La proteína 5 que contiene un motivo tripartito, también conocida como proteína 88 del dedo RING, es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen TRIM5 . [4] La isoforma alfa de esta proteína, TRIM5α , es un factor de restricción de retrovirus , que media el bloqueo temprano específico de la especie para la infección por retrovirus.
TRIM5 |
---|
|
Estructuras disponibles |
---|
PDB | Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB |
---|
Lista de códigos de identificación de PDB |
---|
2ECV , 2YRG |
|
|
Identificadores |
---|
Alias | TRIM5 , RNF88, TRIM5alpha, motivo tripartito que contiene 5 |
---|
Identificaciones externas | OMIM : 608487 MGI : 4821183 HomoloGene : 75345 GeneCards : TRIM5 |
---|
Ubicación de genes ( humanos ) |
---|
| Chr. | Cromosoma 11 (humano) [1] |
---|
| Banda | 11p15.4 | Comienzo | 5.663.195 pb [1] |
---|
Final | 5.938.619 pb [1] |
---|
|
|
Ontología de genes |
---|
Función molecular | • actividad adaptador de proteína-macromolécula • actividad homodimerización proteína • GO: la actividad del receptor de reconocimiento de patrón 0008329 • zinc ion de unión • unión de iones metálicos • GO: proteína de unión 0001948 • proteína idéntica unión • proteína quinasa de unión • actividad de transferasa • actividad de transferasa de ubiquitina-proteína
|
---|
Componente celular | • citoplasma • citosol • omegasoma • estructura anatómica intracelular • núcleo • cuerpo P
|
---|
Proceso biológico | • regulación de lipopolisacárido mediada vía de señalización • interferón-gamma-mediada vía de señalización • ubiquitinación unida a K63 proteína • proceso del sistema inmune • trimerización proteína • regulación positiva de la actividad de factor de transcripción de unión a ADN • regulación de la proteína de localización • autofagia • regulación positiva de Actividad del factor de transcripción NF-kappaB • respuesta de defensa al virus • ubiquitinación de proteínas • activación de la respuesta inmune innata • regulación positiva de la señalización de I-kappaB quinasa / NF-kappaB • respuesta inmune innata • GO: 0022415 proceso viral • regulación positiva de la cascada de MAPK • Vía de señalización del receptor de reconocimiento de patrones • regulación negativa de la entrada viral en la célula huésped • regulación negativa de la liberación viral de la célula huésped
|
---|
Fuentes: Amigo / QuickGO |
|
Ortólogos |
---|
Especies | Humano | Ratón |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (ARNm) | |
---|
NM_033034 NM_033092 NM_033093 |
| |
---|
RefSeq (proteína) | |
---|
NP_149023 NP_149083 NP_149084 |
| |
---|
Ubicación (UCSC) | Crónicas 11: 5,66 - 5,94 Mb | n / A |
---|
Búsqueda en PubMed | [2] | [3] |
---|
Wikidata |
Ver / editar humano | Ver / Editar mouse |
|
TRIM5α está compuesto por 493 aminoácidos que se encuentran en las células de la mayoría de los primates . TRIM5α es un factor inmune intrínseco importante en la defensa inmune innata contra los retrovirus, junto con el APOBEC familia de proteínas, [5] [6] teterina y TRIM22 .
TRIM5α pertenece a la familia de proteínas TRIM (TRIM significa TRI partite M otif); Esta familia fue identificada por primera vez por Reddy en 1992 como proteínas que contienen un dominio de unión de zinc de dedo RING , un dominio de unión de zinc de caja B, seguido de una región de espiral . [7] TRIM5α lleva el dominio C-terminal PRY-SPRY o B30.2 además de los otros dominios.
Cuando un retrovirus entra en el citoplasma de una célula hospedadora, sufre un desprendimiento de la cápside y una transcripción inversa dentro del núcleo del hospedador para producir virus hijos. TRIM5 está presente en el citoplasma y reconoce motivos dentro de las proteínas de la cápside que interfieren con el proceso de desencubrimiento, evitando así la transcripción inversa y el transporte exitosos al núcleo del genoma viral. [8] [9] El mecanismo de acción exacto no se ha demostrado de manera concluyente, pero la proteína de la cápside de los virus restringidos se elimina mediante la degradación dependiente del proteasoma . [10]
Se sospecha la participación de otras proteínas celulares en la inhibición mediada por TRIM5α, pero aún no se ha demostrado. Sin embargo, la ciclofilina A es importante para la inhibición del VIH-1 por TRIM5α en las especies de monos del Viejo Mundo. [11]
La "especificidad" de la restricción, es decir, si un retrovirus dado puede ser dirigido por TRIM5α, está completamente determinada por la secuencia de aminoácidos del dominio C-terminal de la proteína, llamado dominio B30.2 / PRY-SPRY. [12] El aminoácido 332, que se encuentra dentro de este dominio, parece jugar un papel crítico en la determinación de la especificidad de la restricción de retrovirus. [13] [14]
TRIM5α puede haber jugado un papel crítico en el sistema de defensa inmunológico humano hace unos 4 millones de años, cuando el retrovirus PtERV1 estaba infectando a los ancestros de los chimpancés modernos. [14] Si bien aún no se ha encontrado ningún rastro de PtERV1 en el genoma humano, se han encontrado alrededor de 130 rastros de ADN de PtERV1 en el genoma de los chimpancés modernos. Después de recrear parte del retrovirus PtERV1, se informó que TRIM5α evita que el virus ingrese a las células humanas in vitro . Si bien este mecanismo de defensa celular puede haber sido muy útil hace 4 millones de años frente a una epidemia de PtERV1 , tiene el efecto secundario de dejar las células más susceptibles al ataque del retrovirus VIH-1. Recientemente, se han arrojado dudas sobre estas conclusiones. Al usar una cápside de PtERV1, que produce partículas similares a virus de títulos más altos, Perez-Caballero et al. informó que PtERV1 no está restringido por TRIM5α humano o chimpancé. [15]
Los macacos Rhesus , una especie de monos del Viejo Mundo , parecían ser casi completamente resistentes al VIH-1, el virus que causa el SIDA en los seres humanos. [16] La versión de TRIM5α para macacos Rhesus fue muy rápida y tenía una afinidad lo suficientemente alta con la cápsula del VIH entrante como para que pudiera unirla y degradarla rápidamente para neutralizar el virus.
Los seres humanos también tienen un TRIM5α, pero no está lo suficientemente ajustado para mediar una respuesta suficiente. Sin embargo, la versión humana de TRIM5α puede inhibir cepas del virus de la leucemia murina (MLV) [17] [18] , así como del virus de la anemia infecciosa equina (VAIE). [19] [20]
Antes del descubrimiento de TRIM5α como proteína antiviral, el fenotipo de inhibición se había descrito y acuñado como Ref1 (en células humanas) y Lv1 (en células de mono). Esta terminología está ahora en gran parte abandonada.
Se aisló una proteína relacionada, denominada TRIMCyp (o TRIM5-CypA), en el mono búho , una especie de mono del Nuevo Mundo , y se demostró que inhibe de forma potente la infección por VIH-1. [21] Una proteína similar ha surgido de forma independiente en los monos del Viejo Mundo y se ha identificado en varias especies de macacos. [22] [23]
Recientemente se describió que la estimulación del inmunoproteasoma mediada por interferón-α permite a TRIM5α humano para una inhibición eficaz dependiente de la cápside de la síntesis e infección del ADN del VIH-1. [24]