El pequeño modificador 2 relacionado con la ubiquitina es una proteína que en humanos está codificada por el gen SUMO2 . [5]
SUMO2 | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | SUMO2 , HSMT3, SMT3B, SMT3H2, SUMO3, Smt3A, pequeño modificador 2 similar a la ubiquitina, pequeño modificador 2 similar a la ubiquitina | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 603042 MGI : 2158813 HomoloGene : 87858 GeneCards : SUMO2 | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 17: 75,17 - 75,18 Mb | Crónicas 11: 115,52 - 115,54 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Función
Este gen codifica una proteína que es miembro de la familia de proteínas SUMO (pequeño modificador similar a la ubiquitina). Es una proteína similar a la ubiquitina y funciona de manera similar a la ubiquitina, ya que se une a proteínas diana como parte de un sistema de modificación postraduccional . Sin embargo, a diferencia de la ubiquitina, que se asocia principalmente con proteínas dirigidas a la degradación proteasomal , SUMO2 participa en una variedad de procesos celulares, como el transporte nuclear, la regulación transcripcional, la apoptosis y la estabilidad de las proteínas. No es activo hasta que los dos últimos aminoácidos del extremo carboxi-terminal se hayan separado. Se han informado numerosos pseudogenes para este gen. Se han caracterizado variantes de corte y empalme transcripcionales alternativas que codifican diferentes isoformas . [6]
Interacciones
Se ha demostrado que SUMO2 interactúa con TRIM63 [7] y CFAP298 . [8]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000188612 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000020738 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Mannen H, Tseng HM, Cho CL, Li SS (mayo de 1996). "Clonación y expresión del homólogo humano HSMT3 al supresor de levadura SMT3 de mutaciones MIF2 en un gen de proteína centrómero" . Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 222 (1): 178–80. doi : 10.1006 / bbrc.1996.0717 . PMID 8630065 .
- ^ "Entrez Gene: supresor SUMO2 SMT3 de mif dos 3 homólogo 2 (S. cerevisiae)" .
- ^ Dai KS, Liew CC (junio de 2001). "Una nueva proteína de dedo de zinc RING de músculo estriado humano, SMRZ, interactúa con SMT3b a través de su dominio RING" . La revista de química biológica . 276 (26): 23992–9. doi : 10.1074 / jbc.M011208200 . PMID 11283016 .
- ^ Golebiowski F, Matic I, Tatham MH, Cole C, Yin Y, Nakamura A, Cox J, Barton GJ, Mann M, Hay RT (2009). "Cambios en todo el sistema a las modificaciones de SUMO en respuesta al choque térmico". Señalización científica . 2 (72): ra24. doi : 10.1126 / scisignal.2000282 . PMID 19471022 . S2CID 33450256 .
Otras lecturas
- Maruyama K, Sugano S (enero de 1994). "Oligo-taponamiento: un método simple para reemplazar la estructura de la tapa de los ARNm eucariotas con oligoribonucleótidos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
- Lapenta V, Chiurazzi P, van der Spek P, Pizzuti A, Hanaoka F, Brahe C (marzo de 1997). "SMT3A, un homólogo humano del gen SMT3 de S. cerevisiae, se asigna al cromosoma 21qter y define una nueva familia de genes". Genómica . 40 (2): 362–6. doi : 10.1006 / geno.1996.4556 . PMID 9119407 .
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (octubre de 1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5 '". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
- Kamitani T, Nguyen HP, Kito K, Fukuda-Kamitani T, Yeh ET (febrero de 1998). "Modificación covalente de PML por la familia sentrina de proteínas similares a la ubiquitina" . La revista de química biológica . 273 (6): 3117–20. doi : 10.1074 / jbc.273.6.3117 . PMID 9452416 .
- Kamitani T, Kito K, Nguyen HP, Fukuda-Kamitani T, Yeh ET (mayo de 1998). "Caracterización de un segundo miembro de la familia sentrina de proteínas similares a la ubiquitina" . La revista de química biológica . 273 (18): 11349–53. doi : 10.1074 / jbc.273.18.11349 . PMID 9556629 .
- Saitoh H, Hinchey J (marzo de 2000). "Heterogeneidad funcional de pequeños modificadores de proteínas relacionadas con ubiquitina SUMO-1 versus SUMO-2/3" . La revista de química biológica . 275 (9): 6252–8. doi : 10.1074 / jbc.275.9.6252 . PMID 10692421 .
- Nishida T, Tanaka H, Yasuda H (noviembre de 2000). "Una nueva isopeptidasa 1 específica de Smt3 de mamífero (SMT3IP1) localizada en el nucleolo en la interfase" . Revista europea de bioquímica / FEBS . 267 (21): 6423–7. doi : 10.1046 / j.1432-1327.2000.01729.x . PMID 11029585 .
- Dai KS, Liew CC (junio de 2001). "Una nueva proteína de dedo de zinc RING de músculo estriado humano, SMRZ, interactúa con SMT3b a través de su dominio RING" . La revista de química biológica . 276 (26): 23992–9. doi : 10.1074 / jbc.M011208200 . PMID 11283016 .
- Tatham MH, Jaffray E, Vaughan OA, Desterro JM, Botting CH, Naismith JH, Hay RT (septiembre de 2001). "Las cadenas poliméricas de SUMO-2 y SUMO-3 se conjugan con sustratos proteicos por SAE1 / SAE2 y Ubc9" . La revista de química biológica . 276 (38): 35368–74. doi : 10.1074 / jbc.M104214200 . PMID 11451954 .
- Nishida T, Kaneko F, Kitagawa M, Yasuda H (octubre de 2001). "Caracterización de una nueva isopeptidasa específica de SUMO-1 / Smt3 de mamífero, un homólogo de axam de rata, que es una proteína de unión a axina que promueve la degradación de beta-catenina" . La revista de química biológica . 276 (42): 39060–6. doi : 10.1074 / jbc.M103955200 . PMID 11489887 .
- Hardeland U, Steinacher R, Jiricny J, Schär P (marzo de 2002). "La modificación de la glicosilasa de ADN timina humana por proteínas similares a la ubiquitina facilita el recambio enzimático" . El diario EMBO . 21 (6): 1456–64. doi : 10.1093 / emboj / 21.6.1456 . PMC 125358 . PMID 11889051 .
- Kim J, Cantwell CA, Johnson PF, Pfarr CM, Williams SC (octubre de 2002). "La actividad transcripcional de las proteínas de unión al potenciador / CCAAT está controlada por un dominio inhibidor conservado que es un objetivo para la sumoilación" . La revista de química biológica . 277 (41): 38037–44. doi : 10.1074 / jbc.M207235200 . PMID 12161447 .
- Su HL, Li SS (agosto de 2002). "Características moleculares de genes SUMO de tipo ubiquitina humana y sus proteínas codificadas". Gene . 296 (1–2): 65–73. doi : 10.1016 / S0378-1119 (02) 00843-0 . PMID 12383504 .
- Petrie K, Guidez F, Howell L, Healy L, Waxman S, Greaves M, Zelent A (mayo de 2003). "El gen de la histona desacetilasa 9 codifica múltiples isoformas de proteínas" . La revista de química biológica . 278 (18): 16059–72. doi : 10.1074 / jbc.M212935200 . PMID 12590135 .
- Hietakangas V, Ahlskog JK, Jakobsson AM, Hellesuo M, Sahlberg NM, Holmberg CI, Mikhailov A, Palvimo JJ, Pirkkala L, Sistonen L (abril de 2003). "La fosforilación de la serina 303 es un requisito previo para la modificación SUMO inducible por estrés del factor de choque térmico 1" . Biología Molecular y Celular . 23 (8): 2953–68. doi : 10.1128 / MCB.23.8.2953-2968.2003 . PMC 152542 . PMID 12665592 .
- Eaton EM, Sealy L (agosto de 2003). "Modificación de CCAAT / proteína de unión a potenciador-beta por los pequeños miembros de la familia del modificador similar a ubiquitina (SUMO), SUMO-2 y SUMO-3" . La revista de química biológica . 278 (35): 33416–21. doi : 10.1074 / jbc.M305680200 . PMID 12810706 .
- Tatham MH, Kim S, Yu B, Jaffray E, Song J, Zheng J, Rodriguez MS, Hay RT, Chen Y (agosto de 2003). "Papel de un sitio N-terminal de Ubc9 en la unión y conjugación SUMO-1, -2 y -3". Bioquímica . 42 (33): 9959–69. doi : 10.1021 / bi0345283 . PMID 12924945 .
- Chung TL, Hsiao HH, Yeh YY, Shia HL, Chen YL, Liang PH, Wang AH, Khoo KH, Shoei-Lung Li S (septiembre de 2004). "Modificación in vitro de fragmentos de la proteína CENP-C del centrómero humano mediante una proteína modificadora pequeña de tipo ubiquitina (SUMO): identificación definitiva de los sitios de modificación mediante análisis de espectrometría de masas en tándem de los isopéptidos" . La revista de química biológica . 279 (38): 39653–62. doi : 10.1074 / jbc.M405637200 . PMID 15272016 .