Potyvirus

Género de virus de ARN de cadena positiva de la familia Potyviridae

Potyvirus
Genoma del virus de la viruela del ciruelo con micrografía electrónica y modelo de viriones
Clasificación de virus
(no clasificado):	Virus
Reino :	Riboviria
Reino:	Orthornavirae
Filo:	Pisuviricota
Clase:	Stelpaviricetes
Pedido:	Patatavirales
Familia:	Potyviridae
Género:	Potyvirus
Especies
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Potyvirus es un género de virus de ARN de cadena positiva de la familia Potyviridae . Las plantas sirven como huéspedes naturales. El género se nombra después de virus miembro de olla virus ato Y . Los potyvirus representan alrededor del treinta por ciento de los virus de plantas actualmente conocidos. Al igual que los begomovirus , los miembros de este género pueden causar pérdidas significativas en cultivos agrícolas, pastoriles, hortícolas y ornamentales . Más de 200 especies de pulgones transmiten potyvirus, y la mayoría son de la subfamilia Aphidinae (géneros Macrosiphum y Myzus). El género contiene 190 especies. ^{[1] [2]}

Virología

Estructura

El virión está no envueltos con una flexuosa y filamentoso nucleocápside , 680 a 900 nanómetros (nm) de largo y es 11-20 nm de diámetro. ^[1] La nucleocápside contiene alrededor de 2000 copias de la proteína de la cápside. La simetría de la nucleocápside es helicoidal con un paso de 3,4 nm.

Genoma

Mapa genómico de un miembro típico del género Potyvirus .

El genoma es un ARN lineal, de sentido positivo y monocatenario que varía en tamaño de 9 000 a 12 000 bases nucleotídicas . La mayoría de los potyvirus tienen genomas no segmentados, ^[1] aunque varias especies son bipartitas. La composición de la base es: 21-23,51-26% G; 23-30,15-44% A; 14,9-22,41-28% C; 15,6–24,41–30,9% U. ^{[ cita requerida ]}

En las especies con un solo genoma, en el extremo 5 'se une covalentemente una proteína (la proteína VPg ). Codifica un único marco de lectura abierto (ORF) expresado como un precursor de poliproteína de 350 kDa. Esto se procesa en diez proteínas más pequeñas: proteasa de proteína 1 (P1-Pro), proteasa de componente auxiliar (HC-Pro), proteína 3 (P3), inclusión cilíndrica (CI), proteína viral ligada al genoma (Vpg), inclusión nuclear A (NIa), inclusión nuclear B (NIb), proteína de la cápside (CP) y dos pequeñas proteínas putativas conocidas como 6K1 y 6K2. El cistrón P3 también codifica una segunda proteína, P3N-PIPO, que se genera mediante un desplazamiento de marco de +2 . ^[3]

Proteínas

Diagrama del virión potyvirus

Propiedades de la proteína viral:

P1-Pro (~ 33 kilo Daltons (kDa) de peso molecular) es una serina proteasa .

HC-Pro (~ 52 KDa) es una proteasa que también participa en la transmisión de pulgones. Como proteasa, escinde undipéptido de glicina- glicina en su propio extremo C-terminal . También interactúa con el factor de iniciación eucariota 4 (eIF4). Actúa comosupresor silenciador del ARN viral.

P3 (~ 41 kDa) no se conoce la función. Interactúa con una gran subunidad de la ribulosa-1,5-bisfosfato carboxilasa / oxigenasa .

CI (~ 71 kDa) es una ARN helicasa con actividad ATPasa . También participa en la unión de la membrana.

NIa (~ 50 kDa) se escinde en NIa-Pro a proteasa (~ 27 kDa) y la proteína VPg (~ 22 kDa).

NIb (~ 59 kDa) es una ARN polimerasa dependiente de ARN .

6K1 (~ 6 kDa) no se conoce la función. La proteína 6K2 (~ 6 kDa), que tiene un solo dominio transmembrana, se acumula en las membranas celulares del hospedador y se cree que desempeña un papel en la formación de las vesículas de replicación del virus.

P3N-PIPO (~ 25 kDa) la función no se conoce pero parece ser esencial. Interactúa con las subunidades grandes y pequeñas de la ribulosa-1,5-bisfosfato carboxilasa / oxigenasa.

CP la proteína de la cápside oscila entre 30 y 35 kDa de peso.

La proteína VPg interactúa con el factor de iniciación eucariota 4E (eIF4E). ^[4] Esta interacción parece ser esencial para la infectividad viral. Dos proteasas, P1 y la proteasa del componente auxiliar (HC) catalizan solo reacciones autoproteolíticas en sus respectivos extremos C. Las reacciones de escisión restantes son catalizadas por mecanismos trans-proteolíticos o autoproteolíticos por la proteína de inclusión nuclear pequeña (NIa-Pro). Esta última proteína es una homología evolutiva de la proteinasa 3C de picornavirus . ^{[ cita requerida ]}

Ciclo vital

Replicación y movimiento del virus del mosaico de la soja (SMV) dentro de la célula

La replicación puede ocurrir en el citoplasma , ^[1] núcleos , cloroplastos , aparato de Golgi , vacuolas celulares o, más raramente, en sitios inusuales.

Los potyvirus producen inclusiones proteínicas en las células vegetales infectadas. Estos pueden ser cristales en el citoplasma o en el núcleo, como cuerpos X amorfos, cuerpos membranosos, viroplasmas o molinetes. Las inclusiones pueden contener viriones o no (según la especie). Estas inclusiones pueden verse en el microscopio óptico en tiras de hojas de tejido vegetal infectado teñidas con naranja-verde (tinción de proteínas) pero no con Azure A (tinción de ácido nucleico). ^{[5] [6] [7]} Hay cuatro tipos diferentes de inclusiones de potyvirus. ^[8]

La replicación sigue el modelo de replicación del virus de ARN de cadena positiva. La transcripción del virus de ARN de cadena positiva es el método de transcripción. La traducción se realiza mediante un desplazamiento del marco ribosómico -1. El virus sale de la célula huésped mediante un movimiento viral guiado por túbulos. Las plantas sirven como hospedadores naturales. El virus se transmite a través de un vector (insectos). Las rutas de transmisión son vectoriales y mecánicas. ^[1]

Evolución

Los potyvirus evolucionaron hace entre 6.600 y 7.250 años. ^{[9] [10]} Parece que han evolucionado en el suroeste de Eurasia o en el norte de África . La tasa de mutación estimada es de aproximadamente 1,15 × 10 ⁻⁴ sustituciones de nucleótidos / sitio / año. ^{[ cita requerida ]}

Difusión geográfica

La agricultura se introdujo en Australia en el siglo XVIII. Esta introducción también incluyó patógenos de plantas. En Australia se han aislado 38 especies de potyvirus. Se han encontrado dieciocho potyvirus sólo en Australia y se presume que son endémicos allí. Los veinte restantes parecen haber sido introducidos con la agricultura. ^{[ cita requerida ]}

Taxonomía

Potyvirus contiene las siguientes especies: ^[2]

• Virus del mosaico de la berenjena africana
• Virus del mosaico de la sandía argelina
• Virus del mosaico de la alstroemeria
• Virus del mosaico leve Alternanthera
• Virus del moteado de la hoja del amaranto
• Virus del mosaico del lirio del Amazonas
• Angélica virus Y
• Virus de Apium Y
• Virus del mosaico de Araujia
• Virus del moteado de Arracacha
• Virus del espárrago 1
• Virus del mosaico de la bráctea del banano
• Virus Barbacena Y
• Virus del mosaico de la basella rugosa
• Virus de la necrosis del mosaico común del frijol
• Virus del mosaico común del frijol
• Virus del mosaico amarillo del frijol
• Virus del mosaico de la remolacha
• Virus que rompe la flor de la begonia
• Virus del mosaico de Bidens
• Virus del moteado de Bidens
• Virus A de la escila azul
• Virus del mosaico de Brugmansia
• Virus del moteado de Brugmansia suaveolens
• Virus del mosaico de la flor de mariposa
• Virus del mosaico leve de Calanthe
• Virus latente del lirio de cala
• Virus del moteado de Callistephus
• El virus de la vena amarilla de Canna
• Virus del moteado de la vena del clavel
• Virus de la hoja fina de la zanahoria
• Virus de la zanahoria Y
• Virus del mosaico de Catharanthus
• Virus del mosaico del apio
• Virus del mosaico del ceratobio
• Virus de la mancha anular del chile
• Virus del moteado veinal del chile
• Virus del mosaico de la alcachofa china
• Virus del clitoria Y
• Virus de la vena amarilla del trébol
• Virus de la racha del pie de gallo
• Virus de la datura colombiana
• Virus del mosaico de la commelina
• Virus del mosaico de la franja de Costus
• Virus del mosaico transmitido por el pulgón del caupí
• Virus de bandas de las venas de las cucurbitáceas
• Virus de Cypripedium Y
• Virus A de Cyrtanthus elatus
• Virus del mosaico de Daphne
• Virus Daphne Y
• Virus del mosaico de Dasheen
• Virus de la puntilla de Datura
• Virus del mosaico clorótico de Dendrobium
• Virus del mosaico de Dioscorea
• Virus Diuris Y
• Virus A de la orquídea burro
• Virus de distorsión de la Passiflora de Asia oriental
• Virus de la Passiflora de Asia oriental
• Virus del mosaico necrótico de la endibia
• Virus de la mancha anular de Euphorbia
• Virus del mosaico de la fresia
• Virus de la fritillary Y
• Virus del mosaico de rayas Gloriosa
• Virus del mosaico de Gomphocarpus
• Virus del mosaico de Habenaria
• Virus del mosaico de Hardenbergia
• Virus del mosaico de beleño
• Virus Hibbertia Y
• Virus del mosaico del hippeastrum
• Virus del mosaico del jacinto
• Virus de rotura de flores de Impatiens
• Virus del mosaico del iris fulva
• Virus del mosaico leve del iris
• Virus del mosaico severo del iris
• Virus del mosaico del ñame japonés
• Virus del jazmín T
• Virus del mosaico de Johnsongrass
• Virus del mosaico de Kalanchoe
• Virus del mosaico de Keunjorong
• Virus del mosaico de Konjac
• Virus de la raya amarilla del puerro
• Virus necrótico italiano de la lechuga
• Virus del mosaico de la lechuga
• Virus del moteado de lirio
• Lily virus Y
• Virus del mosaico de Lupinus
• Virus del moteado leve de Lycoris
• Virus del mosaico enano del maíz
• Virus de aclaramiento de la vena de la malva
• Virus Mashua Y
• Virus que rompe el azafrán de las praderas
• Virus de la ruda mediterránea
• Virus del mosaico de la sandía marroquí
• Virus de la degeneración del narciso
• Virus de los amarillos de la temporada tardía del narciso
• Virus de la raya amarilla del narciso
• Virus de la franja amarilla Nerine
• Virus del mosaico de Noni
• Virus del mosaico Nothoscordum
• Virus de la enana amarilla de la cebolla
• Virus del mosaico de Ornithogalum
• Virus Ornithogalum 2
• Virus de Ornithogalum 3
• Virus Panax Y
• Virus del mosaico de la distorsión de la hoja de papaya
• Virus de la mancha anular de la papaya
• Virus de la necrosis del mosaico de París
• Virus de París 1
• Virus del mosaico de la chirivía
• Virus de la clorosis de la pasiflora
• Virus del moteado de la pasionaria
• Virus de la madera de la fruta de la pasión
• Virus del mosaico transmitido por semillas de guisantes
• Virus del moteado del maní
• Virus asociado al mosaico de pacanas
• Virus del mosaico de Pennisetum
• Virus del moteado de la pimienta
• Virus del mosaico severo de la pimienta
• Virus del moteado veinal de la pimienta
• Virus del mosaico amarillo de la pimienta
• Virus del mosaico del tomate de Perú
• Virus del mosaico de Pfaffia
• Virus del moteado leve Platycodon
• Virus de la rotura de la flor de la pleione
• Pleione virus Y
• Virus de la viruela de la ciruela
• Virus del mosaico de la hierba carmín
• Virus A de la patata
• Virus de la patata V
• Virus de la papa Y
• Virus de la mancha amarilla de la papa
• Virus de la distorsión de la hoja de Ranunculus
• Virus del mosaico leve del ranúnculo
• Virus del mosaico del ranúnculo
• Virus Rhopalanthe Y
• Virus latente del azafrán
• Sarcochilus virus Y
• Virus del mosaico de la cebolleta
• Virus de la raya amarilla de la chalota
• Virus del mosaico del sorgo
• Virus del mosaico de la soja
• Virus del mosaico de Spiranthes 3
• Virus del mosaico de la sandía de Sudán
• Virus del mosaico de la caña de azúcar
• Virus del moteado clorótico del girasol
• Virus del mosaico leve del girasol
• Virus del mosaico del girasol
• Virus de la mancha del anillo de girasol
• Virus del moteado plumoso de la batata
• Virus latente de la batata
• Virus moteado leve de la batata
• Virus de la batata 2
• Virus C de la batata
• Virus de la batata G
• Virus de la malformación de la hoja de tamarillo
• Virus del mosaico de Telfairia
• Virus del mosaico de Telosma
• Virus del mosaico de la fritillary de Thunberg
• Virus del grabado del tabaco
• Virus mosqueado del tabaco
• Virus del mosaico de las bandas de las venas del tabaco
• Virus del moteado de las venas del tabaco
• Virus del acrobacias necróticas del tomate
• Virus del mosaico leve de Tradescantia
• Virus del mosaico leve de la tuberculosis
• Virus del moteado leve de la tuberosa
• Virus de ruptura de tulipanes
• Virus del mosaico del tulipán
• Virus del mosaico del nabo
• Virus de estrías cloróticas de tallo retorcido
• Virus de la pasionaria de Uganda
• Virus del mosaico de Vallota
• Virus del mosaico de la distorsión de vainilla
• Verbena virus Y
• Virus del moteado de la hoja de la sandía
• Virus del mosaico de la sandía
• Virus de bandas del melón salvaje
• Virus asintomático de la cebolla silvestre
• Virus del mosaico de la papa silvestre
• Virus del mosaico del tomate silvestre
• Virus del mosaico de las venas de las glicinias
• Virus del mosaico leve del ñame
• Virus del mosaico del ñame
• Virus del mosaico de Yambean
• Virus del mosaico leve de Zantedeschia
• Virus del mosaico de zea
• Virus de la puntilla del calabacín
• Virus del mosaico del calabacín tigre
• Virus de la mota amarilla del calabacín
• Virus del mosaico amarillo del calabacín

Otros cuatro virus se clasificaron previamente como especies de este género, pero fueron abolidos debido a la falta de información sobre la secuencia genética: ^[11]

• Virus de bandas de venas verdes del caupí
• Virus de la mancha ocular del maní
• Virus de Helenium Y
• Virus del mosaico Tropaeolum

Referencias

1. "Zona viral" . EXPASY . Consultado el 15 de junio de 2015 .
2. "Taxonomía de virus: versión 2020" . Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV). Marzo de 2021 . Consultado el 21 de mayo de 2021 .
3. Chung, BY; Miller, WA; Atkins, JF; Firth, AE (2008). "Un gen esencial superpuesto en Potyviridae" . Proc Natl Acad Sci USA . 105 (15): 5897–5902. Código Bibliográfico : 2008PNAS..105.5897C . doi : 10.1073 / pnas.0800468105 . PMC 2311343 . PMID 18408156 .  
4. Léonard, S; Plante, D; Wittmann, S; Daigneault, N; Fortin, MG; Laliberté, JF (2000). "La formación de complejos entre potyvirus VPg y el factor de iniciación eucariota de traducción 4E se correlaciona con la infectividad del virus" . J Virol . 74 (17): 7730–7737. doi : 10.1128 / jvi.74.17.7730-7737.2000 . PMC 112301 . PMID 10933678 .  
5. "Materiales y métodos para la detección de inclusiones virales" . Universidad de Florida - Instituto de Ciencias Agrícolas y Alimentarias. Archivado desde el original el 19 de febrero de 2012.
6. Christie, RG y Edwardson, JR (1977). Fla Agric. Exp. Stn Monog. Núm. 9, 150 págs.
7. ¿Cómo se diagnostica una infección por virus en una planta? Archivado el 4 de agosto de 2012 en archive.today
8. Departamento de Agricultura y Servicios al Consumidor de Florida: virus de plantas de Florida y sus inclusiones — Potyvirus
9. Gibbs, AJ; Ohshima, K; Phillips, MJ; Gibbs, MJ (2008). "La prehistoria de los potyvirus: su radiación inicial fue durante los albores de la agricultura" . PLOS ONE . 3 (6): e2523. Código Bibliográfico : 2008PLoSO ... 3.2523G . doi : 10.1371 / journal.pone.0002523 . PMC 2429970 . PMID 18575612 .  
10. Gibbs, A; Ohshima, K (2010). "Potyvirus y la revolución digital". Annu Rev Phytopathol . 48 : 205-23. doi : 10.1146 / annurev-phyto-073009-114404 . PMID 20438367 . 
11. Wylie S, Adams MJ, Chalam C, Kreuze JF, Lopez-Moya JJ, Ohshima K, Praveen S, Rabenstein F, Stenger DC, Wang A, Zerbini FM (2016). "Crear tres especies en el género Potyvirus y abolir cinco especies en el género Potyvirus " (PDF) . Consultado el 26 de julio de 2021 .

Bibliografía

• Ward, CW; Shukla, DD (1991). "Taxonomía de potyvirus: problemas actuales y algunas soluciones". Intervirología . 32 (5): 269–96. doi : 10.1159 / 000150211 . PMID  1657820 .
• King, Andrew MQ; et al., eds. (2012). " Potyvirus " . Taxonomía de virus: clasificación y nomenclatura de virus: noveno informe del Comité Internacional de Taxonomía de Virus . Londres: Academic Press. págs. 926–1072. ISBN 978-0123846846. Consultado el 9 de diciembre de 2014 .

enlaces externos

• Taxonomía UniProt: Potyvirus
• Viralzone: Potyvirus
• ICTV