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TRAF6
Proteína TRAF6 PDB 1lb4.png
Estructuras disponibles
PDBBúsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Lista de códigos de identificación de PDB

1LB4, 1LB5, 1LB6, 2ECI, 2JMD, 3HCS, 3HCT, 3HCU, 4Z8M

Identificadores
AliasTRAF6 , MGC: 3310, RNF85, factor 6 asociado al receptor de TNF
Identificaciones externasOMIM : 602355 MGI : 108072 HomoloGene : 3395 GeneCards : TRAF6
Ubicación de genes ( humanos )
Chromosome 11 (human)
Chr.Chromosome 11 (human)[1]
Chromosome 11 (human)
Genomic location for TRAF6
Genomic location for TRAF6
Band11p12Start36,483,769 bp[1]
End36,510,272 bp[1]
Ubicación de genes ( ratón )
Chromosome 2 (mouse)
Chr.Chromosome 2 (mouse)[2]
Chromosome 2 (mouse)
Genomic location for TRAF6
Genomic location for TRAF6
Band2|2 E2Start101,678,429 bp[2]
End101,701,669 bp[2]
Patrón de expresión de ARN
PBB GE TRAF6 205558 at fs.png
More reference expression data
Ontología de genes
Molecular function• protein N-terminus binding
• histone deacetylase binding
• GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity
• metal ion binding
• mitogen-activated protein kinase kinase kinase binding
• zinc ion binding
• GO:0001948 protein binding
• thioesterase binding
• ubiquitin conjugating enzyme binding
• protein kinase binding
• protein kinase B binding
• ubiquitin-protein transferase activity
• identical protein binding
• ubiquitin protein ligase binding
• transferase activity
• tumor necrosis factor receptor binding
Cellular component• cytoplasm
• cytosol
• Lipid droplet
• perinuclear region of cytoplasm
• cytoplasmic side of plasma membrane
• nucleus
• cell membrane
• cell cortex
• endosome membrane
• CD40 receptor complex
• protein-containing complex
Biological process• positive regulation of transcription regulatory region DNA binding
• response to interleukin-1
• toll-like receptor signaling pathway
• Fc-epsilon receptor signaling pathway
• odontogenesis of dentin-containing tooth
• animal organ morphogenesis
• T-helper 1 type immune response
• toll-like receptor 9 signaling pathway
• regulation of apoptotic process
• ossification
• cytokine-mediated signaling pathway
• osteoclast differentiation
• positive regulation of osteoclast differentiation
• stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway
• activation of NF-kappaB-inducing kinase activity
• bone resorption
• JNK cascade
• membrane protein intracellular domain proteolysis
• protein ubiquitination
• positive regulation of T cell proliferation
• I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• protein autoubiquitination
• immune system process
• positive regulation of JUN kinase activity
• positive regulation of DNA-binding transcription factor activity
• protein polyubiquitination
• negative regulation of apoptotic process
• negative regulation of transcription by RNA polymerase II
• positive regulation of lipopolysaccharide-mediated signaling pathway
• activation of MAPK activity
• positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
• positive regulation of interleukin-2 production
• positive regulation of T cell cytokine production
• immune response
• negative regulation of transcription, DNA-templated
• nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway
• positive regulation of protein ubiquitination
• positive regulation of smooth muscle cell proliferation
• antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II
• cell development
• protein K63-linked ubiquitination
• myeloid dendritic cell differentiation
• MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway
• neural tube closure
• bone remodeling
• positive regulation of apoptotic process
• positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• cellular response to lipopolysaccharide
• T cell receptor signaling pathway
• activation of protein kinase activity
• positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• signal transduction
• cellular response to DNA damage stimulus
• protein deubiquitination
• regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• interleukin-1-mediated signaling pathway
• cellular response to cytokine stimulus
• positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling
• positive regulation of leukocyte adhesion to vascular endothelial cell
Sources:Amigo / QuickGO
Ortólogos
EspeciesHumanoRatón
Entrez

7189

22034

Ensembl

ENSG00000175104

ENSMUSG00000027164

UniProt

Q9Y4K3

P70196

RefSeq (ARNm)

NM_145803
NM_004620

NM_009424
NM_001303273

RefSeq (proteína)

NP_004611
NP_665802

NP_001290202
NP_033450

Ubicación (UCSC)Crónicas 11: 36,48 - 36,51 MbCr 2: 101,68 - 101,7 Mb
Búsqueda en PubMed[3][4]
Wikidata
Ver / editar humanoVer / Editar mouse

TRAF6 es una proteína humana TRAF .

Función

La proteína codificada por este gen es miembro de la familia de proteínas del factor asociado al receptor de TNF (TRAF). Las proteínas TRAF están asociadas y median en la transducción de señales de miembros de la superfamilia de receptores de TNF. Esta proteína media la señalización no solo de los miembros de la superfamilia de receptores de TNF, sino también de los miembros de la familia Toll / IL-1. Se ha demostrado que las señales de receptores como CD40, TNFSF11 / TRANCE / RANKL e IL-1 están mediadas por esta proteína. Esta proteína también interactúa con varias proteínas quinasas, incluidas IRAK1 / IRAK , SRCy PKCzeta, que proporciona un vínculo entre distintas vías de señalización. Esta proteína funciona como un transductor de señal en la vía NF-kappaB que activa la quinasa IkappaB (IKK) en respuesta a las citocinas proinflamatorias. Se ha descubierto que la interacción de esta proteína con UBE2N / UBC13 y UBE2V1 / UEV1A, que son enzimas conjugadoras de ubiquitina que catalizan la formación de cadenas de poliubiquitina, es necesaria para la activación de IKK por esta proteína. Se han informado dos variantes de transcripción empalmadas alternativamente que codifican proteínas idénticas. [5]

Vía de señalización de receptores toll-like. Las líneas grises discontinuas representan asociaciones desconocidas

Interacciones

Se ha demostrado que TRAF6 interactúa con:

  • PREGUNTE1 , [6] [7] [8]
  • CD40 , [9] [10]
  • FHL2 , [11]
  • HSPB2 , [12]
  • IKBKG , [13] [14]
  • IRAK1 , [15] [16] [17] [18] [19] [20] [21] [22] [23]
  • IRAK2 , [16] [17]
  • TAB1 , [24] [25] [26]
  • MAP3K7IP2 , [13] [23] [24] [25] [27] [28]
  • MAP3K7 [8] [23] [24] [25] [26] [27] [29]
  • PPP4C , [30]
  • RANGO , [31] [32] [33] [34] [35]
  • SDCBP , [15]
  • SIGIRR , [36]
  • Sequestosoma 1 , [37]
  • TAX1BP1 , [22]
  • TNFAIP3 , [38] [39]
  • TNFRSF13B , [40]
  • UBE2N , [41] y
  • Ubiquitina C . [14] [28] [30] [42] [43]

Organismos modelo

Se han utilizado organismos modelo en el estudio de la función TRAF6. Una línea de ratón knockout condicional llamada Traf6 tm2a (EUCOMM) Wtsi se generó en el Wellcome Trust Sanger Institute . [44] Los animales machos y hembras se sometieron a un cribado fenotípico estandarizado [45] para determinar los efectos de la deleción. [46] [47] [48] [49] Pruebas de detección adicionales realizadas: - Fenotipado inmunológico en profundidad [50]

Fenotipo de ratón knockout de Traf6
CaracterísticaFenotipo
All data available at.[45][50]
Peripheral blood leukocytes 6 WeeksNormal
InsulinNormal
Haematology 6 WeeksNormal
Homozygous viability at P14Abnormal
Recessive lethal studyAbnormal
Body weightNormal
Neurological assessmentNormal
Grip strengthNormal
DysmorphologyNormal
Indirect calorimetryNormal
Glucose tolerance testNormal
Auditory brainstem responseNormal
DEXANormal
RadiographyNormal
Eye morphologyNormal
Clinical chemistryNormal
Haematology 16 WeeksNormal
Peripheral blood leukocytes 16 WeeksNormal
Heart weightNormal
Salmonella infectionNormal
Cytotoxic T Cell FunctionNormal
Spleen ImmunophenotypingNormal
Mesenteric Lymph Node ImmunophenotypingNormal
Epidermal Immune CompositionNormal

Referencias

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Lectura adicional

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Enlaces externos

  • TRAF6 en los encabezados de materias médicas de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU. (MeSH)