| Tombusviridae | |
|---|---|
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Clasificación de virus  | |
| (no clasificado): | Virus |
| Reino : | Riboviria |
| Reino: | Orthornavirae |
| Filo: | Kitrinoviricota |
| Clase: | Tolucaviricetes |
| Pedido: | Tolivirales |
| Familia: | Tombusviridae |
Tombusviridae es una familia de virus vegetales de ARN de sentido positivo monocatenario . Actualmente hay 76 especies en esta familia, divididas en tres subfamilias. [1] [2] El nombre se deriva de la especie tipo del género Tombusvirus , virus del achaparramiento del tomate (TBSV). [3]
Genoma [ editar ]
Todos los Tombusviridae tienen un genoma lineal no segmentado (monopartito) , con la excepción de los Dianthovirus, cuyo genoma es bipartito. [4] El genoma tiene aproximadamente 4,6 a 4,8 kb de longitud, carece de un casquete de 5 ' y una cola de poli (A), y codifica de 4 a 6 ORF . La polimerasa codifica un codón de parada ámbar que es el sitio de un evento de lectura completa dentro de ORF1, produciendo dos productos necesarios para la replicación. No hay helicasa codificada por el virus. [5]
Estructura [ editar ]
El ARN está encapsulado en una cápside icosaédrica (T = 3) , compuesta por 180 unidades de una sola proteína de cubierta de 27 a 42 K de tamaño; el virión mide entre 28 y 35 nm de diámetro y no está envuelto. [1] [6]
Ciclo de vida [ editar ]
La replicación viral es citoplasmática y lisogénica. La entrada en la célula huésped se logra mediante la penetración en la célula huésped. La replicación sigue el modelo de replicación del virus de ARN de cadena positiva. La transcripción de virus de ARN de cadena positiva, utilizando el modelo de terminación prematura de la transcripción de ARN subgenómico, es el método de transcripción. La traducción se realiza mediante exploración con fugas, desplazamiento del marco ribosómico -1, iniciación viral y supresión de la terminación. El virus sale de la célula huésped mediante un movimiento viral guiado por túbulos. Las plantas sirven como hospedadores naturales. Las rutas de transmisión son mecánicas, transmitidas por semillas y por contacto. [1] [7]
Los virus de esta familia se transmiten principalmente por el suelo, algunos transmitidos por especies de hongos del orden Chytridiales , otros por ningún vector conocido. Los viriones se pueden propagar por el agua, el crecimiento de raíces en el suelo infectado, el contacto entre plantas, polen o semillas, según la especie del virus. Estos virus pueden transmitirse con éxito mediante injertos o inoculación mecánica, y tanto el virión como el material genético por sí solos son infecciosos. [6]
Replicación [ editar ]
Los miembros de Tombusviridae se replican en el citoplasma mediante el uso de plantillas de hebra negativa. El proceso de replicación deja un excedente de hebras de ARN de sentido positivo (+), y se cree que el ARN viral no solo actúa como plantilla para la replicación, sino que también es capaz de manipular y regular la síntesis de ARN . [5]
Se ha demostrado que el nivel de síntesis de ARN se ve afectado por las propiedades de acción cis de ciertos elementos en el ARN (como ARN1 y 2 [8] [9] ), que incluyen secuencias promotoras centrales que regulan el sitio de inicio de la síntesis de cadenas de ARN complementarias. Se cree que este mecanismo es reconocido por la ARN polimerasa dependiente de ARN , que se encuentra codificada dentro del genoma. [5] [7] [10]
Se ha descubierto que Tombusviridae coopta GAPDH , una enzima metabólica del huésped, para su uso en el centro de replicación. GAPDH puede unirse a la cadena de ARN (-) y mantenerla en el complejo de replicasa, lo que permite que las cadenas de ARN (+) sintetizadas a partir de ella se exporten y se acumulen en la célula huésped. La regulación a la baja de GAPDH redujo la acumulación de ARN viral y eliminó el excedente de copias de ARN (+). [11]
Notas [ editar ]
La investigación ha demostrado que la infección de plantas por tombusvirus contiene ARN interferentes defectuosos que nacen directamente del genoma del ARN del virus y no del genoma del hospedador. Los ARN de DI víricos con su tamaño pequeño y elementos que actúan en cis son buenos moldes tanto in vivo como in vitro en los que estudiar la replicación del ARN. [12] [13] [14]
El ARN subgenómico se utiliza en la síntesis de algunas proteínas; se generan por la terminación prematura de la síntesis de la cadena (-). Las plantillas de sgRNA y sgRNA de sentido negativo se encuentran en las células infectadas. [6]
Taxonomía [ editar ]
Subfamilia: Calvusvirinae ; géneros:
- Umbravirus
Subfamilia: Procedovirinae ; géneros:
- Alfacarmovirus
- Alfanecrovirus
- Aureusvirus
- Avenavirus
- Betacarmovirus
- Betanecrovirus
- Gallantivirus
- Gammacarmovirus
- Macanavirus
- Machlomovirus
- Panicovirus
- Pelarspovirus
- Tombusvirus
- Zeavirus
más especies de la subfamilia no asignadas a un género:
- Virus Ahlum transmitido por el agua
- Virus del mosaico leve del frijol
- Virus de la necrosis de Chenopodium
- Virus del pepino transmitido por el suelo
- Seguimiento del virus de lespedeza 1
- Virus de Weddel transmitido por el agua
Subfamilia: Regressovirinae ; géneros:
- Diantovirus
Referencias [ editar ]
- ^ a b c "Zona viral" . EXPASY . Consultado el 15 de junio de 2015 .
- ^ ICTV. "Taxonomía de virus: versión 2014" . Consultado el 15 de junio de 2015 .
- ^ Habili, N. y Symons, RH (1989). Relación evolutiva entre luteovirus y otros virus de plantas de ARN basada en motivos de secuencia en sus polimerasas de ARN putativas y helicasas de ácido nucleico. Investigación sobre ácidos nucleicos 17 : 23, 9543–55
- ^ Enciclopedia de Wiley Interscience de ciencias biológicas: Tombusviridae
- ^ a b c ICTV : Familia - Tombusviridae , en: Taxonomía de virus. Noveno informe del Comité Internacional sobre Taxonomía de Virus 2012, págs. 1111-1138, 23 de noviembre de 2011, doi: 10.1016 / B978-0-12-384684-6.00096-3
- ^ a b c ICTVdB: la base de datos universal de virus, versión 3 00.074. Tombusviridae
- ^ a b Beth L. Nicholson, Pui Kei K. Lee, KA White: Los elementos internos de replicación del ARN prevalecen en Tombusviridae , en: Frente. Microbiol., 6 de agosto de 2012, doi: 10.3389 / fmicb.2012.00279
- ^ Lommel SA, Weston-Fina M, Xiong Z, Lomonossoff GP (septiembre de 1988). "La secuencia de nucleótidos y la organización de genes del virus del mosaico necrótico del trébol rojo RNA-2" . Ácidos nucleicos Res . 16 (17): 8587–602. doi : 10.1093 / nar / 16.17.8587 . PMC 338578 . PMID 3047682 .
- ^ Mizumoto H, Tatsuta M, Kaido M, Mise K, Okuno T (noviembre de 2003). "Mejora traduccional independiente de la tapa por la región no traducida 3 'del virus del mosaico necrótico del trébol rojo RNA1" . J. Virol . 77 (22): 12113–21. doi : 10.1128 / JVI.77.22.12113-12121.2003 . PMC 254280 . PMID 14581548 .
- ^ K. Andrew White, Peter D. Nagy: Avances en la biología molecular de Tombusvirus: expresión génica, replicación del genoma y recombinación , en: Progreso en investigación de ácidos nucleicos y biología molecular, vol. 78, 2004, págs. 187-226, doi: 10.1016 / S0079-6603 (04) 78005-8
- ^ Wang, R. y Nagy, P. (2008) El virus de la acrobacia tupida del tomate coopta la función de unión al ARN de una enzima metabólica del hospedador para la síntesis del ARN genómico viral. Anfitrión celular y microbio 3 : 3 178–187
- ^ NCBI: ARN-4 interferente defectuoso del virus del enanismo tupido del tomate (TBSV-P DI-4) y ARN-5 interferente defectuoso del virus del enanismo tupido del tomate (TBSV-P DI-5)
- ^ Yamamura, Yoshimi; Scholthof, Herman B. (1 de septiembre de 2005). "Virus del acrobacias tupidas del tomate: un sistema modelo resistente para estudiar las interacciones virus-planta". Patología Molecular Vegetal . 6 (5): 491–502. doi : 10.1111 / j.1364-3703.2005.00301.x . PMID 20565674 .
- ^ Scholthof, Karen-Beth G .; Scholthof, Herman B .; Jackson, Andrew O. (1 de agosto de 1995). "El efecto de los ARN interferentes defectuosos sobre la acumulación de proteínas del virus del acrobacias tupidas del tomate y las implicaciones para la atenuación de enfermedades". Virología . 211 (1): 324–328. doi : 10.1006 / viro.1995.1410 . PMID 7645230 .
Enlaces externos [ editar ]
- Zona viral : Tombusviridae
- ICTV
