La subunidad 10 del factor de iniciación de la transcripción TFIID es una proteína que en humanos está codificada por el gen TAF10 . [5] [6]
TAF10 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | TAF10 , TAF2A, TAF2H, TAFII30, factor 10 asociado a la proteína de unión a la caja TATA | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 600475 MGI : 1346320 HomoloGene : 86923 GeneCards : TAF10 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (ARNm) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (proteína) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ubicación (UCSC) | Crónicas 11: 6,61 - 6,61 Mb | Crónicas 7: 105,74 - 105,74 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
|
Función
El inicio de la transcripción por la ARN polimerasa II requiere las actividades de más de 70 polipéptidos. La proteína que coordina estas actividades es el factor de transcripción IID (TFIID), que se une al promotor central para posicionar la polimerasa correctamente, sirve como andamio para el ensamblaje del resto del complejo de transcripción y actúa como un canal para las señales reguladoras. TFIID está compuesto por la proteína de unión a TATA (TBP) y un grupo de proteínas conservadas evolutivamente conocidas como factores asociados a TBP o TAF. Los TAF pueden participar en la transcripción basal, servir como coactivadores, funcionar en el reconocimiento de promotores o modificar los factores de transcripción generales (GTF) para facilitar el ensamblaje complejo y el inicio de la transcripción. Este gen codifica una de las pequeñas subunidades de TFIID que está asociada con un subconjunto de complejos de TFIID. Los estudios con células humanas y de mamíferos han demostrado que esta subunidad es necesaria para la activación transcripcional por el receptor de estrógeno, para la progresión a través del ciclo celular, y también puede ser necesaria para ciertos programas de diferenciación celular. [6]
Interacciones
Se ha demostrado que TAF10 interactúa con TAF9 , [7] homólogo de la proteína de inicio de la transcripción SPT3 , [7] [8] TAF13 [9] y proteína de unión a TATA . [10] [11]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000166337 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000043866 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Jacq X, Brou C, Lutz Y, Davidson I, Chambon P, Tora L (noviembre de 1994). "El TAFII30 humano está presente en un complejo TFIID distinto y es necesario para la activación transcripcional por parte del receptor de estrógenos". Celular . 79 (1): 107-17. doi : 10.1016 / 0092-8674 (94) 90404-9 . PMID 7923369 . S2CID 19698550 .
- ^ a b "Entrez Gen: TAF10 TAF10 RNA polimerasa II, factor asociado a la proteína de unión a la caja TATA (TBP), 30kDa" .
- ^ a b Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A, Lymar ES, Gamper AM, Kundu TK, Chait BT, Roeder RG (octubre de 2001). "El complejo STAGA humano es un coactivador de transcripción de acetilación de cromatina que interactúa con factores de unión al daño de ADN y empalme de pre-mRNA in vivo" . Mol. Célula. Biol . 21 (20): 6782–95. doi : 10.1128 / MCB.21.20.6782-6795.2001 . PMC 99856 . PMID 11564863 .
- ^ Brand M, Moggs JG, Oulad-Abdelghani M, Lejeune F, Dilworth FJ, Stevenin J, Almouzni G, Tora L (junio de 2001). "La proteína de unión al ADN dañada por los rayos UV en el complejo TFTC vincula el reconocimiento del daño del ADN a la acetilación del nucleosoma" . EMBO J . 20 (12): 3187–96. doi : 10.1093 / emboj / 20.12.3187 . PMC 150203 . PMID 11406595 .
- ^ Mengus G, May M, Jacq X, Staub A, Tora L, Chambon P, Davidson I (abril de 1995). "Clonación y caracterización de hTAFII18, hTAFII20 y hTAFII28: tres subunidades del factor de transcripción humano TFIID" . EMBO J . 14 (7): 1520–31. doi : 10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07138.x . PMC 398239 . PMID 7729427 .
- ^ Bellorini M, Lee DK, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (junio de 1997). "Interacciones NF-Y-TBP de unión a CCAAT: NF-YB y NF-YC requieren dominios cortos adyacentes a sus motivos de pliegues de histonas para la asociación con residuos básicos de TBP" . Ácidos nucleicos Res . 25 (11): 2174–81. doi : 10.1093 / nar / 25.11.2174 . PMC 146709 . PMID 9153318 .
- ^ Ruppert S, Wang EH, Tjian R (marzo de 1993). "Clonación y expresión de TAFII250 humano: un factor asociado a TBP implicado en la regulación del ciclo celular". Naturaleza . 362 (6416): 175–9. doi : 10.1038 / 362175a0 . PMID 7680771 . S2CID 4364676 .
Otras lecturas
- Mengus G, May M, Jacq X, Staub A, Tora L, Chambon P, Davidson I (1995). "Clonación y caracterización de hTAFII18, hTAFII20 y hTAFII28: tres subunidades del factor de transcripción humano TFIID" . EMBO J . 14 (7): 1520–31. doi : 10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07138.x . PMC 398239 . PMID 7729427 .
- Zhou Q, Sharp PA (1995). "Nuevo mecanismo y factor de regulación por VIH-1 Tat" . EMBO J . 14 (2): 321–8. doi : 10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07006.x . PMC 398086 . PMID 7835343 .
- Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (1995). "Una nueva restricción mediada por LBP-1 de la transcripción del VIH-1 en el nivel de elongación in vitro" . J. Biol. Chem . 270 (5): 2274–83. doi : 10.1074 / jbc.270.5.2274 . PMID 7836461 .
- Ou SH, García-Martínez LF, Paulssen EJ, Gaynor RB (1994). "Papel de los motivos flanqueantes de la caja E en la función del elemento TATA de tipo 1 del virus de inmunodeficiencia humana" . J. Virol . 68 (11): 7188–99. doi : 10.1128 / JVI.68.11.7188-7199.1994 . PMC 237158 . PMID 7933101 .
- Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF, Duvall JF, Fattaey A, Chiang CM, Roeder RG, Brady JN (1994). "Interacción directa de TFIID humano con el tat transactivador de VIH-1". Naturaleza . 367 (6460): 295–9. doi : 10.1038 / 367295a0 . PMID 8121496 . S2CID 4362048 .
- Scheer E, Mattei MG, Jacq X, Chambon P, Tora L (1995). "Organización y localización cromosómica del gen (TAF2H) que codifica el factor II 30 asociado a TBP humana (TAFII30)". Genómica . 29 (1): 269–72. doi : 10.1006 / geno.1995.1243 . PMID 8530084 .
- vom Baur E, Zechel C, Heery D, Heine MJ, Garnier JM, Vivat V, Le Douarin B, Gronemeyer H, Chambon P, Losson R (1996). "Interacciones dependientes de ligando diferencial entre el dominio de activación de AF-2 de receptores nucleares y los factores intermediarios transcripcionales putativos mSUG1 y TIF1" . EMBO J . 15 (1): 110–24. doi : 10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00339.x . PMC 449923 . PMID 8598193 .
- Wang Z, Morris GF, Rice AP, Xiong W, Morris CB (1996). "Los mutantes de tipo salvaje y defectuosos de transactivación de la proteína Tat del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 se unen a la proteína de unión a TATA humana in vitro". J. Adquirir. Inmunodeficiencia. Syndr. Tararear. Retrovirol . 12 (2): 128–38. doi : 10.1097 / 00042560-199606010-00005 . PMID 8680883 .
- Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (1996). "Las mutaciones en el dominio carboxi-terminal de TBP afectan la síntesis de transcripciones cortas y completas del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 de manera similar" . J. Virol . 70 (8): 5025–34. doi : 10.1128 / JVI.70.8.5025-5034.1996 . PMC 190456 . PMID 8764009 .
- Kashanchi F, Khleif SN, Duvall JF, Sadaie MR, Radonovich MF, Cho M, Martin MA, Chen SY, Weinmann R, Brady JN (1996). "La interacción de Tat del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 con un sitio único de TFIID inhibe el cofactor negativo Dr1 y estabiliza el complejo TFIID-TFIIA" . J. Virol . 70 (8): 5503–10. doi : 10.1128 / JVI.70.8.5503-5510.1996 . PMC 190508 . PMID 8764062 .
- Zhou Q, Sharp PA (1996). "Tat-SF1: cofactor para la estimulación del alargamiento transcripcional por Tat del VIH-1". Ciencia . 274 (5287): 605–10. Código Bibliográfico : 1996Sci ... 274..605Z . doi : 10.1126 / science.274.5287.605 . PMID 8849451 . S2CID 13266489 .
- García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). "Asociación de Tat con complejos purificados de preiniciación de la transcripción de VIH-1 y VIH-2" . J. Biol. Chem . 272 (11): 6951–8. doi : 10.1074 / jbc.272.11.6951 . PMID 9054383 .
- Chéhensse V, Boulvin C, Luce S, Tora L, Junien C, Henry I (1997). "Asignación del gen TAFII30 humano (TAF2H) a la banda de cromosomas humanos 11p15.3 utilizando híbridos de células somáticas". Cytogenet. Cell Genet . 76 (1–2): 41–2. doi : 10.1159 / 000134510 . PMID 9154123 .
- Ogryzko VV, Kotani T, Zhang X, Schiltz RL, Howard T, Yang XJ, Howard BH, Qin J, Nakatani Y (1998). "TAF similares a histonas dentro del complejo acetilasa de histonas PCAF". Celular . 94 (1): 35–44. doi : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81219-2 . PMID 9674425 . S2CID 18942972 .
- Vassilev A, Yamauchi J, Kotani T, Prives C, Avantaggiati ML, Qin J, Nakatani Y (1998). "La subunidad de 400 kDa del complejo PCAF histona acetilasa pertenece a la superfamilia ATM" . Mol. Celular . 2 (6): 869–75. doi : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80301-9 . PMID 9885574 .
- Marca M, Yamamoto K, Staub A, Tora L (1999). "La identificación de subunidades complejas que contienen TAFII libres de proteínas de unión a TATA sugiere un papel en la acetilación de nucleosomas y la transducción de señales" . J. Biol. Chem . 274 (26): 18285–9. doi : 10.1074 / jbc.274.26.18285 . PMID 10373431 .
- Metzger D, Scheer E, Soldatov A, Tora L (1999). "Se requiere TAF (II) 30 de mamífero para la progresión del ciclo celular y los programas de diferenciación celular específicos" . EMBO J . 18 (17): 4823–34. doi : 10.1093 / emboj / 18.17.4823 . PMC 1171554 . PMID 10469660 .
- Marca M, Moggs JG, Oulad-Abdelghani M, Lejeune F, Dilworth FJ, Stevenin J, Almouzni G, Tora L (2001). "La proteína de unión al ADN dañada por los rayos UV en el complejo TFTC vincula el reconocimiento del daño del ADN a la acetilación del nucleosoma" . EMBO J . 20 (12): 3187–96. doi : 10.1093 / emboj / 20.12.3187 . PMC 150203 . PMID 11406595 .
- Gangloff YG, Pointud JC, Thuault S, Carré L, Romier C, Muratoglu S, Brand M, Tora L, Couderc JL, Davidson I (2001). "Los componentes TFIID humanos TAF (II) 140 y Drosophila BIP2 (TAF (II) 155) son nuevos metazoos homólogos de la levadura TAF (II) 47 que contienen un pliegue de histona y un dedo PHD" . Mol. Célula. Biol . 21 (15): 5109–21. doi : 10.1128 / MCB.21.15.5109-5121.2001 . PMC 87236 . PMID 11438666 .
enlaces externos
- Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q12962 (subunidad 10 del factor de iniciación de la transcripción TFIID) en el PDBe-KB .