" Candidatus Thorarchaeota ", o simplemente Thorarchaeota , es un filo dentro del superfilo Asgard archaea . El superfilo Asgard representa los parientes procariotas más cercanos de los eucariotas . Dado que existe una relación tan estrecha entre los dos dominios diferentes, proporciona más evidencia a la teoría del árbol de la vida de dos dominios que establece que los eucariotas se ramificaron desde el dominio de las arqueas . Las arqueas de Asgard son microbios marinos unicelulares que contienen apéndices en forma de rama y tienen genes similares a los de eukarya. [1] El superfilo asgard archaea está compuesto por Thorarchaeota,Lokiarchaeota , Odinarchaeota y Heimdallarchaeota . [2] Los thorarchaeota se identificaron por primera vez en la zona de transición de sulfato-metano en sedimentos de agua de marea. Thorarcheota se distribuye ampliamente en sedimentos marinos y de agua dulce.
Thorarchaeota | |
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clasificación cientifica | |
Dominio: | Arqueas |
Reino: | Proteoarchaeota |
Superphylum: | Asgard (arqueas) |
Filo: | " Candidatus Thorarchaeota" |
Sinónimos | |
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Descubrimiento
Los thorarchaeota se descubrieron analizando los sedimentos del estuario obtenidos del río White Oak en Carolina del Norte . Los estuarios son cuerpos de agua salobre donde se encuentran el agua dulce y el agua marina, proporcionando un área rica y única de nutrientes. [3] Un estudiante de doctorado de la Universidad de Texas descubrió nuevas características de Thorarchaeota que viven bajo sedimentos y con propiedades anóxicas . Los estudiantes graduados demostraron además que las arqueas ayudaron en la degradación de la materia orgánica, la fijación de carbono inorgánico y la reducción del azufre. [4] Los genomas de Thorarchaeota que se obtuvieron del medio marino parecían tener diversidad en las vías metabólicas con el potencial de degradar y absorber proteínas y carbohidratos. [5]
Descripción
Thorarchaeota no se ha cultivado en un laboratorio. Lo que se sabe sobre Thorarchaeota proviene del análisis de genomas parciales y casi completos. Se han secuenciado 3.029 proteínas de los genomas parciales. [6] Estos genomas contienen genes que sugieren que Thorarchaeota puede tener la capacidad de degradar la materia orgánica, lo que sugiere un papel en el ciclo del carbono y un papel intermedio en el ciclo del azufre . Se han encontrado genes para una vía Wood-Ljungdahl casi completa , pero carecían de los genes de la formiato deshidrogenasa . Esto podría deberse a tener genomas incompletos. Thorachaeota puede utilizar la vía de la tetrahidrometanopterina Wood-Ljungdahl para reducir el dióxido de carbono. [7] Thorarchaeota tiene genes para la degradación y asimilación de proteínas que incluyen los genes clostripain y gingipain . También tienen genes para peptidasas extracelulares . Estos genes pueden sugerir que la principal fuente de carbono de Thorarchaeota son las proteínas y los péptidos. [5] Los genomas parciales secuenciados de Thorarchaeota también tienen los genes de la glucólisis presentes. Les faltan los genes de las hexoquinasas , sin embargo, tienen los genes de las piruvato quinasas y la fosfoenolpiruvato sintasa . La presencia de los genes de estas enzimas puede influir en la capacidad de adaptarse a diferentes condiciones ambientales. Se han encontrado genes para la fijación de nitrógeno en la mayoría de las muestras que contienen los genomas parciales; sin embargo, no se han encontrado genes para las enzimas catalizadoras de la reducción de nitritos . [7] Algunos de los genomas parciales secuenciados tienen vías de Calvin-Benson-Bassham casi completas y se ha descubierto que utilizan RuBisCO de tipo IV . Mientras que otros phyla dentro del Asgard Superphylum usan RuBisCO tipo III y tipo IV, ninguno tiene la vía Calvin-Benson-Bassham. [7]
Referencias
- ^ "Archaea de Asgard esquiva finalmente cultivada en laboratorio" . The Scientist Magazine® . Consultado el 16 de noviembre de 2019 .
- ^ Zaremba-Niedzwiedzka, Katarzyna; Cáceres, Eva F .; Saw, Jimmy H .; Bäckström, Disa; Juzokaite, Lina; Vancaester, Emmelien; Seitz, Kiley W .; Anantharaman, Karthik; Starnawski, Piotr; Kjeldsen, Kasper U .; Stott, Matthew B. (enero de 2017). "Asgard archaea iluminar el origen de la complejidad celular eucariota" . Naturaleza . 541 (7637): 353–358. Código Bib : 2017Natur.541..353Z . doi : 10.1038 / nature21031 . ISSN 1476-4687 . PMID 28077874 . S2CID 4458094 .
- ^ Adam, Panagiotis S; Borrel, Guillaume; Brochier-Armanet, Céline; Gribaldo, Simonetta (noviembre de 2017). "El árbol en crecimiento de Archaea: nuevas perspectivas sobre su diversidad, evolución y ecología" . El diario ISME . 11 (11): 2407–2425. doi : 10.1038 / ismej.2017.122 . ISSN 1751-7362 . PMC 5649171 . PMID 28777382 .
- ^ "Nuevos filos de microbios identificados" . utmsi.utexas.edu . Consultado el 16 de noviembre de 2019 .
- ^ a b Seitz, Kiley W; Lazar, Cassandre S; Hinrichs, Kai-Uwe; Teske, Andreas P; Baker, Brett J (julio de 2016). "Reconstrucción genómica de un filo de arqueas de sedimento novedoso y profundamente ramificado con vías para la acetogénesis y la reducción de azufre" . El diario ISME . 10 (7): 1696-1705. doi : 10.1038 / ismej.2015.233 . ISSN 1751-7362 . PMC 4918440 . PMID 26824177 .
- ^ "Candidatus Thorarchaeota archaeon SMTZ1-83" . www.uniprot.org . Consultado el 16 de noviembre de 2019 .
- ^ a b c Liu, Yang; Zhou, Zhichao; Pan, Jie; Baker, Brett J .; Gu, Ji-Dong; Li, Meng (abril de 2018). "La inferencia genómica comparativa sugiere un estilo de vida mixotrófico para Thorarchaeota" . El diario ISME . 12 (4): 1021–1031. doi : 10.1038 / s41396-018-0060-x . ISSN 1751-7370 . PMC 5864231 . PMID 29445130 .