Subgenómico de ARNm ' s son secciones esencialmente más pequeñas del original transcripto cadena molde .
Durante la transcripción , la hebra de la plantilla original generalmente se lee desde el extremo 3 ' hasta el 5' de principio a fin. Los ARNm subgenómicos se crean cuando la transcripción comienza en el extremo 3 'de la hebra de la plantilla (o 5' de la plantilla que se va a sintetizar nuevamente) y comienza a copiarse hacia el extremo 5 'de la hebra de la plantilla antes de "saltar" al final de la plantilla y copiando los últimos nucleótidos del extremo 5 'de la plantilla (terminando la cola 3' para la hebra recién creada).
Como resultado, la hebra traducida tendrá un extremo 5 'similar en diversos grados con la plantilla original (dependiendo de qué parte de la plantilla saltó la transcripción) y un extremo 3' similar a la plantilla. [1]
El ARN viral de sentido positivo (5 'a 3') que puede traducirse directamente en las proteínas virales deseadas, se somete a un proceso similar al descrito en 3 'a 5'. Se pueden omitir partes del ARN viral durante la traducción.
El resultado es que se pueden crear muchas proteínas diferentes a partir de la misma hebra de ARNm, con extremos 5 'similares (en diversos grados) y los mismos extremos 3'. O bien, se pueden crear diferentes proteínas con ARN viral de sentido positivo.
La sección de 5 'de la hebra recién creada coincide con la de la hebra de plantilla, y esta sección de la hebra de plantilla se denomina "conjunto anidado". [2]
3 '5' GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCACGTTATATATACGTTATTTCTGCGCGGAAAAAAAAA - Cadena de plantilla original 5 '3' GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCACGTTATATATAC --------------- AAAAAAAAA | GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCAC -------------------------- AAAAAAAAA | = ARNm subgenómico. GCCGCCCCGTAT ---------------------------------------- AAAAAAAAA | GCCGCCCCGTAT = Conjunto anidado: indica saltos.
Este complejo método de transcripción está generalmente restringido a virus , especialmente aquellos de ARN monocatenario de sentido positivo o virus de Clase IV que utilizan el Sistema de Clasificación de Baltimore , por ejemplo, virus del orden Nidovirales .
Se utiliza principalmente para compactar más información genética en una menor cantidad de material genético. [3]