproteobacteria | CTGT (N) 8 ACAG | [5] |
Deltaproteobacteria | CTRHAMRYBYGTTCAGS | [6] |
Bacterias grampositivas | CGAACRNRYGTTYC | [7] [8] |
Cianobacterias | RGTAC (N) 3 DGTWCB | [9] |
Consulte Nomenclatura de ácidos nucleicos para obtener una explicación de las letras de nucleótidos que no pertenecen al GATC.
Ver también
Referencias
- ^ Walker, GC (octubre de 1995). "Proteínas reguladas por SOS en la síntesis y mutagénesis de ADN translesión". Tendencias en Ciencias Bioquímicas . 20 (10): 416–20. doi : 10.1016 / s0968-0004 (00) 89091-x . PMID 8533155 .
- ^ Gillor, Osnat; Vriezen, Jan AC; Riley, Margaret A. (junio de 2008). "El papel de las cajas SOS en la regulación de la bacteriocina entérica" . Microbiología . 154 (6): 1783-1792. doi : 10.1099 / mic.0.2007 / 016139-0 . PMC 2729051 . PMID 18524933 .
- ^ Fernández de Henestrosa AR, Rivera E, Tapias A, Barbé J (junio de 1998). "Identificación de la caja SOS de Rhodobacter sphaeroides " . Mol. Microbiol . 28 (5): 991–1003. doi : 10.1046 / j.1365-2958.1998.00860.x . PMID 9663685 .
- ^ Tapias A, Barbé J (agosto de 1999). "Regulación de la transcripción divergente de los promotores uvrA-ssb en Sinorhizobium meliloti ". Mol. Gen. Genet . 262 (1): 121-30. doi : 10.1007 / s004380051066 . PMID 10503543 . S2CID 2373618 .
- ^ Erill I, Escribano M, Campoy S, Barbé J (noviembre de 2003). "El análisis in silico revela una variabilidad sustancial en el contenido de genes del regulón LexA de proteobacterias gamma" . Bioinformática . 19 (17): 2225–36. doi : 10.1093 / bioinformatics / btg303 . PMID 14630651 .
- ^ Campoy S, Fontes M, Padmanabhan S, Cortés P, Llagostera M, Barbé J (agosto de 2003). "Inducción de expresión génica mediada por daño de ADN independiente de LexA en Myxococcus xanthus " . Mol. Microbiol . 49 (3): 769–81. doi : 10.1046 / j.1365-2958.2003.03592.x . PMID 12864858 .
- ^ Winterling KW, Chafin D, Hayes JJ, et al. (15 de abril de 1998). "El sitio de unión de Bacillus subtilis DinR: redefinición de la secuencia de consenso" . J. Bacteriol . 180 (8): 2201-11. doi : 10.1128 / JB.180.8.2201-2211.1998 . PMC 107149 . PMID 9555905 .
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- ^ Mazón G, Lucena JM, Campoy S, Fernández de Henestrosa AR, Candau P, Barbé J (febrero de 2004). "Las secuencias de unión a LexA en Gram-positivas y cianobacterias están estrechamente relacionadas". Mol. Gineta. Genómica . 271 (1): 40–9. doi : 10.1007 / s00438-003-0952-x . PMID 14652736 . S2CID 9219764 .
- Erill I, et al. (2004). "Diferencias en la estructura del regulón LexA entre Proteobacteria a través de genómica comparativa asistida in vivo" . Investigación de ácidos nucleicos . 32 (22): 6617–26. doi : 10.1093 / nar / gkh996 . PMC 545464 . PMID 15604457 .
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