SYNE2


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Nesprin-2 es una proteína que en humanos está codificada por el gen SYNE2 . [5] [6] [7] El gen SYNE2 humano consta de 116 exones y codifica nesprin-2, un miembro de la familia de repeticiones de espectrina de envoltura nuclear (NE) (nesprin). Las nesprinas son proteínas modulares con un dominio de varilla de repetición de espectrina extendida central (SR) y un dominio transmembrana de homología C-terminal de Klarsicht / ANC-1 / Syne (KASH), que actúa como un motivo direccional NE. Nesprin-2 (Nesp2) se une a la F-actina citoplasmática, uniendo el núcleo al citoesqueleto y manteniendo la integridad estructural del núcleo.

El gen SYNE2 humano codifica una proteína de 6885 aminoácidos (isoforma 1, gigante Nesp2); el empalme alternativo de ARNm produce transcripciones que codifican una isoforma más grande y numerosas isoformas más pequeñas, algunas de las cuales son específicas de varios tejidos; Los sitios alternativos de inicio y terminación dentro del ARNm también permiten la traducción de isoformas más pequeñas, muchas de las cuales poseen secuencias terminales N o C únicas codificadas por intrones retenidos. Dos mecanismos crean variantes de empalme de nesprin-2 con el dominio KASH eliminado (deltaKASH). En las variantes deltaKASH1, la deleción de los exones 111-112 del casete da como resultado un cambio de marco que interrumpe el dominio KASH pero retiene la región no traducida 3 '(UTR) en el exón 116 utilizada para las isoformas que contienen el dominio KASH. Este mecanismo, que también ocurre en el ARNm de SYNE1 que codifica nesprin-1 ( enaptin), genera isoformas deltaKASH1 que terminan con una cola distinta de 11 aminoácidos (GIAGHSATPPA reemplaza YPMLRYTNGPPPT en isoformas con KASH). La utilización de un codón de parada alternativo en el exón 115, que va seguido de una UTR 3 'distinta, genera variantes deltaKASH2. Este mecanismo trunca isoformas más grandes sin generar una secuencia C-terminal distinta. La expresión de las variantes deltaKASH1 ocurre principalmente en el cerebro y el riñón, con cantidades más pequeñas en el corazón; Las variantes deltaKASH2 se detectan en el corazón y el bazo. [8]

Referencias

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000054654 - Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000063450 - Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  5. ^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (julio de 1999). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. XIII. Las secuencias completas de 100 nuevos clones de ADNc del cerebro que codifican proteínas grandes in vitro" . DNA Res . 6 (1): 63–70. doi : 10.1093 / dnares / 6.1.63 . PMID 10231032 . 
  6. ^ Apel ED, Lewis RM, Grady RM, Sanes JR (noviembre de 2000). "Syne-1, una proteína relacionada con distrofina y Klarsicht asociada con núcleos sinápticos en la unión neuromuscular" . J Biol Chem . 275 (41): 31986–95. doi : 10.1074 / jbc.M004775200 . PMID 10878022 . 
  7. ^ "Entrez Gene: repetición de espectrina SYNE2 que contiene, envoltura nuclear 2" .
  8. ^ Rajgor D, Mellad JA, Autore F, Zhang Q, Shanahan CM (julio de 2012). "Varias variantes de nesprin-1 y nesprin-2 novedosas actúan como andamios intracelulares específicos de tejido versátiles" . PLOS ONE . 7 (7): e40098. doi : 10.1371 / journal.pone.0040098 . PMC 3388047 . PMID 22768332 .  

Otras lecturas

  • Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, et al. (2003). "Construcción de clones de ADNc listos para la expresión para genes KIAA: curación manual de 330 clones de ADNc de KIAA" . DNA Res . 9 (3): 99–106. doi : 10.1093 / dnares / 9.3.99 . PMID  12168954 .
  • Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). "Hacia un catálogo de genes y proteínas humanos: secuenciación y análisis de 500 nuevas proteínas completas que codifican ADNc humanos" . Genome Res . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101 / gr.GR1547R . PMC  311072 . PMID  11230166 .
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  • Zhen YY, Libotte T, Munck M y col. (2003). "NUANCE, una proteína gigante que conecta el núcleo y el citoesqueleto de actina". J. Cell Sci . 115 (Pt. 15): 3207–22. PMID  12118075 .
  • Zhang Q, Ragnauth C, Greener MJ y col. (2003). "Las nesprinas son proteínas gigantes de unión a actina, ortólogas a la proteína muscular MSP-300 de Drosophila melanogaster". Genómica . 80 (5): 473–81. doi : 10.1016 / S0888-7543 (02) 96859-X . PMID  12408964 .
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