La familia de motivos tripartitos ( TRIM ) es una familia de proteínas . [1]
Función
Muchas proteínas TRIM son inducidas por interferones , que son componentes importantes de la resistencia a patógenos y se sabe que varias proteínas TRIM son necesarias para la restricción de la infección por lentivirus . Las proteínas TRIM participan en el reconocimiento de patógenos y en la regulación de las vías transcripcionales en la defensa del huésped. [2]
Estructura
El motivo tripartito siempre está presente en el extremo N de las proteínas TRIM. El motivo TRIM incluye los siguientes tres dominios: [1]
- (1) un dominio de dedo RING
- (2) uno o dos dominios de dedos de zinc de caja B
- cuando solo hay una caja B, siempre es una caja B de tipo 2
- cuando hay dos cajas B, la caja B de tipo 1 siempre precede a la caja B de tipo 2
- (3) región de la bobina enrollada
El extremo C-terminal de las proteínas TRIM contiene:
- Proteínas del grupo 1 : un dominio C-terminal seleccionado de la siguiente lista:
- Dominios NHL e IGFLMN, ya sea en asociación o solos
- Dominio PHD asociado a un bromodominio
- Dominio MATH (por ejemplo, TRIM37 )
- Dominio ARF (por ejemplo, TRIM23 )
- Dominio EXOIII (en, por ejemplo, TRIM19 ) o
- Proteínas del grupo 2 : un dominio C-terminal de SPRY
- por ejemplo, TRIM21
Miembros de la familia
La familia TRIM se divide en dos grupos que difieren en la estructura del dominio y la organización genómica: [3]
- Los miembros del grupo 1 poseen una variedad de dominios C-terminales y están representados tanto en vertebrados como en invertebrados.
- El grupo 2 está ausente en invertebrados, posee un dominio SPRY C-terminal [4]
Los miembros de la familia incluyen:
- Grupo 1
- Dominio PHD-BROMO que contiene: TRIM24 (TIF1α), TRIM28 (TIF1β), TRIM33 (TIF1γ) - actúan como correpresores
- 1-10: TRIM1 , TRIM2 , TRIM3 , TRIM8 , TRIM9
- 11-20: TRIM12 , TRIM13 , TRIM14 , TRIM16 , TRIM18 , TRIM19
- 21-30: TRIM23 , TRIM25 , TRIM29 , TRIM30
- 31-40: TRIM32 , TRIM36 , TRIM37
- 41-50: TRIM42 , TRIM44 , TRIM45 , TRIM46 , TRIM47
- 51-60: TRIM51 , TRIM53 , TRIM54 , TRIM55 , TRIM56 , TRIM57 , TRIM59
- 61-70: TRIM62 , TRIM63 , TRIM65 , TRIM66 , TRIM67 , TRIM69 , TRIM70
- 71-75: TRIM71
- Grupo 2
- 1-10: TRIM4 , TRIM5 , TRIM6 , TRIM7 , TRIM10
- 11-20: TRIM11 , TRIM12 , TRIM15 , TRIM17 , TRIM20
- 21-30: TRIM21 , TRIM22 , TRIM26 , TRIM27 , TRIM30
- 31-40: TRIM31 , TRIM34 , TRIM35 , TRIM38 , TRIM39 , TRIM40
- 41-50: TRIM41 , TRIM43 , TRIM48 , TRIM49 , TRIM50
- 51-60: TRIM51 , TRIM52 , TRIM53 , TRIM57 , TRIM58 , TRIM60
- 61-70: TRIM61 , TRIM64 , TRIM68 , TRIM69 , TRIM70
- 71-75: TRIM72 , TRIM73 , TRIM74 , TRIM75
Referencias
- ^ a b Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (mayo de 2001). "La familia de motivos tripartitos identifica compartimentos celulares" . EMBO J . 20 (9): 2140–51. doi : 10.1093 / emboj / 20.9.2140 . PMC 125245 . PMID 11331580 .
- ^ Ozato K, Shin DM, Chang TH, Morse HC (noviembre de 2008). "Proteínas de la familia TRIM y sus roles emergentes en la inmunidad innata" . Nat. Rev. Immunol . 8 (11): 849–60. doi : 10.1038 / nri2413 . PMC 3433745 . PMID 18836477 .
- ^ Sardiello M, Cairo S, Fontanella B, Ballabio A, Meroni G (2008). "El análisis genómico de la familia TRIM revela dos grupos de genes con distintas propiedades evolutivas" . BMC Evol. Biol . 8 : 225. doi : 10.1186 / 1471-2148-8-225 . PMC 2533329 . PMID 18673550 .
- ^ Ponting C, Schultz J, Bork P (junio de 1997). "Dominios SPRY en receptores de rianodina (Ca (2 +) - canales de liberación)". Trends Biochem. Sci . 22 (6): 193–4. doi : 10.1016 / S0968-0004 (97) 01049-9 . PMID 9204703 .